Heatmap: Cluster_88 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11307 (11307)	-1.63	-1.87	-2.0	1.35	1.79	-0.42	0.65	-	-2.36	0.1	-0.82
Transcript_contig_2247 (2247)	-0.71	-0.86	-1.05	0.44	0.87	0.22	-0.14	-1.3	-1.01	0.86	0.46
Transcript_contig_3807 (3807)	-0.46	-0.25	-1.58	0.51	1.82	-0.45	-0.46	-0.55	-3.57	0.22	-0.39
Transcript_contig_54014 (54014)	-0.47	-1.08	-0.13	0.7	1.3	-0.17	0.51	-1.15	-1.29	-0.1	-0.5
Transcript_contig_54173 (54173)	-0.14	-0.35	-0.71	0.63	1.3	-0.61	0.17	-0.73	-1.04	0.08	-0.41
Transcript_contig_54582 (54582)	-2.52	-3.29	-1.37	0.87	1.76	0.01	-1.55	-2.6	-2.61	1.05	0.46
Transcript_contig_54862 (54862)	-0.62	-0.67	-0.18	0.23	0.72	-0.28	-0.4	-0.32	-0.73	0.87	0.26
Transcript_contig_54900 (54900)	0.02	0.35	-1.45	-0.03	0.85	-0.19	-1.01	0.4	-1.61	0.62	0.01
Transcript_contig_55407 (55407)	-1.35	-1.41	-1.6	0.63	1.98	-0.49	-0.98	-1.21	-0.92	0.48	-0.26
Transcript_contig_55566 (55566)	0.47	0.26	-0.4	-0.21	-0.3	0.12	1.05	0.25	-1.26	-0.58	-0.85
Transcript_contig_55629 (55629)	-1.56	-2.02	-1.28	0.83	1.64	0.01	-1.03	-1.61	-1.98	0.8	0.36
Transcript_contig_55987 (55987)	-0.48	-0.35	-1.47	0.57	1.44	-0.15	-0.01	0.07	-2.01	0.1	-0.56
Transcript_contig_56228 (56228)	-0.04	0.07	-1.48	0.6	1.1	-0.27	0.03	-0.03	-1.24	-0.02	-0.49
Transcript_contig_56497 (56497)	-0.46	-0.56	-1.84	0.61	1.25	-0.29	-0.28	-0.44	-0.85	0.51	0.08
Transcript_contig_56581 (56581)	-1.26	-1.53	-1.5	0.93	1.7	-0.41	-0.62	-1.7	-2.15	0.75	0.15
Transcript_contig_56634 (56634)	-0.73	-1.08	-0.67	0.73	1.72	-0.81	-0.49	-0.91	-1.51	0.22	0.01
Transcript_contig_56713 (56713)	-0.91	-1.22	-0.09	0.7	1.69	-0.57	-0.09	-0.94	-1.08	-0.05	-0.59
Transcript_contig_56802 (56802)	0.19	0.3	-2.42	0.19	1.11	-0.52	-0.67	-0.19	-1.4	0.63	0.02
Transcript_contig_57271 (57271)	-0.42	-0.56	-1.07	0.24	1.22	-0.62	-0.55	-0.33	0.41	0.22	-0.04
Transcript_contig_57501 (57501)	-0.08	0.41	-0.97	0.05	0.71	0.06	-0.56	0.19	-3.01	0.63	-0.0
Transcript_contig_57640 (57640)	-0.66	-0.95	-1.48	0.74	1.48	0.07	-0.49	-1.78	-0.75	0.56	-0.15
Transcript_contig_57758 (57758)	-1.38	-1.74	-0.32	1.02	1.94	-0.91	-0.77	-1.92	-0.78	-0.06	-0.44
Transcript_contig_57829 (57829)	-1.88	-3.54	0.15	0.93	1.59	0.19	-0.26	-3.3	-2.0	0.37	-0.0
Transcript_contig_58687 (58687)	-0.15	0.22	-1.09	-0.08	0.25	0.07	-0.12	0.51	-0.3	0.34	-0.22
Transcript_contig_58885 (58885)	-1.31	-1.3	-0.34	0.59	1.26	0.28	-0.31	-0.85	-0.65	0.41	-0.04
Transcript_contig_59299 (59299)	-0.68	-0.68	-0.63	0.58	1.31	-0.12	-0.24	-0.63	-0.92	0.41	-0.21
Transcript_contig_59923 (59923)	0.07	-0.77	-0.6	-0.37	-0.38	-0.03	0.06	-0.95	0.74	0.53	0.6
Transcript_contig_6352 (6352)	-1.64	-2.2	-0.11	0.79	1.47	0.15	-0.27	-1.42	-3.86	0.81	-0.14
Transcript_contig_67504 (67504)	-0.83	-1.95	0.48	0.52	1.78	-1.45	-0.65	-1.56	0.14	-0.31	-0.57
Transcript_contig_68473 (68473)	-0.33	0.03	0.25	0.5	0.62	-0.19	0.23	0.23	-2.76	-0.15	-0.37
Transcript_contig_68850 (68850)	-3.19	-2.48	-4.32	-2.09	-2.14	1.53	-4.17	-2.57	-3.15	2.26	1.13
Transcript_contig_70140 (70140)	-4.06	-2.97	-	-	-	1.52	-1.66	-1.45	-	0.84	2.45
Transcript_contig_70611 (70611)	-0.42	-0.65	-0.51	0.41	0.6	0.21	0.15	-1.18	-0.54	0.58	0.23
Transcript_contig_7627 (7627)	-0.58	-0.81	-0.17	0.42	0.98	0.17	0.3	-2.41	0.14	0.24	-0.44
Transcript_contig_78057 (78057)	-0.3	-0.31	-1.11	0.18	0.77	-0.03	0.05	-0.36	0.01	0.44	-0.1
Transcript_contig_78287 (78287)	-0.02	0.06	0.17	0.53	0.4	-0.25	0.76	-0.34	-0.56	-0.67	-1.16
Transcript_contig_78312 (78312)	-1.76	-1.53	-1.04	0.96	1.62	-0.06	-0.68	-1.22	-0.98	0.3	0.12
Transcript_contig_78585 (78585)	-0.01	-0.7	-0.02	0.54	0.35	0.55	0.57	-1.67	-0.54	0.07	-0.56
Transcript_contig_79085 (79085)	-0.06	-0.28	0.69	0.48	0.15	-0.23	0.15	-0.27	-0.29	-0.51	-0.33
Transcript_contig_79122 (79122)	-0.33	-1.85	-0.05	0.1	0.54	-0.52	0.23	-1.65	1.06	0.18	0.05
Transcript_contig_79177 (79177)	-0.32	-1.21	0.42	0.57	0.66	0.12	1.05	-0.9	-1.68	-0.36	-0.79
Transcript_contig_79206 (79206)	-0.3	-0.36	-0.08	0.09	0.12	0.35	0.25	0.01	-0.85	0.18	0.21
Transcript_contig_79258 (79258)	-0.26	-0.97	-0.43	-0.16	-0.04	0.16	0.0	-0.77	0.02	0.86	0.59
Transcript_contig_79459 (79459)	-0.14	-1.29	-0.52	-0.31	-0.15	-0.25	0.16	-1.0	0.55	0.83	0.66
Transcript_contig_79491 (79491)	-0.21	-0.2	-0.95	0.42	0.93	0.26	0.01	-0.18	-4.8	0.56	-0.14
Transcript_contig_79597 (79597)	0.57	0.88	-0.48	0.23	-0.63	-0.18	0.58	0.3	-4.78	0.05	-1.06
Transcript_contig_79813 (79813)	-2.18	-2.6	-0.26	1.07	1.67	0.24	-0.6	-3.62	-2.48	0.54	-0.08
Transcript_contig_80024 (80024)	-0.18	-0.75	-0.52	-0.37	-0.25	0.02	-0.04	-0.45	0.5	0.88	0.31
Transcript_contig_80061 (80061)	-0.12	-1.7	-0.31	-0.2	0.02	-0.35	0.23	-1.78	0.99	0.58	0.44
Transcript_contig_80077 (80077)	0.01	-0.11	-0.55	-0.43	-0.37	-0.5	-0.45	0.32	0.22	0.77	0.38
Transcript_contig_80103 (80103)	-0.98	-3.09	0.56	0.7	1.09	0.17	0.93	-3.74	-2.22	0.16	-0.5
Transcript_contig_80113 (80113)	-0.4	-0.35	-0.96	0.16	0.63	0.21	-0.38	-0.28	-0.37	0.26	0.65
Transcript_contig_80128 (80128)	-0.05	0.16	-0.14	0.07	0.21	0.03	0.5	0.54	-2.03	-0.04	-0.54
Transcript_contig_80167 (80167)	-0.91	-3.09	0.29	0.02	0.52	1.06	0.94	-3.24	-5.81	0.88	-0.48
Transcript_contig_80186 (80186)	-0.67	-0.94	0.43	0.56	0.65	0.26	0.55	-0.55	-1.31	-0.04	-0.45
Transcript_contig_80323 (80323)	-0.31	-0.24	-0.87	-0.31	-0.02	0.36	-0.35	0.15	-0.43	0.67	0.58
Transcript_contig_80352 (80352)	0.0	-3.82	-1.66	-1.32	-1.24	-0.87	-1.33	-4.34	1.63	1.34	1.12
Transcript_contig_80362 (80362)	-0.88	-2.77	0.79	1.01	1.21	0.26	1.19	-3.59	-2.71	-3.27	-1.23
Transcript_contig_80407 (80407)	-0.64	-4.62	0.57	0.9	0.65	0.17	1.17	-5.85	-0.55	-0.4	-0.86
Transcript_contig_80427 (80427)	-0.01	0.24	-0.31	0.39	0.66	-0.18	0.55	0.51	-2.2	-0.7	-0.9
Transcript_contig_80623 (80623)	0.56	-0.3	-1.38	-2.17	-1.44	-0.92	-1.18	-2.69	0.85	1.29	1.24
Transcript_contig_80676 (80676)	-0.34	-1.72	-1.79	-1.57	-1.23	0.4	-1.28	-1.84	1.72	0.57	1.05
Transcript_contig_89359 (89359)	-0.35	-0.39	0.01	0.74	0.68	-0.39	-0.22	-0.29	-0.91	0.35	-0.11
Transcript_contig_89530 (89530)	0.02	0.37	-0.61	-0.17	0.38	-0.13	-0.09	0.45	-2.06	0.5	-0.05
Transcript_contig_89772 (89772)	-0.03	-0.31	-0.16	-0.35	-1.12	-1.37	-0.09	-0.24	1.79	-0.29	-0.65
Transcript_contig_89827 (89827)	-2.33	-2.44	-1.51	1.06	2.03	-0.94	-1.1	-2.82	-2.81	0.81	0.1
Transcript_contig_89831 (89831)	0.51	0.12	-0.9	0.56	0.37	0.08	0.44	-0.77	-1.73	0.35	-0.71
Transcript_contig_89990 (89990)	-0.3	-0.31	-1.53	-0.62	-0.37	0.1	-0.91	-0.14	1.21	0.67	0.25
Transcript_contig_90013 (90013)	-0.21	-0.58	-0.09	0.11	0.58	-0.32	0.01	-0.45	0.06	0.44	0.02
Transcript_contig_90531 (90531)	-0.48	-0.81	-0.49	0.13	0.32	0.1	-0.04	-0.42	0.06	0.73	0.21
Transcript_contig_90584 (90584)	-0.02	-1.86	-1.31	-0.96	-1.06	-0.86	-0.66	-1.7	1.94	0.54	0.63
Transcript_contig_90604 (90604)	-0.64	-0.67	-0.17	0.04	0.74	0.56	0.42	-0.41	-0.89	-0.36	0.34
Transcript_contig_90650 (90650)	-0.47	-0.72	0.12	0.22	0.63	0.19	0.37	-0.39	-1.14	0.31	-0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.