Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_31565 (31565)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_42086 (42086)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.98
Transcript_contig_51093 (51093)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_53881 (53881)	0.21	0.17	0.18	0.19	0.17	0.17	0.16	0.14	1.0	0.24	0.25
Transcript_contig_53931 (53931)	0.61	0.58	0.38	0.67	1.0	0.44	0.59	0.62	0.74	0.74	0.56
Transcript_contig_53954 (53954)	0.65	0.41	0.48	0.47	0.49	0.42	0.27	0.22	0.81	1.0	0.83
Transcript_contig_54079 (54079)	0.73	0.68	0.52	0.66	1.0	0.53	0.58	0.55	0.69	0.77	0.63
Transcript_contig_54361 (54361)	0.54	0.38	0.5	0.27	0.08	0.22	0.21	0.28	1.0	0.47	0.51
Transcript_contig_54394 (54394)	0.38	0.24	0.22	0.59	0.69	0.23	0.4	0.19	1.0	0.45	0.39
Transcript_contig_54407 (54407)	0.5	0.17	0.7	0.65	1.0	0.49	0.74	0.18	0.99	0.76	0.72
Transcript_contig_54410 (54410)	0.48	0.51	0.12	0.51	0.95	0.39	0.24	0.57	0.15	1.0	0.68
Transcript_contig_54616 (54616)	0.77	0.74	0.54	0.57	0.56	0.39	0.57	0.66	1.0	0.61	0.58
Transcript_contig_54653 (54653)	0.68	0.67	0.76	0.88	1.0	0.37	0.6	0.63	0.49	0.65	0.5
Transcript_contig_54873 (54873)	0.32	0.3	0.3	0.75	0.89	0.3	0.39	0.33	1.0	0.45	0.31
Transcript_contig_54876 (54876)	0.87	0.85	0.62	0.91	0.99	0.56	0.63	0.68	0.7	1.0	0.89
Transcript_contig_54921 (54921)	0.65	0.6	0.12	0.49	0.79	0.48	0.29	0.65	0.47	1.0	0.85
Transcript_contig_54948 (54948)	0.49	0.32	0.53	0.54	1.0	0.31	0.56	0.32	0.96	0.52	0.47
Transcript_contig_55018 (55018)	0.94	0.79	0.67	0.6	0.82	0.31	0.62	0.59	1.0	0.82	0.66
Transcript_contig_55030 (55030)	0.61	0.47	0.48	0.82	1.0	0.71	0.42	0.4	0.87	0.74	0.61
Transcript_contig_55209 (55209)	0.64	0.45	0.24	0.52	0.63	0.48	0.64	0.3	1.0	0.83	0.67
Transcript_contig_55294 (55294)	0.62	0.54	0.28	0.52	1.0	0.24	0.4	0.4	0.35	0.73	0.62
Transcript_contig_55420 (55420)	0.51	0.35	0.26	0.15	0.09	0.14	0.19	0.31	1.0	0.48	0.46
Transcript_contig_55437 (55437)	0.75	0.82	0.19	0.56	0.73	0.53	0.61	0.68	0.62	1.0	0.6
Transcript_contig_55439 (55439)	0.37	0.44	0.39	0.64	1.0	0.27	0.31	0.6	0.32	0.47	0.37
Transcript_contig_55463 (55463)	0.69	0.51	0.62	0.8	0.74	0.48	0.65	0.5	0.71	1.0	0.82
Transcript_contig_55719 (55719)	0.76	0.58	0.29	0.72	1.0	0.43	0.55	0.43	0.45	0.78	0.64
Transcript_contig_55761 (55761)	0.69	0.56	0.53	0.62	1.0	0.36	0.59	0.67	0.94	0.77	0.79
Transcript_contig_55794 (55794)	0.48	0.53	0.31	0.55	1.0	0.58	0.62	0.54	0.37	0.87	0.64
Transcript_contig_55830 (55830)	0.68	0.49	0.36	0.61	1.0	0.27	0.51	0.5	0.67	0.8	0.72
Transcript_contig_55931 (55931)	1.0	0.87	0.38	0.47	0.83	0.46	0.54	0.82	0.97	1.0	0.93
Transcript_contig_56039 (56039)	0.62	0.36	0.64	0.89	0.88	0.51	1.0	0.39	0.56	0.68	0.65
Transcript_contig_56067 (56067)	0.54	0.47	0.58	0.67	0.94	0.33	0.58	0.41	1.0	0.59	0.41
Transcript_contig_56076 (56076)	0.22	0.11	0.38	0.45	0.33	0.24	0.46	0.1	1.0	0.21	0.22
Transcript_contig_56182 (56182)	0.6	0.52	0.23	0.32	0.5	0.27	0.27	0.35	1.0	0.52	0.46
Transcript_contig_56403 (56403)	0.55	0.17	0.46	0.42	0.75	0.39	0.29	0.16	0.46	1.0	0.86
Transcript_contig_56670 (56670)	0.58	0.59	0.27	0.57	1.0	0.36	0.51	0.35	0.37	0.58	0.45
Transcript_contig_57039 (57039)	0.79	0.71	0.7	0.6	0.71	0.41	0.78	1.0	0.53	0.78	0.68
Transcript_contig_57117 (57117)	0.89	0.91	0.73	0.85	0.86	0.46	0.71	0.82	0.57	1.0	0.74
Transcript_contig_57326 (57326)	0.46	0.34	0.28	0.59	0.73	0.28	0.52	0.26	1.0	0.55	0.42
Transcript_contig_58101 (58101)	0.52	0.35	0.51	0.73	1.0	0.5	0.66	0.43	0.7	0.63	0.62
Transcript_contig_58162 (58162)	0.64	0.66	0.69	0.85	1.0	0.48	0.59	0.55	0.33	0.62	0.55
Transcript_contig_58480 (58480)	0.7	0.59	0.77	0.86	1.0	0.32	0.52	0.55	0.59	0.82	0.63
Transcript_contig_58710 (58710)	0.47	0.36	0.83	0.87	1.0	0.68	0.82	0.45	0.5	0.76	0.62
Transcript_contig_58729 (58729)	0.32	0.31	0.18	0.38	0.65	0.28	0.26	0.29	1.0	0.36	0.32
Transcript_contig_58815 (58815)	0.51	0.38	0.12	0.81	1.0	0.82	0.53	0.33	0.3	0.5	0.46
Transcript_contig_59261 (59261)	0.21	0.05	0.09	0.12	0.2	0.13	0.13	0.05	1.0	0.35	0.4
Transcript_contig_61148 (61148)	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_6169 (6169)	0.5	0.26	0.47	0.58	0.62	0.43	0.42	0.25	0.61	0.77	1.0
Transcript_contig_61849 (61849)	0.53	0.31	0.85	1.0	0.91	0.7	0.94	0.43	0.48	0.69	0.74
Transcript_contig_63361 (63361)	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.76	1.0
Transcript_contig_64409 (64409)	0.72	0.71	0.26	0.59	0.77	0.92	0.47	0.82	0.49	1.0	0.75
Transcript_contig_65620 (65620)	0.3	0.0	0.0	0.17	0.0	0.14	1.0	0.0	0.63	0.12	0.0
Transcript_contig_65974 (65974)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.51	1.0
Transcript_contig_67462 (67462)	0.96	0.87	0.2	0.76	0.83	0.35	0.42	0.41	0.72	1.0	0.72
Transcript_contig_67544 (67544)	1.0	0.81	0.29	0.52	0.79	0.34	0.52	0.5	0.62	0.84	0.7
Transcript_contig_78268 (78268)	0.46	0.31	0.26	0.29	0.39	0.28	0.25	0.2	1.0	0.58	0.55
Transcript_contig_78419 (78419)	0.96	0.82	0.5	0.74	0.89	0.49	0.83	0.66	1.0	0.96	0.74
Transcript_contig_78678 (78678)	0.17	0.05	1.0	0.5	0.11	0.36	0.13	0.02	0.52	0.65	0.54
Transcript_contig_78977 (78977)	0.6	0.41	0.16	0.29	0.53	0.33	0.21	0.42	0.44	1.0	0.82
Transcript_contig_79016 (79016)	0.58	0.59	0.61	0.57	0.58	0.32	0.48	0.5	1.0	0.48	0.35
Transcript_contig_79066 (79066)	0.48	0.3	0.96	1.0	0.71	0.56	0.92	0.43	0.4	0.62	0.54
Transcript_contig_79161 (79161)	0.55	0.22	0.57	0.56	0.53	0.62	0.98	0.29	0.7	1.0	0.79
Transcript_contig_79331 (79331)	0.33	0.28	0.95	1.0	0.8	0.5	0.9	0.36	0.27	0.22	0.31
Transcript_contig_79864 (79864)	0.36	0.35	0.14	0.18	0.23	0.17	0.24	0.36	1.0	0.42	0.34
Transcript_contig_79914 (79914)	1.0	0.6	0.12	0.14	0.16	0.13	0.07	0.24	0.49	0.32	0.36
Transcript_contig_7992 (7992)	0.22	0.19	0.39	0.32	0.15	0.63	1.0	0.12	0.51	0.54	0.47
Transcript_contig_80036 (80036)	0.57	0.19	0.23	0.28	0.31	0.29	0.33	0.27	0.51	0.82	1.0
Transcript_contig_80695 (80695)	0.62	0.59	0.8	0.96	1.0	0.64	0.8	0.61	0.98	0.62	0.52
Transcript_contig_89291 (89291)	0.41	0.25	0.33	0.27	0.17	0.24	0.62	0.25	1.0	0.42	0.29
Transcript_contig_89453 (89453)	0.61	0.59	0.38	0.59	0.87	0.44	0.7	0.54	1.0	0.62	0.53
Transcript_contig_89643 (89643)	0.3	0.16	0.86	1.0	0.85	0.4	0.81	0.19	0.52	0.35	0.33
Transcript_contig_90208 (90208)	0.4	0.16	0.73	0.93	0.89	0.67	0.9	0.08	1.0	0.6	0.6
Transcript_contig_90608 (90608)	0.44	0.14	0.47	0.56	0.62	0.56	0.82	0.15	1.0	0.72	0.67
Transcript_contig_90642 (90642)	0.73	0.42	0.6	0.72	0.8	0.67	0.84	0.46	0.88	1.0	0.96

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)