1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
12pM Fe,Midday
12pM Fe,Midnight
58pM Fe,Midday
58pM Fe,Midnight
233pM Fe,Midnight
1160pM Fe,Midday
1160pM Fe,Midnight
High carbon,Dark
High carbon,Light
Low carbon,Dark
Phloroglucinol
Silicon starvation,12h
0.9 0.88 0.79 0.59 0.64 0.46 0.73 1.0 0.76 0.28 0.51 0.63
0.89 0.76 1.0 0.54 0.64 0.71 0.44 0.73 0.6 0.5 0.5 0.49
0.81 1.0 0.71 0.58 0.34 0.24 0.21 0.74 0.34 0.75 0.05 0.4
1.0 0.44 0.61 0.26 0.18 0.3 0.25 0.41 0.36 0.08 0.23 0.22
1.0 0.75 0.72 0.54 0.33 0.38 0.29 0.49 0.46 0.23 0.23 0.16
1.0 0.74 0.73 0.51 0.54 0.68 0.28 0.61 0.63 0.36 0.35 0.57
0.92 0.9 1.0 0.45 0.38 0.38 0.21 0.58 0.59 0.35 0.44 0.25
1.0 0.52 0.61 0.43 0.36 0.31 0.51 0.56 0.35 0.2 0.08 0.35
0.36 0.41 0.71 0.3 0.8 0.5 1.0 0.7 0.62 0.63 0.77 0.54
0.52 0.9 0.38 1.0 0.74 0.44 0.44 0.77 0.43 0.39 0.48 0.48
1.0 0.67 0.81 0.6 0.37 0.59 0.39 0.41 0.33 0.27 0.29 0.19
0.89 1.0 0.58 0.51 0.48 0.6 0.33 0.53 0.41 0.29 0.71 0.76
0.98 0.75 1.0 0.69 0.84 0.77 0.79 0.81 0.75 0.54 0.51 0.97
1.0 0.44 0.64 0.3 0.18 0.44 0.21 0.4 0.33 0.12 0.2 0.25
1.0 0.63 0.75 0.5 0.56 0.58 0.15 0.49 0.29 0.46 0.38 0.68
1.0 0.96 0.76 0.93 0.63 0.51 0.24 0.68 0.49 0.45 0.61 0.47
0.47 0.76 0.25 0.62 0.72 0.21 0.34 1.0 0.62 0.3 0.24 0.48
0.45 1.0 0.47 0.59 0.8 0.3 0.51 0.88 0.51 0.31 0.72 0.63
1.0 0.67 0.64 0.4 0.22 0.36 0.24 0.5 0.28 0.42 0.04 0.01
1.0 0.92 0.89 0.85 0.73 0.64 0.63 0.77 0.6 0.52 0.47 0.6
1.0 0.72 0.3 0.47 0.26 0.11 0.12 0.51 0.27 0.1 0.62 0.14
0.72 0.74 0.66 0.81 0.55 0.49 0.29 0.57 0.61 0.46 0.37 1.0
0.92 0.59 0.75 0.66 0.43 0.52 0.5 0.59 0.53 0.35 1.0 0.64
0.47 0.43 0.35 0.27 0.32 0.24 0.33 0.97 0.75 0.53 1.0 0.2
0.46 0.64 0.37 1.0 0.46 0.27 0.34 0.37 0.29 0.18 0.39 0.26
1.0 0.62 0.69 0.54 0.32 0.53 0.36 0.38 0.32 0.2 0.31 0.44
0.54 0.45 0.43 0.74 0.42 0.38 0.4 0.89 0.77 0.42 1.0 0.86
0.32 0.67 0.08 0.52 0.73 0.35 0.44 0.94 1.0 0.2 0.21 0.27
0.99 1.0 0.62 0.65 0.61 0.46 0.5 0.6 0.63 0.25 0.36 0.39
1.0 0.81 0.65 0.59 0.42 0.37 0.27 0.68 0.42 0.45 0.18 0.11
0.87 1.0 0.81 0.73 0.93 0.94 0.6 0.72 0.65 0.46 0.66 0.96
1.0 0.84 0.91 0.81 0.73 0.69 0.69 0.85 0.85 0.52 0.66 0.55
1.0 0.69 0.72 0.68 0.29 0.69 0.13 0.41 0.38 0.2 0.71 0.25
1.0 0.44 0.44 0.35 0.27 0.17 0.33 0.25 0.16 0.12 0.68 0.07
0.62 0.98 0.32 0.74 0.5 0.44 0.39 0.4 0.24 0.06 1.0 0.31
0.52 0.69 0.44 0.43 0.42 0.33 0.21 0.97 1.0 0.25 0.9 0.34
0.74 0.77 0.62 0.56 0.49 0.5 0.23 0.6 0.43 0.49 0.4 1.0
1.0 0.52 0.54 0.33 0.33 0.4 0.4 0.4 0.37 0.17 0.3 0.21
0.95 1.0 0.76 1.0 0.62 0.57 0.33 0.58 0.51 0.25 0.51 0.87
0.96 0.85 0.75 0.84 0.54 0.62 0.58 0.69 0.64 0.48 1.0 0.35
1.0 0.5 0.55 0.34 0.21 0.5 0.2 0.47 0.43 0.28 0.25 0.38
1.0 0.75 0.73 0.53 0.56 0.65 0.31 0.57 0.43 0.3 0.63 0.84
1.0 0.44 0.48 0.36 0.21 0.54 0.1 0.37 0.36 0.17 0.25 0.8
1.0 0.89 0.71 0.58 0.51 0.56 0.26 0.54 0.42 0.33 0.42 0.72
0.88 0.81 0.44 0.67 0.64 0.38 0.49 1.0 0.81 0.43 0.77 0.67
1.0 0.53 0.75 0.34 0.36 0.71 0.19 0.46 0.42 0.27 0.34 0.19
1.0 0.67 0.78 0.72 0.53 0.73 0.26 0.5 0.6 0.25 0.27 0.6
0.55 1.0 0.7 0.74 0.92 0.69 0.34 0.84 0.27 0.59 0.34 0.42
0.95 0.77 1.0 0.86 0.53 0.52 0.32 0.63 0.42 0.35 0.5 0.44
1.0 0.66 0.89 0.32 0.42 0.52 0.3 0.71 0.63 0.36 0.5 0.25
0.88 1.0 0.55 0.85 0.79 0.39 0.4 0.9 0.59 0.33 0.63 0.52
0.17 0.58 0.09 1.0 0.63 0.05 0.35 0.82 0.54 0.54 0.16 0.58
0.18 0.33 0.1 0.51 1.0 0.12 0.42 0.76 0.54 0.6 0.26 0.26
0.02 0.41 0.01 0.38 0.29 0.1 0.57 1.0 0.72 0.02 0.16 0.07
0.98 0.85 1.0 0.7 0.68 0.66 0.58 0.7 0.52 0.42 0.38 0.41
1.0 0.82 0.93 0.64 0.59 0.63 0.56 0.61 0.58 0.47 0.45 0.49
0.65 1.0 0.38 0.91 0.78 0.35 0.55 0.61 0.37 0.39 0.91 0.36
0.91 0.88 0.81 0.89 0.89 0.6 0.85 0.81 0.66 0.6 1.0 0.73
1.0 0.52 0.69 0.44 0.13 0.35 0.21 0.32 0.24 0.27 0.1 0.23
0.37 0.65 0.26 1.0 0.76 0.11 0.58 0.89 0.17 0.42 0.6 0.12
1.0 0.91 0.98 0.82 0.69 0.73 0.43 0.76 0.58 0.55 0.57 0.67
0.81 1.0 0.76 0.88 0.46 0.56 0.37 0.71 0.53 0.39 0.51 0.58
1.0 0.72 0.63 0.93 0.41 0.53 0.49 0.59 0.56 0.29 0.56 0.64
1.0 0.58 0.42 0.43 0.16 0.27 0.1 0.27 0.2 0.07 0.87 0.17
1.0 0.67 0.86 0.6 0.41 0.52 0.41 0.58 0.45 0.36 0.15 0.39
1.0 0.9 0.95 0.95 0.53 0.68 0.27 1.0 0.78 0.51 0.82 0.66
0.44 0.43 0.28 0.64 0.47 0.25 0.15 0.75 1.0 0.25 0.23 0.46
1.0 0.89 0.78 0.61 0.53 0.71 0.32 0.7 0.63 0.43 0.51 0.57
0.94 0.18 0.59 0.14 0.16 0.46 0.07 0.72 0.66 0.19 1.0 0.08
0.81 1.0 0.54 0.74 0.3 0.37 0.4 0.36 0.19 0.14 0.37 0.18
0.93 1.0 0.74 0.95 0.69 0.55 0.38 0.99 0.62 0.5 0.55 0.68
0.96 0.68 0.63 0.4 0.4 0.61 0.3 0.59 0.45 1.0 0.43 0.47
1.0 0.7 0.73 0.51 0.34 0.44 0.32 0.51 0.42 0.42 0.19 0.52
0.98 1.0 0.76 0.93 0.63 0.6 0.72 0.73 0.76 0.39 0.67 0.97
0.59 0.64 1.0 0.37 0.7 0.54 0.48 0.44 0.37 0.44 0.44 0.77
0.69 0.57 1.0 0.64 0.36 0.4 0.2 0.37 0.26 0.19 0.41 0.18
1.0 0.67 0.64 0.63 0.41 0.53 0.32 0.55 0.37 0.29 0.51 0.44
0.93 0.96 0.97 1.0 0.89 0.75 0.91 0.82 0.71 0.61 0.53 0.62
1.0 0.83 0.77 0.55 0.57 0.79 0.44 0.6 0.49 0.34 0.75 0.57
1.0 0.52 0.69 0.5 0.27 0.57 0.39 0.35 0.32 0.29 0.34 0.27
1.0 0.66 0.68 0.6 0.56 0.58 0.55 0.61 0.67 0.34 0.51 0.79
1.0 0.64 0.87 0.65 0.48 0.61 0.58 0.54 0.53 0.35 0.41 0.58
1.0 0.96 0.87 0.61 0.67 0.4 0.5 0.86 0.62 0.55 0.66 0.39
0.33 0.43 0.15 0.27 0.43 0.06 0.3 0.73 0.83 0.25 1.0 0.37
0.4 0.57 0.2 0.26 0.38 0.05 0.27 0.85 1.0 0.24 0.8 0.23
1.0 0.65 0.64 0.6 0.46 0.53 0.42 0.42 0.37 0.22 0.58 0.35
1.0 0.81 0.64 0.5 0.64 0.63 0.15 0.59 0.35 0.38 0.52 0.65
1.0 0.65 0.57 0.42 0.41 0.51 0.25 0.55 0.56 0.36 0.45 0.28
0.95 1.0 0.62 0.88 0.52 0.41 0.56 0.63 0.45 0.21 0.28 0.16
1.0 0.77 0.91 0.67 0.64 0.66 0.68 0.71 0.69 0.47 0.41 0.59
1.0 0.79 0.81 0.48 0.42 0.75 0.31 0.69 0.58 0.42 0.62 0.62
0.27 0.38 0.71 0.49 0.67 0.33 1.0 0.75 0.52 0.55 0.75 0.5
1.0 0.8 0.59 0.6 0.37 0.45 0.31 0.63 0.34 0.24 0.51 0.39
1.0 0.8 0.94 0.67 0.47 0.52 0.32 0.65 0.87 0.37 0.47 0.53
0.97 0.76 1.0 0.58 0.52 0.62 0.78 0.57 0.64 0.28 0.47 0.49
1.0 0.92 0.79 0.92 0.55 0.61 0.34 0.78 0.49 0.4 0.58 0.45
1.0 0.61 0.74 0.65 0.36 0.43 0.46 0.66 0.59 0.29 0.55 0.23
0.54 0.43 1.0 0.53 0.19 0.43 0.53 0.26 0.38 0.02 0.89 0.76
0.77 0.77 0.78 0.76 0.72 0.67 0.91 0.98 1.0 0.62 0.65 0.76
1.0 0.7 0.93 0.45 0.53 0.54 0.53 0.54 0.59 0.26 0.27 0.18
0.8 0.35 1.0 0.39 0.39 0.33 0.13 0.26 0.27 0.19 0.16 0.24
1.0 0.96 0.56 0.99 0.49 0.46 0.48 0.66 0.43 1.0 0.43 0.48
1.0 0.53 0.83 0.31 0.51 0.77 0.16 0.76 0.62 0.31 0.49 0.55
0.72 0.76 1.0 0.87 0.5 0.68 0.42 0.51 0.43 0.44 0.53 0.3
0.74 0.94 0.69 0.65 0.72 0.64 0.35 0.53 0.44 0.42 0.73 1.0
0.98 0.69 1.0 0.63 0.62 0.69 0.63 0.54 0.57 0.4 0.45 0.53
0.59 0.56 1.0 0.65 0.39 0.41 0.22 0.41 0.4 0.25 0.24 0.3
0.72 0.93 0.52 1.0 0.86 0.43 0.39 0.72 0.32 0.44 0.88 0.37
1.0 0.69 0.99 0.77 0.56 0.57 0.71 0.66 0.57 0.38 0.37 0.31
0.67 0.88 0.63 1.0 0.56 0.54 0.33 0.66 0.61 0.42 0.5 0.7
1.0 0.71 0.77 0.7 0.24 0.39 0.3 0.63 0.54 0.19 0.76 0.35
0.6 0.7 1.0 0.83 0.45 0.43 0.52 0.65 0.49 0.14 0.24 0.27
0.19 0.2 1.0 0.29 0.07 0.14 0.03 0.1 0.09 0.03 0.04 0.11
0.94 0.87 0.67 0.78 0.53 0.56 0.35 1.0 0.75 0.5 0.73 0.8
1.0 0.72 0.74 0.47 0.26 0.45 0.26 0.45 0.39 0.2 0.31 0.2
0.98 0.82 1.0 0.79 0.55 0.63 0.54 0.54 0.52 0.25 0.75 0.39
1.0 0.59 0.74 0.6 0.37 0.42 0.41 0.53 0.5 0.19 0.5 0.3
0.99 0.86 1.0 0.43 0.38 0.48 0.25 0.6 0.39 0.43 0.14 0.31
1.0 0.79 0.6 0.49 0.39 0.51 0.26 0.38 0.4 0.18 0.52 0.47
1.0 0.6 0.67 0.38 0.19 0.41 0.18 0.47 0.6 0.15 0.26 0.32
1.0 0.68 1.0 0.58 0.52 0.65 0.43 0.67 0.72 0.44 0.43 0.41
1.0 0.8 0.64 0.68 0.27 0.31 0.21 0.38 0.26 0.15 0.17 0.27
1.0 0.86 0.95 0.57 0.51 0.78 0.43 0.75 0.6 0.53 0.36 0.82
0.89 1.0 0.69 0.87 0.51 0.52 0.53 0.75 0.57 0.23 0.64 0.42
1.0 0.85 0.88 0.72 0.46 0.62 0.56 0.42 0.37 0.17 0.21 0.14
0.41 0.47 0.39 0.74 0.36 0.24 0.18 0.73 0.51 0.32 1.0 0.38
1.0 0.7 0.73 0.52 0.35 0.59 0.44 0.47 0.43 0.23 0.51 0.24
1.0 0.55 0.81 0.33 0.31 0.56 0.34 0.54 0.5 0.17 0.5 0.29
0.56 0.54 0.57 0.63 0.42 0.39 0.31 0.85 0.79 0.41 0.93 1.0
0.75 0.53 0.61 0.73 0.47 0.53 0.19 0.64 0.62 0.3 1.0 0.47
0.64 0.9 0.34 1.0 0.71 0.94 0.68 0.82 0.8 0.24 0.72 0.58
1.0 0.55 0.68 0.43 0.17 0.49 0.29 0.43 0.4 0.26 0.4 0.5
1.0 0.67 0.75 0.52 0.37 0.44 0.27 0.5 0.43 0.48 0.14 0.71
0.25 0.75 0.11 0.49 1.0 0.05 0.19 0.6 0.49 0.48 0.59 0.33
0.9 0.99 0.74 0.83 1.0 0.55 0.39 0.84 0.57 0.77 0.5 0.5
0.52 0.94 0.34 1.0 0.74 0.45 0.56 0.63 0.28 0.37 0.55 0.41
0.18 1.0 0.1 0.74 0.76 0.12 0.42 0.74 0.25 0.41 0.33 0.08
0.28 1.0 0.18 0.77 0.86 0.12 0.66 0.79 0.33 0.47 0.44 0.14
0.77 1.0 0.75 0.92 0.56 0.78 0.49 0.88 0.74 0.44 0.44 0.62
1.0 0.65 0.72 0.39 0.16 0.32 0.2 0.31 0.23 0.13 0.07 0.18
1.0 0.91 0.68 0.8 0.4 0.62 0.51 0.59 0.46 0.41 0.36 0.5
1.0 0.45 0.66 0.46 0.34 0.65 0.2 0.49 0.48 0.23 0.66 0.41
0.91 0.64 0.74 0.39 0.36 0.68 0.21 0.48 0.43 0.29 0.58 1.0
0.95 0.74 0.75 1.0 0.64 0.55 0.36 0.55 0.39 0.32 0.8 0.68
0.79 1.0 0.69 0.95 0.75 0.38 0.37 0.95 0.73 0.42 0.54 0.71
1.0 0.47 0.62 0.34 0.36 0.62 0.29 0.55 0.5 0.21 0.42 0.32
1.0 0.71 0.81 0.58 0.39 0.57 0.37 0.42 0.35 0.22 0.38 0.24
0.83 0.85 1.0 0.5 0.39 0.48 0.21 0.9 0.61 0.48 0.13 0.11
1.0 0.62 0.79 0.68 0.53 0.6 0.63 0.43 0.4 0.27 0.29 0.67
1.0 0.94 0.9 0.57 0.27 0.5 0.34 0.39 0.3 0.2 0.33 0.48
0.5 0.54 0.44 0.81 0.6 0.23 0.29 0.86 0.66 0.67 1.0 0.99
1.0 0.67 0.68 0.38 0.24 0.32 0.28 0.44 0.4 0.29 0.04 0.01
1.0 0.62 0.72 0.39 0.23 0.35 0.31 0.4 0.42 0.42 0.04 0.0
0.47 0.7 1.0 0.37 0.44 0.47 0.33 0.49 0.45 0.3 0.39 0.46
1.0 0.53 0.74 0.42 0.16 0.43 0.34 0.21 0.18 0.09 0.35 0.12
0.31 0.88 0.2 1.0 0.51 0.25 0.38 0.87 0.43 0.76 0.57 0.7
1.0 0.83 0.9 0.99 0.37 0.65 0.21 0.79 0.9 0.46 0.76 0.8
1.0 0.63 0.97 0.5 0.44 0.7 0.56 0.64 0.57 0.45 0.25 0.45
1.0 0.81 0.94 0.72 0.68 0.67 0.97 0.65 0.59 0.58 0.9 0.7
0.88 0.59 0.88 0.4 0.72 0.7 0.87 0.76 0.55 0.6 1.0 0.94
0.94 1.0 0.52 0.63 0.47 0.48 0.22 0.39 0.48 0.32 0.75 0.54
0.96 0.83 0.71 0.63 0.53 0.72 0.19 0.63 0.4 0.5 0.51 1.0
1.0 0.86 0.94 0.5 0.46 0.45 0.26 0.6 0.52 0.2 0.31 0.5
1.0 0.61 0.45 0.47 0.25 0.41 0.26 0.47 0.42 0.18 0.37 0.31
0.8 0.63 1.0 0.41 0.32 0.49 0.19 0.43 0.43 0.44 0.24 0.27
1.0 0.76 0.69 0.59 0.44 0.63 0.34 0.57 0.46 0.28 0.42 0.53
0.28 0.25 0.04 0.15 0.74 0.15 0.36 1.0 0.47 0.21 0.38 0.01
0.69 0.62 1.0 0.54 0.36 0.5 0.36 0.39 0.35 0.25 0.31 0.16
0.99 1.0 0.83 0.79 0.53 0.19 0.4 0.83 0.61 0.39 0.1 0.93
1.0 0.44 0.78 0.31 0.35 0.62 0.36 0.58 0.44 0.23 0.17 0.07
0.92 1.0 0.96 0.88 0.96 0.65 0.34 0.97 0.56 0.45 0.78 0.39
0.65 0.52 0.39 0.56 0.33 0.41 0.46 0.68 0.45 0.29 1.0 0.79
0.38 0.57 0.34 0.44 0.4 0.33 0.13 0.65 0.38 0.26 1.0 0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)