Heatmap: Cluster_333 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1031_g233390.1 (Contig1465.g13448)
0.01 0.33 0.35 0.36 0.39 0.29 0.49 0.65 0.35 0.7 0.78 1.0 0.77 0.42 0.59 0.78 0.63 0.34 0.67 0.86 0.54 0.67 0.51 0.53 0.73 0.6 0.63
Sro1042_g234720.1 (Contig734.g8420)
0.15 0.47 0.71 0.65 0.52 0.34 0.51 0.54 0.86 0.67 0.87 0.77 0.85 0.46 0.63 0.57 0.9 0.84 1.0 0.94 0.85 0.45 0.73 0.5 0.24 0.42 0.65
Sro1091_g240280.1 (Contig2884.g23029)
0.0 0.38 0.36 0.44 0.38 0.16 0.36 0.37 0.3 0.54 0.65 0.61 0.81 0.35 0.56 0.57 0.4 0.85 1.0 0.93 0.77 0.33 0.43 0.66 0.92 0.7 0.64
Sro1119_g243250.1 (Contig1053.g10363)
0.0 0.7 1.0 0.49 0.33 0.09 0.27 0.19 0.34 0.4 0.52 0.44 0.42 0.41 0.33 0.64 0.64 0.27 0.35 0.52 0.39 0.44 0.22 0.24 0.21 0.29 0.29
Sro1143_g245910.1 (Contig934.g9717)
0.02 0.37 0.58 0.49 0.42 0.29 0.44 0.29 0.51 0.6 0.67 0.91 1.0 0.71 0.52 0.31 0.82 0.33 0.56 0.81 0.52 0.35 0.4 0.4 0.68 0.57 0.43
Sro1204_g252200.1 (Contig1757.g15595)
0.07 0.27 0.19 0.33 0.29 0.34 0.6 0.48 0.52 0.71 0.8 0.85 0.81 0.45 0.57 0.77 0.52 0.52 0.86 1.0 0.72 0.5 0.55 0.8 0.71 0.57 0.74
Sro1309_g261530.1 (Contig3914.g29996)
0.01 0.59 0.76 0.98 0.8 0.4 0.41 0.41 0.56 0.69 0.82 0.81 0.88 0.76 0.66 0.64 0.79 0.52 1.0 0.92 0.66 0.54 0.54 0.37 0.31 0.48 0.65
Sro133_g063030.1 (Contig2274.g18862)
0.04 0.55 0.56 0.37 0.25 0.26 0.37 0.33 0.45 0.49 0.63 0.67 0.66 0.4 0.51 0.45 1.0 0.39 0.65 0.55 0.6 0.27 0.43 0.64 0.24 0.34 0.48
Sro133_g063130.1 (Contig2274.g18872)
0.05 0.19 0.2 0.29 0.32 0.24 0.32 0.27 0.34 0.59 0.71 0.72 0.45 0.85 0.56 0.69 1.0 0.77 0.74 0.51 0.55 0.41 0.47 0.28 0.2 0.58 0.48
Sro1385_g268190.1 (Contig774.g8717)
0.01 0.78 0.52 0.54 0.45 0.36 0.4 0.48 0.57 0.51 0.85 0.7 0.7 0.55 0.62 0.49 1.0 0.44 0.78 0.61 0.48 0.74 0.66 0.43 0.13 0.36 0.54
0.04 0.27 0.51 0.25 0.29 0.2 0.54 0.6 0.45 0.78 0.78 0.85 0.5 0.71 0.78 0.77 0.78 0.65 0.83 0.85 1.0 0.64 0.5 0.43 0.14 0.4 0.81
Sro1457_g274360.1 (Contig749.g8552)
0.01 0.17 0.27 0.24 0.32 0.06 0.16 0.17 0.26 0.26 0.27 0.29 0.16 0.21 0.38 1.0 0.18 0.37 0.43 0.27 0.2 0.07 0.21 0.12 0.1 0.13 0.28
Sro147_g067930.1 (Contig246.g3016)
0.1 0.25 0.47 0.37 0.33 0.2 0.29 0.37 0.41 0.46 0.47 0.59 0.44 0.55 0.56 1.0 0.51 0.48 0.55 0.53 0.57 0.35 0.34 0.25 0.17 0.2 0.41
Sro148_g068100.1 (Contig3597.g27802)
0.0 0.73 0.69 0.46 0.48 0.3 0.24 0.46 0.81 0.54 0.73 0.53 0.5 0.71 0.53 0.55 0.87 0.52 1.0 0.79 0.43 0.67 0.51 0.1 0.04 0.3 0.65
Sro150_g068940.1 (Contig1519.g13857)
0.05 0.36 0.28 0.37 0.4 0.69 0.43 0.48 0.37 0.7 0.88 0.9 0.65 0.61 0.58 0.49 1.0 0.25 0.45 0.53 0.94 0.37 0.49 0.64 0.38 0.56 0.81
Sro1571_g283300.1 (Contig4686.g34841)
0.02 0.26 0.41 0.37 0.19 0.23 0.27 0.12 0.6 0.65 0.9 1.0 0.66 0.91 0.63 0.44 0.71 0.49 0.81 0.81 0.58 0.05 0.35 0.19 0.07 0.21 0.5
Sro1571_g283310.1 (Contig4686.g34842)
0.02 0.35 0.68 0.52 0.28 0.06 0.09 0.12 0.33 0.37 0.26 0.8 0.6 0.34 0.31 0.26 0.62 0.44 0.85 1.0 0.41 0.11 0.09 0.06 0.06 0.21 0.29
0.03 0.0 0.31 0.07 0.15 0.03 0.16 0.05 0.18 0.31 0.04 0.38 1.0 0.43 0.25 0.55 0.12 0.29 0.47 0.67 0.22 0.17 0.19 0.19 0.33 0.36 0.21
Sro1783_g297250.1 (Contig2385.g19564)
0.01 0.55 0.71 0.24 0.18 0.16 0.24 0.16 0.43 0.46 0.7 0.58 0.76 0.51 0.45 0.42 1.0 0.41 0.5 0.88 0.46 0.32 0.31 0.15 0.11 0.27 0.42
Sro178_g078310.1 (Contig275.g3556)
0.08 0.31 0.35 0.28 0.24 0.17 0.12 0.05 0.17 0.48 0.41 0.57 0.48 0.52 0.29 0.24 0.69 0.37 1.0 0.77 0.47 0.02 0.13 0.06 0.01 0.16 0.31
Sro180_g078900.1 (Contig350.g4769)
0.03 0.48 0.29 0.28 0.2 0.28 0.6 0.56 0.38 0.65 0.81 0.67 0.68 0.42 0.72 0.83 0.55 0.64 1.0 0.93 0.75 0.73 0.53 0.71 0.54 0.57 0.75
Sro185_g080410.1 (Contig1228.g11516)
0.01 0.71 0.89 0.85 0.98 0.57 0.55 0.38 0.44 0.73 0.76 0.88 0.69 0.9 0.82 0.81 0.98 0.87 1.0 0.81 0.69 0.37 0.5 0.36 0.35 0.67 0.52
Sro1946_g307010.1 (Contig895.g9490)
0.01 0.72 1.0 0.52 0.49 0.31 0.35 0.35 0.45 0.59 0.61 0.8 0.55 0.74 0.52 0.56 0.42 0.54 0.92 0.57 0.69 0.5 0.43 0.36 0.16 0.34 0.5
Sro2027_g311720.1 (Contig818.g9109)
0.66 0.47 0.31 0.4 0.42 0.3 0.41 0.46 0.68 0.6 0.71 0.72 0.87 0.54 0.54 0.51 0.6 0.66 0.8 1.0 0.71 0.47 0.52 0.39 0.36 0.43 0.47
Sro2173_g317560.1 (Contig2757.g22195)
0.02 0.17 0.29 0.38 0.32 0.14 0.16 0.16 0.38 0.53 0.7 0.79 0.43 0.84 0.39 0.48 1.0 0.33 0.48 0.53 0.62 0.18 0.45 0.11 0.04 0.32 0.46
Sro2241_g320340.1 (Contig1724.g15417)
0.0 0.4 0.51 0.45 0.45 0.16 0.42 0.38 0.44 0.72 0.85 0.89 0.75 0.9 0.54 0.41 1.0 0.4 0.52 0.76 0.71 0.35 0.31 0.46 0.57 0.5 0.76
Sro2797_g337330.1 (Contig637.g7705)
0.01 0.36 0.52 0.43 0.36 0.22 0.31 0.2 0.38 0.6 0.68 0.66 0.59 0.63 0.57 1.0 0.7 0.64 0.76 0.75 0.76 0.32 0.41 0.24 0.18 0.33 0.52
Sro282_g107620.1 (Contig1420.g13105)
0.02 0.04 0.06 0.01 0.02 0.41 0.27 0.23 0.55 0.42 0.5 0.5 0.7 0.46 0.5 0.5 1.0 0.62 0.52 0.65 0.53 0.77 0.4 0.29 0.21 0.38 0.41
Sro321_g116720.1 (Contig56.g428)
0.12 0.27 0.52 0.37 0.24 0.49 0.44 0.34 0.44 0.61 0.68 0.84 0.64 0.6 0.56 0.59 0.99 0.77 1.0 0.72 0.59 0.27 0.43 0.78 0.45 0.59 0.45
Sro341_g121460.1 (Contig3952.g30278)
0.02 0.6 0.3 0.29 0.23 0.25 0.45 0.32 0.24 0.82 0.69 0.84 0.64 1.0 0.55 0.38 0.7 0.3 0.5 0.76 0.67 0.16 0.25 0.52 0.7 0.58 0.68
Sro36_g022720.1 (Contig97.g1127)
0.01 0.52 0.93 0.46 0.38 0.29 0.24 0.25 0.15 0.62 0.56 0.68 1.0 0.66 0.52 0.52 0.56 0.31 0.76 0.57 0.63 0.49 0.36 0.32 0.27 0.47 0.52
Sro391_g133060.1 (Contig2759.g22207)
0.12 0.29 0.46 0.43 0.33 0.32 0.32 0.34 0.49 0.65 0.88 0.81 0.75 0.58 0.73 0.96 0.86 0.64 1.0 0.89 0.72 0.21 0.35 0.3 0.09 0.45 0.69
0.5 0.42 0.56 0.7 0.53 0.32 0.58 0.4 0.64 0.76 0.95 0.89 0.91 0.51 0.75 0.83 0.58 0.91 0.92 0.97 1.0 0.38 0.53 0.54 0.48 0.38 0.58
Sro42_g025580.1 (Contig312.g4135)
0.01 0.48 0.69 0.78 0.63 0.2 0.41 0.38 0.45 0.61 0.92 0.6 0.86 0.85 0.66 0.41 0.79 0.47 0.68 1.0 0.67 0.37 0.44 0.29 0.26 0.33 0.6
Sro434_g142180.1 (Contig783.g8775)
0.13 0.32 0.2 0.34 0.23 0.22 0.29 0.32 0.32 0.67 0.6 0.87 0.88 0.63 0.57 0.51 0.86 0.37 0.53 1.0 0.78 0.46 0.36 0.23 0.16 0.35 0.42
Sro445_g144550.1 (Contig1488.g13610)
0.18 0.67 0.61 0.5 0.47 0.28 0.39 0.36 0.4 0.69 0.67 0.79 0.75 0.77 0.62 0.64 0.66 0.6 0.72 1.0 0.74 0.33 0.39 0.33 0.16 0.28 0.53
Sro45_g026810.1 (Contig2311.g19063)
0.5 0.67 0.85 0.63 0.74 0.13 0.51 0.39 0.45 0.62 0.59 0.77 0.94 0.27 0.48 0.44 0.65 0.33 0.54 0.82 0.56 0.44 0.49 0.82 1.0 0.6 0.48
Sro462_g147910.1 (Contig196.g2270)
0.06 0.3 0.33 0.17 0.21 0.25 0.24 0.16 0.18 0.7 0.87 1.0 0.86 0.79 0.67 0.72 0.96 0.52 0.69 0.93 0.66 0.11 0.21 0.19 0.03 0.36 0.6
Sro470_g149470.1 (Contig850.g9341)
0.21 0.25 0.3 0.32 0.25 0.3 0.41 0.39 0.45 0.7 0.72 1.0 0.75 0.57 0.56 0.52 0.74 0.4 0.55 0.88 0.74 0.2 0.37 0.32 0.12 0.28 0.5
Sro491_g153650.1 (Contig4139.g31620)
0.02 0.52 0.68 0.41 0.35 0.29 0.41 0.33 0.57 0.6 0.92 0.73 0.91 0.73 0.73 0.82 1.0 0.76 0.72 0.88 0.54 0.46 0.53 0.36 0.26 0.36 0.57
Sro524_g159890.1 (Contig202.g2386)
0.35 0.41 0.57 0.54 0.5 0.25 0.5 0.48 0.61 0.66 0.9 0.78 1.0 0.68 0.61 0.57 0.77 0.69 0.75 0.87 0.75 0.3 0.44 0.51 0.45 0.42 0.56
Sro532_g161530.1 (Contig1529.g13904)
0.0 0.45 0.37 0.45 0.3 0.2 0.32 0.27 0.36 0.43 0.75 0.57 0.85 0.26 0.41 0.46 1.0 0.32 0.55 0.68 0.5 0.28 0.28 0.35 0.35 0.31 0.53
Sro540_g163030.1 (Contig4704.g34992)
0.17 0.73 0.69 0.71 0.38 0.28 0.54 0.49 0.6 0.75 0.75 0.85 1.0 0.79 0.75 0.72 0.94 0.45 0.74 0.96 0.85 0.48 0.54 0.92 0.59 0.57 0.58
Sro549_g164560.1 (Contig1749.g15561)
0.4 0.36 0.54 0.55 0.45 0.26 0.53 0.42 0.54 0.61 0.9 0.7 0.94 0.48 0.65 0.73 0.69 0.69 0.74 1.0 0.66 0.22 0.49 0.55 0.7 0.41 0.57
Sro554_g165560.1 (Contig3803.g29155)
0.03 0.47 0.43 0.35 0.3 0.23 0.42 0.44 0.43 0.68 0.88 0.86 0.68 0.46 0.63 1.0 0.45 0.62 0.81 0.94 0.98 0.45 0.41 0.54 0.73 0.65 0.55
Sro55_g032150.1 (Contig4458.g33489)
0.07 0.74 0.81 0.56 0.39 0.31 0.31 0.32 0.47 0.63 0.66 0.91 0.43 0.59 0.48 0.39 1.0 0.34 0.62 0.89 0.62 0.33 0.32 0.22 0.09 0.24 0.48
Sro57_g033270.1 (Contig284.g3695)
0.03 0.23 0.07 0.11 0.15 0.28 0.58 0.48 0.74 0.64 0.74 0.77 0.86 0.66 0.63 0.38 0.78 0.78 1.0 0.99 0.74 0.71 0.53 0.5 0.16 0.39 0.47
Sro607_g174650.1 (Contig3533.g27323)
0.02 0.32 0.28 0.57 0.6 0.17 0.14 0.15 0.15 0.56 0.5 0.63 0.41 0.66 0.46 1.0 0.52 0.83 1.0 0.62 0.62 0.17 0.25 0.26 0.4 0.61 0.32
Sro608_g174760.1 (Contig3978.g30559)
0.0 0.37 0.4 0.45 0.29 0.56 0.31 0.21 0.37 0.47 0.76 0.55 0.97 0.37 0.5 0.48 0.68 0.54 0.68 1.0 0.54 0.21 0.28 0.34 0.3 0.4 0.44
0.15 0.44 0.44 0.33 0.32 0.3 0.54 0.37 0.48 0.79 0.71 0.98 0.59 0.99 0.68 0.71 0.61 0.46 0.57 1.0 0.87 0.47 0.46 0.4 0.27 0.39 0.57
Sro621_g176850.1 (Contig1511.g13802)
0.46 0.1 0.1 0.11 0.19 0.37 0.13 0.31 0.47 0.55 0.38 0.6 0.49 0.47 0.42 0.41 0.77 0.14 0.28 0.86 1.0 0.31 0.26 0.08 0.11 0.26 0.38
Sro632_g178720.1 (Contig512.g6780)
0.01 1.0 0.66 0.5 0.57 0.25 0.58 0.39 0.64 0.67 0.95 0.88 0.38 0.74 0.71 0.8 0.93 0.41 0.56 0.67 0.77 0.67 0.55 0.4 0.32 0.43 0.69
Sro667_g184120.1 (Contig793.g8873)
0.0 0.7 0.77 1.0 0.63 0.69 0.21 0.37 0.35 0.63 0.91 0.65 0.48 0.83 0.68 0.49 0.84 0.32 0.55 0.54 0.68 0.42 0.44 0.64 0.25 0.48 0.85
Sro692_g188040.1 (Contig950.g9812)
0.09 0.26 0.25 0.36 0.42 0.1 0.21 0.21 0.37 0.54 0.46 0.71 0.46 1.0 0.42 0.41 0.65 0.35 0.45 0.58 0.49 0.62 0.58 0.14 0.12 0.49 0.36
Sro717_g192030.1 (Contig1315.g12150)
0.33 0.2 0.28 0.22 0.21 0.33 0.36 0.3 0.77 0.63 0.66 0.75 0.82 0.46 0.51 0.58 0.64 0.64 0.8 1.0 0.79 0.33 0.48 0.24 0.14 0.27 0.54
Sro721_g192730.1 (Contig2526.g20634)
0.07 0.18 0.1 0.07 0.11 0.29 0.65 0.54 0.54 0.57 0.65 0.52 0.69 0.75 0.69 0.78 0.63 0.62 0.68 0.82 1.0 0.44 0.64 0.36 0.11 0.22 0.57
Sro741_g195690.1 (Contig2851.g22870)
0.0 0.38 0.23 0.3 0.28 0.27 0.44 0.6 0.75 0.61 0.71 0.67 0.7 0.25 0.44 0.46 0.77 0.8 0.83 1.0 0.74 0.45 0.65 0.37 0.37 0.54 0.54
Sro74_g040810.1 (Contig4700.g34943)
0.0 0.27 0.27 0.26 0.26 0.31 0.26 0.31 0.28 0.45 0.64 0.43 0.68 0.5 0.5 0.45 0.64 0.55 0.51 1.0 0.43 0.32 0.36 0.23 0.12 0.34 0.47
Sro759_g198240.1 (Contig608.g7524)
0.12 0.15 0.09 0.11 0.1 0.13 0.34 0.24 0.31 0.53 0.39 0.66 0.77 0.68 0.42 0.48 0.3 0.32 0.47 1.0 0.56 0.38 0.29 0.19 0.15 0.25 0.3
Sro769_g199890.1 (Contig2367.g19491)
0.02 0.08 0.2 0.21 0.19 0.15 0.18 0.33 0.35 0.51 0.43 1.0 0.42 0.85 0.48 0.44 0.32 0.42 0.61 0.43 0.7 0.31 0.27 0.34 0.08 0.23 0.44
Sro7_g005790.1 (Contig389.g5232)
0.03 0.38 0.79 0.65 0.5 0.35 0.52 0.22 0.33 0.66 0.95 0.82 0.64 0.5 0.66 0.81 0.83 0.48 0.81 1.0 0.96 0.31 0.28 0.7 0.61 0.75 0.59
Sro80_g043240.1 (Contig92.g1068)
0.04 0.41 0.61 0.49 0.49 0.24 0.29 0.29 0.41 0.42 0.57 0.5 0.33 0.38 0.54 1.0 0.51 0.4 0.55 0.38 0.38 0.4 0.47 0.31 0.11 0.32 0.42
Sro813_g206230.1 (Contig4011.g30869)
0.01 0.84 1.0 0.59 0.47 0.25 0.18 0.15 0.35 0.57 0.47 0.66 0.08 0.77 0.32 0.33 0.18 0.28 0.7 0.37 0.65 0.5 0.38 0.32 0.11 0.53 0.67
Sro82_g043880.1 (Contig4032.g30979)
0.01 0.12 0.06 0.08 0.11 0.12 0.18 0.12 0.29 0.39 0.44 0.49 0.44 0.3 0.37 0.39 0.48 0.27 0.42 1.0 0.48 0.42 0.26 0.2 0.12 0.22 0.35
0.06 0.07 0.13 0.16 0.11 0.25 0.34 0.51 0.46 0.66 0.65 0.98 0.71 0.66 0.57 0.63 0.49 0.48 0.66 1.0 0.74 0.2 0.2 0.29 0.04 0.16 0.59
Sro925_g220870.1 (Contig3078.g24546)
0.02 0.28 0.3 0.23 0.2 0.15 0.29 0.17 0.35 0.4 0.34 0.47 0.74 0.44 0.3 0.4 0.42 0.35 0.51 1.0 0.41 0.39 0.34 0.16 0.08 0.21 0.26
Sro97_g049990.1 (Contig689.g8053)
0.0 0.31 0.34 0.23 0.15 0.31 0.19 0.21 0.15 0.54 0.76 0.62 0.78 0.49 0.47 0.4 0.8 0.53 0.72 1.0 0.56 0.16 0.18 0.33 0.15 0.39 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)