Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.4 0.38 0.22 -0.2 -0.08 -0.58 0.11 0.55 0.15 -1.31 -0.41 -0.12
0.46 0.23 0.62 -0.26 -0.02 0.13 -0.57 0.17 -0.12 -0.39 -0.39 -0.41
0.66 0.96 0.46 0.17 -0.59 -1.09 -1.29 0.53 -0.59 0.55 -3.48 -0.37
1.47 0.28 0.76 -0.48 -0.99 -0.25 -0.53 0.17 -0.03 -2.14 -0.68 -0.7
1.1 0.69 0.62 0.2 -0.49 -0.31 -0.66 0.08 -0.01 -1.01 -1.0 -1.53
0.78 0.34 0.32 -0.2 -0.11 0.23 -1.07 0.07 0.11 -0.68 -0.75 -0.04
0.77 0.74 0.89 -0.26 -0.49 -0.49 -1.35 0.1 0.13 -0.6 -0.28 -1.12
1.18 0.23 0.48 -0.05 -0.3 -0.5 0.23 0.35 -0.34 -1.15 -2.41 -0.32
-0.77 -0.57 0.21 -1.03 0.39 -0.3 0.71 0.2 0.03 0.04 0.33 -0.18
-0.15 0.64 -0.6 0.78 0.34 -0.4 -0.41 0.4 -0.43 -0.57 -0.28 -0.27
1.02 0.45 0.71 0.28 -0.42 0.26 -0.34 -0.26 -0.56 -0.89 -0.76 -1.4
0.58 0.76 -0.03 -0.22 -0.29 0.03 -0.86 -0.17 -0.53 -1.0 0.27 0.37
0.33 -0.07 0.35 -0.19 0.11 -0.02 0.01 0.05 -0.06 -0.53 -0.63 0.31
1.41 0.22 0.77 -0.3 -1.07 0.22 -0.87 0.09 -0.2 -1.66 -0.91 -0.56
0.89 0.23 0.48 -0.12 0.06 0.12 -1.85 -0.15 -0.87 -0.24 -0.5 0.33
0.64 0.57 0.24 0.53 -0.02 -0.34 -1.43 0.08 -0.4 -0.53 -0.08 -0.44
-0.08 0.6 -1.0 0.31 0.52 -1.25 -0.54 1.0 0.31 -0.76 -1.05 -0.07
-0.4 0.74 -0.34 -0.03 0.43 -0.97 -0.23 0.55 -0.22 -0.96 0.27 0.08
1.33 0.75 0.68 -0.0 -0.86 -0.16 -0.73 0.32 -0.49 0.09 -3.37 -5.04
0.48 0.35 0.3 0.24 0.03 -0.17 -0.2 0.11 -0.26 -0.45 -0.61 -0.27
1.37 0.89 -0.34 0.29 -0.58 -1.77 -1.69 0.41 -0.52 -1.89 0.69 -1.45
0.25 0.28 0.12 0.42 -0.14 -0.3 -1.04 -0.09 0.0 -0.4 -0.7 0.72
0.56 -0.07 0.26 0.08 -0.53 -0.25 -0.33 -0.07 -0.25 -0.84 0.68 0.04
-0.04 -0.19 -0.48 -0.88 -0.6 -1.01 -0.57 0.99 0.62 0.11 1.03 -1.29
0.12 0.6 -0.18 1.25 0.14 -0.64 -0.29 -0.17 -0.52 -1.23 -0.09 -0.69
1.07 0.39 0.53 0.19 -0.59 0.16 -0.4 -0.32 -0.59 -1.23 -0.64 -0.11
-0.18 -0.44 -0.5 0.29 -0.52 -0.66 -0.62 0.55 0.33 -0.55 0.72 0.49
-0.58 0.48 -2.5 0.13 0.61 -0.43 -0.12 0.98 1.07 -1.28 -1.19 -0.85
0.75 0.77 0.07 0.14 0.05 -0.34 -0.23 0.04 0.09 -1.24 -0.7 -0.61
1.01 0.71 0.38 0.25 -0.26 -0.42 -0.86 0.46 -0.25 -0.13 -1.43 -2.21
0.16 0.36 0.06 -0.08 0.25 0.28 -0.38 -0.1 -0.26 -0.76 -0.24 0.3
0.4 0.15 0.26 0.1 -0.06 -0.13 -0.14 0.16 0.17 -0.54 -0.19 -0.47
0.96 0.43 0.48 0.41 -0.82 0.42 -1.93 -0.33 -0.43 -1.35 0.47 -1.02
1.49 0.31 0.31 -0.05 -0.41 -1.05 -0.1 -0.52 -1.15 -1.63 0.93 -2.33
0.32 0.97 -0.63 0.56 -0.01 -0.19 -0.36 -0.34 -1.04 -3.07 1.0 -0.67
-0.05 0.36 -0.29 -0.34 -0.36 -0.7 -1.37 0.83 0.88 -1.13 0.73 -0.68
0.37 0.44 0.11 -0.02 -0.21 -0.18 -1.34 0.08 -0.42 -0.21 -0.49 0.81
1.27 0.31 0.39 -0.33 -0.34 -0.04 -0.05 -0.05 -0.16 -1.26 -0.49 -0.96
0.52 0.59 0.2 0.59 -0.1 -0.21 -0.99 -0.18 -0.39 -1.42 -0.38 0.39
0.47 0.3 0.11 0.29 -0.34 -0.16 -0.26 -0.01 -0.11 -0.52 0.53 -0.99
1.23 0.23 0.38 -0.33 -1.03 0.24 -1.1 0.15 0.01 -0.62 -0.79 -0.18
0.72 0.3 0.26 -0.19 -0.13 0.1 -0.96 -0.09 -0.49 -1.02 0.05 0.46
1.24 0.06 0.18 -0.23 -0.99 0.35 -2.15 -0.19 -0.22 -1.34 -0.78 0.92
0.79 0.63 0.3 -0.0 -0.19 -0.04 -1.15 -0.1 -0.45 -0.82 -0.48 0.32
0.41 0.28 -0.61 0.01 -0.05 -0.81 -0.45 0.59 0.29 -0.64 0.21 0.01
1.1 0.2 0.7 -0.44 -0.36 0.62 -1.29 -0.0 -0.14 -0.8 -0.46 -1.26
0.8 0.23 0.44 0.31 -0.12 0.35 -1.17 -0.2 0.05 -1.2 -1.07 0.06
-0.17 0.7 0.18 0.26 0.58 0.17 -0.85 0.44 -1.2 -0.07 -0.85 -0.56
0.64 0.35 0.72 0.5 -0.2 -0.21 -0.95 0.05 -0.51 -0.81 -0.28 -0.46
0.87 0.27 0.7 -0.78 -0.38 -0.07 -0.87 0.38 0.21 -0.61 -0.13 -1.11
0.43 0.62 -0.24 0.38 0.28 -0.75 -0.71 0.46 -0.13 -0.99 -0.05 -0.32
-1.47 0.35 -2.34 1.12 0.46 -3.13 -0.4 0.84 0.23 0.23 -1.48 0.34
-1.21 -0.36 -2.02 0.26 1.24 -1.78 -0.0 0.85 0.35 0.49 -0.73 -0.7
-4.09 0.38 -4.92 0.27 -0.12 -1.62 0.88 1.67 1.2 -3.66 -0.97 -2.1
0.58 0.37 0.61 0.1 0.04 -0.0 -0.19 0.1 -0.34 -0.63 -0.78 -0.68
0.63 0.34 0.52 -0.01 -0.14 -0.04 -0.22 -0.09 -0.16 -0.46 -0.53 -0.39
0.1 0.72 -0.68 0.58 0.37 -0.78 -0.13 0.02 -0.71 -0.64 0.59 -0.75
0.18 0.14 0.01 0.14 0.15 -0.42 0.08 0.01 -0.27 -0.42 0.32 -0.14
1.41 0.47 0.88 0.22 -1.49 -0.1 -0.83 -0.25 -0.63 -0.48 -1.87 -0.69
-0.4 0.39 -0.9 1.02 0.62 -2.16 0.22 0.85 -1.55 -0.24 0.27 -2.06
0.47 0.33 0.43 0.18 -0.06 0.0 -0.75 0.08 -0.32 -0.4 -0.35 -0.11
0.37 0.66 0.28 0.48 -0.45 -0.17 -0.76 0.16 -0.25 -0.68 -0.31 -0.12
0.71 0.24 0.05 0.6 -0.6 -0.22 -0.33 -0.07 -0.13 -1.06 -0.12 0.07
1.4 0.61 0.14 0.19 -1.28 -0.47 -1.86 -0.48 -0.91 -2.35 1.2 -1.2
0.91 0.33 0.69 0.16 -0.37 -0.03 -0.36 0.11 -0.26 -0.56 -1.85 -0.43
0.41 0.26 0.33 0.33 -0.5 -0.16 -1.49 0.41 0.05 -0.58 0.12 -0.18
-0.02 -0.05 -0.66 0.52 0.08 -0.84 -1.6 0.74 1.16 -0.82 -0.96 0.06
0.64 0.47 0.28 -0.07 -0.28 0.14 -0.99 0.13 -0.02 -0.58 -0.32 -0.16
1.12 -1.3 0.44 -1.65 -1.43 0.1 -2.72 0.75 0.61 -1.19 1.21 -2.46
0.85 1.15 0.27 0.72 -0.58 -0.27 -0.15 -0.34 -1.26 -1.67 -0.3 -1.3
0.38 0.49 0.06 0.41 -0.06 -0.37 -0.92 0.48 -0.22 -0.51 -0.39 -0.08
0.74 0.25 0.12 -0.51 -0.52 0.08 -0.94 0.03 -0.37 0.8 -0.44 -0.3
0.98 0.46 0.51 -0.01 -0.6 -0.2 -0.69 0.01 -0.26 -0.26 -1.38 0.05
0.36 0.39 -0.01 0.29 -0.26 -0.35 -0.09 -0.06 0.01 -0.95 -0.19 0.35
0.06 0.18 0.82 -0.62 0.31 -0.06 -0.22 -0.35 -0.61 -0.37 -0.36 0.44
0.65 0.37 1.19 0.54 -0.29 -0.14 -1.13 -0.23 -0.76 -1.24 -0.1 -1.26
0.91 0.34 0.28 0.25 -0.37 0.0 -0.75 0.06 -0.51 -0.86 -0.06 -0.27
0.2 0.25 0.26 0.31 0.14 -0.11 0.16 0.02 -0.18 -0.4 -0.61 -0.39
0.64 0.38 0.27 -0.22 -0.18 0.3 -0.54 -0.1 -0.39 -0.92 0.22 -0.16
1.12 0.19 0.58 0.13 -0.79 0.31 -0.22 -0.41 -0.53 -0.68 -0.42 -0.77
0.67 0.07 0.11 -0.06 -0.17 -0.13 -0.19 -0.05 0.08 -0.87 -0.3 0.33
0.73 0.07 0.52 0.11 -0.34 0.02 -0.05 -0.16 -0.18 -0.79 -0.55 -0.05
0.57 0.5 0.37 -0.15 -0.02 -0.75 -0.43 0.36 -0.13 -0.28 -0.04 -0.79
-0.4 -0.01 -1.49 -0.69 -0.0 -2.76 -0.5 0.77 0.95 -0.78 1.22 -0.21
-0.11 0.39 -1.14 -0.76 -0.21 -3.19 -0.68 0.96 1.19 -0.87 0.87 -0.95
0.94 0.33 0.31 0.22 -0.19 0.04 -0.32 -0.32 -0.49 -1.23 0.15 -0.58
0.81 0.51 0.17 -0.19 0.16 0.15 -1.89 0.03 -0.73 -0.61 -0.14 0.18
1.0 0.38 0.2 -0.25 -0.29 0.02 -1.02 0.14 0.16 -0.49 -0.15 -0.83
0.77 0.85 0.15 0.66 -0.09 -0.42 0.01 0.18 -0.3 -1.41 -0.99 -1.78
0.55 0.17 0.41 -0.04 -0.1 -0.04 -0.01 0.06 0.02 -0.53 -0.75 -0.21
0.68 0.34 0.39 -0.39 -0.56 0.26 -1.02 0.14 -0.09 -0.56 -0.01 -0.02
-1.1 -0.59 0.31 -0.24 0.22 -0.82 0.8 0.37 -0.14 -0.08 0.37 -0.21
0.95 0.62 0.19 0.22 -0.48 -0.2 -0.76 0.28 -0.62 -1.13 -0.03 -0.43
0.66 0.33 0.56 0.08 -0.44 -0.28 -0.98 0.04 0.46 -0.77 -0.45 -0.26
0.61 0.25 0.65 -0.15 -0.31 -0.04 0.28 -0.17 0.0 -1.2 -0.45 -0.38
0.62 0.5 0.28 0.49 -0.24 -0.09 -0.95 0.26 -0.42 -0.72 -0.17 -0.52
0.87 0.16 0.43 0.24 -0.61 -0.35 -0.25 0.28 0.11 -0.9 0.01 -1.27
0.13 -0.22 1.01 0.09 -1.39 -0.2 0.08 -0.93 -0.39 -4.63 0.85 0.61
-0.02 -0.02 0.0 -0.05 -0.12 -0.23 0.22 0.32 0.35 -0.33 -0.27 -0.04
0.88 0.36 0.78 -0.28 -0.05 -0.02 -0.04 -0.0 0.13 -1.05 -0.99 -1.63
1.09 -0.09 1.41 0.06 0.05 -0.17 -1.51 -0.52 -0.51 -1.0 -1.23 -0.67
0.59 0.54 -0.24 0.57 -0.45 -0.51 -0.45 -0.0 -0.61 0.59 -0.61 -0.47
0.81 -0.1 0.54 -0.89 -0.17 0.44 -1.87 0.41 0.12 -0.88 -0.2 -0.04
0.27 0.35 0.74 0.54 -0.25 0.19 -0.5 -0.22 -0.48 -0.43 -0.18 -0.99
0.17 0.52 0.08 -0.01 0.13 -0.03 -0.89 -0.29 -0.58 -0.62 0.16 0.61
0.6 0.1 0.64 -0.02 -0.06 0.09 -0.03 -0.26 -0.18 -0.7 -0.51 -0.28
0.37 0.31 1.14 0.53 -0.21 -0.14 -1.04 -0.13 -0.17 -0.86 -0.91 -0.6
0.19 0.56 -0.27 0.66 0.44 -0.57 -0.71 0.19 -0.98 -0.53 0.48 -0.77
0.66 0.12 0.65 0.29 -0.17 -0.16 0.17 0.06 -0.14 -0.74 -0.76 -1.05
0.1 0.49 0.0 0.68 -0.15 -0.2 -0.92 0.08 -0.04 -0.58 -0.32 0.17
0.87 0.37 0.48 0.36 -1.18 -0.48 -0.85 0.2 -0.02 -1.57 0.47 -0.66
0.19 0.41 0.92 0.66 -0.24 -0.31 -0.01 0.31 -0.09 -1.87 -1.16 -0.96
0.01 0.09 2.4 0.6 -1.54 -0.44 -2.71 -0.97 -1.04 -2.66 -2.23 -0.85
0.41 0.29 -0.07 0.15 -0.41 -0.35 -1.0 0.5 0.08 -0.51 0.05 0.18
1.14 0.66 0.7 0.06 -0.81 -0.0 -0.78 -0.01 -0.23 -1.21 -0.55 -1.16
0.6 0.34 0.63 0.29 -0.24 -0.04 -0.26 -0.25 -0.32 -1.36 0.22 -0.73
0.96 0.2 0.52 0.23 -0.46 -0.28 -0.32 0.05 -0.04 -1.42 -0.04 -0.78
0.92 0.72 0.94 -0.28 -0.45 -0.12 -1.04 0.21 -0.43 -0.27 -1.91 -0.77
1.0 0.67 0.27 -0.02 -0.34 0.02 -0.92 -0.38 -0.31 -1.5 0.04 -0.1
1.2 0.46 0.62 -0.21 -1.21 -0.09 -1.27 0.13 0.46 -1.51 -0.77 -0.45
0.67 0.12 0.67 -0.11 -0.29 0.06 -0.54 0.1 0.19 -0.5 -0.55 -0.61
1.22 0.91 0.59 0.67 -0.66 -0.44 -1.05 -0.19 -0.73 -1.56 -1.33 -0.65
0.56 0.33 0.49 -0.25 -0.42 0.2 -0.68 0.13 -0.17 -0.35 -0.93 0.27
0.48 0.66 0.13 0.46 -0.32 -0.3 -0.27 0.24 -0.15 -1.49 0.01 -0.6
0.91 0.67 0.72 0.42 -0.21 0.22 0.07 -0.35 -0.54 -1.61 -1.32 -1.91
-0.21 -0.02 -0.29 0.64 -0.42 -0.98 -1.44 0.61 0.09 -0.58 1.07 -0.33
0.95 0.44 0.49 0.01 -0.57 0.19 -0.23 -0.14 -0.27 -1.17 -0.03 -1.11
1.02 0.15 0.72 -0.59 -0.65 0.19 -0.53 0.13 0.01 -1.5 0.03 -0.74
-0.13 -0.2 -0.11 0.04 -0.55 -0.67 -1.01 0.45 0.36 -0.58 0.59 0.7
0.39 -0.1 0.09 0.37 -0.29 -0.11 -1.59 0.16 0.12 -0.92 0.81 -0.26
-0.13 0.37 -1.03 0.52 0.03 0.43 -0.03 0.23 0.2 -1.56 0.04 -0.27
1.1 0.24 0.53 -0.12 -1.42 0.06 -0.7 -0.11 -0.22 -0.84 -0.23 0.1
0.93 0.36 0.53 -0.0 -0.5 -0.25 -0.98 -0.08 -0.27 -0.12 -1.91 0.44
-0.83 0.76 -2.0 0.13 1.17 -3.24 -1.21 0.43 0.15 0.1 0.41 -0.42
0.33 0.47 0.05 0.22 0.48 -0.37 -0.87 0.23 -0.33 0.1 -0.52 -0.51
-0.11 0.72 -0.73 0.82 0.39 -0.34 -0.01 0.15 -1.0 -0.62 -0.04 -0.46
-1.27 1.23 -2.15 0.8 0.84 -1.85 -0.03 0.8 -0.78 -0.07 -0.38 -2.34
-0.87 0.99 -1.47 0.62 0.77 -2.03 0.39 0.65 -0.59 -0.11 -0.19 -1.87
0.13 0.52 0.11 0.39 -0.32 0.15 -0.52 0.33 0.08 -0.68 -0.65 -0.17
1.46 0.84 0.99 0.11 -1.23 -0.17 -0.89 -0.22 -0.68 -1.45 -2.31 -1.02
0.73 0.6 0.16 0.41 -0.58 0.03 -0.24 -0.04 -0.4 -0.57 -0.73 -0.26
0.99 -0.17 0.39 -0.13 -0.57 0.38 -1.35 -0.02 -0.07 -1.13 0.39 -0.28
0.71 0.2 0.4 -0.52 -0.62 0.28 -1.44 -0.22 -0.38 -0.96 0.05 0.84
0.55 0.2 0.22 0.63 -0.01 -0.22 -0.85 -0.22 -0.71 -1.02 0.32 0.07
0.2 0.53 -0.0 0.45 0.12 -0.85 -0.9 0.45 0.08 -0.71 -0.36 0.05
1.07 -0.01 0.39 -0.47 -0.39 0.39 -0.69 0.2 0.07 -1.16 -0.19 -0.59
0.99 0.49 0.69 0.21 -0.35 0.17 -0.45 -0.26 -0.54 -1.21 -0.4 -1.09
0.62 0.64 0.88 -0.12 -0.46 -0.18 -1.35 0.73 0.18 -0.16 -2.04 -2.27
0.8 0.1 0.46 0.23 -0.13 0.07 0.13 -0.43 -0.54 -1.09 -0.98 0.22
0.95 0.86 0.8 0.13 -0.95 -0.04 -0.61 -0.42 -0.79 -1.34 -0.66 -0.11
-0.35 -0.22 -0.51 0.36 -0.07 -1.46 -1.11 0.44 0.07 0.07 0.66 0.64
1.33 0.75 0.78 -0.06 -0.74 -0.3 -0.49 0.15 0.02 -0.44 -3.23 -5.36
1.29 0.6 0.81 -0.07 -0.82 -0.21 -0.38 -0.03 0.04 0.03 -3.51 -6.71
-0.05 0.51 1.03 -0.41 -0.16 -0.05 -0.55 0.01 -0.12 -0.7 -0.33 -0.09
1.39 0.47 0.95 0.14 -1.23 0.16 -0.15 -0.84 -1.05 -2.12 -0.12 -1.66
-0.87 0.62 -1.55 0.81 -0.15 -1.21 -0.6 0.6 -0.4 0.41 -0.01 0.31
0.47 0.2 0.31 0.46 -0.97 -0.15 -1.75 0.14 0.32 -0.64 0.08 0.14
0.74 0.07 0.69 -0.24 -0.43 0.24 -0.08 0.09 -0.07 -0.41 -1.23 -0.42
0.38 0.08 0.29 -0.09 -0.17 -0.2 0.34 -0.23 -0.37 -0.42 0.22 -0.13
0.24 -0.34 0.25 -0.89 -0.04 -0.08 0.23 0.05 -0.43 -0.31 0.43 0.35
0.75 0.83 -0.12 0.17 -0.27 -0.23 -1.35 -0.51 -0.22 -0.81 0.41 -0.05
0.59 0.39 0.15 -0.01 -0.25 0.18 -1.71 -0.01 -0.66 -0.34 -0.31 0.66
0.86 0.64 0.77 -0.14 -0.24 -0.31 -1.07 0.13 -0.09 -1.44 -0.81 -0.14
1.21 0.5 0.07 0.11 -0.82 -0.07 -0.73 0.12 -0.04 -1.28 -0.22 -0.5
0.77 0.42 1.09 -0.21 -0.55 0.06 -1.31 -0.13 -0.12 -0.09 -0.98 -0.81
0.84 0.45 0.3 0.08 -0.34 0.17 -0.72 0.02 -0.28 -0.98 -0.41 -0.09
-0.25 -0.41 -3.01 -1.19 1.12 -1.12 0.09 1.57 0.48 -0.65 0.16 -4.97
0.58 0.43 1.12 0.23 -0.34 0.12 -0.36 -0.23 -0.41 -0.87 -0.59 -1.57
0.65 0.66 0.39 0.32 -0.26 -1.76 -0.65 0.4 -0.05 -0.69 -2.61 0.55
1.16 -0.01 0.81 -0.55 -0.36 0.49 -0.31 0.38 -0.01 -0.98 -1.42 -2.67
0.31 0.44 0.38 0.25 0.38 -0.19 -1.13 0.4 -0.41 -0.72 0.09 -0.92
0.26 -0.07 -0.47 0.03 -0.71 -0.42 -0.25 0.33 -0.26 -0.89 0.88 0.54
-0.16 0.42 -0.33 0.05 -0.11 -0.37 -1.71 0.6 -0.19 -0.73 1.22 -0.73

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.