Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1129_g244330.1 (Contig2187.g18226)	0.0	0.16	0.07	0.3	0.11	0.0	0.84	1.0	0.33	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.01	0.03	0.02	0.01	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro113_g056040.1 (Contig4126.g31569)	0.01	0.07	0.36	0.1	0.02	0.11	0.06	0.11	0.04	0.58	0.01	1.0	0.03	0.42	0.38	0.16	0.06	0.13	0.13	0.06	0.79	0.0	0.04	0.08	0.04	0.02	0.3
Sro113_g056110.1 (Contig4126.g31576)	0.04	0.39	0.26	0.05	0.08	0.09	0.15	0.14	0.08	0.71	0.06	0.99	0.01	0.52	0.84	0.14	0.03	0.06	0.06	0.02	1.0	0.01	0.08	0.05	0.0	0.0	0.35
Sro1152_g246920.1 (Contig333.g4432)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	1.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.02	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1158_g247450.1 (Contig718.g8286)	0.0	0.19	0.0	0.91	0.0	0.0	0.37	0.03	0.1	0.23	0.11	0.0	0.72	0.0	0.27	0.83	0.08	0.52	1.0	0.69	0.29	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.13
Sro1201_g251990.1 (Contig377.g5066)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.57	0.59	0.1	0.0	0.0	0.0	0.22	0.14	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1378_g267590.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.02	0.11	0.0	0.63	0.96	0.54	0.07	0.92	0.0	0.0	0.43	0.71	0.0	0.0	0.2	0.0	1.0	0.0	0.0
Sro1477_g276000.1 (Contig191.g2247)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1501_g277950.1 (Contig2462.g20158)	0.02	0.88	0.79	0.81	0.81	0.48	0.8	0.74	0.59	0.6	0.65	0.6	0.7	0.53	0.62	0.63	0.55	0.82	1.0	0.67	0.48	0.3	0.61	0.59	0.53	0.51	0.51
Sro1531_g280200.1 (Contig2576.g20926)	0.0	0.2	0.19	0.08	0.08	0.2	0.27	0.55	0.39	0.3	0.51	0.5	0.39	0.41	0.4	0.31	0.7	0.26	0.19	0.22	1.0	0.55	0.43	0.18	0.18	0.11	0.32
Sro1560_g282550.1 (Contig3879.g29830)	0.04	0.28	0.29	0.39	0.47	0.48	1.0	0.5	0.3	0.48	0.51	0.71	0.09	0.35	0.4	0.51	0.19	0.32	0.06	0.04	0.37	0.06	0.24	0.36	0.29	0.26	0.39
Sro1571_g283330.1 (Contig4686.g34844)	0.0	1.0	0.71	0.71	0.45	0.01	0.21	0.53	0.33	0.16	0.14	0.11	0.24	0.08	0.09	0.05	0.06	0.36	0.31	0.44	0.07	0.03	0.34	0.08	0.06	0.07	0.05
Sro1587_g284241.1	0.0	0.36	0.0	0.0	0.16	0.0	0.23	0.28	0.14	0.36	0.12	0.21	0.0	0.0	0.23	0.07	0.0	0.87	0.46	0.0	1.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.1
Sro159_g071810.1 (Contig500.g6721)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1836_g300660.1 (Contig1941.g16696)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.16	0.29	0.09	0.0	0.17	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1848_g301460.1 (Contig4444.g33359)	0.0	0.05	0.12	0.07	0.08	0.14	1.0	0.94	0.53	0.06	0.03	0.05	0.03	0.47	0.14	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.12	0.5	0.61	0.27	0.03	0.04
Sro1907_g304700.1 (Contig2841.g22822)	0.0	0.05	0.15	0.11	0.15	0.07	0.18	0.15	0.11	0.1	0.04	0.06	0.06	0.65	0.05	0.0	0.1	0.34	0.06	0.05	0.11	0.07	0.2	0.23	1.0	0.43	0.01
Sro1_g000960.1 (Contig3007.g24011)	0.03	0.07	0.04	0.08	0.1	0.16	0.51	0.78	0.73	0.39	0.29	0.56	0.05	0.16	0.26	0.22	0.14	0.38	0.33	0.09	1.0	0.71	0.4	0.05	0.02	0.06	0.21
Sro207_g086911.1	0.0	0.03	0.0	0.01	0.05	0.01	0.63	1.0	0.37	0.15	0.01	0.02	0.07	0.05	0.02	0.0	0.01	0.16	0.06	0.19	0.59	0.13	0.32	0.17	0.0	0.02	0.03
Sro2199_g318790.1 (Contig604.g7511)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.36	0.0	1.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro225_g091890.1 (Contig1661.g14987)	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.38	0.0	0.61	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.08
Sro2269_g321340.1 (Contig2676.g21656)	1.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.35	0.16	0.0	0.0	0.97	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.45	0.0	0.25	0.2	0.0	0.0	0.0
Sro2271_g321430.1 (Contig244.g2982)	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	1.0	0.54	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.08	0.0	0.16	0.0	0.1	0.0	0.54	0.26	0.22	0.0	0.09
Sro2302_g322520.1 (Contig3019.g24083)	0.01	0.03	0.0	0.02	0.01	0.17	1.0	0.81	0.15	0.23	0.03	0.13	0.46	0.37	0.13	0.33	0.03	0.02	0.0	0.3	0.2	0.15	0.92	0.14	0.52	0.09	0.1
Sro2311_g322810.1 (Contig3301.g25895)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.24	0.21	0.17	0.16	0.05	0.07	0.09	0.84	0.07	0.01	0.12	0.39	0.02	0.07	0.62	0.0	0.29	0.24	1.0	0.45	0.02
Sro2334_g323770.2	0.1	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.22	0.1	0.3	0.12	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.21	0.22	0.23	0.3	0.56	0.33	0.0
Sro237_g095270.1 (Contig1864.g16298)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro241_g096380.1 (Contig4317.g32556)	0.01	0.76	0.43	0.61	0.58	0.41	0.85	0.67	0.49	0.58	0.67	0.64	0.96	0.5	0.56	0.54	0.54	0.63	0.58	1.0	0.52	0.39	0.42	0.64	0.53	0.46	0.42
Sro2776_g336850.1 (Contig650.g7771)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.4	0.31	0.3	0.22	0.39	0.38	0.04	0.12	0.19	0.18	0.81	0.76	0.74	0.35	0.01	0.25	0.23	0.64	0.18	0.15
Sro27_g018100.1 (Contig3926.g30071)	0.05	0.63	0.37	0.2	0.25	0.08	0.48	1.0	0.89	0.4	0.46	0.31	0.53	0.29	0.47	0.63	0.27	0.57	0.39	0.72	0.52	0.49	0.74	0.21	0.21	0.16	0.33
Sro2826_g338023.1	0.01	0.11	0.03	0.04	0.04	0.03	1.0	0.6	0.38	0.34	0.1	0.29	0.11	0.14	0.11	0.19	0.05	0.35	0.15	0.12	0.79	0.1	0.31	0.45	0.82	0.69	0.08
Sro2904_g339910.1 (Contig926.g9703)	0.0	0.15	0.13	0.06	0.15	0.0	0.78	0.39	0.43	0.03	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	1.0	0.32	0.0	0.2	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro3225_g345590.1 (Contig1499.g13689)	0.0	0.0	0.11	0.0	0.35	0.0	0.39	1.0	0.23	0.1	0.06	0.16	0.19	0.05	0.06	0.09	0.0	0.22	0.24	0.06	0.06	0.12	0.71	0.0	0.0	0.0	0.06
Sro339_g121090.1 (Contig3791.g29115)	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	1.0	0.0	0.0	0.29
Sro33_g021180.1 (Contig2613.g21139)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	1.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro33_g021670.1 (Contig2613.g21188)	0.29	1.0	0.53	0.84	0.64	0.02	0.83	0.57	0.59	0.42	0.17	0.63	0.02	0.05	0.15	0.33	0.18	0.01	0.01	0.02	0.16	0.06	0.29	0.13	0.06	0.08	0.1
Sro33_g021680.1 (Contig2613.g21189)	0.41	1.0	0.46	0.56	0.29	0.13	0.83	0.64	0.75	0.54	0.39	0.54	0.13	0.0	0.06	0.12	0.0	0.0	0.0	0.04	0.26	0.1	0.45	0.15	0.1	0.0	0.2
Sro380_g130540.1 (Contig3948.g30246)	0.23	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.62	0.01	1.0	0.11	0.68	0.03	0.02	0.02	0.0	0.03	0.05	1.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02
Sro3848_g351442.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro3_g002130.1 (Contig3832.g29398)	0.03	0.47	1.0	0.67	0.32	0.01	0.59	0.57	0.51	0.34	0.16	0.39	0.11	0.07	0.12	0.19	0.21	0.48	0.67	0.2	0.59	0.16	0.38	0.2	0.15	0.35	0.11
Sro4184_g353310.1 (Contig2063.g17678)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	1.0	0.0	0.16	0.33	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro4203_g353371.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	1.0	0.29	0.29	0.19	0.34	0.0	0.0	0.3	0.33	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.2	0.0	0.0	0.14	0.62
Sro4287_g353620.1 (Contig3641.g28140)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.88	0.16	0.19	0.04	0.51	0.0	0.2	0.0	0.29	0.21	0.12	0.0	0.58	0.0	0.0	0.83	0.0	0.03	0.33	1.0	0.22	0.48
Sro43_g026050.1 (Contig2453.g20071)	0.0	0.44	0.65	0.37	0.47	0.29	1.0	0.46	0.46	0.18	0.12	0.07	0.33	0.19	0.16	0.04	0.06	0.11	0.03	0.1	0.13	0.08	0.61	0.33	0.19	0.04	0.06
Sro465_g148510.1 (Contig3955.g30296)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.15	0.03	0.58	0.35	0.33	0.0	0.0	0.15	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.5
Sro527_g160540.1 (Contig1568.g14236)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro55_g032130.1 (Contig4458.g33487)	0.01	1.0	0.71	0.6	0.53	0.07	0.43	0.67	0.35	0.48	0.93	0.52	0.16	0.37	0.51	0.27	0.29	0.19	0.18	0.28	0.38	0.06	0.36	0.34	0.17	0.29	0.31
Sro597_g172920.1 (Contig417.g5579)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro5_g004350.1 (Contig4001.g30750)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.16	1.0	0.54	0.05	0.03	0.04	0.06	0.0	0.02	0.05	0.0	0.16	0.12	0.06	0.05	0.04	0.25	0.13	0.5	0.42	0.02
Sro610_g175150.1 (Contig255.g3141)	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.17	0.0	0.35	0.1	0.08	0.05	1.0	0.1	0.0	0.05	0.15	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14
Sro637_g179460.1 (Contig2599.g21067)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.42	0.19	0.13	0.12	0.06	0.14	0.09	0.01	0.05	0.09	0.01	1.0	0.37	0.35	0.12	0.0	0.09	0.06	0.05	0.09	0.04
Sro668_g184280.1 (Contig3161.g25033)	0.02	0.57	0.29	0.06	0.09	0.1	0.94	1.0	0.52	0.33	0.03	0.25	0.0	0.56	0.31	0.02	0.05	0.09	0.08	0.01	0.98	0.0	0.54	0.08	0.05	0.01	0.12
Sro668_g184330.1 (Contig3161.g25038)	0.01	0.39	0.27	0.33	0.35	0.31	1.0	1.0	0.54	0.18	0.31	0.06	0.43	0.01	0.43	0.55	0.15	0.66	0.19	0.35	0.17	0.12	0.53	0.36	0.53	0.15	0.2
Sro673_g185321.2	0.08	0.03	0.09	0.06	0.06	0.0	0.24	1.0	0.17	0.22	0.1	0.43	0.23	0.08	0.3	0.91	0.21	0.43	0.2	0.38	0.15	0.21	0.6	0.18	0.77	0.21	0.23
Sro687_g187310.1 (Contig4445.g33376)	0.01	0.53	0.28	0.41	0.27	0.01	0.71	0.92	0.62	0.07	0.0	0.01	0.16	0.01	0.01	0.0	0.0	0.92	1.0	0.15	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.02
Sro723_g193000.1 (Contig2673.g21644)	0.01	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.45	0.9	1.0	0.14	0.0	0.04	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.08	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro780_g201490.1 (Contig2838.g22783)	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.07	0.48	1.0	0.2	0.0	0.12	0.39	0.46	0.29	0.28	0.53	0.0	0.15	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.16
Sro820_g207290.1 (Contig34.g211)	0.0	0.74	0.38	0.36	0.53	0.0	0.17	1.0	0.94	0.07	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro82_g044000.1 (Contig4032.g30991)	0.0	0.39	0.24	0.0	0.31	0.0	0.63	0.23	0.39	0.24	0.0	0.13	0.23	0.06	0.06	0.07	0.07	0.14	0.2	1.0	0.48	0.0	0.78	0.0	0.18	0.0	0.0
Sro85_g045430.1 (Contig4580.g34220)	0.01	0.27	0.63	0.32	0.2	0.01	0.14	0.15	0.11	0.27	0.08	0.14	0.05	0.27	0.16	0.06	0.09	0.02	0.08	0.07	1.0	0.02	0.04	0.08	0.1	0.05	0.17
Sro878_g214820.1 (Contig706.g8171)	0.0	0.48	0.46	0.6	0.46	0.06	1.0	0.61	0.27	0.21	0.25	0.23	0.38	0.1	0.22	0.26	0.24	0.42	0.14	0.25	0.19	0.04	0.25	0.16	0.22	0.14	0.15
Sro890_g216720.1 (Contig4208.g32014)	0.01	0.33	1.0	0.44	0.41	0.43	0.56	0.4	0.7	0.1	0.1	0.09	0.08	0.81	0.45	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.11	0.53	0.1	0.15	0.03	0.11
Sro904_g218350.1 (Contig2814.g22572)	0.01	0.06	0.13	0.09	0.06	0.03	0.17	1.0	0.79	0.08	0.08	0.12	0.04	0.04	0.07	0.05	0.13	0.07	0.05	0.06	0.11	0.08	0.35	0.05	0.06	0.03	0.05
Sro908_g218890.1 (Contig954.g9852)	0.03	0.08	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.39	0.61	0.05	0.04	0.09	0.14	0.0	0.03	0.03	0.03	0.12	0.16	0.29	0.05	0.02	0.36	0.0	0.05	0.0	0.01
Sro915_g219730.1 (Contig3226.g25523)	0.11	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.07	1.0	0.75	0.08	0.0	0.15	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.12	0.1	0.05	0.21	0.07	0.06	0.03	0.01
Sro95_g049160.1 (Contig45.g301)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	1.0	0.26	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)