Heatmap: Cluster_161 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_12782 (12782)	0.02	0.0	0.36	0.54	1.0	0.16	0.5	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_1279 (1279)	0.16	0.0	0.39	0.9	1.0	0.74	0.86	0.0	0.5	0.27	0.14
Transcript_contig_13829 (13829)	0.13	0.06	0.29	0.75	1.0	0.19	0.39	0.0	0.0	0.07	0.13
Transcript_contig_17005 (17005)	0.11	0.03	0.04	0.39	1.0	0.2	0.16	0.08	0.0	0.19	0.0
Transcript_contig_18226 (18226)	0.07	0.0	0.35	0.65	1.0	0.06	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19589 (19589)	0.09	0.02	0.26	0.56	1.0	0.12	0.31	0.0	0.0	0.02	0.05
Transcript_contig_218 (218)	0.21	0.16	0.35	0.4	1.0	0.13	0.39	0.15	0.06	0.08	0.06
Transcript_contig_24095 (24095)	0.24	0.0	0.45	0.85	1.0	0.45	0.54	0.0	0.0	0.05	0.1
Transcript_contig_2707 (2707)	0.18	0.04	0.43	0.62	1.0	0.18	0.46	0.06	0.0	0.14	0.16
Transcript_contig_4294 (4294)	0.19	0.18	0.27	0.45	1.0	0.24	0.42	0.23	0.08	0.16	0.06
Transcript_contig_4814 (4814)	0.07	0.04	0.28	0.61	1.0	0.23	0.33	0.01	0.0	0.18	0.14
Transcript_contig_54284 (54284)	0.19	0.14	0.49	0.7	1.0	0.28	0.45	0.13	0.15	0.23	0.2
Transcript_contig_57118 (57118)	0.04	0.04	0.76	0.67	1.0	0.2	0.18	0.03	0.02	0.0	0.1
Transcript_contig_57449 (57449)	0.19	0.16	0.16	0.6	1.0	0.14	0.33	0.1	0.09	0.14	0.09
Transcript_contig_58724 (58724)	0.22	0.17	0.42	0.82	1.0	0.28	0.5	0.18	0.06	0.19	0.13
Transcript_contig_592 (592)	0.02	0.01	0.07	0.38	1.0	0.06	0.15	0.04	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_59892 (59892)	0.17	0.07	0.33	0.45	1.0	0.16	0.44	0.06	0.0	0.21	0.12
Transcript_contig_59899 (59899)	0.23	0.13	0.77	0.77	1.0	0.33	0.54	0.12	0.12	0.02	0.16
Transcript_contig_60420 (60420)	0.06	0.0	0.13	0.31	1.0	0.1	0.33	0.01	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_60562 (60562)	0.19	0.14	0.49	0.56	1.0	0.21	0.49	0.13	0.01	0.14	0.12
Transcript_contig_60655 (60655)	0.19	0.19	0.52	0.72	1.0	0.2	0.36	0.3	0.19	0.3	0.19
Transcript_contig_61600 (61600)	0.34	0.31	0.5	0.84	1.0	0.58	0.59	0.37	0.29	0.32	0.26
Transcript_contig_62202 (62202)	0.06	0.0	0.39	0.49	1.0	0.13	0.33	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_6250 (6250)	0.15	0.02	0.32	0.59	1.0	0.15	0.4	0.06	0.0	0.03	0.1
Transcript_contig_62614 (62614)	0.02	0.0	0.34	0.59	1.0	0.36	0.5	0.0	0.0	0.01	0.04
Transcript_contig_63415 (63415)	0.27	0.22	0.48	0.73	1.0	0.39	0.78	0.13	0.01	0.25	0.16
Transcript_contig_66152 (66152)	0.07	0.07	0.38	0.53	1.0	0.21	0.28	0.02	0.01	0.13	0.07
Transcript_contig_67695 (67695)	0.16	0.16	0.36	0.29	1.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.02	0.09
Transcript_contig_68091 (68091)	0.1	0.0	0.31	0.47	1.0	0.45	0.58	0.0	0.27	0.02	0.02
Transcript_contig_68412 (68412)	0.13	0.12	0.32	0.58	1.0	0.25	0.4	0.15	0.36	0.12	0.13
Transcript_contig_68640 (68640)	0.05	0.0	0.05	0.59	1.0	0.2	0.34	0.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_68973 (68973)	0.1	0.0	0.27	0.54	1.0	0.25	0.47	0.0	0.02	0.44	0.36
Transcript_contig_68992 (68992)	0.08	0.0	0.26	0.35	1.0	0.16	0.35	0.0	0.0	0.24	0.11
Transcript_contig_70443 (70443)	0.11	0.0	0.63	0.58	1.0	0.26	0.68	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_78137 (78137)	0.07	0.02	0.31	0.54	1.0	0.24	0.47	0.01	0.03	0.08	0.11
Transcript_contig_78172 (78172)	0.12	0.14	0.55	0.67	1.0	0.22	0.42	0.22	0.01	0.25	0.23
Transcript_contig_78706 (78706)	0.13	0.02	0.26	0.59	1.0	0.18	0.51	0.04	0.0	0.05	0.04
Transcript_contig_78734 (78734)	0.14	0.09	0.59	0.72	1.0	0.3	0.55	0.05	0.09	0.19	0.13
Transcript_contig_79172 (79172)	0.18	0.22	0.4	0.74	1.0	0.31	0.37	0.31	0.02	0.09	0.25
Transcript_contig_79371 (79371)	0.05	0.0	0.4	0.5	1.0	0.23	0.3	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_79570 (79570)	0.22	0.19	0.42	0.61	1.0	0.14	0.37	0.08	0.02	0.09	0.12
Transcript_contig_79637 (79637)	0.06	0.0	0.57	0.81	1.0	0.29	0.37	0.0	0.11	0.32	0.17
Transcript_contig_79663 (79663)	0.27	0.14	0.26	0.31	1.0	0.2	0.31	0.04	0.0	0.01	0.0
Transcript_contig_79827 (79827)	0.07	0.0	0.61	0.67	1.0	0.43	0.64	0.0	0.07	0.0	0.04
Transcript_contig_79994 (79994)	0.11	0.0	0.42	0.53	1.0	0.18	0.48	0.0	0.0	0.11	0.08
Transcript_contig_80292 (80292)	0.07	0.0	0.0	0.23	1.0	0.09	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_80324 (80324)	0.12	0.09	0.52	0.76	1.0	0.21	0.48	0.12	0.02	0.1	0.1
Transcript_contig_80418 (80418)	0.16	0.0	0.5	0.6	1.0	0.22	0.64	0.0	0.08	0.07	0.11
Transcript_contig_80422 (80422)	0.1	0.04	0.33	0.49	1.0	0.22	0.28	0.08	0.03	0.1	0.1
Transcript_contig_80470 (80470)	0.05	0.0	0.52	0.57	1.0	0.22	0.64	0.0	0.0	0.05	0.04
Transcript_contig_80481 (80481)	0.09	0.0	0.53	0.69	1.0	0.24	0.54	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_80736 (80736)	0.08	0.0	0.49	0.9	1.0	0.31	0.67	0.0	0.0	0.42	0.28
Transcript_contig_81108 (81108)	0.08	0.05	0.4	0.6	1.0	0.23	0.34	0.06	0.1	0.21	0.16
Transcript_contig_82864 (82864)	0.04	0.0	0.34	0.51	1.0	0.07	0.18	0.0	0.0	0.02	0.02
Transcript_contig_89700 (89700)	0.18	0.18	0.5	0.66	1.0	0.37	0.52	0.23	0.09	0.15	0.12
Transcript_contig_90292 (90292)	0.1	0.03	0.42	0.6	1.0	0.15	0.35	0.01	0.1	0.05	0.08
Transcript_contig_90583 (90583)	0.06	0.01	0.37	0.56	1.0	0.3	0.53	0.01	0.0	0.0	0.09
Transcript_contig_9336 (9336)	0.16	0.22	0.27	0.48	1.0	0.19	0.42	0.14	0.04	0.11	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)