Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_2581 (2581)	0.0	0.0	0.34	0.55	0.0	0.48	0.21	0.0	0.0	1.0	0.39
Transcript_contig_29779 (29779)	0.18	0.0	0.0	0.52	0.94	0.35	0.3	0.0	0.0	1.0	0.72
Transcript_contig_4584 (4584)	0.78	0.88	0.56	0.95	0.65	0.54	1.0	0.42	0.39	0.81	0.61
Transcript_contig_4941 (4941)	0.26	0.3	0.48	0.89	1.0	0.57	0.33	0.29	0.04	0.71	0.49
Transcript_contig_53838 (53838)	0.8	0.81	0.62	0.83	0.89	0.56	1.0	0.62	0.18	0.4	0.3
Transcript_contig_53989 (53989)	0.73	1.0	0.27	0.38	0.37	0.68	0.52	0.75	0.85	0.93	0.48
Transcript_contig_54230 (54230)	0.58	0.58	0.37	0.55	0.5	0.53	1.0	0.43	0.02	0.26	0.19
Transcript_contig_54332 (54332)	0.11	0.05	0.38	0.69	1.0	0.53	0.38	0.06	0.08	0.68	0.54
Transcript_contig_54575 (54575)	0.61	0.66	0.54	1.0	0.52	0.57	0.93	0.18	0.02	0.79	0.39
Transcript_contig_54750 (54750)	1.0	0.91	0.5	0.42	0.4	0.9	0.98	0.52	0.56	0.92	0.61
Transcript_contig_55064 (55064)	0.27	0.29	0.17	0.7	1.0	0.5	0.41	0.23	0.14	0.79	0.57
Transcript_contig_55120 (55120)	0.11	0.06	0.18	0.57	1.0	0.31	0.27	0.05	0.03	0.44	0.28
Transcript_contig_55409 (55409)	0.45	0.36	0.23	0.3	0.3	0.28	0.18	0.1	0.05	1.0	0.64
Transcript_contig_55440 (55440)	0.09	0.04	0.31	0.72	1.0	0.61	0.28	0.03	0.13	0.89	0.61
Transcript_contig_55477 (55477)	0.18	0.22	0.35	0.74	1.0	0.24	0.33	0.18	0.02	0.51	0.33
Transcript_contig_55811 (55811)	0.46	0.47	0.72	0.76	1.0	0.61	0.62	0.32	0.42	0.97	0.67
Transcript_contig_55857 (55857)	0.46	0.47	1.0	0.67	0.66	0.51	0.53	0.36	0.31	0.93	0.56
Transcript_contig_56007 (56007)	0.92	0.89	0.32	0.7	0.8	0.96	1.0	0.48	0.45	1.0	0.6
Transcript_contig_56846 (56846)	0.42	0.26	0.97	0.52	0.41	0.28	0.25	0.3	0.48	1.0	0.85
Transcript_contig_57044 (57044)	0.64	0.82	0.64	0.78	0.97	0.58	0.57	0.62	0.47	1.0	0.66
Transcript_contig_57155 (57155)	0.21	0.16	0.33	0.69	1.0	0.56	0.53	0.08	0.11	0.99	0.55
Transcript_contig_57353 (57353)	0.18	0.1	0.87	0.78	0.55	0.39	0.39	0.03	0.76	1.0	0.58
Transcript_contig_57447 (57447)	0.16	0.16	0.17	0.51	1.0	0.45	0.23	0.18	0.02	0.73	0.5
Transcript_contig_57522 (57522)	0.21	0.27	0.07	0.7	1.0	0.38	0.23	0.27	0.06	0.83	0.49
Transcript_contig_57614 (57614)	0.12	0.11	0.22	0.55	1.0	0.41	0.25	0.12	0.09	0.54	0.35
Transcript_contig_57622 (57622)	0.04	0.02	0.22	0.2	0.45	0.25	0.08	0.02	0.02	1.0	0.62
Transcript_contig_57726 (57726)	0.1	0.01	0.26	0.35	0.37	0.15	0.2	0.0	0.38	1.0	0.67
Transcript_contig_58008 (58008)	0.07	0.04	0.07	0.59	0.94	0.53	0.13	0.03	0.22	1.0	0.57
Transcript_contig_58203 (58203)	0.26	0.25	0.19	0.72	1.0	0.34	0.42	0.28	0.05	0.29	0.2
Transcript_contig_58205 (58205)	0.63	0.77	0.62	0.87	0.78	0.81	1.0	0.68	0.35	0.98	0.75
Transcript_contig_58355 (58355)	0.87	1.0	0.62	0.57	0.66	0.49	0.61	0.76	0.07	0.54	0.34
Transcript_contig_58582 (58582)	0.5	0.3	0.69	0.95	0.66	0.51	1.0	0.16	0.04	0.75	0.28
Transcript_contig_59259 (59259)	0.64	0.78	0.55	0.66	1.0	0.3	0.46	0.88	0.25	0.62	0.46
Transcript_contig_59471 (59471)	0.29	0.22	0.92	0.68	0.36	0.36	0.46	0.07	0.11	1.0	0.5
Transcript_contig_60417 (60417)	0.4	0.47	0.56	0.9	1.0	0.59	0.96	0.24	0.04	0.73	0.39
Transcript_contig_61509 (61509)	0.1	0.13	0.16	0.54	1.0	0.33	0.14	0.06	0.01	0.57	0.44
Transcript_contig_61602 (61602)	0.08	0.04	0.34	0.55	0.69	0.24	0.31	0.0	0.33	1.0	0.52
Transcript_contig_61634 (61634)	0.65	0.64	0.48	0.51	0.69	0.65	0.41	0.23	0.62	1.0	0.59
Transcript_contig_62331 (62331)	0.09	0.05	0.21	0.62	1.0	0.55	0.25	0.02	0.27	0.8	0.58
Transcript_contig_66361 (66361)	0.08	0.11	0.18	0.41	0.55	0.48	0.22	0.08	0.01	1.0	0.64
Transcript_contig_67478 (67478)	0.64	0.69	0.57	0.76	0.6	0.81	1.0	0.37	0.28	0.88	0.54
Transcript_contig_78241 (78241)	0.88	0.94	0.87	0.66	0.47	0.57	0.7	0.75	1.0	0.83	0.54
Transcript_contig_78297 (78297)	0.47	0.44	0.61	0.64	0.5	0.9	1.0	0.36	0.37	0.73	0.52
Transcript_contig_78298 (78298)	0.34	0.33	0.69	0.9	1.0	0.3	0.58	0.12	0.11	0.87	0.62
Transcript_contig_78377 (78377)	0.59	0.45	1.0	0.66	0.48	0.42	0.34	0.31	0.5	0.92	0.74
Transcript_contig_78604 (78604)	0.84	0.98	0.67	0.77	0.52	0.73	1.0	0.46	0.31	0.85	0.45
Transcript_contig_78691 (78691)	0.72	1.0	0.34	0.32	0.24	0.8	0.39	0.94	0.11	0.78	0.5
Transcript_contig_78916 (78916)	0.6	0.67	0.79	0.85	1.0	0.32	0.6	0.91	0.69	0.54	0.46
Transcript_contig_78939 (78939)	0.79	0.92	0.57	0.77	0.66	0.58	0.86	0.58	0.4	1.0	0.5
Transcript_contig_79302 (79302)	0.51	0.55	0.37	0.48	0.92	0.46	0.34	0.23	0.23	1.0	0.66
Transcript_contig_79583 (79583)	0.75	0.84	0.61	0.76	0.68	0.62	1.0	0.51	0.01	0.45	0.23
Transcript_contig_79926 (79926)	0.56	0.68	0.65	0.76	0.98	0.85	0.93	0.83	0.05	1.0	0.61
Transcript_contig_883 (883)	0.09	0.08	0.24	0.63	1.0	0.34	0.19	0.07	0.08	0.47	0.3
Transcript_contig_89276 (89276)	0.7	1.0	0.35	0.52	0.7	0.66	0.71	0.98	0.32	0.69	0.39
Transcript_contig_89310 (89310)	0.08	0.05	0.31	0.8	1.0	0.29	0.2	0.06	0.05	0.87	0.51
Transcript_contig_89380 (89380)	0.41	0.44	0.44	0.82	1.0	0.45	0.8	0.47	0.54	0.74	0.52
Transcript_contig_89570 (89570)	0.84	0.45	0.81	1.0	0.7	0.47	0.97	0.34	0.69	0.94	0.69
Transcript_contig_89689 (89689)	0.21	0.18	0.41	0.66	1.0	0.28	0.47	0.17	0.34	0.36	0.28
Transcript_contig_89814 (89814)	0.64	0.74	0.76	1.0	0.56	0.53	0.83	0.65	0.62	0.26	0.49
Transcript_contig_89879 (89879)	0.42	0.4	0.22	0.69	0.91	0.53	0.56	0.22	0.23	1.0	0.62
Transcript_contig_89926 (89926)	0.07	0.06	0.28	0.65	1.0	0.56	0.2	0.03	0.06	0.69	0.43
Transcript_contig_91020 (91020)	0.05	0.2	0.08	0.42	1.0	0.62	0.56	0.0	0.0	1.0	0.85

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)