Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.39 (tig00000042_g15430.t1)
0.11 0.08 0.11 0.16 0.18 0.08 0.14 0.12 0.17 0.05 0.09 0.14 0.11 0.07 0.01 0.02 0.0 0.16 0.08 0.03 0.1 0.02 0.27 1.0 0.21 0.35
0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.04 0.04 0.02 0.01 0.15 0.01 0.25 0.08 0.16 0.27 0.29 0.45 0.09 0.51 1.0 0.19 0.41
Cpa|evm.model.tig00000133.24 (tig00001253_g7804.t1)
0.01 0.07 0.13 0.18 0.17 0.19 0.22 0.15 0.21 0.29 0.32 0.34 0.05 0.22 0.12 0.14 0.13 0.18 0.11 0.12 0.21 0.27 0.59 1.0 0.21 0.29
Cpa|evm.model.tig00000157.129 (tig00000157_g9733.t1)
0.01 0.02 0.07 0.07 0.14 0.1 0.21 0.17 0.22 0.11 0.22 0.12 0.04 0.15 0.22 0.15 0.22 0.37 0.17 0.28 0.07 0.16 1.0 0.39 0.78 0.36
Cpa|evm.model.tig00000157.8 (tig00000157_g9596.t1)
0.0 0.03 0.01 0.03 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.39 0.35 0.46 0.35 0.35 0.51 0.51 0.34 0.06 0.96 0.52 0.76 1.0
Cpa|evm.model.tig00000189.8 (tig00000189_g14310.t1)
0.15 0.07 0.06 0.13 0.11 0.07 0.1 0.17 0.13 0.16 0.29 0.25 0.22 0.26 0.26 0.39 0.09 0.22 0.34 0.39 0.33 0.35 0.71 1.0 0.36 0.42
Cpa|evm.model.tig00000248.33 (tig00000449_g954.t1)
0.05 0.05 0.01 0.06 0.06 0.05 0.04 0.03 0.09 0.15 0.02 0.12 0.05 0.03 0.04 0.03 0.01 0.02 0.01 0.05 0.33 0.08 0.52 1.0 0.45 0.1
Cpa|evm.model.tig00000254.87 (tig00000254_g22544.t1)
0.03 0.06 0.03 0.02 0.02 0.0 0.03 0.06 0.07 0.06 0.1 0.11 0.03 0.19 0.22 0.19 0.21 0.34 0.52 0.37 0.63 0.05 1.0 0.97 0.18 0.44
Cpa|evm.model.tig00000310.47 (tig00000310_g23971.t1)
0.54 0.27 0.18 0.14 0.12 0.07 0.15 0.18 0.23 0.32 0.32 0.36 0.42 0.16 0.18 0.09 0.22 0.29 0.23 0.16 0.37 0.16 0.29 1.0 0.33 0.31
Cpa|evm.model.tig00000310.49 (tig00000310_g23972.t1)
0.5 0.19 0.1 0.1 0.07 0.03 0.06 0.07 0.11 0.14 0.27 0.23 0.25 0.1 0.09 0.04 0.07 0.2 0.31 0.09 0.54 0.14 0.35 1.0 0.62 0.33
Cpa|evm.model.tig00000361.48 (tig00000361_g24397.t1)
0.14 0.1 0.11 0.16 0.14 0.11 0.11 0.1 0.12 0.18 0.19 0.18 0.08 0.3 0.32 0.33 0.24 0.36 0.35 0.28 0.34 0.32 0.65 1.0 0.46 0.35
Cpa|evm.model.tig00000430.50 (tig00000430_g639.t1)
0.09 0.17 0.32 0.41 0.51 0.44 0.54 0.31 0.35 0.38 0.28 0.41 0.07 0.63 0.5 0.59 0.46 0.5 0.68 0.48 0.19 0.25 1.0 0.86 0.44 0.6
Cpa|evm.model.tig00000449.31 (tig00000449_g959.t1)
0.02 0.06 0.07 0.22 0.28 0.39 0.2 0.25 0.26 0.16 0.09 0.12 0.09 0.16 0.05 0.21 0.03 0.52 0.19 0.07 0.4 0.22 1.0 0.82 0.42 0.26
Cpa|evm.model.tig00000480.71 (tig00000480_g1337.t1)
0.04 0.07 0.07 0.07 0.09 0.31 0.38 0.37 0.45 0.4 0.28 0.26 0.04 0.48 0.63 0.54 0.48 0.81 0.66 0.51 0.17 0.52 1.0 0.24 0.33 0.28
Cpa|evm.model.tig00000488.5 (tig00020556_g11006.t1)
0.04 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.04 0.05 0.05 0.06 0.02 0.2 0.11 0.2 0.06 0.26 0.28 0.27 0.35 0.12 0.31 1.0 0.25 0.47
Cpa|evm.model.tig00000571.11 (tig00000571_g2163.t1)
0.0 0.01 0.0 0.07 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.09 0.03 0.03 0.07 0.41 0.18 0.09 0.32 0.43 0.08 0.19 0.1 1.0 0.48 0.17 0.27
Cpa|evm.model.tig00000615.17 (tig00000615_g2546.t1)
0.41 0.27 0.2 0.29 0.34 0.32 0.37 0.32 0.25 0.24 0.26 0.37 0.31 0.22 0.34 0.28 0.28 0.44 0.34 0.16 0.05 0.36 1.0 0.94 0.43 0.35
Cpa|evm.model.tig00000865.63 (tig00000865_g5113.t1)
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.04 0.04 0.02 0.08 0.05 0.07 0.27 0.07 0.56 1.0 0.28 0.17
Cpa|evm.model.tig00001056.15 (tig00001056_g6637.t1)
0.1 0.04 0.05 0.06 0.08 0.06 0.03 0.04 0.08 0.1 0.13 0.09 0.07 0.19 0.63 0.23 0.05 0.2 0.14 0.08 0.49 0.35 1.0 0.99 0.46 0.51
Cpa|evm.model.tig00001065.19 (tig00001065_g6720.t1)
0.28 0.16 0.15 0.15 0.12 0.17 0.15 0.18 0.15 0.18 0.22 0.28 0.21 0.19 0.09 0.17 0.18 0.17 0.16 0.15 0.38 0.29 0.5 1.0 0.52 0.48
Cpa|evm.model.tig00001160.5 (tig00001160_g7338.t1)
0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.07 0.0 0.05 0.03 0.1 0.07 0.04 0.23 0.13 0.0 0.4 0.25 1.0 0.84 0.68 0.45
Cpa|evm.model.tig00001181.3 (tig00001181_g7420.t1)
0.17 0.16 0.15 0.09 0.03 0.02 0.0 0.09 0.04 0.24 0.3 0.17 0.3 0.12 0.06 0.09 0.0 0.09 0.06 0.15 0.2 0.16 0.71 1.0 0.21 0.46
Cpa|evm.model.tig00001231.4 (tig00021357_g20764.t1)
0.1 0.04 0.04 0.11 0.14 0.26 0.33 0.23 0.24 0.45 0.47 0.43 0.07 0.08 0.03 0.17 0.05 0.04 0.06 0.22 0.21 0.12 0.22 0.78 0.41 1.0
Cpa|evm.model.tig00001265.5 (tig00001265_g7891.t1)
0.17 0.1 0.04 0.06 0.15 0.23 0.18 0.12 0.29 0.17 0.06 0.19 0.1 0.49 0.44 0.42 0.35 0.37 0.56 0.41 0.21 0.12 1.0 0.39 0.52 0.37
Cpa|evm.model.tig00001493.13 (tig00001493_g8987.t1)
0.15 0.1 0.02 0.12 0.12 0.18 0.17 0.17 0.22 0.12 0.19 0.22 0.05 0.05 0.05 0.01 0.01 0.12 0.09 0.05 0.22 0.29 1.0 0.91 0.26 0.32
Cpa|evm.model.tig00001729.3 (tig00001729_g9737.t1)
0.08 0.04 0.04 0.13 0.19 0.31 0.28 0.15 0.12 0.15 0.12 0.08 0.06 0.22 0.17 0.2 0.05 0.05 0.18 0.14 0.27 0.15 0.74 1.0 0.23 0.35
Cpa|evm.model.tig00020528.7 (tig00020528_g9982.t1)
0.12 0.26 0.25 0.31 0.23 0.28 0.37 0.47 0.35 0.46 0.4 0.36 0.23 0.82 0.39 0.77 0.5 0.85 0.51 0.71 0.29 0.83 1.0 0.66 0.62 0.98
Cpa|evm.model.tig00020562.41 (tig00020562_g11166.t1)
0.04 0.06 0.06 0.02 0.09 0.06 0.05 0.07 0.25 0.23 0.17 0.21 0.11 0.32 0.51 0.27 0.45 0.61 0.6 0.26 0.18 0.09 1.0 0.8 0.23 0.44
0.05 0.08 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.08 0.22 0.85 1.0 0.27 0.35
Cpa|evm.model.tig00020564.26 (tig00001127_g7159.t1)
0.04 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.03 0.04 0.1 0.1 0.05 0.07 0.22 0.18 0.63 0.2 0.88 1.0 0.7 0.32
Cpa|evm.model.tig00020675.14 (tig00020675_g12595.t1)
0.04 0.0 0.07 0.06 0.06 0.02 0.15 0.11 0.24 0.14 0.04 0.17 0.0 0.12 0.46 0.43 0.33 0.42 0.39 0.4 0.09 0.28 1.0 0.83 0.03 0.17
Cpa|evm.model.tig00020675.15 (tig00020675_g12596.t1)
0.15 0.05 0.13 0.07 0.09 0.18 0.34 0.13 0.26 0.27 0.2 0.28 0.03 0.15 0.19 0.17 0.17 0.54 0.63 0.19 0.04 0.48 0.99 1.0 0.37 0.25
Cpa|evm.model.tig00020723.99 (tig00000219_g19517.t1)
0.22 0.11 0.09 0.11 0.12 0.08 0.07 0.07 0.13 0.16 0.24 0.25 0.16 0.07 0.12 0.05 0.09 0.15 0.11 0.1 0.19 0.1 0.3 1.0 0.14 0.19
Cpa|evm.model.tig00020734.36 (tig00021318_g20150.t1)
0.08 0.05 0.18 0.14 0.21 0.14 0.28 0.16 0.24 0.25 0.16 0.18 0.09 0.61 0.24 0.36 0.29 0.42 0.44 0.23 0.18 0.0 1.0 0.63 0.27 0.59
0.05 0.04 0.05 0.04 0.03 0.06 0.02 0.05 0.07 0.06 0.11 0.08 0.01 0.36 0.35 0.38 0.33 0.61 0.34 0.39 0.09 0.54 0.62 1.0 0.68 0.38
Cpa|evm.model.tig00020830.44 (tig00020909_g15377.t1)
0.33 0.14 0.1 0.17 0.27 0.34 0.41 0.49 0.42 0.66 0.6 0.6 0.34 0.82 0.55 0.5 0.47 0.6 0.58 0.52 0.5 0.81 1.0 0.74 0.96 0.86
Cpa|evm.model.tig00020849.13 (tig00020849_g14643.t1)
0.02 0.01 0.02 0.04 0.04 0.03 0.05 0.07 0.05 0.07 0.07 0.06 0.01 0.41 0.47 0.27 0.25 0.3 0.31 0.33 0.42 0.06 0.87 1.0 0.57 0.28
Cpa|evm.model.tig00020902.100 (tig00020878_g14865.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.24 0.11 0.04 1.0 0.12 0.53
Cpa|evm.model.tig00020902.103 (tig00020902_g15041.t1)
0.06 0.08 0.11 0.15 0.08 0.13 0.14 0.17 0.17 0.09 0.18 0.18 0.08 0.12 0.13 0.17 0.02 0.23 0.14 0.07 0.13 0.08 1.0 0.53 0.16 0.23
Cpa|evm.model.tig00020902.115 (tig00020902_g15059.t1)
0.1 0.2 0.21 0.25 0.35 0.34 0.33 0.29 0.26 0.27 0.32 0.31 0.07 0.42 0.36 0.45 0.29 0.64 0.69 0.28 0.25 0.14 0.91 1.0 0.95 0.64
Cpa|evm.model.tig00020902.17 (tig00020902_g14961.t1)
0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.14 1.0 0.2 0.19
Cpa|evm.model.tig00020902.18 (tig00020902_g14961.t1)
0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.09 1.0 0.23 0.14
Cpa|evm.model.tig00020909.60 (tig00020909_g15377.t1)
0.23 0.14 0.1 0.15 0.2 0.17 0.23 0.29 0.29 0.51 0.5 0.53 0.32 0.59 0.56 0.38 0.49 0.48 0.44 0.37 0.37 0.46 0.66 1.0 0.56 0.47
Cpa|evm.model.tig00020951.51 (tig00020951_g16454.t1)
0.02 0.01 0.03 0.02 0.05 0.04 0.04 0.1 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.3 0.33 0.25 0.45 0.43 0.46 0.14 0.28 0.17 1.0 0.63 0.85 0.56
Cpa|evm.model.tig00020951.52 (tig00021571_g22359.t1)
0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.1 0.21 0.24 0.18 0.19 0.06 0.14 1.0 0.46 0.41 0.33
Cpa|evm.model.tig00020952.8 (tig00020952_g16475.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.38 0.38 0.38 0.76 0.45 0.61 0.19 0.12 1.0 0.97 0.47 0.37
Cpa|evm.model.tig00021036.49 (tig00021036_g17323.t1)
0.09 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.04 0.1 0.06 0.09 0.13 0.08 0.05 0.03 0.07 0.0 0.02 0.07 0.03 0.08 0.22 0.05 0.4 1.0 0.3 0.28
Cpa|evm.model.tig00021038.14 (tig00021038_g17501.t1)
0.05 0.11 0.09 0.11 0.2 0.19 0.27 0.21 0.25 0.2 0.18 0.17 0.05 0.16 0.16 0.21 0.16 0.44 0.19 0.17 0.14 0.19 1.0 0.94 0.42 0.31
Cpa|evm.model.tig00021073.29 (tig00021073_g18033.t1)
0.24 0.21 0.15 0.21 0.21 0.2 0.24 0.17 0.2 0.22 0.26 0.38 0.25 0.16 0.19 0.13 0.1 0.25 0.24 0.11 0.48 0.36 0.47 1.0 0.54 0.36
Cpa|evm.model.tig00021108.44 (tig00021108_g18337.t1)
0.01 0.05 0.0 0.03 0.07 0.04 0.03 0.05 0.0 0.03 0.04 0.03 0.01 0.98 0.63 0.64 0.53 0.5 0.52 0.57 0.74 0.51 0.73 1.0 0.74 0.59
Cpa|evm.model.tig00021312.55 (tig00021312_g20089.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.07 0.0 0.0 0.09 0.39 0.35 0.0 0.42 0.12 0.28 0.7 0.11 0.82 1.0 0.31 0.5
Cpa|evm.model.tig00021338.5 (tig00021338_g20369.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.4 0.41 0.23 0.41 0.34 0.29 0.61 0.05 0.96 1.0 0.46 0.6
Cpa|evm.model.tig00021339.22 (tig00021339_g20400.t1)
0.48 0.45 0.36 0.5 0.53 0.51 0.47 0.47 0.49 0.47 0.45 0.52 0.33 0.45 0.4 0.4 0.36 0.45 0.48 0.33 0.15 0.58 1.0 0.83 0.42 0.31
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.0 0.11 0.0 0.0 0.13 0.26 0.1 0.32 0.2 0.15 0.33 0.94 0.1 1.0 0.63 1.0 0.53
Cpa|evm.model.tig00021365.17 (tig00021365_g20830.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.09 1.0 0.05 0.45
Cpa|evm.model.tig00021441.5 (tig00000754_g3908.t1)
0.06 0.21 0.14 0.25 0.19 0.16 0.32 0.17 0.24 0.21 0.23 0.15 0.1 0.08 0.05 0.04 0.09 0.11 0.11 0.06 0.53 0.07 0.9 1.0 0.34 0.42
Cpa|evm.model.tig00021463.15 (tig00020848_g14616.t1)
0.18 0.23 0.28 0.23 0.33 0.26 0.4 0.32 0.16 0.3 0.26 0.21 0.17 0.38 0.5 0.44 0.36 0.57 0.57 0.68 0.21 0.24 1.0 0.2 0.5 0.2
Cpa|evm.model.tig00021501.14 (tig00021501_g21955.t1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.2 0.31 0.14 0.3 0.51 0.18 0.48 0.25 1.0 0.81 0.6 0.47
Cpa|evm.model.tig00021504.7 (tig00021504_g21971.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.21 0.12 0.07 0.47 0.16 0.09 0.29 0.04 1.0 0.58 0.6 0.45
Cpa|evm.model.tig00021571.1 (tig00021571_g22354.t1)
0.03 0.0 0.03 0.07 0.08 0.04 0.0 0.07 0.03 0.0 0.03 0.07 0.09 0.15 0.3 0.23 0.25 0.23 0.27 0.3 0.12 0.11 0.63 1.0 0.41 0.36
Cpa|evm.model.tig00021571.8 (tig00021571_g22359.t1)
0.05 0.02 0.06 0.06 0.06 0.09 0.13 0.08 0.04 0.13 0.1 0.13 0.04 0.34 0.36 0.27 0.28 0.29 0.41 0.45 0.37 0.15 0.56 1.0 0.47 0.6
Cpa|evm.model.tig00021621.6 (tig00021621_g22962.t1)
0.12 0.12 0.2 0.47 0.17 0.19 0.22 0.3 0.13 0.12 0.15 0.19 0.05 0.02 0.02 0.07 0.08 0.02 0.12 0.04 0.18 0.3 0.22 1.0 0.66 0.55
Cpa|evm.model.tig00021687.21 (tig00021687_g23129.t3)
0.23 0.14 0.21 0.17 0.14 0.15 0.24 0.19 0.16 0.19 0.12 0.14 0.21 0.47 0.48 0.47 0.42 0.4 0.45 0.41 0.38 0.25 0.51 0.32 1.0 0.46
Cpa|evm.model.tig00021717.2 (tig00021717_g23138.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.12 0.19 0.07 0.12 0.15 0.08 0.25 0.23 0.69 1.0 0.35 0.26
Cpa|evm.model.tig00021717.9 (tig00021717_g23145.t1)
0.16 0.2 0.12 0.17 0.21 0.26 0.23 0.27 0.2 0.15 0.2 0.23 0.15 0.15 0.1 0.25 0.14 0.14 0.09 0.18 0.46 0.33 0.71 1.0 0.59 0.24
Cpa|evm.model.tig00021721.25 (tig00021721_g23227.t1)
0.22 0.23 0.09 0.22 0.21 0.2 0.44 0.26 0.31 0.24 0.09 0.32 0.06 0.43 0.41 0.12 0.0 0.33 0.14 0.32 0.39 0.28 0.63 1.0 0.52 0.65
Cpa|evm.model.tig00021745.36 (tig00021745_g23379.t1)
0.03 0.03 0.01 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.28 0.23 0.21 0.26 0.26 0.43 0.14 0.29 1.0 0.69 0.88 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)