Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1285 (1285)	0.36	0.85	-1.49	-0.49	0.33	0.18	-0.11	0.76	-5.12	0.16	-0.55
Transcript_contig_14226 (14226)	0.05	0.75	-1.55	-0.14	1.04	-0.29	-1.15	0.68	-	0.37	-0.3
Transcript_contig_3336 (3336)	0.13	0.58	-0.12	0.14	0.27	-0.24	0.18	0.31	-2.85	-0.01	-0.27
Transcript_contig_384 (384)	0.44	0.56	-1.19	-0.07	0.22	-0.34	0.06	0.73	-1.17	0.02	-0.59
Transcript_contig_53726 (53726)	0.36	0.7	-0.77	-0.41	0.02	-0.53	-0.35	0.89	0.21	-0.71	-0.62
Transcript_contig_53791 (53791)	0.38	0.69	-0.59	0.14	0.34	-0.25	0.27	0.13	-2.13	0.18	-0.86
Transcript_contig_54122 (54122)	0.38	0.74	-0.61	-0.3	-0.53	-0.38	-0.38	0.44	0.1	0.18	-0.39
Transcript_contig_54154 (54154)	0.44	0.66	-1.68	-0.45	-0.07	-0.26	-0.11	0.15	-0.34	0.55	-0.1
Transcript_contig_54264 (54264)	0.56	0.87	-0.18	-0.57	-1.02	-1.24	-0.25	0.57	-0.77	0.62	-0.35
Transcript_contig_54293 (54293)	0.43	0.89	-1.02	-0.63	-0.18	-0.43	-0.1	0.69	-0.69	0.24	-0.55
Transcript_contig_54309 (54309)	0.43	0.92	-1.32	-0.75	-0.48	-0.41	-0.16	0.58	-1.28	0.62	-0.05
Transcript_contig_54419 (54419)	0.56	0.79	-1.66	-0.63	0.12	-0.32	-0.37	0.31	-1.46	0.66	0.0
Transcript_contig_54500 (54500)	-0.09	0.55	-0.63	-0.17	0.51	-1.2	-0.56	0.9	-0.84	0.28	-0.16
Transcript_contig_54624 (54624)	0.46	0.68	-0.26	-0.29	-0.49	-0.13	-0.52	0.24	-0.41	0.28	-0.15
Transcript_contig_54657 (54657)	0.49	0.76	-0.75	-0.2	-0.22	-0.36	0.2	-0.18	-0.51	0.45	-0.54
Transcript_contig_54664 (54664)	0.45	0.77	-0.71	-0.7	-0.28	-0.9	-0.13	0.91	0.12	-0.25	-0.69
Transcript_contig_54718 (54718)	0.31	0.64	-0.05	-0.11	-0.37	-0.06	-0.22	0.49	-1.19	0.1	-0.3
Transcript_contig_54912 (54912)	0.27	0.63	-0.88	-0.57	0.09	-1.03	-0.56	0.75	-0.11	0.41	-0.22
Transcript_contig_55070 (55070)	0.35	0.74	-1.49	-0.27	0.38	-0.8	-0.03	0.61	-0.7	0.18	-0.45
Transcript_contig_55079 (55079)	0.33	0.69	-0.54	-0.45	-0.36	0.14	0.14	0.67	-0.76	-0.45	-0.3
Transcript_contig_55103 (55103)	0.46	0.84	-0.57	-0.43	-0.55	-0.66	-0.26	0.78	0.11	-0.3	-0.59
Transcript_contig_55292 (55292)	0.23	0.54	-0.47	-0.54	-0.42	-0.85	-0.35	1.03	-0.11	0.21	-0.41
Transcript_contig_55411 (55411)	0.4	0.81	-0.54	-0.05	0.29	-0.03	0.23	0.52	-1.48	-0.33	-1.69
Transcript_contig_55481 (55481)	0.3	0.74	-1.04	-0.54	0.66	-0.97	-0.29	0.49	-0.57	0.39	-0.67
Transcript_contig_55516 (55516)	0.22	0.58	-1.01	-0.84	-0.76	-0.74	-0.64	1.14	-0.49	0.58	0.05
Transcript_contig_55972 (55972)	0.2	0.79	-0.57	-0.1	0.19	0.05	0.04	0.67	-3.66	0.03	-0.67
Transcript_contig_55991 (55991)	0.29	0.63	-0.53	-0.56	-0.29	-0.36	-0.15	0.55	0.2	-0.02	-0.39
Transcript_contig_55996 (55996)	0.63	1.09	-0.98	-0.71	-0.53	-1.16	-0.62	0.74	0.22	-0.1	-0.64
Transcript_contig_56053 (56053)	0.16	0.67	-0.54	-0.1	-0.17	-0.3	-0.04	1.02	-1.18	-0.04	-0.84
Transcript_contig_56162 (56162)	0.26	0.56	-1.25	-0.25	0.0	-0.61	-0.12	0.61	0.24	0.01	-0.38
Transcript_contig_56348 (56348)	0.51	0.63	-1.4	-0.57	-0.05	-0.17	-0.05	0.5	-0.26	0.27	-0.48
Transcript_contig_56461 (56461)	0.27	0.82	-0.32	0.01	0.02	-0.65	-0.05	0.74	-0.86	-0.28	-0.84
Transcript_contig_56503 (56503)	0.34	0.73	-1.68	-0.47	0.19	-0.15	-0.09	0.65	-1.44	0.46	-0.43
Transcript_contig_56540 (56540)	0.58	0.88	-0.78	-0.53	-0.81	-0.66	-0.25	0.54	0.6	-0.38	-0.73
Transcript_contig_56542 (56542)	0.71	0.98	-0.55	-1.08	-1.14	-0.95	-0.39	0.99	0.33	-0.55	-0.79
Transcript_contig_56594 (56594)	0.49	0.98	-0.64	-0.16	-0.29	-0.12	-0.03	0.48	-1.85	-0.02	-0.49
Transcript_contig_56854 (56854)	0.32	0.7	-0.54	0.43	0.28	0.07	0.24	0.07	-2.57	-0.18	-0.86
Transcript_contig_56941 (56941)	0.24	0.98	-0.47	0.05	0.04	-0.76	-0.35	1.29	-4.48	-0.32	-1.36
Transcript_contig_57324 (57324)	0.39	0.71	-0.47	0.26	0.21	-0.33	-0.2	0.14	-0.22	-0.35	-0.81
Transcript_contig_57329 (57329)	0.38	0.55	-0.5	-0.07	-0.13	-0.19	0.3	-0.09	-0.82	0.35	-0.38
Transcript_contig_57395 (57395)	0.29	0.64	-0.89	-0.29	0.36	-0.53	-0.08	0.26	-0.1	0.05	-0.39
Transcript_contig_57465 (57465)	0.35	0.77	-1.82	-0.05	0.7	-0.33	-0.39	0.94	-2.87	-0.14	-0.7
Transcript_contig_57594 (57594)	-0.51	0.53	-0.66	0.47	1.02	-0.59	-0.93	1.32	-3.87	-0.51	-1.52
Transcript_contig_57604 (57604)	0.4	0.7	-0.15	-0.15	0.08	-0.3	-0.25	0.11	-1.27	0.37	-0.42
Transcript_contig_57850 (57850)	0.4	0.8	-1.04	-0.27	0.05	-1.42	-0.69	0.87	-0.04	0.1	-0.47
Transcript_contig_58238 (58238)	0.07	0.66	-0.91	-0.25	-0.0	0.24	0.15	0.99	-1.73	-0.33	-0.66
Transcript_contig_58270 (58270)	0.84	1.13	-1.29	-0.93	-0.72	-1.77	-0.79	0.88	0.37	-0.31	-0.57
Transcript_contig_58287 (58287)	0.32	0.74	0.03	-0.01	-0.03	-0.04	0.38	0.45	-2.56	-0.58	-0.71
Transcript_contig_5836 (5836)	0.45	1.09	-1.33	-1.2	0.39	-0.72	-0.92	1.29	-	-0.06	-0.27
Transcript_contig_58453 (58453)	0.49	0.89	-0.84	-0.61	-0.28	-0.23	-0.12	0.48	-0.67	0.16	-0.33
Transcript_contig_58515 (58515)	0.12	0.61	-1.09	0.16	0.45	-0.04	-0.24	0.88	-1.94	-0.07	-0.84
Transcript_contig_58560 (58560)	0.3	0.5	-0.75	-0.07	0.33	0.15	0.25	0.35	-1.03	-0.29	-0.59
Transcript_contig_58643 (58643)	-0.13	0.39	-0.95	-0.8	-0.41	-0.76	-0.25	0.78	0.61	0.5	-0.24
Transcript_contig_58646 (58646)	0.39	0.57	-1.11	-0.54	-0.02	-0.46	-0.07	0.65	-0.21	0.15	-0.24
Transcript_contig_58674 (58674)	0.38	0.79	-1.03	-0.27	-0.07	-0.35	-0.82	1.01	-2.0	0.21	-0.12
Transcript_contig_58681 (58681)	0.29	0.7	-0.4	-0.17	-0.08	-0.49	-0.63	0.79	-0.46	-0.08	-0.32
Transcript_contig_58726 (58726)	0.71	1.02	-0.4	-0.46	-0.65	-1.35	-0.62	0.66	-0.02	-0.3	-0.33
Transcript_contig_58755 (58755)	0.18	0.47	-0.78	-0.38	0.18	-0.67	-0.16	0.67	-0.26	0.32	-0.32
Transcript_contig_58988 (58988)	0.16	0.78	-1.0	-0.73	-0.15	0.06	-0.86	1.23	-3.25	0.29	-0.18
Transcript_contig_59003 (59003)	0.55	0.96	-1.19	0.06	0.68	-0.94	-0.68	0.41	-0.87	-0.16	-0.77
Transcript_contig_59134 (59134)	0.4	0.99	-1.27	-0.69	0.44	-1.25	-1.35	1.29	-1.05	-0.05	-0.74
Transcript_contig_59167 (59167)	1.0	1.25	-1.99	-1.26	-0.48	-1.74	-1.59	1.16	-1.35	0.19	-0.28
Transcript_contig_59325 (59325)	0.35	0.67	-1.38	-0.87	-0.58	-0.7	-0.04	0.99	0.74	-0.65	-0.62
Transcript_contig_59335 (59335)	0.89	1.12	-1.78	-1.11	-0.94	-2.12	-0.91	1.13	-0.19	0.08	-0.3
Transcript_contig_59372 (59372)	0.33	0.87	-2.09	-0.47	0.21	0.3	-0.04	0.72	-2.15	-0.04	-0.42
Transcript_contig_59496 (59496)	0.53	0.93	-1.85	-0.71	-0.22	-0.98	-0.94	1.07	-0.35	0.07	-0.08
Transcript_contig_59504 (59504)	0.19	0.7	-0.54	-0.37	0.16	-0.42	-0.27	0.99	-1.39	-0.03	-0.43
Transcript_contig_59651 (59651)	0.66	1.02	-0.77	-0.34	0.16	-1.31	-0.57	0.89	-0.85	-0.26	-0.81
Transcript_contig_59704 (59704)	0.27	0.6	-1.07	-0.18	0.16	0.19	0.25	0.29	-0.07	-0.3	-1.06
Transcript_contig_59794 (59794)	0.53	0.94	0.09	-0.3	-0.42	-0.1	0.52	0.52	-1.54	-1.03	-1.36
Transcript_contig_59822 (59822)	0.64	1.02	-0.37	-0.38	-0.37	-1.13	-0.41	1.13	-0.95	-0.85	-0.66
Transcript_contig_59940 (59940)	0.53	0.53	-0.56	-0.4	0.74	-0.42	-0.21	0.23	-1.68	0.24	-0.45
Transcript_contig_60311 (60311)	0.15	0.72	0.2	-0.41	0.43	-1.82	-0.3	0.91	-1.83	0.0	-0.44
Transcript_contig_60550 (60550)	0.83	1.17	-0.92	-1.48	-0.76	-1.19	-1.13	1.17	-0.79	-0.16	-0.19
Transcript_contig_61412 (61412)	0.4	0.78	-1.07	-0.99	-0.91	-1.71	-0.42	0.52	0.61	0.71	-0.33
Transcript_contig_61446 (61446)	0.45	0.86	-1.11	-0.61	-0.4	-0.4	-0.77	0.72	-0.5	0.53	-0.31
Transcript_contig_61971 (61971)	0.3	0.63	-0.53	-0.54	-0.09	-0.42	-0.05	1.04	-1.41	0.05	-0.49
Transcript_contig_620 (620)	0.57	0.72	-1.27	-1.38	-0.7	-1.01	0.19	0.9	0.2	0.11	-0.45
Transcript_contig_62031 (62031)	0.27	0.7	-1.06	-0.24	-0.02	-0.05	-0.08	0.62	-1.94	0.38	-0.24
Transcript_contig_62370 (62370)	0.27	0.86	-0.04	0.04	-0.48	-0.11	0.03	0.51	-2.56	0.1	-0.63
Transcript_contig_62767 (62767)	0.6	0.85	-1.5	-1.85	-1.0	-1.53	-1.02	1.43	-2.39	0.59	0.39
Transcript_contig_63184 (63184)	0.51	0.9	-0.72	-0.48	-0.17	-0.36	-0.36	0.26	-0.55	0.29	-0.26
Transcript_contig_67585 (67585)	0.42	0.69	-0.93	-0.41	-0.1	0.25	0.18	0.32	-2.09	0.42	-0.51
Transcript_contig_67658 (67658)	0.74	1.14	-1.15	-1.38	-0.07	-1.71	-0.24	1.31	-4.88	0.06	-0.66
Transcript_contig_68696 (68696)	0.39	1.03	-0.66	0.12	0.01	-1.28	-0.37	1.35	-	-0.46	-1.13
Transcript_contig_69028 (69028)	0.32	0.69	-0.71	-0.63	-0.26	-0.26	-0.02	0.69	0.02	0.04	-0.82
Transcript_contig_69341 (69341)	0.57	0.79	-1.71	-0.54	-0.1	-0.62	-0.15	0.76	-0.69	0.32	-0.4
Transcript_contig_704 (704)	0.33	0.52	-1.05	-0.59	-0.04	-0.93	-0.12	1.02	-1.26	0.61	-0.38
Transcript_contig_70870 (70870)	0.27	0.53	-1.69	-0.46	-0.11	-1.59	-0.3	0.64	0.69	0.36	-0.34
Transcript_contig_749 (749)	0.44	0.94	-1.14	-0.97	0.05	-1.29	-0.78	0.91	-3.17	0.57	0.32
Transcript_contig_78157 (78157)	0.4	0.52	-0.99	-0.49	-0.25	-0.08	0.05	0.31	0.32	0.04	-0.51
Transcript_contig_78389 (78389)	0.52	0.99	-1.38	-0.17	0.96	-0.52	-0.36	0.71	-3.23	-0.5	-1.17
Transcript_contig_78501 (78501)	0.3	0.59	-1.15	0.12	0.31	-0.61	-0.18	0.48	-0.79	0.17	-0.23
Transcript_contig_78887 (78887)	0.5	0.88	-0.87	-0.41	-0.2	0.41	0.61	0.32	-3.41	-0.18	-0.98
Transcript_contig_78978 (78978)	0.5	0.73	-0.86	-0.51	-0.5	0.29	0.2	0.66	-0.88	-0.01	-1.03
Transcript_contig_79163 (79163)	-0.05	0.6	-0.53	-0.1	0.49	-0.58	-0.6	1.26	-3.45	0.02	-0.58
Transcript_contig_79204 (79204)	0.57	1.01	-0.79	-0.83	-0.89	-0.24	-0.4	1.15	-2.09	-0.22	-0.13
Transcript_contig_79511 (79511)	0.55	1.16	-1.01	-1.13	-1.39	-0.84	-0.59	0.98	-2.31	0.62	0.03
Transcript_contig_80080 (80080)	0.26	0.93	-2.02	-1.39	-1.1	-0.83	-1.27	1.58	-1.39	0.34	0.24
Transcript_contig_80141 (80141)	0.49	0.87	-0.47	-0.1	0.26	-1.33	-0.86	0.77	-3.1	0.29	-0.11
Transcript_contig_81950 (81950)	0.76	1.14	-2.13	-1.09	-0.96	-1.15	-1.37	1.12	-0.56	0.5	-0.35
Transcript_contig_81964 (81964)	0.42	0.89	-0.51	-1.03	-0.01	-1.48	-0.49	1.53	-1.72	-0.62	-0.49
Transcript_contig_82245 (82245)	0.67	0.9	-1.45	-0.29	-0.42	0.22	0.62	0.2	-4.65	0.16	-0.74
Transcript_contig_82812 (82812)	0.41	0.57	-0.98	-0.67	0.21	-0.14	-0.04	1.17	-1.13	-0.26	-1.12
Transcript_contig_83456 (83456)	0.0	0.51	-1.03	0.97	1.14	-1.68	-0.64	1.21	-	-0.9	-2.91
Transcript_contig_89129 (89129)	0.31	0.66	-1.23	-0.67	0.12	-0.51	-0.78	0.9	-0.28	0.28	-0.25
Transcript_contig_89240 (89240)	0.37	0.68	-0.08	-0.01	-0.3	0.25	0.13	0.71	-2.28	-0.48	-0.94
Transcript_contig_89712 (89712)	0.35	0.44	-0.75	-0.03	0.66	-0.21	0.09	0.26	-0.62	-0.25	-0.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.