1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_245 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051720.1 (Contig348.g4725)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.01 1.34 0.0 0.0 0.02 0.0 14.78 3.43 1.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Sro1037_g234110.1 (Contig2347.g19300)
 0.0 0.05 0.06 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.17 0.14 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1117_g242950.1 (Contig1027.g10241)
 0.0 0.04 0.0 0.04 0.05 0.2 0.14 0.06 0.08 0.37 0.57 0.3 2.28 0.29 0.25 0.24 0.19 4.84 1.37 3.31 0.15 0.03 0.05 0.08 0.05 0.02 0.51
Sro1184_g250190.1 (Contig2400.g19664)
 0.0 0.19 2.7 0.92 1.27 0.93 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 8.45 0.0 0.02 0.09 0.0 4.93 4.39 5.44 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1297_g260470.1 (Contig4097.g31296)
 0.1 0.29 0.0 0.18 0.48 0.04 1.7 5.98 4.98 1.12 0.14 0.13 2.76 4.48 0.43 0.07 0.24 14.93 2.05 3.35 0.49 0.52 1.73 0.15 0.39 0.47 0.25
Sro1342_g264540.1 (Contig68.g690)
 0.14 0.86 1.46 0.78 0.49 0.05 1.04 0.93 2.44 0.92 0.0 0.11 15.04 0.0 0.45 0.15 0.07 13.18 1.39 18.03 0.42 0.63 1.38 0.22 0.0 0.16 0.07
Sro1463_g274860.1 (Contig87.g921)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.09 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro149_g068580.1 (Contig259.g3226)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.17 0.0 0.01 0.0 0.0 0.37 0.19 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1526_g279780.1 (Contig1576.g14319)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1529_g280030.1 (Contig392.g5312)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.09 0.04 0.02 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1636_g287580.1 (Contig3111.g24739)
 1.62 1.02 0.78 2.1 1.75 2.21 1.32 6.81 4.51 3.81 0.78 5.72 4.52 0.71 0.69 2.05 3.44 20.22 9.37 7.18 2.34 2.18 3.84 0.91 6.88 1.07 1.94
4.38 0.0 0.37 0.0 0.62 1.0 2.56 3.83 3.76 7.76 7.06 10.68 17.7 2.87 4.05 3.31 3.35 71.27 16.28 21.17 8.21 1.78 2.38 2.85 1.04 1.59 2.56
Sro1751_g295300.1 (Contig3845.g29594)
 0.24 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.12 0.14 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2045_g312420.1 (Contig2859.g22927)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2092_g314070.1 (Contig3651.g28196)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.21 0.21 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro209_g087480.1 (Contig4070.g31219)
 26.69 2.44 1.32 5.68 3.42 4.55 1.84 2.64 2.45 5.37 13.17 3.89 9.67 0.82 5.39 3.72 7.54 70.4 28.0 12.6 3.01 0.7 1.47 8.35 15.55 5.7 5.78
Sro2553_g331050.1 (Contig1602.g14541)
 10.62 5.97 7.54 28.44 50.0 3.0 19.44 21.98 13.87 132.51 15.93 204.45 145.65 135.1 20.82 31.65 47.0 3346.91 330.54 432.33 254.87 41.77 18.08 81.25 750.44 276.37 5.47
Sro2600_g332290.1 (Contig4572.g34137)
 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.27 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2666_g334160.1 (Contig4029.g30950)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.09 0.0 0.2 0.89 0.03 0.02 0.0 0.0 1.1 0.36 0.63 0.03 0.02 0.01 0.18 0.0 0.0 0.05
Sro283_g107850.1 (Contig4255.g32216)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.27 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro288_g108900.1 (Contig62.g510)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.0 0.22 0.26 0.0 1.89 0.0 0.16 0.0 0.0 2.76 1.59 1.57 0.0 0.0 0.01 0.33 0.23 0.25 0.26
Sro30_g019710.1 (Contig3962.g30371)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3141_g344380.1 (Contig3095.g24657)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro320_g116410.1 (Contig3665.g28302)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.41 3.64 0.07 0.23 0.56 0.0 14.46 6.65 3.37 0.07 0.0 0.0 0.54 0.43 0.48 0.09
Sro323_g117420.1 (Contig364.g4923)
 0.28 0.0 1.33 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 2.25 0.71 1.17 0.22 0.0 0.24 0.43 0.0 0.0 0.21
Sro348_g123140.1 (Contig2346.g19280)
 0.03 0.33 0.05 0.05 0.05 0.02 0.24 0.23 0.24 0.79 0.37 0.6 1.46 1.46 0.36 0.23 0.57 4.28 1.19 0.28 0.67 0.17 0.05 0.35 0.08 0.43 0.85
Sro374_g129310.1 (Contig347.g4692)
 0.0 55.02 5.61 18.79 4.43 0.98 0.68 0.07 0.0 9.45 9.35 4.64 5.79 0.65 9.43 3.28 13.67 108.72 68.85 24.93 2.45 0.51 0.38 0.49 0.0 0.63 6.66
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.13 0.47 0.06 0.22 0.33 0.09 0.29 0.54 0.11 0.24 0.0 0.52 2.27 0.34 1.31 0.76 0.1 0.14 0.06 0.0 0.39 0.03
Sro3_g002040.1 (Contig3832.g29389)
 0.0 0.12 0.1 0.14 0.1 0.96 1.03 1.03 0.98 1.0 0.86 0.37 6.0 0.38 1.23 1.29 1.55 19.0 8.05 6.37 1.01 0.56 0.74 0.12 0.5 0.21 0.75
Sro404_g135870.1 (Contig4176.g31847)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro411_g137520.1 (Contig243.g2958)
 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.09 0.67 0.0 0.03 0.0 0.0 1.61 0.64 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.17 4.52 6.45 5.49 4.68 0.58 2.87 3.66 2.39 3.06 2.5 2.98 4.97 1.28 2.33 2.08 1.88 20.53 12.61 5.26 3.71 2.44 1.24 3.3 5.23 6.44 2.17
0.0 0.29 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.05 0.0 1.56 0.56 0.95 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro697_g189040.1 (Contig3345.g26203)
 0.0 1.07 1.47 0.5 1.17 0.64 3.95 0.95 0.33 4.19 1.6 5.69 12.39 1.05 1.9 0.47 0.63 20.23 10.02 15.05 6.2 1.7 1.81 2.94 7.4 6.28 1.54
Sro69_g038730.1 (Contig4677.g34782)
 0.11 8.87 10.13 11.34 9.39 1.91 2.06 3.6 4.19 7.3 2.64 7.2 30.57 0.83 2.77 10.79 3.49 29.95 18.31 22.13 7.09 2.75 2.97 1.87 2.73 5.8 5.92
Sro738_g195340.1 (Contig2916.g23213)
 0.0 1.3 1.22 2.45 1.44 0.1 0.28 0.14 0.58 0.39 0.51 0.13 2.1 0.0 0.1 0.11 1.38 7.58 3.16 1.69 0.03 0.12 0.2 1.08 0.87 0.54 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 3.65 0.0 0.0 0.0 0.0 5.82 1.0 2.24 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro812_g206040.1 (Contig1219.g11464)
 0.0 0.37 0.14 0.59 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.01 0.58 0.0 0.01 0.0 0.0 6.89 1.55 0.62 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro817_g206910.1 (Contig4010.g30855)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.29 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro837_g209160.1 (Contig405.g5509)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.17 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro845_g209970.1 (Contig2192.g18249)
 0.13 3.67 2.07 3.55 3.8 0.33 2.09 3.51 5.23 4.53 3.15 5.62 14.61 4.16 2.85 2.14 2.67 23.28 11.27 11.39 6.38 5.06 4.22 2.91 3.79 4.38 1.71
Sro892_g216980.1 (Contig1567.g14232)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.04 1.13 0.0 0.02 0.0 0.0 1.78 0.45 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro967_g225870.1 (Contig1083.g10526)
 0.0 0.12 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.18 0.11 0.04 0.33 0.0 0.01 0.09 0.05 2.44 0.91 1.66 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07
Sro96_g049640.1 (Contig3763.g28890)
 0.08 1.12 3.39 5.02 2.14 0.45 1.42 1.15 1.01 1.54 1.19 0.98 5.49 1.06 1.75 1.64 2.06 12.76 3.57 6.4 2.61 0.88 0.75 1.18 1.41 0.97 1.12

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)