Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1129_g244330.1 (Contig2187.g18226)
0.0 0.36 0.16 0.68 0.25 0.0 1.91 2.27 0.76 0.03 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.02 0.07 0.04 0.03 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro113_g056040.1 (Contig4126.g31569)
0.03 0.17 0.84 0.23 0.06 0.26 0.14 0.25 0.09 1.36 0.03 2.34 0.07 0.99 0.89 0.37 0.14 0.3 0.3 0.14 1.86 0.0 0.08 0.18 0.09 0.04 0.69
Sro113_g056110.1 (Contig4126.g31576)
0.63 5.77 3.9 0.77 1.13 1.32 2.24 2.04 1.17 10.56 0.87 14.65 0.16 7.63 12.46 2.0 0.44 0.86 0.89 0.34 14.81 0.11 1.24 0.8 0.04 0.06 5.15
Sro1152_g246920.1 (Contig333.g4432)
0.0 0.36 1.01 1.25 0.89 1.89 9.85 119.68 65.99 0.48 0.09 0.11 2.2 0.08 0.21 0.31 0.17 0.61 0.26 3.13 0.37 2.77 10.35 0.22 0.19 0.28 0.11
Sro1158_g247450.1 (Contig718.g8286)
0.0 0.04 0.0 0.19 0.0 0.0 0.08 0.01 0.02 0.05 0.02 0.0 0.15 0.0 0.06 0.18 0.02 0.11 0.21 0.15 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro1201_g251990.1 (Contig377.g5066)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.66 0.68 0.12 0.0 0.0 0.0 0.25 0.16 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.06 0.0 0.33 0.5 0.28 0.03 0.48 0.0 0.0 0.23 0.37 0.0 0.0 0.1 0.0 0.52 0.0 0.0
Sro1477_g276000.1 (Contig191.g2247)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1501_g277950.1 (Contig2462.g20158)
0.86 34.19 30.93 31.76 31.44 18.59 31.39 28.88 23.11 23.51 25.4 23.31 27.44 20.77 24.25 24.49 21.37 32.19 39.05 26.24 18.76 11.79 23.73 22.96 20.52 19.97 19.78
Sro1531_g280200.1 (Contig2576.g20926)
0.04 1.89 1.84 0.8 0.81 1.96 2.59 5.25 3.71 2.91 4.92 4.84 3.69 3.96 3.87 2.95 6.66 2.47 1.78 2.12 9.58 5.31 4.1 1.71 1.75 1.06 3.04
Sro1560_g282550.1 (Contig3879.g29830)
2.86 18.25 18.68 25.2 30.43 31.05 65.05 32.39 19.53 30.97 32.95 45.91 5.61 22.85 26.01 33.14 12.27 20.57 3.69 2.85 24.07 4.09 15.35 23.55 18.63 17.04 25.3
Sro1571_g283330.1 (Contig4686.g34844)
0.0 3.84 2.74 2.71 1.73 0.05 0.81 2.04 1.25 0.63 0.55 0.41 0.93 0.3 0.33 0.18 0.24 1.38 1.2 1.69 0.27 0.12 1.32 0.31 0.24 0.28 0.2
0.0 0.46 0.0 0.0 0.2 0.0 0.3 0.36 0.18 0.46 0.15 0.26 0.0 0.0 0.29 0.1 0.0 1.11 0.58 0.0 1.27 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.13
Sro159_g071810.1 (Contig500.g6721)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1836_g300660.1 (Contig1941.g16696)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.08 0.02 0.0 0.04 0.03 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1848_g301460.1 (Contig4444.g33359)
0.0 1.63 4.03 2.43 2.89 4.91 34.43 32.23 18.31 2.05 1.04 1.65 1.05 16.34 4.69 0.0 0.0 0.22 0.0 0.19 1.51 3.98 17.12 20.91 9.36 1.1 1.43
Sro1907_g304700.1 (Contig2841.g22822)
1.56 73.95 214.81 153.95 216.81 101.59 255.83 213.63 162.99 137.25 57.39 82.21 83.28 936.49 68.37 6.87 144.52 489.27 91.7 76.53 157.18 100.2 284.95 331.41 1430.5 610.14 10.65
Sro1_g000960.1 (Contig3007.g24011)
0.35 0.67 0.45 0.76 0.96 1.61 5.06 7.7 7.24 3.87 2.86 5.54 0.53 1.6 2.57 2.14 1.4 3.75 3.28 0.87 9.93 7.05 3.98 0.51 0.17 0.63 2.06
0.0 0.03 0.0 0.01 0.05 0.01 0.74 1.18 0.43 0.18 0.01 0.02 0.08 0.05 0.02 0.0 0.01 0.19 0.07 0.22 0.7 0.15 0.37 0.21 0.01 0.02 0.03
Sro2199_g318790.1 (Contig604.g7511)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro225_g091890.1 (Contig1661.g14987)
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.26 0.0 0.42 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.69 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro2269_g321340.1 (Contig2676.g21656)
0.07 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
Sro2271_g321430.1 (Contig244.g2982)
0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 6.45 3.47 0.36 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.31 0.5 0.0 1.04 0.0 0.62 0.0 3.45 1.68 1.41 0.0 0.55
Sro2302_g322520.1 (Contig3019.g24083)
0.11 0.31 0.0 0.2 0.11 1.74 10.08 8.15 1.54 2.3 0.31 1.29 4.67 3.77 1.36 3.34 0.33 0.22 0.03 3.06 2.07 1.48 9.3 1.41 5.27 0.92 0.97
Sro2311_g322810.1 (Contig3301.g25895)
0.16 0.0 0.08 0.43 0.18 11.63 36.59 31.18 25.41 23.79 6.84 10.71 14.0 125.37 9.76 1.51 17.76 58.92 3.56 9.81 92.39 0.16 43.65 35.25 149.42 67.8 2.7
0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.08 0.03 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.06 0.06 0.07 0.08 0.16 0.09 0.0
Sro237_g095270.1 (Contig1864.g16298)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro241_g096380.1 (Contig4317.g32556)
0.29 19.98 11.26 15.94 15.06 10.84 22.36 17.5 12.84 15.07 17.58 16.77 25.17 13.0 14.63 14.22 14.24 16.58 15.26 26.18 13.67 10.32 11.06 16.65 13.77 12.15 11.02
Sro2776_g336850.1 (Contig650.g7771)
0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 3.91 1.57 1.23 1.17 0.85 1.52 1.48 0.16 0.45 0.75 0.69 3.15 2.95 2.87 1.38 0.06 0.96 0.89 2.5 0.69 0.59
Sro27_g018100.1 (Contig3926.g30071)
0.35 4.44 2.63 1.39 1.78 0.56 3.37 7.07 6.27 2.83 3.29 2.22 3.78 2.02 3.35 4.42 1.94 4.01 2.76 5.08 3.67 3.47 5.22 1.47 1.45 1.13 2.34
0.01 0.16 0.04 0.06 0.06 0.04 1.41 0.84 0.54 0.47 0.15 0.41 0.15 0.19 0.16 0.27 0.07 0.5 0.21 0.17 1.12 0.14 0.44 0.64 1.16 0.97 0.11
Sro2904_g339910.1 (Contig926.g9703)
0.0 0.41 0.36 0.16 0.42 0.0 2.15 1.08 1.17 0.09 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.99 2.76 0.89 0.0 0.55 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3225_g345590.1 (Contig1499.g13689)
0.0 0.0 0.08 0.0 0.25 0.0 0.29 0.73 0.17 0.07 0.04 0.12 0.14 0.04 0.04 0.06 0.0 0.16 0.18 0.04 0.04 0.09 0.52 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro339_g121090.1 (Contig3791.g29115)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.15 0.0 0.0 0.04
Sro33_g021180.1 (Contig2613.g21139)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.16 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro33_g021670.1 (Contig2613.g21188)
1.39 4.77 2.51 4.0 3.06 0.1 3.97 2.71 2.8 2.02 0.82 3.0 0.11 0.26 0.71 1.56 0.85 0.06 0.07 0.07 0.77 0.31 1.4 0.61 0.27 0.38 0.46
Sro33_g021680.1 (Contig2613.g21189)
1.22 2.99 1.39 1.69 0.87 0.38 2.48 1.92 2.25 1.6 1.18 1.61 0.4 0.0 0.18 0.37 0.0 0.0 0.0 0.13 0.78 0.29 1.36 0.44 0.29 0.0 0.59
Sro380_g130540.1 (Contig3948.g30246)
18.73 0.77 1.13 2.07 6.51 1.15 0.57 1.28 1.45 51.48 0.83 82.85 9.44 55.94 2.61 1.93 1.62 0.41 2.38 4.45 82.85 1.1 0.94 1.96 2.18 2.04 1.76
0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3_g002130.1 (Contig3832.g29398)
0.09 1.25 2.67 1.79 0.86 0.04 1.58 1.53 1.37 0.91 0.43 1.05 0.28 0.2 0.31 0.52 0.55 1.27 1.79 0.53 1.56 0.43 1.01 0.55 0.4 0.95 0.3
Sro4184_g353310.1 (Contig2063.g17678)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.11 0.0 0.02 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.23 0.07 0.07 0.04 0.08 0.0 0.0 0.07 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.03 0.14
Sro4287_g353620.1 (Contig3641.g28140)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 1.87 0.34 0.41 0.09 1.07 0.0 0.43 0.0 0.61 0.43 0.25 0.0 1.23 0.0 0.0 1.75 0.0 0.06 0.7 2.11 0.45 1.01
Sro43_g026050.1 (Contig2453.g20071)
0.25 31.69 46.97 26.49 34.11 21.07 72.48 33.12 33.61 13.0 9.02 5.25 23.98 13.76 11.28 3.15 4.6 8.18 2.03 7.11 9.12 5.94 43.89 24.11 14.11 2.87 4.61
Sro465_g148510.1 (Contig3955.g30296)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.16 0.1 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.13
Sro527_g160540.1 (Contig1568.g14236)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro55_g032130.1 (Contig4458.g33487)
0.04 3.61 2.55 2.17 1.9 0.25 1.54 2.42 1.28 1.73 3.37 1.86 0.57 1.32 1.84 0.98 1.04 0.68 0.64 1.0 1.37 0.21 1.29 1.23 0.63 1.04 1.12
Sro597_g172920.1 (Contig417.g5579)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro5_g004350.1 (Contig4001.g30750)
0.09 0.1 0.04 0.04 0.04 0.75 1.86 11.31 6.06 0.54 0.34 0.43 0.67 0.06 0.2 0.58 0.01 1.83 1.31 0.66 0.6 0.46 2.86 1.48 5.67 4.77 0.17
Sro610_g175150.1 (Contig255.g3141)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.06 0.0 0.13 0.04 0.03 0.02 0.36 0.04 0.0 0.02 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
Sro637_g179460.1 (Contig2599.g21067)
0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 4.21 1.94 1.27 1.18 0.59 1.38 0.89 0.14 0.49 0.86 0.13 10.02 3.71 3.46 1.19 0.0 0.86 0.63 0.47 0.87 0.36
Sro668_g184280.1 (Contig3161.g25033)
1.06 29.77 15.06 2.91 4.72 5.14 49.02 51.97 27.02 16.95 1.65 12.89 0.07 29.05 16.36 1.24 2.8 4.55 4.22 0.47 51.11 0.2 28.16 3.98 2.72 0.61 6.3
Sro668_g184330.1 (Contig3161.g25038)
0.79 25.72 18.34 21.78 23.14 21.01 66.72 66.64 36.09 11.83 20.61 4.23 28.76 0.63 28.92 36.97 10.28 44.08 12.72 23.13 11.38 8.1 35.37 23.93 35.2 9.92 13.05
0.12 0.04 0.13 0.09 0.1 0.0 0.37 1.54 0.26 0.34 0.15 0.66 0.36 0.12 0.47 1.41 0.32 0.66 0.31 0.59 0.23 0.33 0.92 0.27 1.18 0.33 0.36
Sro687_g187310.1 (Contig4445.g33376)
0.1 5.15 2.78 3.98 2.69 0.07 6.92 9.0 6.08 0.69 0.0 0.1 1.56 0.07 0.06 0.01 0.04 9.01 9.78 1.47 0.01 0.01 4.22 0.02 0.0 0.0 0.16
Sro723_g193000.1 (Contig2673.g21644)
0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.37 0.75 0.83 0.11 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.07 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro780_g201490.1 (Contig2838.g22783)
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.14 0.28 0.06 0.0 0.03 0.11 0.13 0.08 0.08 0.15 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro820_g207290.1 (Contig34.g211)
0.0 18.15 9.37 8.85 13.08 0.02 4.29 24.64 23.17 1.73 0.14 0.01 0.08 0.0 0.54 0.2 0.13 0.31 0.05 0.08 0.03 1.96 15.24 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro82_g044000.1 (Contig4032.g30991)
0.0 0.19 0.12 0.0 0.15 0.0 0.31 0.11 0.19 0.12 0.0 0.07 0.11 0.03 0.03 0.04 0.04 0.07 0.1 0.5 0.24 0.0 0.38 0.0 0.09 0.0 0.0
Sro85_g045430.1 (Contig4580.g34220)
0.11 2.01 4.73 2.4 1.48 0.05 1.03 1.16 0.83 2.04 0.64 1.04 0.34 2.05 1.24 0.42 0.68 0.16 0.59 0.54 7.52 0.16 0.29 0.6 0.73 0.37 1.31
Sro878_g214820.1 (Contig706.g8171)
0.07 12.43 11.68 15.35 11.72 1.56 25.67 15.71 6.99 5.37 6.3 5.9 9.73 2.48 5.7 6.8 6.24 10.86 3.71 6.34 4.99 1.05 6.31 4.01 5.7 3.67 3.85
Sro890_g216720.1 (Contig4208.g32014)
0.52 11.94 36.11 16.02 14.85 15.52 20.25 14.29 25.17 3.68 3.63 3.23 2.73 29.15 16.12 0.59 1.95 0.6 1.06 0.62 1.16 3.79 19.12 3.63 5.38 0.96 3.9
Sro904_g218350.1 (Contig2814.g22572)
1.27 5.66 11.58 8.0 4.99 3.08 14.95 88.73 70.06 6.93 7.52 10.44 3.78 3.49 6.45 4.14 11.62 6.33 4.63 5.73 9.51 7.11 30.7 4.35 5.56 2.81 4.51
Sro908_g218890.1 (Contig954.g9852)
0.04 0.13 0.0 0.0 0.0 0.03 1.63 0.63 1.0 0.07 0.07 0.15 0.23 0.0 0.05 0.05 0.04 0.19 0.26 0.47 0.08 0.03 0.58 0.0 0.08 0.0 0.02
Sro915_g219730.1 (Contig3226.g25523)
0.44 0.0 0.13 0.0 0.0 0.07 0.28 4.0 3.0 0.32 0.0 0.59 0.26 0.2 0.07 0.05 0.07 0.0 0.0 0.47 0.42 0.22 0.82 0.26 0.23 0.11 0.04
Sro95_g049160.1 (Contig45.g301)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)