Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.39 (tig00000042_g15430.t1)
0.72 0.48 0.67 1.01 1.11 0.52 0.9 0.78 1.1 0.34 0.57 0.91 0.7 0.42 0.07 0.1 0.0 0.98 0.49 0.22 0.64 0.14 1.68 6.32 1.3 2.21
0.64 0.26 0.14 0.09 0.18 0.28 0.76 0.13 0.09 0.68 0.62 0.33 0.21 2.43 0.16 3.94 1.33 2.51 4.16 4.51 7.04 1.39 8.04 15.7 2.92 6.44
Cpa|evm.model.tig00000133.24 (tig00001253_g7804.t1)
0.08 0.38 0.74 1.02 0.97 1.05 1.26 0.86 1.18 1.65 1.77 1.89 0.28 1.25 0.69 0.77 0.75 1.03 0.59 0.67 1.16 1.48 3.33 5.6 1.17 1.6
Cpa|evm.model.tig00000157.129 (tig00000157_g9733.t1)
0.35 0.56 1.81 1.89 3.79 2.7 5.62 4.52 5.87 3.06 5.89 3.17 0.98 3.91 6.0 4.12 5.88 9.9 4.52 7.49 1.87 4.27 26.68 10.37 20.75 9.56
Cpa|evm.model.tig00000157.8 (tig00000157_g9596.t1)
0.0 0.08 0.04 0.09 0.12 0.04 0.05 0.04 0.04 0.08 0.08 0.0 0.0 1.27 1.13 1.49 1.13 1.15 1.65 1.66 1.1 0.21 3.12 1.68 2.48 3.25
Cpa|evm.model.tig00000189.8 (tig00000189_g14310.t1)
0.42 0.19 0.18 0.35 0.31 0.21 0.27 0.46 0.36 0.45 0.81 0.7 0.63 0.73 0.72 1.08 0.26 0.62 0.95 1.09 0.94 0.99 2.01 2.81 1.01 1.17
Cpa|evm.model.tig00000248.33 (tig00000449_g954.t1)
0.17 0.18 0.04 0.22 0.23 0.18 0.15 0.09 0.33 0.55 0.08 0.44 0.17 0.11 0.15 0.09 0.04 0.09 0.04 0.19 1.18 0.3 1.88 3.62 1.61 0.35
Cpa|evm.model.tig00000254.87 (tig00000254_g22544.t1)
0.18 0.41 0.22 0.11 0.11 0.02 0.16 0.35 0.43 0.39 0.66 0.68 0.18 1.24 1.38 1.21 1.35 2.16 3.29 2.37 4.01 0.34 6.36 6.18 1.15 2.82
Cpa|evm.model.tig00000310.47 (tig00000310_g23971.t1)
3.92 1.96 1.29 1.01 0.87 0.49 1.07 1.28 1.64 2.29 2.3 2.62 3.06 1.12 1.29 0.68 1.57 2.12 1.64 1.17 2.7 1.16 2.11 7.21 2.37 2.23
Cpa|evm.model.tig00000310.49 (tig00000310_g23972.t1)
0.81 0.31 0.16 0.16 0.11 0.05 0.1 0.1 0.18 0.23 0.43 0.37 0.4 0.16 0.14 0.07 0.12 0.32 0.51 0.15 0.86 0.22 0.56 1.61 1.01 0.53
Cpa|evm.model.tig00000361.48 (tig00000361_g24397.t1)
0.32 0.22 0.25 0.38 0.33 0.25 0.26 0.24 0.29 0.41 0.45 0.42 0.19 0.71 0.75 0.76 0.56 0.83 0.82 0.64 0.8 0.76 1.5 2.32 1.07 0.82
Cpa|evm.model.tig00000430.50 (tig00000430_g639.t1)
1.21 2.36 4.31 5.55 6.89 5.96 7.35 4.17 4.73 5.14 3.84 5.58 1.0 8.63 6.82 8.07 6.32 6.85 9.33 6.54 2.59 3.34 13.63 11.71 5.93 8.22
Cpa|evm.model.tig00000449.31 (tig00000449_g959.t1)
0.04 0.15 0.16 0.49 0.64 0.89 0.46 0.57 0.59 0.37 0.21 0.28 0.21 0.36 0.12 0.47 0.08 1.18 0.44 0.15 0.91 0.5 2.28 1.88 0.96 0.6
Cpa|evm.model.tig00000480.71 (tig00000480_g1337.t1)
1.3 2.43 2.4 2.27 2.91 10.31 12.66 12.25 14.93 13.25 9.49 8.75 1.25 16.2 21.02 18.23 16.15 27.08 22.29 17.1 5.65 17.37 33.52 8.19 11.01 9.45
Cpa|evm.model.tig00000488.5 (tig00020556_g11006.t1)
0.24 0.0 0.04 0.04 0.08 0.02 0.18 0.05 0.2 0.25 0.25 0.3 0.13 1.09 0.58 1.1 0.33 1.43 1.52 1.47 1.9 0.65 1.69 5.48 1.36 2.56
Cpa|evm.model.tig00000571.11 (tig00000571_g2163.t1)
0.0 0.03 0.0 0.21 0.09 0.05 0.09 0.0 0.0 0.15 0.26 0.09 0.1 0.2 1.23 0.53 0.26 0.95 1.3 0.25 0.58 0.29 2.99 1.43 0.52 0.79
Cpa|evm.model.tig00000615.17 (tig00000615_g2546.t1)
5.02 3.38 2.5 3.52 4.18 3.98 4.51 3.92 3.07 2.99 3.21 4.55 3.76 2.66 4.25 3.43 3.5 5.47 4.16 1.92 0.58 4.38 12.34 11.53 5.3 4.35
Cpa|evm.model.tig00000865.63 (tig00000865_g5113.t1)
0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.07 0.05 0.09 0.11 0.0 0.04 0.05 0.0 0.23 0.18 0.19 0.11 0.4 0.26 0.36 1.33 0.36 2.78 4.94 1.37 0.83
Cpa|evm.model.tig00001056.15 (tig00001056_g6637.t1)
0.28 0.12 0.13 0.16 0.21 0.18 0.08 0.1 0.22 0.27 0.36 0.26 0.2 0.52 1.75 0.65 0.14 0.55 0.4 0.22 1.36 0.99 2.8 2.77 1.29 1.43
Cpa|evm.model.tig00001065.19 (tig00001065_g6720.t1)
18.77 10.77 9.98 9.8 7.93 11.21 10.12 12.35 9.97 11.83 14.61 18.39 14.24 13.02 6.29 11.45 12.05 11.28 10.87 9.91 25.42 19.17 33.22 66.8 34.73 32.39
Cpa|evm.model.tig00001160.5 (tig00001160_g7338.t1)
0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.03 0.01 0.06 0.04 0.03 0.13 0.08 0.0 0.23 0.14 0.57 0.48 0.39 0.26
Cpa|evm.model.tig00001181.3 (tig00001181_g7420.t1)
0.21 0.2 0.18 0.11 0.04 0.02 0.0 0.11 0.04 0.29 0.36 0.21 0.36 0.15 0.08 0.11 0.0 0.11 0.08 0.19 0.24 0.19 0.87 1.22 0.25 0.57
Cpa|evm.model.tig00001231.4 (tig00021357_g20764.t1)
1.18 0.41 0.49 1.27 1.57 2.92 3.76 2.62 2.75 5.12 5.34 4.79 0.82 0.86 0.38 1.94 0.57 0.48 0.69 2.53 2.33 1.31 2.45 8.84 4.57 11.27
Cpa|evm.model.tig00001265.5 (tig00001265_g7891.t1)
0.33 0.19 0.07 0.11 0.3 0.45 0.35 0.23 0.56 0.33 0.11 0.37 0.19 0.95 0.85 0.83 0.69 0.72 1.1 0.8 0.41 0.23 1.96 0.77 1.01 0.73
Cpa|evm.model.tig00001493.13 (tig00001493_g8987.t1)
0.57 0.39 0.09 0.47 0.45 0.68 0.66 0.65 0.87 0.46 0.73 0.84 0.18 0.21 0.18 0.05 0.05 0.45 0.34 0.2 0.86 1.13 3.89 3.55 1.01 1.25
Cpa|evm.model.tig00001729.3 (tig00001729_g9737.t1)
4.89 2.42 2.76 7.92 11.66 19.06 17.09 9.06 7.63 9.46 7.53 4.88 3.66 13.39 10.33 12.12 3.2 2.83 11.24 8.74 16.35 9.2 45.54 61.44 14.22 21.78
Cpa|evm.model.tig00020528.7 (tig00020528_g9982.t1)
0.18 0.39 0.37 0.47 0.34 0.41 0.56 0.7 0.52 0.68 0.6 0.54 0.35 1.23 0.59 1.15 0.75 1.27 0.77 1.06 0.44 1.25 1.5 0.99 0.93 1.47
Cpa|evm.model.tig00020562.41 (tig00020562_g11166.t1)
0.12 0.19 0.2 0.07 0.3 0.18 0.15 0.24 0.8 0.74 0.55 0.68 0.37 1.02 1.63 0.87 1.45 1.95 1.91 0.83 0.59 0.28 3.2 2.56 0.74 1.4
0.36 0.61 0.2 0.09 0.05 0.12 0.05 0.0 0.15 0.4 0.4 0.4 0.03 0.01 0.61 0.0 0.0 0.36 0.02 0.07 0.6 1.73 6.73 7.96 2.15 2.8
Cpa|evm.model.tig00020564.26 (tig00001127_g7159.t1)
0.07 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.02 0.06 0.08 0.19 0.21 0.1 0.14 0.43 0.37 1.27 0.4 1.76 2.0 1.39 0.65
Cpa|evm.model.tig00020675.14 (tig00020675_g12595.t1)
0.17 0.0 0.32 0.28 0.29 0.1 0.69 0.49 1.11 0.66 0.17 0.77 0.0 0.56 2.15 1.99 1.53 1.95 1.83 1.85 0.41 1.32 4.67 3.89 0.13 0.81
Cpa|evm.model.tig00020675.15 (tig00020675_g12596.t1)
1.22 0.43 1.02 0.61 0.73 1.5 2.77 1.07 2.1 2.17 1.66 2.31 0.27 1.19 1.59 1.39 1.37 4.38 5.12 1.55 0.34 3.91 8.09 8.17 3.04 2.03
Cpa|evm.model.tig00020723.99 (tig00000219_g19517.t1)
7.6 3.7 3.19 3.89 4.08 2.88 2.37 2.47 4.44 5.36 8.09 8.52 5.52 2.34 4.13 1.87 3.06 5.06 3.94 3.55 6.37 3.59 10.36 34.3 4.93 6.39
Cpa|evm.model.tig00020734.36 (tig00021318_g20150.t1)
0.5 0.34 1.17 0.93 1.34 0.9 1.8 1.03 1.58 1.6 1.02 1.19 0.56 3.94 1.58 2.35 1.85 2.72 2.85 1.5 1.17 0.0 6.47 4.06 1.76 3.85
0.31 0.23 0.3 0.25 0.16 0.37 0.09 0.28 0.4 0.35 0.62 0.47 0.07 2.08 2.02 2.2 1.92 3.59 1.99 2.28 0.53 3.16 3.62 5.85 3.96 2.19
Cpa|evm.model.tig00020830.44 (tig00020909_g15377.t1)
12.26 5.24 3.77 6.31 9.86 12.47 15.3 18.03 15.72 24.39 22.1 22.24 12.57 30.39 20.24 18.44 17.44 22.33 21.57 19.26 18.64 30.16 37.09 27.55 35.46 31.79
Cpa|evm.model.tig00020849.13 (tig00020849_g14643.t1)
0.16 0.13 0.16 0.33 0.36 0.27 0.43 0.59 0.45 0.6 0.62 0.56 0.1 3.72 4.27 2.47 2.22 2.71 2.84 2.96 3.82 0.58 7.9 9.07 5.15 2.49
Cpa|evm.model.tig00020902.100 (tig00020878_g14865.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.16 0.17 0.0 0.23 0.0 0.0 0.87 0.4 0.16 3.68 0.45 1.96
Cpa|evm.model.tig00020902.103 (tig00020902_g15041.t1)
0.63 0.81 1.1 1.44 0.77 1.25 1.38 1.66 1.63 0.9 1.75 1.72 0.82 1.21 1.27 1.62 0.19 2.25 1.34 0.72 1.22 0.76 9.71 5.1 1.56 2.23
Cpa|evm.model.tig00020902.115 (tig00020902_g15059.t1)
1.72 3.56 3.73 4.43 6.11 5.98 5.87 5.14 4.63 4.81 5.66 5.44 1.31 7.39 6.28 7.88 5.08 11.23 12.15 4.89 4.35 2.52 15.93 17.59 16.64 11.22
Cpa|evm.model.tig00020902.17 (tig00020902_g14961.t1)
0.08 0.05 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.04 0.02 0.04 0.09 0.05 0.15 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.28 0.24 0.55 3.9 0.77 0.75
Cpa|evm.model.tig00020902.18 (tig00020902_g14961.t1)
0.12 0.08 0.07 0.02 0.05 0.03 0.03 0.04 0.02 0.1 0.24 0.14 0.11 0.22 0.0 0.1 0.0 0.01 0.02 0.0 0.27 0.23 0.59 6.54 1.49 0.91
Cpa|evm.model.tig00020909.60 (tig00020909_g15377.t1)
20.72 13.12 9.08 13.82 18.0 15.4 20.65 25.93 26.51 45.84 45.52 48.4 28.95 53.22 50.95 34.2 44.26 43.78 39.88 33.85 33.22 41.38 60.11 90.69 50.39 42.21
Cpa|evm.model.tig00020951.51 (tig00020951_g16454.t1)
0.09 0.02 0.13 0.07 0.22 0.17 0.18 0.42 0.16 0.02 0.08 0.07 0.04 1.27 1.39 1.04 1.87 1.78 1.91 0.57 1.17 0.72 4.17 2.64 3.55 2.36
Cpa|evm.model.tig00020951.52 (tig00021571_g22359.t1)
0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.07 0.15 0.17 0.12 0.13 0.04 0.1 0.69 0.32 0.28 0.23
Cpa|evm.model.tig00020952.8 (tig00020952_g16475.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.22 0.22 0.22 0.43 0.26 0.35 0.11 0.07 0.57 0.55 0.27 0.21
Cpa|evm.model.tig00021036.49 (tig00021036_g17323.t1)
0.11 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.11 0.07 0.1 0.15 0.09 0.06 0.03 0.08 0.0 0.02 0.08 0.04 0.09 0.25 0.05 0.46 1.14 0.35 0.32
Cpa|evm.model.tig00021038.14 (tig00021038_g17501.t1)
0.39 0.97 0.74 0.96 1.66 1.61 2.31 1.79 2.17 1.71 1.54 1.43 0.44 1.38 1.34 1.82 1.39 3.77 1.57 1.41 1.2 1.64 8.5 7.99 3.55 2.66
Cpa|evm.model.tig00021073.29 (tig00021073_g18033.t1)
7.48 6.39 4.53 6.44 6.63 6.28 7.36 5.2 6.26 6.86 8.22 11.72 7.68 4.96 5.92 4.0 3.11 7.9 7.53 3.34 14.85 11.06 14.56 31.12 16.8 11.26
Cpa|evm.model.tig00021108.44 (tig00021108_g18337.t1)
0.02 0.07 0.0 0.04 0.11 0.07 0.05 0.07 0.0 0.04 0.06 0.05 0.02 1.54 0.99 1.01 0.84 0.79 0.82 0.9 1.16 0.81 1.15 1.58 1.17 0.94
Cpa|evm.model.tig00021312.55 (tig00021312_g20089.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.03 0.12 0.11 0.0 0.13 0.04 0.09 0.22 0.03 0.26 0.32 0.1 0.16
Cpa|evm.model.tig00021338.5 (tig00021338_g20369.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.72 0.74 0.42 0.74 0.62 0.51 1.09 0.09 1.72 1.8 0.82 1.07
Cpa|evm.model.tig00021339.22 (tig00021339_g20400.t1)
11.03 10.27 8.35 11.44 12.13 11.61 10.82 10.7 11.33 10.72 10.32 12.03 7.53 10.23 9.26 9.15 8.35 10.31 11.06 7.58 3.44 13.27 22.93 19.0 9.57 7.16
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.3 0.0 0.17 0.0 0.0 0.2 0.43 0.17 0.52 0.32 0.24 0.53 1.53 0.16 1.63 1.02 1.62 0.86
Cpa|evm.model.tig00021365.17 (tig00021365_g20830.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.15 0.18 0.13 1.39 0.07 0.62
Cpa|evm.model.tig00021441.5 (tig00000754_g3908.t1)
0.31 1.06 0.67 1.24 0.94 0.81 1.62 0.83 1.21 1.05 1.15 0.77 0.48 0.38 0.26 0.21 0.42 0.55 0.54 0.32 2.63 0.32 4.5 4.97 1.68 2.07
Cpa|evm.model.tig00021463.15 (tig00020848_g14616.t1)
1.57 2.03 2.5 2.04 2.9 2.29 3.53 2.85 1.44 2.67 2.26 1.82 1.54 3.31 4.4 3.91 3.13 5.03 4.99 5.97 1.81 2.09 8.81 1.78 4.43 1.75
Cpa|evm.model.tig00021501.14 (tig00021501_g21955.t1)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.1 0.15 0.07 0.15 0.25 0.09 0.24 0.12 0.49 0.4 0.3 0.23
Cpa|evm.model.tig00021504.7 (tig00021504_g21971.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.04 0.03 0.17 0.06 0.03 0.11 0.02 0.37 0.21 0.22 0.17
Cpa|evm.model.tig00021571.1 (tig00021571_g22354.t1)
0.02 0.0 0.02 0.05 0.05 0.03 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.05 0.06 0.1 0.2 0.15 0.17 0.15 0.18 0.2 0.08 0.07 0.43 0.68 0.28 0.24
Cpa|evm.model.tig00021571.8 (tig00021571_g22359.t1)
0.06 0.03 0.07 0.07 0.07 0.1 0.15 0.08 0.04 0.14 0.11 0.14 0.04 0.37 0.4 0.3 0.31 0.32 0.46 0.5 0.41 0.17 0.63 1.11 0.52 0.67
Cpa|evm.model.tig00021621.6 (tig00021621_g22962.t1)
0.23 0.22 0.37 0.89 0.32 0.35 0.42 0.57 0.25 0.23 0.28 0.35 0.1 0.04 0.04 0.13 0.14 0.04 0.22 0.08 0.33 0.56 0.42 1.89 1.25 1.04
Cpa|evm.model.tig00021687.21 (tig00021687_g23129.t3)
0.62 0.37 0.55 0.45 0.39 0.39 0.64 0.52 0.44 0.51 0.32 0.37 0.56 1.25 1.27 1.24 1.12 1.07 1.21 1.08 1.0 0.66 1.35 0.84 2.66 1.23
Cpa|evm.model.tig00021717.2 (tig00021717_g23138.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.16 0.26 0.09 0.17 0.2 0.11 0.34 0.3 0.92 1.34 0.47 0.35
Cpa|evm.model.tig00021717.9 (tig00021717_g23145.t1)
2.74 3.35 1.96 2.84 3.5 4.33 3.89 4.49 3.42 2.5 3.38 3.92 2.5 2.57 1.76 4.21 2.43 2.37 1.52 3.11 7.79 5.5 11.89 16.87 9.88 4.05
Cpa|evm.model.tig00021721.25 (tig00021721_g23227.t1)
0.11 0.11 0.05 0.11 0.11 0.1 0.22 0.13 0.16 0.12 0.04 0.16 0.03 0.22 0.21 0.06 0.0 0.17 0.07 0.16 0.2 0.14 0.32 0.51 0.27 0.33
Cpa|evm.model.tig00021745.36 (tig00021745_g23379.t1)
0.11 0.12 0.02 0.18 0.0 0.05 0.05 0.0 0.02 0.02 0.02 0.12 0.0 0.63 1.21 0.99 0.9 1.09 1.09 1.83 0.61 1.25 4.26 2.95 3.72 1.57

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)