1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_245 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051720.1 (Contig348.g4725)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1037_g234110.1 (Contig2347.g19300)
 0.0 0.23 0.27 0.3 0.21 0.0 0.01 0.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.75 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.76 0.6 0.0 0.16 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1117_g242950.1 (Contig1027.g10241)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.01 0.02 0.08 0.12 0.06 0.47 0.06 0.05 0.05 0.04 1.0 0.28 0.68 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.11
Sro1184_g250190.1 (Contig2400.g19664)
 0.0 0.02 0.32 0.11 0.15 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.58 0.52 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1297_g260470.1 (Contig4097.g31296)
 0.01 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.11 0.4 0.33 0.08 0.01 0.01 0.18 0.3 0.03 0.0 0.02 1.0 0.14 0.22 0.03 0.04 0.12 0.01 0.03 0.03 0.02
Sro1342_g264540.1 (Contig68.g690)
 0.01 0.05 0.08 0.04 0.03 0.0 0.06 0.05 0.14 0.05 0.0 0.01 0.83 0.0 0.02 0.01 0.0 0.73 0.08 1.0 0.02 0.03 0.08 0.01 0.0 0.01 0.0
Sro1463_g274860.1 (Contig87.g921)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.33 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro149_g068580.1 (Contig259.g3226)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.45 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.53 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1526_g279780.1 (Contig1576.g14319)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1529_g280030.1 (Contig392.g5312)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.22 0.1 0.06 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1636_g287580.1 (Contig3111.g24739)
 0.08 0.05 0.04 0.1 0.09 0.11 0.07 0.34 0.22 0.19 0.04 0.28 0.22 0.04 0.03 0.1 0.17 1.0 0.46 0.35 0.12 0.11 0.19 0.05 0.34 0.05 0.1
0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.05 0.05 0.11 0.1 0.15 0.25 0.04 0.06 0.05 0.05 1.0 0.23 0.3 0.12 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 0.04
Sro1751_g295300.1 (Contig3845.g29594)
 0.4 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.23 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro2045_g312420.1 (Contig2859.g22927)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2092_g314070.1 (Contig3651.g28196)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.47 0.47 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro209_g087480.1 (Contig4070.g31219)
 0.38 0.03 0.02 0.08 0.05 0.06 0.03 0.04 0.03 0.08 0.19 0.06 0.14 0.01 0.08 0.05 0.11 1.0 0.4 0.18 0.04 0.01 0.02 0.12 0.22 0.08 0.08
Sro2553_g331050.1 (Contig1602.g14541)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.06 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 1.0 0.1 0.13 0.08 0.01 0.01 0.02 0.22 0.08 0.0
Sro2600_g332290.1 (Contig4572.g34137)
 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.62 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2666_g334160.1 (Contig4029.g30950)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.08 0.0 0.18 0.81 0.02 0.02 0.0 0.0 1.0 0.33 0.57 0.03 0.02 0.01 0.16 0.0 0.0 0.04
Sro283_g107850.1 (Contig4255.g32216)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 1.0 0.25 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro288_g108900.1 (Contig62.g510)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.08 0.09 0.0 0.69 0.0 0.06 0.0 0.0 1.0 0.58 0.57 0.0 0.0 0.0 0.12 0.08 0.09 0.09
Sro30_g019710.1 (Contig3962.g30371)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3141_g344380.1 (Contig3095.g24657)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro320_g116410.1 (Contig3665.g28302)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.25 0.0 0.02 0.04 0.0 1.0 0.46 0.23 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.01
Sro323_g117420.1 (Contig364.g4923)
 0.12 0.0 0.59 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0 0.31 0.52 0.1 0.0 0.11 0.19 0.0 0.0 0.09
Sro348_g123140.1 (Contig2346.g19280)
 0.01 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.05 0.06 0.18 0.09 0.14 0.34 0.34 0.08 0.05 0.13 1.0 0.28 0.07 0.16 0.04 0.01 0.08 0.02 0.1 0.2
Sro374_g129310.1 (Contig347.g4692)
 0.0 0.51 0.05 0.17 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.09 0.04 0.05 0.01 0.09 0.03 0.13 1.0 0.63 0.23 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.2 0.02 0.1 0.14 0.04 0.13 0.24 0.05 0.11 0.0 0.23 1.0 0.15 0.58 0.33 0.04 0.06 0.03 0.0 0.17 0.01
Sro3_g002040.1 (Contig3832.g29389)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.02 0.32 0.02 0.06 0.07 0.08 1.0 0.42 0.34 0.05 0.03 0.04 0.01 0.03 0.01 0.04
Sro404_g135870.1 (Contig4176.g31847)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro411_g137520.1 (Contig243.g2958)
 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.06 0.42 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.4 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.01 0.22 0.31 0.27 0.23 0.03 0.14 0.18 0.12 0.15 0.12 0.15 0.24 0.06 0.11 0.1 0.09 1.0 0.61 0.26 0.18 0.12 0.06 0.16 0.25 0.31 0.11
0.0 0.18 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.36 0.61 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro697_g189040.1 (Contig3345.g26203)
 0.0 0.05 0.07 0.02 0.06 0.03 0.2 0.05 0.02 0.21 0.08 0.28 0.61 0.05 0.09 0.02 0.03 1.0 0.5 0.74 0.31 0.08 0.09 0.15 0.37 0.31 0.08
Sro69_g038730.1 (Contig4677.g34782)
 0.0 0.29 0.33 0.37 0.31 0.06 0.07 0.12 0.14 0.24 0.09 0.24 1.0 0.03 0.09 0.35 0.11 0.98 0.6 0.72 0.23 0.09 0.1 0.06 0.09 0.19 0.19
Sro738_g195340.1 (Contig2916.g23213)
 0.0 0.17 0.16 0.32 0.19 0.01 0.04 0.02 0.08 0.05 0.07 0.02 0.28 0.0 0.01 0.02 0.18 1.0 0.42 0.22 0.0 0.02 0.03 0.14 0.11 0.07 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.17 0.39 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro812_g206040.1 (Contig1219.g11464)
 0.0 0.05 0.02 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.22 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro817_g206910.1 (Contig4010.g30855)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.43 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.62 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro837_g209160.1 (Contig405.g5509)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.36 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro845_g209970.1 (Contig2192.g18249)
 0.01 0.16 0.09 0.15 0.16 0.01 0.09 0.15 0.22 0.19 0.14 0.24 0.63 0.18 0.12 0.09 0.11 1.0 0.48 0.49 0.27 0.22 0.18 0.12 0.16 0.19 0.07
Sro892_g216980.1 (Contig1567.g14232)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.64 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.25 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro967_g225870.1 (Contig1083.g10526)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.02 0.13 0.0 0.0 0.04 0.02 1.0 0.37 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro96_g049640.1 (Contig3763.g28890)
 0.01 0.09 0.27 0.39 0.17 0.04 0.11 0.09 0.08 0.12 0.09 0.08 0.43 0.08 0.14 0.13 0.16 1.0 0.28 0.5 0.2 0.07 0.06 0.09 0.11 0.08 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)