Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1699 (1699)	1.0	1.0	0.35	0.44	0.5	0.32	0.45	0.51	0.61	0.35	0.22
Transcript_contig_3462 (3462)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_47287 (47287)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97
Transcript_contig_4745 (4745)	0.35	0.46	0.38	0.59	0.59	1.0	0.64	0.33	0.7	0.72	0.5
Transcript_contig_50928 (50928)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_50962 (50962)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.56	0.72
Transcript_contig_50976 (50976)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_51022 (51022)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.51	1.0
Transcript_contig_51025 (51025)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_51047 (51047)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_51050 (51050)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_51103 (51103)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.32
Transcript_contig_51131 (51131)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_51215 (51215)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_51232 (51232)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_51260 (51260)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0
Transcript_contig_51731 (51731)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	1.0	0.98
Transcript_contig_53952 (53952)	0.99	1.0	0.25	0.76	0.68	0.41	0.48	0.33	0.13	0.71	0.47
Transcript_contig_54232 (54232)	0.51	0.49	0.43	0.7	1.0	0.24	0.59	0.5	0.1	0.26	0.23
Transcript_contig_54315 (54315)	0.3	0.17	0.47	1.0	0.89	0.43	0.6	0.21	0.19	0.56	0.43
Transcript_contig_54515 (54515)	0.66	0.86	0.1	0.73	0.44	0.25	0.65	1.0	0.12	0.73	0.49
Transcript_contig_54717 (54717)	0.98	1.0	0.09	0.27	0.4	0.27	0.43	0.39	0.15	0.42	0.25
Transcript_contig_55201 (55201)	0.45	0.43	0.53	0.82	1.0	0.45	0.45	0.45	0.68	0.71	0.52
Transcript_contig_55658 (55658)	0.15	0.18	0.84	0.24	0.0	0.9	0.04	0.06	0.07	0.24	1.0
Transcript_contig_55901 (55901)	0.37	0.36	0.35	0.46	0.49	0.56	0.23	0.14	0.13	1.0	0.62
Transcript_contig_56407 (56407)	0.38	0.31	0.3	0.75	1.0	0.45	0.81	0.39	0.21	0.33	0.32
Transcript_contig_56571 (56571)	0.53	0.35	0.56	0.69	0.87	0.62	0.59	0.22	0.65	1.0	0.81
Transcript_contig_56715 (56715)	0.54	0.55	0.41	0.71	1.0	0.64	0.7	0.39	0.55	0.98	0.75
Transcript_contig_57158 (57158)	0.46	0.38	0.42	0.7	1.0	0.33	0.78	0.3	0.29	0.26	0.27
Transcript_contig_57806 (57806)	0.73	0.92	0.21	0.69	1.0	0.6	0.33	0.91	0.15	0.88	0.62
Transcript_contig_57996 (57996)	0.01	0.01	1.0	0.65	0.32	0.16	0.1	0.0	0.0	0.0	0.2
Transcript_contig_58011 (58011)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33
Transcript_contig_58043 (58043)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_58057 (58057)	0.9	1.0	0.27	0.35	0.37	0.4	0.28	0.48	0.17	0.42	0.29
Transcript_contig_58561 (58561)	0.88	1.0	0.4	0.77	0.82	0.24	0.56	0.93	0.45	0.26	0.29
Transcript_contig_58645 (58645)	0.3	0.41	0.33	0.49	0.62	0.44	0.34	0.77	1.0	0.93	0.77
Transcript_contig_58662 (58662)	0.38	0.31	0.12	0.08	0.06	0.33	0.37	0.15	1.0	0.38	0.11
Transcript_contig_59040 (59040)	0.49	0.59	0.52	0.81	0.98	0.46	0.5	1.0	0.92	0.55	0.56
Transcript_contig_59101 (59101)	0.38	0.12	0.51	0.81	0.96	0.66	0.54	0.08	0.6	1.0	0.86
Transcript_contig_59158 (59158)	0.7	0.78	0.5	0.85	1.0	0.65	0.4	0.5	0.4	0.8	0.62
Transcript_contig_59166 (59166)	0.42	0.41	0.23	0.42	0.51	0.36	0.2	0.54	0.69	1.0	0.86
Transcript_contig_59182 (59182)	0.52	0.27	0.37	1.0	0.64	0.46	0.76	0.21	0.27	0.73	0.55
Transcript_contig_59277 (59277)	0.61	1.0	0.54	0.33	0.65	0.38	0.61	0.38	0.03	0.47	0.29
Transcript_contig_59457 (59457)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_59763 (59763)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.06	0.92
Transcript_contig_60797 (60797)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61082 (61082)	0.0	0.0	0.12	0.78	1.0	0.18	0.03	0.0	0.0	0.09	0.0
Transcript_contig_61152 (61152)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61198 (61198)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61493 (61493)	0.74	1.0	0.02	0.23	0.25	0.35	0.23	0.71	0.06	0.2	0.12
Transcript_contig_61711 (61711)	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_61717 (61717)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.51	1.0
Transcript_contig_6294 (6294)	0.58	1.0	0.05	0.32	0.31	0.37	0.15	0.59	0.07	0.28	0.31
Transcript_contig_65413 (65413)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65949 (65949)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.98
Transcript_contig_65954 (65954)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_65963 (65963)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65994 (65994)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66009 (66009)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66014 (66014)	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33
Transcript_contig_66028 (66028)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67417 (67417)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67419 (67419)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67420 (67420)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67708 (67708)	0.49	1.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.04	0.49	0.0	0.17	0.13
Transcript_contig_67899 (67899)	0.32	0.18	0.19	0.36	0.48	0.58	0.31	0.17	0.5	1.0	0.99
Transcript_contig_68036 (68036)	0.01	0.02	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.01
Transcript_contig_68674 (68674)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_68775 (68775)	0.05	0.02	1.0	0.25	0.08	0.59	0.04	0.01	0.12	0.01	0.53
Transcript_contig_68815 (68815)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	1.0	0.4
Transcript_contig_69252 (69252)	1.0	0.78	0.2	0.85	0.98	0.3	0.64	0.38	0.4	0.48	0.41
Transcript_contig_69551 (69551)	0.42	0.36	0.12	0.36	0.25	0.37	0.22	0.43	1.0	0.87	0.73
Transcript_contig_69782 (69782)	0.19	0.34	0.23	0.34	0.43	0.47	1.0	0.54	0.03	0.59	0.39
Transcript_contig_69853 (69853)	0.27	0.18	0.5	0.73	1.0	0.21	0.35	0.08	0.62	0.1	0.13
Transcript_contig_69876 (69876)	0.04	0.04	0.15	0.03	0.0	1.0	0.01	0.01	0.12	0.09	0.89
Transcript_contig_70305 (70305)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_72719 (72719)	0.17	0.0	0.81	1.0	0.92	0.71	0.64	0.0	0.43	0.83	0.88
Transcript_contig_74344 (74344)	0.53	0.0	0.99	1.0	0.17	0.49	0.66	0.0	0.19	0.36	0.59
Transcript_contig_76051 (76051)	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.95	0.01	0.0	0.02	1.0	0.86
Transcript_contig_77679 (77679)	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	1.0	0.19
Transcript_contig_77690 (77690)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_78196 (78196)	0.46	0.27	0.15	1.0	0.92	0.13	0.66	0.01	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_78322 (78322)	0.58	0.3	0.24	0.71	0.77	0.74	0.77	0.34	0.86	1.0	0.93
Transcript_contig_78586 (78586)	0.93	1.0	0.17	0.51	0.87	0.49	0.39	0.49	0.12	0.82	0.54
Transcript_contig_79146 (79146)	0.59	0.92	0.57	0.78	0.96	0.4	0.59	1.0	0.46	0.53	0.55
Transcript_contig_79203 (79203)	0.47	0.29	0.43	0.71	0.99	0.35	0.38	0.34	1.0	0.59	0.7
Transcript_contig_79456 (79456)	0.01	0.01	0.09	0.32	1.0	0.22	0.26	0.01	0.0	0.01	0.04
Transcript_contig_79533 (79533)	0.39	0.18	0.38	0.68	0.82	0.57	0.51	0.18	0.29	1.0	0.85
Transcript_contig_79641 (79641)	0.89	1.0	0.26	0.12	0.12	0.08	0.35	0.32	0.0	0.28	0.4
Transcript_contig_79817 (79817)	0.87	1.0	0.1	0.25	0.32	0.36	0.45	0.46	0.09	0.35	0.2
Transcript_contig_79847 (79847)	0.88	0.63	0.42	0.9	1.0	0.46	0.93	0.26	0.52	0.38	0.38
Transcript_contig_79968 (79968)	0.05	0.01	0.25	0.12	0.04	0.91	0.02	0.0	0.04	0.92	1.0
Transcript_contig_79980 (79980)	0.03	0.0	0.44	0.26	0.06	0.96	0.07	0.0	0.01	0.07	1.0
Transcript_contig_79982 (79982)	0.23	0.12	0.45	0.69	0.77	0.47	0.38	0.1	0.28	1.0	0.93
Transcript_contig_80079 (80079)	0.15	0.0	1.0	0.57	0.8	0.2	0.18	0.0	0.21	0.33	0.49
Transcript_contig_80207 (80207)	0.17	0.04	0.4	1.0	0.88	0.27	0.66	0.01	0.02	0.85	0.74
Transcript_contig_80250 (80250)	0.08	0.0	0.1	0.08	0.15	0.47	0.17	0.0	0.0	1.0	0.37
Transcript_contig_80276 (80276)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_80504 (80504)	0.0	0.0	0.0	0.22	1.0	0.27	0.0	0.0	0.08	0.1	0.03
Transcript_contig_80751 (80751)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	1.0	0.32
Transcript_contig_80756 (80756)	0.01	0.0	0.1	0.32	1.0	0.29	0.02	0.0	0.01	0.03	0.21
Transcript_contig_80868 (80868)	0.0	0.0	0.02	0.22	1.0	0.08	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01
Transcript_contig_80958 (80958)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81052 (81052)	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81534 (81534)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_81555 (81555)	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.68	1.0	0.5
Transcript_contig_81677 (81677)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81691 (81691)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_81823 (81823)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.2
Transcript_contig_85864 (85864)	0.16	0.59	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.8	1.0
Transcript_contig_88821 (88821)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_89227 (89227)	0.13	0.02	0.61	0.78	1.0	0.66	0.71	0.02	0.01	0.59	0.43
Transcript_contig_89287 (89287)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_89311 (89311)	0.49	0.23	0.36	0.66	0.66	0.48	0.44	0.27	0.73	1.0	0.83
Transcript_contig_89394 (89394)	0.94	0.93	0.31	0.55	0.47	0.98	0.75	0.36	1.0	0.51	0.31
Transcript_contig_89419 (89419)	0.89	1.0	0.45	0.5	0.62	0.32	0.79	0.96	0.39	0.44	0.26
Transcript_contig_89482 (89482)	0.88	0.6	0.49	0.77	1.0	0.35	0.74	0.21	0.56	0.51	0.4
Transcript_contig_89604 (89604)	0.69	0.56	0.75	0.95	0.81	0.71	1.0	0.3	0.55	0.43	0.47
Transcript_contig_89636 (89636)	0.87	0.83	0.49	0.59	0.7	0.82	0.45	0.25	0.17	1.0	0.71
Transcript_contig_89857 (89857)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_89946 (89946)	0.43	0.6	0.2	0.46	0.58	0.97	0.32	0.41	0.03	1.0	0.66
Transcript_contig_90153 (90153)	0.34	0.47	0.48	0.57	1.0	0.34	0.53	0.5	0.47	0.48	0.27
Transcript_contig_90844 (90844)	0.0	0.0	0.05	0.18	1.0	0.06	0.28	0.0	0.0	0.01	0.0
Transcript_contig_90904 (90904)	0.2	0.15	0.48	1.0	0.93	0.7	0.68	0.1	0.14	0.4	0.51
Transcript_contig_91026 (91026)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_91073 (91073)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_91126 (91126)	0.64	0.0	0.37	0.31	0.29	0.0	1.0	0.0	0.33	0.61	0.26
Transcript_contig_91373 (91373)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_91384 (91384)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_91539 (91539)	0.49	1.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.62	0.51	0.0	0.26	0.0
Transcript_contig_91606 (91606)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_9458 (9458)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	1.0	0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)