Heatmap: Cluster_244 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1487 (1487)	0.42	0.23	0.15	0.25	0.26	0.43	1.0	0.31	0.17	0.2	0.11
Transcript_contig_22386 (22386)	0.13	0.04	0.47	0.11	0.16	0.24	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2345 (2345)	0.21	0.28	0.53	0.51	0.3	0.5	1.0	0.34	0.0	0.24	0.2
Transcript_contig_24939 (24939)	0.08	0.03	0.39	0.31	0.06	0.54	1.0	0.1	0.0	0.05	0.03
Transcript_contig_300 (300)	0.21	0.05	0.23	0.37	0.37	0.47	1.0	0.02	0.12	0.1	0.14
Transcript_contig_342 (342)	0.13	0.17	0.81	0.42	0.72	0.59	1.0	0.51	0.33	0.31	0.48
Transcript_contig_352 (352)	0.07	0.0	0.39	0.39	0.57	0.31	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_3598 (3598)	0.39	0.22	0.46	0.59	0.81	0.54	1.0	0.12	0.27	0.37	0.23
Transcript_contig_3817 (3817)	0.39	0.19	0.47	0.68	0.86	0.54	1.0	0.11	0.1	0.54	0.37
Transcript_contig_4351 (4351)	0.12	0.0	0.61	0.2	0.08	0.23	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_4526 (4526)	0.45	0.25	0.18	1.0	0.28	0.13	0.98	0.12	0.0	0.32	0.06
Transcript_contig_4607 (4607)	0.15	0.0	0.26	0.25	0.05	0.18	1.0	0.0	0.0	0.07	0.06
Transcript_contig_53978 (53978)	0.45	0.42	0.56	0.69	0.68	0.56	1.0	0.27	0.11	0.53	0.24
Transcript_contig_54119 (54119)	0.43	0.28	0.15	0.15	0.14	0.37	1.0	0.25	0.06	0.14	0.08
Transcript_contig_54137 (54137)	0.17	0.02	0.54	0.58	0.57	0.47	1.0	0.05	0.53	0.29	0.26
Transcript_contig_54322 (54322)	0.17	0.16	0.74	0.71	0.96	0.43	1.0	0.25	0.14	0.14	0.15
Transcript_contig_54595 (54595)	0.37	0.18	0.13	0.26	0.3	0.35	1.0	0.13	0.07	0.21	0.12
Transcript_contig_54799 (54799)	0.37	0.26	0.17	0.22	0.26	0.38	1.0	0.32	0.07	0.04	0.05
Transcript_contig_54917 (54917)	0.24	0.16	0.38	0.39	0.18	0.4	1.0	0.07	0.01	0.12	0.07
Transcript_contig_55273 (55273)	0.32	0.23	0.56	0.69	0.69	0.49	1.0	0.15	0.33	0.45	0.25
Transcript_contig_55320 (55320)	0.45	0.28	0.17	0.27	0.26	0.49	1.0	0.21	0.32	0.4	0.21
Transcript_contig_55880 (55880)	0.3	0.15	0.3	0.4	0.44	0.39	1.0	0.06	0.01	0.21	0.1
Transcript_contig_56290 (56290)	0.21	0.0	0.68	0.98	0.99	0.64	1.0	0.0	0.2	0.22	0.33
Transcript_contig_5638 (5638)	0.57	0.47	0.64	0.49	0.74	0.65	1.0	0.33	0.16	0.39	0.29
Transcript_contig_56499 (56499)	0.4	0.18	0.15	0.17	0.19	0.38	1.0	0.23	0.01	0.07	0.05
Transcript_contig_56583 (56583)	0.4	0.22	0.09	0.14	0.19	0.35	1.0	0.22	0.34	0.23	0.16
Transcript_contig_56891 (56891)	0.09	0.0	0.61	0.79	1.0	0.33	0.82	0.0	0.02	0.05	0.07
Transcript_contig_57220 (57220)	0.41	0.38	0.65	0.88	1.0	0.49	1.0	0.32	0.22	0.59	0.48
Transcript_contig_57668 (57668)	0.32	0.22	0.36	0.48	0.56	0.34	1.0	0.17	0.02	0.14	0.12
Transcript_contig_58004 (58004)	0.3	0.22	0.5	0.89	1.0	0.42	0.97	0.08	0.3	0.39	0.23
Transcript_contig_58219 (58219)	0.35	0.23	0.14	0.27	0.6	0.4	1.0	0.22	0.02	0.26	0.15
Transcript_contig_58359 (58359)	0.49	0.43	0.44	0.72	0.58	0.7	1.0	0.27	0.08	0.58	0.39
Transcript_contig_58505 (58505)	0.39	0.3	0.63	0.84	1.0	0.54	0.97	0.25	0.29	0.54	0.31
Transcript_contig_58715 (58715)	0.37	0.3	0.44	0.68	0.72	0.53	1.0	0.23	0.13	0.56	0.35
Transcript_contig_59913 (59913)	0.31	0.24	0.36	0.39	0.7	0.44	1.0	0.28	0.08	0.15	0.08
Transcript_contig_60098 (60098)	0.21	0.11	0.52	0.58	0.45	0.24	1.0	0.13	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_60245 (60245)	0.33	0.0	0.75	0.0	0.0	0.55	1.0	0.0	0.0	0.31	0.09
Transcript_contig_60521 (60521)	0.29	0.14	0.51	0.77	0.67	0.51	1.0	0.16	0.03	0.35	0.31
Transcript_contig_61465 (61465)	0.25	0.16	0.43	0.46	0.68	0.59	1.0	0.1	0.3	0.29	0.23
Transcript_contig_62148 (62148)	0.38	0.14	0.42	0.62	0.72	0.52	1.0	0.33	0.0	0.04	0.01
Transcript_contig_62288 (62288)	0.25	0.08	0.71	0.62	0.69	0.5	1.0	0.05	0.23	0.21	0.2
Transcript_contig_62690 (62690)	0.48	0.29	0.31	0.35	0.61	0.41	1.0	0.46	0.07	0.24	0.15
Transcript_contig_64003 (64003)	0.36	0.21	0.67	0.77	0.8	0.66	1.0	0.35	0.01	0.27	0.21
Transcript_contig_67725 (67725)	0.23	0.11	0.65	0.62	0.55	0.46	1.0	0.09	0.14	0.31	0.25
Transcript_contig_67951 (67951)	0.27	0.19	0.55	0.51	0.57	0.43	1.0	0.16	0.0	0.05	0.05
Transcript_contig_68361 (68361)	0.07	0.07	0.56	0.1	0.09	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_69329 (69329)	0.17	0.08	0.36	0.37	0.37	0.33	1.0	0.02	0.0	0.03	0.05
Transcript_contig_69476 (69476)	0.41	0.41	0.19	0.32	0.32	0.51	1.0	0.34	0.03	0.36	0.17
Transcript_contig_7187 (7187)	0.17	0.03	0.46	0.81	0.81	0.66	1.0	0.0	0.7	0.32	0.26
Transcript_contig_72030 (72030)	0.27	0.1	0.35	0.69	0.62	0.53	1.0	0.0	0.0	0.44	0.13
Transcript_contig_74395 (74395)	0.13	0.0	0.46	0.33	0.04	0.29	1.0	0.0	0.0	0.02	0.07
Transcript_contig_78178 (78178)	0.31	0.19	0.69	1.0	0.86	0.5	0.98	0.14	0.08	0.13	0.18
Transcript_contig_78286 (78286)	0.13	0.07	0.34	0.33	0.69	0.5	1.0	0.21	0.64	0.39	0.32
Transcript_contig_78348 (78348)	0.32	0.18	0.43	0.47	0.54	0.38	1.0	0.1	0.22	0.13	0.14
Transcript_contig_78475 (78475)	0.24	0.14	0.47	0.51	0.35	0.51	1.0	0.1	0.11	0.18	0.11
Transcript_contig_78636 (78636)	0.17	0.07	0.29	0.32	0.53	0.4	1.0	0.16	0.83	0.16	0.18
Transcript_contig_78660 (78660)	0.34	0.34	0.52	0.53	0.45	0.6	1.0	0.34	0.14	0.21	0.21
Transcript_contig_78783 (78783)	0.4	0.23	0.52	0.74	0.93	0.41	1.0	0.07	0.12	0.6	0.36
Transcript_contig_78784 (78784)	0.1	0.0	0.61	0.68	1.0	0.41	0.78	0.0	0.03	0.18	0.17
Transcript_contig_78803 (78803)	0.37	0.2	0.58	0.78	0.91	0.48	1.0	0.13	0.2	0.47	0.27
Transcript_contig_79028 (79028)	0.27	0.21	0.46	0.64	0.59	0.56	1.0	0.11	0.25	0.28	0.22
Transcript_contig_79332 (79332)	0.35	0.31	0.73	0.77	0.72	0.51	1.0	0.33	0.23	0.65	0.41
Transcript_contig_79530 (79530)	0.11	0.0	0.58	0.97	0.65	0.64	1.0	0.0	0.09	0.0	0.16
Transcript_contig_79724 (79724)	0.12	0.11	0.37	0.44	0.45	0.5	1.0	0.0	0.09	0.27	0.22
Transcript_contig_79799 (79799)	0.16	0.09	0.5	0.47	0.53	0.49	1.0	0.19	0.38	0.18	0.2
Transcript_contig_7984 (7984)	0.1	0.07	0.11	0.16	0.0	0.13	1.0	0.22	0.0	0.12	0.0
Transcript_contig_80489 (80489)	0.36	0.29	0.59	0.72	1.0	0.57	0.91	0.16	0.17	0.29	0.26
Transcript_contig_80885 (80885)	0.11	0.0	0.56	0.78	0.78	0.54	1.0	0.0	0.1	0.0	0.03
Transcript_contig_81204 (81204)	0.14	0.07	0.22	0.45	0.16	0.28	1.0	0.0	0.0	0.15	0.16
Transcript_contig_81409 (81409)	0.12	0.0	0.0	0.48	0.16	0.23	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0
Transcript_contig_82573 (82573)	0.39	0.3	0.52	0.58	0.37	0.58	1.0	0.23	0.25	0.36	0.37
Transcript_contig_82794 (82794)	0.12	0.0	0.2	0.59	0.25	0.37	1.0	0.0	0.0	0.09	0.05
Transcript_contig_83010 (83010)	0.23	0.02	0.07	0.25	0.22	0.37	1.0	0.01	0.02	0.18	0.08
Transcript_contig_84017 (84017)	0.41	0.25	0.06	0.29	0.42	0.37	1.0	0.16	0.3	0.17	0.08
Transcript_contig_89469 (89469)	0.39	0.35	0.43	0.61	0.81	0.39	1.0	0.13	0.36	0.4	0.25
Transcript_contig_89692 (89692)	0.2	0.17	0.5	0.81	0.61	0.39	1.0	0.07	0.0	0.04	0.08
Transcript_contig_90137 (90137)	0.24	0.17	0.79	0.67	0.76	0.55	1.0	0.22	0.14	0.39	0.39
Transcript_contig_90199 (90199)	0.53	0.33	0.78	0.59	0.68	0.56	1.0	0.31	0.44	0.55	0.31
Transcript_contig_90234 (90234)	0.39	0.29	0.48	0.47	0.47	0.45	1.0	0.26	0.28	0.28	0.18
Transcript_contig_90480 (90480)	0.29	0.15	0.55	0.71	0.7	0.58	1.0	0.11	0.43	0.31	0.31
Transcript_contig_90696 (90696)	0.17	0.0	0.54	0.82	0.43	0.42	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_91260 (91260)	0.37	0.11	0.63	0.67	0.82	0.7	1.0	0.1	0.05	0.39	0.12
Transcript_contig_9889 (9889)	0.4	0.32	0.57	0.81	0.77	0.63	1.0	0.17	0.19	0.34	0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)