Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_2581 (2581)	-	-	0.34	1.03	-	0.81	-0.34	-	-	1.88	0.54
Transcript_contig_29779 (29779)	-1.05	-	-	0.51	1.37	-0.06	-0.26	-	-	1.46	0.98
Transcript_contig_4584 (4584)	0.18	0.36	-0.3	0.46	-0.08	-0.36	0.53	-0.72	-0.81	0.23	-0.19
Transcript_contig_4941 (4941)	-0.91	-0.7	-0.03	0.87	1.04	0.24	-0.56	-0.76	-3.73	0.55	0.02
Transcript_contig_53838 (53838)	0.32	0.35	-0.04	0.38	0.49	-0.18	0.65	-0.05	-1.84	-0.66	-1.1
Transcript_contig_53989 (53989)	0.21	0.66	-1.22	-0.74	-0.79	0.1	-0.27	0.25	0.43	0.55	-0.39
Transcript_contig_54230 (54230)	0.35	0.35	-0.3	0.27	0.12	0.21	1.14	-0.08	-4.61	-0.79	-1.22
Transcript_contig_54332 (54332)	-1.87	-3.02	-0.1	0.75	1.29	0.36	-0.11	-2.75	-2.4	0.74	0.39
Transcript_contig_54575 (54575)	0.11	0.23	-0.05	0.83	-0.12	0.01	0.72	-1.69	-5.06	0.49	-0.53
Transcript_contig_54750 (54750)	0.51	0.37	-0.48	-0.75	-0.82	0.37	0.48	-0.43	-0.33	0.4	-0.21
Transcript_contig_55064 (55064)	-0.74	-0.69	-1.48	0.6	1.12	0.12	-0.18	-0.97	-1.76	0.78	0.32
Transcript_contig_55120 (55120)	-1.49	-2.3	-0.7	0.94	1.74	0.03	-0.17	-2.65	-3.18	0.54	-0.1
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Transcript_contig_55440 (55440)	-2.18	-3.49	-0.47	0.74	1.22	0.51	-0.62	-3.73	-1.69	1.06	0.5
Transcript_contig_55477 (55477)	-1.02	-0.74	-0.09	0.99	1.42	-0.65	-0.18	-1.09	-4.12	0.46	-0.19
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Transcript_contig_55857 (55857)	-0.35	-0.31	0.76	0.18	0.17	-0.2	-0.14	-0.69	-0.92	0.65	-0.06
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Transcript_contig_58008 (58008)	-2.42	-3.15	-2.49	0.62	1.3	0.48	-1.53	-3.66	-0.79	1.39	0.59
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.