1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_333 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1031_g233390.1 (Contig1465.g13448)
 0.12 3.56 3.77 3.83 4.13 3.12 5.23 6.95 3.74 7.5 8.29 10.65 8.18 4.49 6.28 8.34 6.73 3.58 7.12 9.2 5.78 7.17 5.42 5.66 7.75 6.41 6.71
Sro1042_g234720.1 (Contig734.g8420)
 2.39 7.27 11.02 10.04 8.09 5.26 7.84 8.3 13.31 10.31 13.46 11.87 13.13 7.16 9.7 8.84 13.83 12.92 15.42 14.47 13.12 6.94 11.33 7.68 3.67 6.46 10.01
Sro1091_g240280.1 (Contig2884.g23029)
 0.0 2.56 2.39 2.95 2.54 1.07 2.41 2.49 1.99 3.61 4.38 4.11 5.45 2.37 3.78 3.79 2.67 5.67 6.69 6.24 5.13 2.23 2.91 4.42 6.15 4.67 4.31
Sro1119_g243250.1 (Contig1053.g10363)
 0.0 4.62 6.61 3.23 2.2 0.57 1.76 1.25 2.24 2.66 3.41 2.93 2.79 2.69 2.2 4.2 4.22 1.81 2.29 3.41 2.61 2.93 1.46 1.59 1.37 1.91 1.9
Sro1143_g245910.1 (Contig934.g9717)
 0.15 3.39 5.37 4.47 3.83 2.64 4.03 2.68 4.68 5.48 6.16 8.34 9.18 6.51 4.81 2.85 7.57 3.02 5.13 7.45 4.79 3.17 3.71 3.64 6.28 5.24 3.94
Sro1204_g252200.1 (Contig1757.g15595)
 0.96 3.66 2.66 4.54 4.02 4.66 8.27 6.55 7.12 9.8 10.99 11.7 11.11 6.21 7.79 10.63 7.16 7.2 11.76 13.74 9.91 6.83 7.61 11.06 9.7 7.9 10.1
Sro1309_g261530.1 (Contig3914.g29996)
 0.06 3.26 4.19 5.38 4.38 2.19 2.22 2.26 3.1 3.77 4.51 4.46 4.8 4.16 3.59 3.49 4.31 2.84 5.48 5.03 3.63 2.97 2.94 2.03 1.69 2.62 3.57
Sro133_g063030.1 (Contig2274.g18862)
 0.4 5.28 5.43 3.58 2.38 2.51 3.53 3.13 4.36 4.72 6.04 6.46 6.38 3.84 4.86 4.29 9.62 3.78 6.26 5.32 5.74 2.61 4.1 6.2 2.28 3.3 4.58
Sro133_g063130.1 (Contig2274.g18872)
 15.28 59.8 63.26 91.46 100.41 76.36 101.56 85.19 108.16 187.74 226.04 228.59 143.62 270.19 179.08 217.65 317.29 245.71 234.27 163.25 174.97 129.43 149.89 87.93 63.46 185.27 151.46
Sro1385_g268190.1 (Contig774.g8717)
 0.05 7.32 4.9 5.01 4.23 3.41 3.76 4.45 5.3 4.79 7.91 6.52 6.57 5.13 5.83 4.54 9.35 4.09 7.25 5.68 4.47 6.93 6.19 4.01 1.21 3.38 5.01
0.06 0.43 0.79 0.39 0.45 0.3 0.83 0.93 0.7 1.21 1.21 1.31 0.77 1.1 1.21 1.2 1.2 1.01 1.29 1.31 1.55 1.0 0.78 0.67 0.21 0.61 1.26
Sro1457_g274360.1 (Contig749.g8552)
 0.51 7.59 11.98 10.9 14.34 2.8 7.08 7.73 11.46 11.88 12.0 12.84 6.95 9.51 17.09 44.84 7.95 16.55 19.14 12.01 9.06 3.24 9.28 5.46 4.33 5.68 12.36
Sro147_g067930.1 (Contig246.g3016)
 9.59 25.19 46.41 37.3 32.53 20.3 28.65 36.63 40.39 46.3 46.71 58.93 44.22 54.77 55.32 99.65 51.07 48.13 55.24 52.86 56.72 34.85 33.89 24.71 17.12 19.99 41.31
Sro148_g068100.1 (Contig3597.g27802)
 0.01 3.79 3.6 2.41 2.48 1.56 1.25 2.38 4.21 2.8 3.79 2.74 2.62 3.69 2.76 2.86 4.53 2.73 5.21 4.09 2.22 3.51 2.66 0.51 0.19 1.54 3.41
Sro150_g068940.1 (Contig1519.g13857)
 1.21 9.0 6.93 9.21 10.12 17.35 10.71 12.11 9.24 17.74 22.17 22.73 16.4 15.3 14.7 12.4 25.17 6.28 11.37 13.41 23.7 9.24 12.22 16.07 9.52 14.18 20.29
Sro1571_g283300.1 (Contig4686.g34841)
 0.03 0.46 0.72 0.64 0.33 0.39 0.47 0.2 1.05 1.13 1.57 1.75 1.15 1.59 1.11 0.77 1.25 0.85 1.41 1.42 1.01 0.09 0.61 0.33 0.12 0.37 0.87
Sro1571_g283310.1 (Contig4686.g34842)
 0.01 0.29 0.57 0.44 0.24 0.05 0.08 0.1 0.28 0.31 0.22 0.67 0.51 0.28 0.26 0.22 0.52 0.37 0.71 0.84 0.35 0.09 0.07 0.05 0.05 0.18 0.25
0.23 0.0 2.06 0.47 0.98 0.17 1.08 0.33 1.19 2.05 0.24 2.54 6.59 2.82 1.68 3.66 0.8 1.93 3.1 4.45 1.47 1.1 1.23 1.28 2.18 2.37 1.41
Sro1783_g297250.1 (Contig2385.g19564)
 0.07 6.82 8.78 3.03 2.23 1.93 3.02 1.93 5.31 5.67 8.67 7.21 9.46 6.3 5.64 5.23 12.42 5.08 6.21 10.91 5.73 4.0 3.82 1.9 1.33 3.32 5.23
Sro178_g078310.1 (Contig275.g3556)
 12.54 46.06 52.47 41.45 36.67 25.36 17.75 7.44 25.42 72.46 60.91 85.98 71.65 77.43 43.89 35.4 103.55 55.51 150.14 115.5 70.74 2.56 19.96 9.0 1.21 24.31 46.88
Sro180_g078900.1 (Contig350.g4769)
 0.39 6.72 4.01 3.98 2.82 3.94 8.4 7.77 5.35 9.15 11.36 9.42 9.51 5.89 10.01 11.59 7.67 8.96 13.99 13.02 10.46 10.2 7.35 9.97 7.5 7.92 10.55
Sro185_g080410.1 (Contig1228.g11516)
 0.23 26.38 33.07 31.52 36.2 21.0 20.48 14.19 16.31 26.97 28.28 32.52 25.62 33.26 30.51 29.93 36.48 32.27 37.12 30.1 25.54 13.91 18.74 13.5 12.85 24.74 19.37
Sro1946_g307010.1 (Contig895.g9490)
 0.13 8.78 12.17 6.36 5.98 3.78 4.27 4.28 5.5 7.16 7.48 9.71 6.65 9.0 6.39 6.79 5.16 6.57 11.22 6.89 8.35 6.14 5.27 4.43 1.89 4.2 6.06
Sro2027_g311720.1 (Contig818.g9109)
 11.61 8.26 5.43 6.97 7.4 5.29 7.16 8.1 11.96 10.43 12.36 12.57 15.18 9.5 9.36 8.96 10.52 11.53 13.9 17.47 12.36 8.24 9.02 6.89 6.27 7.59 8.25
Sro2173_g317560.1 (Contig2757.g22195)
 0.67 4.73 8.24 10.83 9.18 3.98 4.54 4.57 10.88 15.11 19.89 22.64 12.14 23.88 11.04 13.81 28.54 9.33 13.62 15.1 17.6 5.17 12.83 3.16 1.24 9.23 12.99
Sro2241_g320340.1 (Contig1724.g15417)
 0.02 4.65 5.95 5.26 5.26 1.87 4.84 4.36 5.06 8.32 9.89 10.3 8.64 10.41 6.3 4.73 11.58 4.6 6.0 8.82 8.27 4.0 3.65 5.3 6.6 5.79 8.8
Sro2797_g337330.1 (Contig637.g7705)
 0.89 24.24 35.35 29.31 24.37 14.89 20.78 13.36 25.89 40.87 45.96 44.55 40.05 43.02 38.72 67.9 47.29 43.72 51.73 51.23 51.43 21.53 27.84 16.03 12.13 22.67 35.14
Sro282_g107620.1 (Contig1420.g13105)
 0.1 0.24 0.33 0.07 0.11 2.26 1.49 1.26 3.03 2.31 2.74 2.75 3.81 2.54 2.73 2.75 5.48 3.39 2.87 3.55 2.93 4.21 2.17 1.58 1.13 2.06 2.24
Sro321_g116720.1 (Contig56.g428)
 1.51 3.44 6.57 4.64 3.05 6.13 5.58 4.33 5.54 7.6 8.51 10.52 7.99 7.56 7.09 7.43 12.49 9.72 12.55 9.02 7.45 3.42 5.35 9.78 5.68 7.4 5.69
Sro341_g121460.1 (Contig3952.g30278)
 0.1 3.58 1.78 1.71 1.37 1.51 2.71 1.91 1.43 4.92 4.13 5.04 3.83 5.97 3.27 2.25 4.17 1.8 2.96 4.56 4.02 0.98 1.47 3.08 4.2 3.48 4.08
Sro36_g022720.1 (Contig97.g1127)
 0.04 1.62 2.91 1.44 1.19 0.9 0.73 0.79 0.48 1.94 1.74 2.13 3.12 2.07 1.62 1.61 1.74 0.96 2.37 1.79 1.96 1.54 1.11 0.98 0.84 1.48 1.62
Sro391_g133060.1 (Contig2759.g22207)
 1.35 3.24 5.07 4.77 3.67 3.57 3.51 3.79 5.46 7.27 9.8 8.98 8.36 6.4 8.14 10.68 9.58 7.15 11.11 9.91 7.96 2.36 3.93 3.37 1.0 4.97 7.64
2.58 2.12 2.85 3.59 2.7 1.64 2.95 2.04 3.28 3.89 4.87 4.52 4.64 2.63 3.81 4.26 2.98 4.66 4.71 4.94 5.11 1.96 2.69 2.76 2.46 1.95 2.98
Sro42_g025580.1 (Contig312.g4135)
 0.21 8.72 12.41 14.03 11.37 3.57 7.36 6.93 8.11 10.98 16.52 10.82 15.56 15.36 11.87 7.45 14.28 8.53 12.3 18.05 12.06 6.66 7.93 5.32 4.69 5.95 10.85
Sro434_g142180.1 (Contig783.g8775)
 1.27 3.15 1.93 3.31 2.23 2.18 2.87 3.17 3.15 6.56 5.85 8.47 8.63 6.17 5.6 4.97 8.43 3.61 5.23 9.79 7.59 4.54 3.51 2.26 1.53 3.39 4.11
Sro445_g144550.1 (Contig1488.g13610)
 6.77 24.48 22.28 18.2 17.11 10.33 14.39 13.08 14.75 25.33 24.61 28.89 27.62 28.29 22.64 23.32 24.12 22.1 26.37 36.69 27.04 12.08 14.33 12.07 5.93 10.35 19.57
Sro45_g026810.1 (Contig2311.g19063)
 8.47 11.26 14.29 10.62 12.56 2.12 8.66 6.56 7.58 10.4 9.9 13.0 15.86 4.52 8.09 7.38 10.89 5.51 9.03 13.77 9.36 7.38 8.21 13.81 16.87 10.13 8.11
Sro462_g147910.1 (Contig196.g2270)
 0.58 2.78 3.1 1.63 1.93 2.31 2.26 1.51 1.69 6.51 8.14 9.34 8.05 7.41 6.22 6.72 8.97 4.83 6.43 8.66 6.12 1.03 1.95 1.76 0.31 3.38 5.62
Sro470_g149470.1 (Contig850.g9341)
 7.97 9.2 11.03 11.88 9.27 11.13 15.47 14.72 16.67 25.94 26.95 37.29 27.92 21.21 21.06 19.52 27.61 14.98 20.51 32.98 27.49 7.59 13.97 11.85 4.57 10.47 18.56
Sro491_g153650.1 (Contig4139.g31620)
 0.83 23.11 30.04 18.38 15.65 12.66 18.05 14.8 25.2 26.36 40.56 32.27 40.27 32.44 32.12 36.13 44.3 33.54 31.94 39.12 24.14 20.46 23.63 15.81 11.61 16.11 25.24
Sro524_g159890.1 (Contig202.g2386)
 35.3 40.6 56.55 54.11 49.87 25.16 49.61 47.38 60.44 65.46 89.74 77.83 99.69 68.04 61.31 56.92 76.58 68.85 74.33 86.38 74.42 29.44 44.25 51.06 44.8 41.46 55.86
Sro532_g161530.1 (Contig1529.g13904)
 0.02 2.63 2.17 2.67 1.76 1.17 1.91 1.58 2.13 2.53 4.42 3.37 5.0 1.55 2.42 2.69 5.88 1.87 3.21 4.0 2.93 1.64 1.65 2.07 2.04 1.79 3.1
Sro540_g163030.1 (Contig4704.g34992)
 1.28 5.71 5.38 5.54 2.93 2.17 4.21 3.85 4.65 5.86 5.87 6.63 7.78 6.11 5.83 5.6 7.29 3.47 5.79 7.44 6.57 3.7 4.19 7.14 4.62 4.4 4.55
Sro549_g164560.1 (Contig1749.g15561)
 61.46 53.94 82.3 83.63 68.27 39.27 80.57 64.49 81.57 92.87 136.18 106.22 142.42 72.49 98.13 110.51 105.24 104.95 111.92 151.79 100.28 33.19 73.66 83.81 106.7 61.65 85.85
Sro554_g165560.1 (Contig3803.g29155)
 0.28 3.9 3.55 2.9 2.5 1.95 3.51 3.69 3.57 5.65 7.29 7.15 5.63 3.82 5.21 8.31 3.74 5.16 6.72 7.85 8.17 3.73 3.42 4.52 6.11 5.43 4.56
Sro55_g032150.1 (Contig4458.g33489)
 0.36 3.69 4.08 2.8 1.97 1.56 1.53 1.6 2.36 3.15 3.32 4.59 2.16 2.98 2.4 1.94 5.02 1.7 3.11 4.49 3.11 1.67 1.59 1.1 0.47 1.2 2.41
Sro57_g033270.1 (Contig284.g3695)
 0.1 0.89 0.28 0.42 0.59 1.07 2.21 1.85 2.85 2.44 2.83 2.94 3.29 2.53 2.42 1.47 2.97 2.97 3.82 3.78 2.84 2.71 2.01 1.92 0.6 1.51 1.78
Sro607_g174650.1 (Contig3533.g27323)
 1.05 14.35 12.32 25.12 26.6 7.64 6.03 6.76 6.77 24.68 22.36 28.12 18.3 29.43 20.59 44.3 23.11 36.73 44.16 27.49 27.5 7.51 10.99 11.65 17.68 27.2 14.34
Sro608_g174760.1 (Contig3978.g30559)
 0.01 2.65 2.89 3.22 2.12 4.04 2.24 1.51 2.7 3.42 5.49 4.0 7.0 2.69 3.61 3.46 4.93 3.91 4.9 7.23 3.93 1.53 1.99 2.49 2.18 2.91 3.21
4.11 12.41 12.27 9.33 8.97 8.29 15.15 10.47 13.43 22.11 19.88 27.57 16.48 27.9 18.98 19.9 17.23 13.03 16.04 28.09 24.54 13.2 12.99 11.34 7.47 11.03 16.15
Sro621_g176850.1 (Contig1511.g13802)
 5.22 1.18 1.15 1.2 2.16 4.24 1.5 3.53 5.38 6.31 4.37 6.86 5.64 5.33 4.75 4.71 8.83 1.65 3.2 9.78 11.41 3.54 2.93 0.86 1.23 3.0 4.36
Sro632_g178720.1 (Contig512.g6780)
 0.09 7.44 4.94 3.69 4.28 1.89 4.32 2.91 4.75 5.01 7.08 6.53 2.86 5.52 5.27 5.92 6.88 3.06 4.17 4.96 5.74 4.96 4.12 3.0 2.38 3.23 5.1
Sro667_g184120.1 (Contig793.g8873)
 0.09 18.93 20.91 27.03 17.01 18.64 5.64 9.93 9.48 17.03 24.47 17.47 13.07 22.33 18.48 13.13 22.83 8.65 14.99 14.52 18.45 11.25 11.87 17.41 6.72 13.09 22.9
Sro692_g188040.1 (Contig950.g9812)
 43.91 131.82 125.33 179.73 209.62 49.4 107.1 105.45 186.35 269.24 229.5 352.29 229.14 499.4 208.22 207.15 323.06 175.56 224.41 290.58 242.89 307.76 289.55 70.31 57.46 242.88 179.74
Sro717_g192030.1 (Contig1315.g12150)
 6.03 3.67 5.02 4.0 3.76 6.0 6.65 5.46 13.98 11.45 11.97 13.65 15.03 8.42 9.27 10.65 11.73 11.64 14.55 18.22 14.45 6.03 8.71 4.35 2.61 4.85 9.92
Sro721_g192730.1 (Contig2526.g20634)
 2.16 5.33 3.12 2.2 3.35 8.6 19.41 16.39 16.19 17.29 19.5 15.74 20.64 22.68 20.62 23.54 18.89 18.8 20.39 24.65 30.08 13.33 19.38 10.7 3.23 6.66 17.06
Sro741_g195690.1 (Contig2851.g22870)
 0.01 1.69 1.03 1.35 1.23 1.19 1.99 2.7 3.36 2.75 3.16 3.02 3.15 1.12 1.99 2.04 3.46 3.57 3.74 4.48 3.33 2.03 2.91 1.65 1.64 2.4 2.41
Sro74_g040810.1 (Contig4700.g34943)
 0.15 11.51 11.16 10.97 10.96 13.21 10.91 12.96 11.91 18.76 26.93 17.96 28.46 21.09 21.17 18.94 26.8 23.07 21.39 42.08 18.01 13.3 15.19 9.83 4.87 14.18 19.89
Sro759_g198240.1 (Contig608.g7524)
 3.24 4.14 2.42 2.96 2.79 3.56 9.08 6.47 8.39 14.14 10.35 17.65 20.63 18.15 11.2 12.76 8.12 8.63 12.48 26.78 14.92 10.13 7.87 5.15 3.97 6.74 8.06
Sro769_g199890.1 (Contig2367.g19491)
 0.1 0.33 0.81 0.88 0.77 0.63 0.76 1.36 1.44 2.11 1.81 4.16 1.74 3.53 1.99 1.82 1.35 1.73 2.55 1.8 2.93 1.29 1.11 1.4 0.33 0.94 1.84
Sro7_g005790.1 (Contig389.g5232)
 0.07 1.09 2.24 1.85 1.41 0.99 1.47 0.61 0.93 1.88 2.71 2.33 1.82 1.43 1.89 2.31 2.35 1.36 2.31 2.84 2.73 0.88 0.78 2.0 1.75 2.13 1.67
Sro80_g043240.1 (Contig92.g1068)
 2.77 29.55 44.14 35.54 35.46 17.22 21.13 20.76 29.58 30.34 41.08 36.18 23.68 27.87 39.47 72.65 36.9 29.34 40.11 27.88 27.39 29.25 34.18 22.34 8.26 23.45 30.2
Sro813_g206230.1 (Contig4011.g30869)
 0.06 8.86 10.53 6.2 4.94 2.68 1.9 1.59 3.73 5.96 4.94 6.94 0.8 8.09 3.42 3.43 1.85 2.95 7.4 3.92 6.84 5.31 4.01 3.33 1.13 5.57 7.1
Sro82_g043880.1 (Contig4032.g30979)
 0.11 1.23 0.59 0.8 1.09 1.2 1.85 1.24 2.92 4.01 4.53 4.98 4.51 3.04 3.77 4.02 4.9 2.72 4.24 10.2 4.88 4.3 2.69 2.09 1.25 2.23 3.54
0.77 0.88 1.58 1.93 1.31 2.95 4.05 6.0 5.51 7.81 7.68 11.65 8.45 7.84 6.78 7.54 5.81 5.68 7.8 11.87 8.81 2.32 2.41 3.46 0.42 1.9 7.02
Sro925_g220870.1 (Contig3078.g24546)
 0.37 6.3 6.7 5.25 4.48 3.38 6.47 3.95 7.9 9.05 7.75 10.66 16.81 9.93 6.74 9.08 9.57 7.96 11.68 22.7 9.4 8.88 7.77 3.54 1.87 4.67 5.91
Sro97_g049990.1 (Contig689.g8053)
 0.01 1.55 1.66 1.13 0.73 1.53 0.95 1.04 0.72 2.67 3.74 3.05 3.83 2.43 2.33 1.95 3.96 2.62 3.57 4.93 2.76 0.77 0.91 1.64 0.74 1.92 2.44

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)