Heatmap: Cluster_88 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11307 (11307)	0.09	0.08	0.07	0.74	1.0	0.22	0.45	0.0	0.06	0.31	0.16
Transcript_contig_2247 (2247)	0.34	0.3	0.26	0.75	1.0	0.64	0.5	0.22	0.27	1.0	0.76
Transcript_contig_3807 (3807)	0.21	0.24	0.09	0.4	1.0	0.21	0.21	0.19	0.02	0.33	0.22
Transcript_contig_54014 (54014)	0.29	0.19	0.37	0.66	1.0	0.36	0.58	0.18	0.17	0.38	0.29
Transcript_contig_54173 (54173)	0.37	0.32	0.25	0.63	1.0	0.27	0.46	0.24	0.2	0.43	0.31
Transcript_contig_54582 (54582)	0.05	0.03	0.11	0.54	1.0	0.3	0.1	0.05	0.05	0.61	0.41
Transcript_contig_54862 (54862)	0.36	0.34	0.48	0.64	0.9	0.45	0.41	0.44	0.33	1.0	0.66
Transcript_contig_54900 (54900)	0.56	0.71	0.2	0.54	1.0	0.49	0.28	0.73	0.18	0.85	0.56
Transcript_contig_55407 (55407)	0.1	0.1	0.08	0.39	1.0	0.18	0.13	0.11	0.13	0.35	0.21
Transcript_contig_55566 (55566)	0.67	0.58	0.37	0.42	0.39	0.53	1.0	0.57	0.2	0.32	0.27
Transcript_contig_55629 (55629)	0.11	0.08	0.13	0.57	1.0	0.32	0.16	0.11	0.08	0.56	0.41
Transcript_contig_55987 (55987)	0.27	0.29	0.13	0.55	1.0	0.33	0.37	0.39	0.09	0.4	0.25
Transcript_contig_56228 (56228)	0.45	0.49	0.17	0.7	1.0	0.39	0.47	0.46	0.2	0.46	0.33
Transcript_contig_56497 (56497)	0.31	0.29	0.12	0.64	1.0	0.35	0.35	0.31	0.23	0.6	0.45
Transcript_contig_56581 (56581)	0.13	0.11	0.11	0.59	1.0	0.23	0.2	0.09	0.07	0.52	0.34
Transcript_contig_56634 (56634)	0.18	0.14	0.19	0.5	1.0	0.17	0.22	0.16	0.11	0.35	0.31
Transcript_contig_56713 (56713)	0.16	0.13	0.29	0.5	1.0	0.21	0.29	0.16	0.15	0.3	0.21
Transcript_contig_56802 (56802)	0.53	0.57	0.09	0.53	1.0	0.32	0.29	0.41	0.18	0.72	0.47
Transcript_contig_57271 (57271)	0.32	0.29	0.2	0.51	1.0	0.28	0.29	0.34	0.57	0.5	0.42
Transcript_contig_57501 (57501)	0.58	0.81	0.31	0.63	1.0	0.64	0.41	0.7	0.08	0.95	0.61
Transcript_contig_57640 (57640)	0.23	0.19	0.13	0.6	1.0	0.38	0.25	0.1	0.21	0.53	0.32
Transcript_contig_57758 (57758)	0.1	0.08	0.21	0.53	1.0	0.14	0.15	0.07	0.15	0.25	0.19
Transcript_contig_57829 (57829)	0.09	0.03	0.37	0.63	1.0	0.38	0.28	0.03	0.08	0.43	0.33
Transcript_contig_58687 (58687)	0.63	0.82	0.33	0.67	0.83	0.74	0.65	1.0	0.57	0.89	0.6
Transcript_contig_58885 (58885)	0.17	0.17	0.33	0.63	1.0	0.51	0.34	0.23	0.27	0.56	0.41
Transcript_contig_59299 (59299)	0.25	0.25	0.26	0.6	1.0	0.37	0.34	0.26	0.21	0.54	0.35
Transcript_contig_59923 (59923)	0.63	0.35	0.4	0.46	0.46	0.59	0.63	0.31	1.0	0.87	0.91
Transcript_contig_6352 (6352)	0.12	0.08	0.34	0.62	1.0	0.4	0.3	0.14	0.02	0.63	0.33
Transcript_contig_67504 (67504)	0.16	0.08	0.41	0.42	1.0	0.11	0.19	0.1	0.32	0.24	0.2
Transcript_contig_68473 (68473)	0.52	0.66	0.77	0.92	1.0	0.57	0.76	0.76	0.1	0.59	0.5
Transcript_contig_68850 (68850)	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.6	0.01	0.04	0.02	1.0	0.46
Transcript_contig_70140 (70140)	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.52	0.06	0.07	0.0	0.33	1.0
Transcript_contig_70611 (70611)	0.49	0.42	0.46	0.88	1.0	0.76	0.73	0.29	0.45	0.98	0.78
Transcript_contig_7627 (7627)	0.34	0.29	0.45	0.68	1.0	0.57	0.63	0.1	0.56	0.6	0.37
Transcript_contig_78057 (78057)	0.48	0.47	0.27	0.66	1.0	0.58	0.61	0.46	0.59	0.8	0.55
Transcript_contig_78287 (78287)	0.58	0.62	0.67	0.86	0.78	0.5	1.0	0.47	0.4	0.37	0.27
Transcript_contig_78312 (78312)	0.1	0.11	0.16	0.63	1.0	0.31	0.2	0.14	0.16	0.4	0.35
Transcript_contig_78585 (78585)	0.67	0.42	0.66	0.98	0.85	0.98	1.0	0.21	0.46	0.7	0.45
Transcript_contig_79085 (79085)	0.6	0.51	1.0	0.87	0.69	0.53	0.69	0.51	0.51	0.44	0.5
Transcript_contig_79122 (79122)	0.38	0.13	0.46	0.51	0.7	0.33	0.56	0.15	1.0	0.54	0.5
Transcript_contig_79177 (79177)	0.39	0.21	0.65	0.72	0.76	0.52	1.0	0.26	0.15	0.38	0.28
Transcript_contig_79206 (79206)	0.64	0.61	0.75	0.84	0.85	1.0	0.93	0.79	0.44	0.89	0.91
Transcript_contig_79258 (79258)	0.46	0.28	0.41	0.49	0.53	0.62	0.55	0.32	0.56	1.0	0.83
Transcript_contig_79459 (79459)	0.51	0.23	0.39	0.46	0.51	0.48	0.63	0.28	0.82	1.0	0.89
Transcript_contig_79491 (79491)	0.45	0.45	0.27	0.7	1.0	0.63	0.52	0.46	0.02	0.77	0.48
Transcript_contig_79597 (79597)	0.81	1.0	0.39	0.64	0.35	0.48	0.81	0.67	0.02	0.56	0.26
Transcript_contig_79813 (79813)	0.07	0.05	0.26	0.66	1.0	0.37	0.21	0.03	0.06	0.46	0.3
Transcript_contig_80024 (80024)	0.48	0.32	0.38	0.42	0.46	0.55	0.53	0.4	0.77	1.0	0.67
Transcript_contig_80061 (80061)	0.46	0.16	0.41	0.44	0.51	0.39	0.59	0.15	1.0	0.75	0.68
Transcript_contig_80077 (80077)	0.59	0.54	0.4	0.43	0.45	0.41	0.43	0.73	0.68	1.0	0.76
Transcript_contig_80103 (80103)	0.24	0.06	0.69	0.77	1.0	0.53	0.9	0.04	0.1	0.52	0.33
Transcript_contig_80113 (80113)	0.48	0.5	0.33	0.71	0.99	0.74	0.49	0.53	0.49	0.76	1.0
Transcript_contig_80128 (80128)	0.66	0.77	0.62	0.72	0.79	0.7	0.97	1.0	0.17	0.67	0.47
Transcript_contig_80167 (80167)	0.25	0.06	0.58	0.49	0.68	1.0	0.92	0.05	0.01	0.88	0.34
Transcript_contig_80186 (80186)	0.4	0.33	0.86	0.94	1.0	0.76	0.94	0.44	0.26	0.62	0.47
Transcript_contig_80323 (80323)	0.51	0.53	0.34	0.51	0.62	0.8	0.49	0.69	0.46	1.0	0.94
Transcript_contig_80352 (80352)	0.32	0.02	0.1	0.13	0.14	0.18	0.13	0.02	1.0	0.81	0.7
Transcript_contig_80362 (80362)	0.23	0.06	0.75	0.87	1.0	0.52	0.99	0.04	0.07	0.04	0.18
Transcript_contig_80407 (80407)	0.28	0.02	0.66	0.83	0.7	0.5	1.0	0.01	0.3	0.34	0.24
Transcript_contig_80427 (80427)	0.63	0.74	0.51	0.83	1.0	0.56	0.92	0.9	0.14	0.39	0.34
Transcript_contig_80623 (80623)	0.6	0.33	0.16	0.09	0.15	0.22	0.18	0.06	0.74	1.0	0.97
Transcript_contig_80676 (80676)	0.24	0.09	0.09	0.1	0.13	0.4	0.12	0.08	1.0	0.45	0.63
Transcript_contig_89359 (89359)	0.47	0.46	0.61	1.0	0.96	0.46	0.51	0.49	0.32	0.77	0.56
Transcript_contig_89530 (89530)	0.72	0.91	0.46	0.63	0.92	0.65	0.66	0.97	0.17	1.0	0.68
Transcript_contig_89772 (89772)	0.28	0.23	0.26	0.23	0.13	0.11	0.27	0.25	1.0	0.24	0.18
Transcript_contig_89827 (89827)	0.05	0.05	0.09	0.51	1.0	0.13	0.11	0.03	0.03	0.43	0.26
Transcript_contig_89831 (89831)	0.97	0.74	0.36	1.0	0.88	0.72	0.92	0.4	0.21	0.87	0.42
Transcript_contig_89990 (89990)	0.35	0.35	0.15	0.28	0.33	0.46	0.23	0.39	1.0	0.69	0.51
Transcript_contig_90013 (90013)	0.58	0.45	0.63	0.73	1.0	0.54	0.68	0.49	0.7	0.91	0.68
Transcript_contig_90531 (90531)	0.43	0.34	0.43	0.66	0.75	0.65	0.58	0.45	0.63	1.0	0.7
Transcript_contig_90584 (90584)	0.26	0.07	0.1	0.13	0.12	0.14	0.16	0.08	1.0	0.38	0.4
Transcript_contig_90604 (90604)	0.38	0.37	0.53	0.61	1.0	0.88	0.8	0.45	0.32	0.47	0.76
Transcript_contig_90650 (90650)	0.47	0.39	0.7	0.76	1.0	0.74	0.84	0.5	0.29	0.81	0.63

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)