Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1285 (1285)	0.71	1.0	0.2	0.39	0.69	0.63	0.51	0.94	0.02	0.62	0.38
Transcript_contig_14226 (14226)	0.5	0.82	0.17	0.44	1.0	0.4	0.22	0.78	0.0	0.63	0.4
Transcript_contig_3336 (3336)	0.73	1.0	0.62	0.74	0.81	0.57	0.76	0.83	0.09	0.66	0.55
Transcript_contig_384 (384)	0.82	0.89	0.26	0.57	0.7	0.48	0.63	1.0	0.27	0.61	0.4
Transcript_contig_53726 (53726)	0.69	0.88	0.32	0.41	0.55	0.37	0.43	1.0	0.63	0.33	0.35
Transcript_contig_53791 (53791)	0.81	1.0	0.41	0.69	0.79	0.52	0.75	0.68	0.14	0.7	0.34
Transcript_contig_54122 (54122)	0.78	1.0	0.39	0.49	0.41	0.46	0.46	0.81	0.64	0.67	0.46
Transcript_contig_54154 (54154)	0.86	1.0	0.2	0.46	0.6	0.53	0.59	0.7	0.5	0.93	0.59
Transcript_contig_54264 (54264)	0.81	1.0	0.48	0.37	0.27	0.23	0.46	0.81	0.32	0.84	0.43
Transcript_contig_54293 (54293)	0.73	1.0	0.27	0.35	0.48	0.4	0.5	0.87	0.34	0.64	0.37
Transcript_contig_54309 (54309)	0.71	1.0	0.21	0.31	0.38	0.4	0.47	0.79	0.22	0.81	0.51
Transcript_contig_54419 (54419)	0.85	1.0	0.18	0.38	0.63	0.46	0.45	0.72	0.21	0.91	0.58
Transcript_contig_54500 (54500)	0.5	0.78	0.35	0.48	0.77	0.23	0.36	1.0	0.3	0.65	0.48
Transcript_contig_54624 (54624)	0.86	1.0	0.52	0.51	0.45	0.57	0.44	0.74	0.47	0.76	0.56
Transcript_contig_54657 (54657)	0.83	1.0	0.35	0.51	0.51	0.46	0.68	0.52	0.41	0.81	0.41
Transcript_contig_54664 (54664)	0.73	0.91	0.33	0.33	0.44	0.29	0.49	1.0	0.58	0.45	0.33
Transcript_contig_54718 (54718)	0.79	1.0	0.62	0.59	0.5	0.61	0.55	0.9	0.28	0.69	0.52
Transcript_contig_54912 (54912)	0.71	0.92	0.32	0.4	0.63	0.29	0.4	1.0	0.55	0.79	0.51
Transcript_contig_55070 (55070)	0.77	1.0	0.21	0.5	0.78	0.35	0.59	0.92	0.37	0.68	0.44
Transcript_contig_55079 (55079)	0.78	1.0	0.43	0.45	0.48	0.69	0.68	0.99	0.37	0.46	0.5
Transcript_contig_55103 (55103)	0.77	1.0	0.38	0.41	0.38	0.35	0.47	0.96	0.6	0.45	0.37
Transcript_contig_55292 (55292)	0.57	0.71	0.35	0.34	0.37	0.27	0.38	1.0	0.45	0.57	0.37
Transcript_contig_55411 (55411)	0.75	1.0	0.39	0.55	0.7	0.56	0.67	0.82	0.2	0.45	0.18
Transcript_contig_55481 (55481)	0.74	1.0	0.29	0.41	0.95	0.31	0.49	0.84	0.4	0.78	0.38
Transcript_contig_55516 (55516)	0.53	0.68	0.22	0.25	0.27	0.27	0.29	1.0	0.32	0.68	0.47
Transcript_contig_55972 (55972)	0.66	1.0	0.39	0.54	0.66	0.6	0.59	0.92	0.05	0.59	0.36
Transcript_contig_55991 (55991)	0.79	1.0	0.45	0.44	0.53	0.5	0.58	0.95	0.74	0.64	0.5
Transcript_contig_55996 (55996)	0.72	1.0	0.24	0.29	0.33	0.21	0.3	0.78	0.54	0.44	0.3
Transcript_contig_56053 (56053)	0.55	0.78	0.34	0.46	0.44	0.4	0.48	1.0	0.22	0.48	0.28
Transcript_contig_56162 (56162)	0.78	0.97	0.27	0.55	0.65	0.43	0.6	1.0	0.77	0.66	0.5
Transcript_contig_56348 (56348)	0.92	1.0	0.25	0.44	0.62	0.58	0.63	0.91	0.54	0.78	0.46
Transcript_contig_56461 (56461)	0.68	1.0	0.46	0.57	0.57	0.36	0.55	0.95	0.31	0.47	0.32
Transcript_contig_56503 (56503)	0.76	1.0	0.19	0.44	0.69	0.54	0.57	0.95	0.22	0.83	0.45
Transcript_contig_56540 (56540)	0.81	1.0	0.32	0.37	0.31	0.34	0.46	0.79	0.82	0.42	0.33
Transcript_contig_56542 (56542)	0.82	1.0	0.35	0.24	0.23	0.26	0.39	1.0	0.64	0.34	0.29
Transcript_contig_56594 (56594)	0.71	1.0	0.33	0.45	0.42	0.47	0.5	0.71	0.14	0.5	0.36
Transcript_contig_56854 (56854)	0.77	1.0	0.43	0.83	0.75	0.65	0.73	0.65	0.1	0.55	0.34
Transcript_contig_56941 (56941)	0.48	0.81	0.29	0.42	0.42	0.24	0.32	1.0	0.02	0.33	0.16
Transcript_contig_57324 (57324)	0.8	1.0	0.44	0.73	0.71	0.49	0.53	0.67	0.52	0.48	0.35
Transcript_contig_57329 (57329)	0.89	1.0	0.49	0.65	0.63	0.6	0.84	0.64	0.39	0.87	0.53
Transcript_contig_57395 (57395)	0.79	1.0	0.35	0.53	0.83	0.45	0.61	0.77	0.6	0.67	0.49
Transcript_contig_57465 (57465)	0.67	0.89	0.15	0.5	0.85	0.41	0.4	1.0	0.07	0.47	0.32
Transcript_contig_57594 (57594)	0.28	0.58	0.25	0.55	0.81	0.27	0.21	1.0	0.03	0.28	0.14
Transcript_contig_57604 (57604)	0.81	1.0	0.56	0.56	0.65	0.5	0.52	0.67	0.26	0.8	0.46
Transcript_contig_57850 (57850)	0.72	0.95	0.27	0.45	0.57	0.2	0.34	1.0	0.53	0.59	0.39
Transcript_contig_58238 (58238)	0.53	0.8	0.27	0.42	0.5	0.6	0.56	1.0	0.15	0.4	0.32
Transcript_contig_58270 (58270)	0.82	1.0	0.19	0.24	0.28	0.13	0.27	0.84	0.59	0.37	0.31
Transcript_contig_58287 (58287)	0.75	1.0	0.61	0.59	0.59	0.58	0.78	0.82	0.1	0.4	0.37
Transcript_contig_5836 (5836)	0.56	0.87	0.16	0.18	0.54	0.25	0.22	1.0	0.0	0.39	0.34
Transcript_contig_58453 (58453)	0.76	1.0	0.3	0.35	0.44	0.46	0.5	0.75	0.34	0.61	0.43
Transcript_contig_58515 (58515)	0.59	0.83	0.25	0.61	0.74	0.53	0.46	1.0	0.14	0.52	0.3
Transcript_contig_58560 (58560)	0.87	1.0	0.42	0.67	0.89	0.79	0.84	0.9	0.35	0.58	0.47
Transcript_contig_58643 (58643)	0.53	0.76	0.3	0.33	0.44	0.34	0.49	1.0	0.89	0.82	0.49
Transcript_contig_58646 (58646)	0.83	0.95	0.3	0.44	0.63	0.46	0.61	1.0	0.55	0.71	0.54
Transcript_contig_58674 (58674)	0.65	0.85	0.24	0.41	0.47	0.39	0.28	1.0	0.12	0.57	0.46
Transcript_contig_58681 (58681)	0.7	0.94	0.44	0.51	0.55	0.41	0.37	1.0	0.42	0.55	0.46
Transcript_contig_58726 (58726)	0.81	1.0	0.37	0.36	0.32	0.19	0.32	0.78	0.49	0.4	0.39
Transcript_contig_58755 (58755)	0.71	0.87	0.37	0.48	0.71	0.4	0.56	1.0	0.53	0.78	0.51
Transcript_contig_58988 (58988)	0.48	0.73	0.21	0.26	0.38	0.44	0.23	1.0	0.04	0.52	0.38
Transcript_contig_59003 (59003)	0.75	1.0	0.23	0.53	0.82	0.27	0.32	0.68	0.28	0.46	0.3
Transcript_contig_59134 (59134)	0.54	0.81	0.17	0.25	0.55	0.17	0.16	1.0	0.2	0.4	0.24
Transcript_contig_59167 (59167)	0.84	1.0	0.11	0.18	0.3	0.13	0.14	0.94	0.16	0.48	0.35
Transcript_contig_59325 (59325)	0.64	0.8	0.19	0.28	0.34	0.31	0.49	1.0	0.84	0.32	0.33
Transcript_contig_59335 (59335)	0.85	0.99	0.13	0.21	0.24	0.11	0.24	1.0	0.4	0.48	0.37
Transcript_contig_59372 (59372)	0.69	1.0	0.13	0.39	0.63	0.67	0.53	0.9	0.12	0.53	0.41
Transcript_contig_59496 (59496)	0.69	0.91	0.13	0.29	0.41	0.24	0.25	1.0	0.38	0.5	0.45
Transcript_contig_59504 (59504)	0.57	0.82	0.35	0.39	0.56	0.38	0.42	1.0	0.19	0.49	0.38
Transcript_contig_59651 (59651)	0.78	1.0	0.29	0.39	0.55	0.2	0.33	0.91	0.27	0.41	0.28
Transcript_contig_59704 (59704)	0.8	1.0	0.31	0.58	0.74	0.75	0.79	0.81	0.63	0.54	0.32
Transcript_contig_59794 (59794)	0.75	1.0	0.56	0.42	0.39	0.48	0.74	0.75	0.18	0.25	0.2
Transcript_contig_59822 (59822)	0.72	0.93	0.35	0.35	0.35	0.21	0.35	1.0	0.24	0.25	0.29
Transcript_contig_59940 (59940)	0.86	0.86	0.4	0.45	1.0	0.45	0.52	0.7	0.19	0.7	0.44
Transcript_contig_60311 (60311)	0.59	0.88	0.61	0.4	0.71	0.15	0.43	1.0	0.15	0.53	0.39
Transcript_contig_60550 (60550)	0.79	1.0	0.23	0.16	0.26	0.19	0.2	1.0	0.26	0.4	0.39
Transcript_contig_61412 (61412)	0.76	1.0	0.28	0.29	0.31	0.18	0.43	0.83	0.89	0.95	0.46
Transcript_contig_61446 (61446)	0.76	1.0	0.25	0.36	0.42	0.42	0.32	0.91	0.39	0.8	0.44
Transcript_contig_61971 (61971)	0.6	0.75	0.34	0.33	0.46	0.36	0.47	1.0	0.18	0.5	0.35
Transcript_contig_620 (620)	0.8	0.88	0.22	0.21	0.33	0.27	0.61	1.0	0.62	0.58	0.39
Transcript_contig_62031 (62031)	0.74	1.0	0.29	0.52	0.61	0.59	0.58	0.95	0.16	0.8	0.52
Transcript_contig_62370 (62370)	0.66	1.0	0.54	0.57	0.4	0.51	0.56	0.78	0.09	0.59	0.36
Transcript_contig_62767 (62767)	0.56	0.67	0.13	0.1	0.19	0.13	0.18	1.0	0.07	0.56	0.48
Transcript_contig_63184 (63184)	0.77	1.0	0.33	0.39	0.48	0.42	0.42	0.64	0.37	0.66	0.45
Transcript_contig_67585 (67585)	0.83	1.0	0.33	0.47	0.58	0.74	0.7	0.78	0.15	0.83	0.43
Transcript_contig_67658 (67658)	0.67	0.89	0.18	0.16	0.39	0.12	0.34	1.0	0.01	0.42	0.26
Transcript_contig_68696 (68696)	0.51	0.8	0.25	0.43	0.39	0.16	0.3	1.0	0.0	0.29	0.18
Transcript_contig_69028 (69028)	0.77	1.0	0.38	0.4	0.52	0.52	0.61	1.0	0.63	0.63	0.35
Transcript_contig_69341 (69341)	0.86	1.0	0.18	0.4	0.54	0.38	0.52	0.98	0.36	0.72	0.44
Transcript_contig_704 (704)	0.62	0.71	0.24	0.33	0.48	0.26	0.46	1.0	0.21	0.75	0.38
Transcript_contig_70870 (70870)	0.75	0.9	0.19	0.45	0.57	0.21	0.5	0.96	1.0	0.8	0.49
Transcript_contig_749 (749)	0.71	1.0	0.24	0.27	0.54	0.21	0.3	0.98	0.06	0.78	0.65
Transcript_contig_78157 (78157)	0.92	1.0	0.35	0.5	0.59	0.66	0.72	0.86	0.87	0.72	0.49
Transcript_contig_78389 (78389)	0.72	1.0	0.19	0.45	0.98	0.35	0.39	0.82	0.05	0.36	0.22
Transcript_contig_78501 (78501)	0.82	1.0	0.3	0.72	0.82	0.44	0.59	0.93	0.38	0.75	0.57
Transcript_contig_78887 (78887)	0.77	1.0	0.3	0.41	0.47	0.72	0.83	0.68	0.05	0.48	0.28
Transcript_contig_78978 (78978)	0.85	1.0	0.33	0.43	0.43	0.74	0.69	0.95	0.33	0.6	0.3
Transcript_contig_79163 (79163)	0.4	0.63	0.29	0.39	0.59	0.28	0.28	1.0	0.04	0.42	0.28
Transcript_contig_79204 (79204)	0.67	0.91	0.26	0.25	0.24	0.38	0.34	1.0	0.11	0.39	0.41
Transcript_contig_79511 (79511)	0.66	1.0	0.22	0.2	0.17	0.25	0.3	0.88	0.09	0.69	0.46
Transcript_contig_80080 (80080)	0.4	0.63	0.08	0.13	0.16	0.19	0.14	1.0	0.13	0.42	0.4
Transcript_contig_80141 (80141)	0.77	1.0	0.39	0.51	0.66	0.22	0.3	0.93	0.06	0.67	0.51
Transcript_contig_81950 (81950)	0.77	1.0	0.1	0.21	0.23	0.2	0.18	0.98	0.31	0.64	0.36
Transcript_contig_81964 (81964)	0.46	0.64	0.24	0.17	0.34	0.12	0.25	1.0	0.11	0.22	0.25
Transcript_contig_82245 (82245)	0.85	1.0	0.2	0.44	0.4	0.63	0.83	0.62	0.02	0.6	0.32
Transcript_contig_82812 (82812)	0.59	0.66	0.22	0.28	0.51	0.4	0.43	1.0	0.2	0.37	0.2
Transcript_contig_83456 (83456)	0.43	0.62	0.21	0.85	0.95	0.14	0.28	1.0	0.0	0.23	0.06
Transcript_contig_89129 (89129)	0.66	0.85	0.23	0.34	0.58	0.38	0.31	1.0	0.44	0.65	0.45
Transcript_contig_89240 (89240)	0.79	0.98	0.58	0.61	0.5	0.73	0.67	1.0	0.13	0.44	0.32
Transcript_contig_89712 (89712)	0.81	0.86	0.38	0.62	1.0	0.55	0.67	0.76	0.41	0.53	0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)