Heatmap: Cluster_301 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1063_g237050.1 (Contig4044.g31056)
0.02 0.29 0.34 0.32 0.29 0.04 0.08 0.21 0.24 0.53 0.46 0.37 0.06 0.16 0.22 0.48 1.0 0.22 0.68 0.61 0.76 0.21 0.17 0.32 0.72 0.55 0.66
Sro1099_g241120.1 (Contig806.g9000)
0.03 0.37 0.25 0.36 0.28 0.03 0.11 0.18 0.49 0.48 0.41 0.37 0.27 0.1 0.21 0.12 0.39 0.15 0.52 1.0 0.57 0.28 0.31 0.27 0.77 0.23 0.47
Sro1107_g242120.1 (Contig4615.g34440)
0.03 0.07 0.01 0.06 0.09 0.06 0.22 0.16 0.07 0.61 0.27 0.71 0.22 0.54 0.38 0.27 0.11 0.24 0.7 1.0 0.79 0.31 0.07 0.27 0.55 0.75 0.54
Sro1132_g244740.1 (Contig3735.g28642)
0.01 0.61 1.0 0.86 0.69 0.11 0.18 0.15 0.13 0.37 0.29 0.39 0.57 0.23 0.15 0.34 0.07 0.25 0.59 0.65 0.39 0.25 0.28 0.39 0.45 0.54 0.35
Sro1132_g244750.1 (Contig3735.g28643)
0.03 0.28 0.81 0.44 0.27 0.13 0.15 0.12 0.24 0.33 0.38 0.26 1.0 0.26 0.22 0.53 0.15 0.21 0.52 0.92 0.41 0.38 0.4 0.25 0.41 0.44 0.38
Sro116_g057190.1 (Contig2228.g18495)
0.0 0.01 0.05 0.02 0.03 0.0 0.02 0.03 0.0 0.33 0.39 0.14 0.0 0.02 0.03 0.07 1.0 0.0 0.64 0.19 0.6 0.06 0.03 0.0 0.03 0.39 0.59
Sro1192_g251110.1 (Contig331.g4407)
0.16 0.95 0.52 0.55 0.66 0.24 0.45 0.47 0.52 0.92 1.0 0.99 0.11 0.55 0.47 0.42 0.77 0.24 1.0 0.74 0.85 0.54 0.41 0.77 0.93 0.66 0.91
Sro1197_g251530.1 (Contig496.g6701)
0.01 0.36 0.29 0.28 0.41 0.21 0.25 0.17 0.47 0.69 0.74 0.74 0.5 0.54 0.53 0.9 0.19 0.32 0.97 1.0 0.86 0.5 0.54 0.36 0.51 0.55 0.73
Sro1295_g260280.1 (Contig1102.g10677)
0.61 0.07 0.03 0.08 0.08 0.04 0.01 0.05 0.05 0.32 0.21 0.22 0.03 0.06 0.05 0.03 1.0 0.02 0.5 0.17 0.31 0.2 0.03 0.07 0.12 0.3 0.45
Sro142_g066190.1 (Contig226.g2668)
0.02 1.0 0.61 0.42 0.49 0.04 0.04 0.13 0.13 0.29 0.24 0.32 0.07 0.2 0.15 0.27 0.16 0.2 0.42 0.36 0.36 0.23 0.13 0.05 0.07 0.14 0.3
Sro145_g067330.1 (Contig3646.g28179)
0.02 1.0 0.47 0.5 0.52 0.04 0.04 0.21 0.01 0.64 0.48 0.84 0.11 0.87 0.09 0.18 0.9 0.11 0.83 0.41 0.72 0.31 0.06 0.05 0.08 0.46 0.84
Sro157_g071190.1 (Contig2362.g19409)
0.08 0.06 0.0 0.0 0.05 0.04 0.13 0.04 0.33 0.7 0.39 0.66 0.01 0.44 0.08 0.16 0.4 0.06 1.0 0.51 0.68 0.37 0.38 0.31 0.1 0.55 0.48
Sro1741_g294640.1 (Contig4311.g32510)
0.05 1.0 0.93 0.77 0.81 0.22 0.31 0.45 0.27 0.76 0.81 0.71 0.38 0.45 0.5 0.73 0.57 0.49 1.0 0.9 0.83 0.74 0.33 0.48 0.48 0.64 1.0
Sro184_g079950.1 (Contig2216.g18398)
0.18 0.03 0.04 0.01 0.03 0.03 0.18 0.1 0.51 0.66 0.65 0.69 0.19 0.39 0.28 0.33 0.37 0.06 0.81 1.0 0.81 0.41 0.44 0.25 0.56 0.72 0.61
Sro1883_g303430.1 (Contig2852.g22885)
0.0 0.9 0.73 0.65 0.76 0.03 0.14 0.09 0.19 0.59 0.53 0.8 0.06 0.28 0.17 0.02 0.81 0.07 1.0 0.5 0.76 0.34 0.38 0.23 0.38 0.6 0.61
Sro2035_g312030.1 (Contig3136.g24891)
0.03 0.12 0.08 0.11 0.15 0.44 0.17 0.25 0.28 0.45 0.5 0.51 0.65 0.21 0.31 0.25 0.22 0.38 0.85 1.0 0.54 0.14 0.34 0.21 0.4 0.53 0.42
Sro208_g087020.1 (Contig351.g4773)
0.01 0.08 0.08 0.21 0.16 0.14 0.13 0.19 0.14 0.56 0.79 0.78 0.12 0.38 0.23 0.22 0.89 0.08 1.0 0.86 0.67 0.45 0.3 0.12 0.19 0.45 0.67
Sro216_g089570.1 (Contig227.g2734)
0.01 0.06 0.08 0.09 0.12 0.13 0.04 0.05 0.23 0.34 0.65 0.47 0.04 0.19 0.08 0.0 0.47 0.01 1.0 0.46 0.3 0.27 0.39 0.1 0.09 0.4 0.37
Sro2404_g326440.1 (Contig3181.g25132)
0.01 0.14 0.03 0.13 0.12 0.03 0.09 0.15 0.15 0.54 0.52 0.61 0.17 0.1 0.04 0.01 0.93 0.08 1.0 0.44 0.84 0.38 0.18 0.03 0.0 0.44 0.58
Sro25_g017370.1 (Contig1417.g13076)
0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.8 0.24 0.51 0.47 0.59 0.7 0.73 0.47 0.17 0.63 0.54 0.67 0.62 0.77 0.85 0.62 0.44 0.48 0.36 0.37 1.0 0.76
Sro264_g102670.1 (Contig921.g9693)
0.01 0.11 0.06 0.05 0.11 0.02 0.02 0.4 0.05 0.43 0.49 0.27 0.05 0.05 0.12 0.64 1.0 0.17 0.77 0.36 0.24 0.61 0.17 0.03 0.07 0.13 0.77
Sro26_g017740.1 (Contig2432.g19945)
0.01 0.07 0.03 0.05 0.05 0.37 0.2 0.29 0.24 0.46 0.37 0.61 0.07 0.29 0.21 0.01 0.21 0.14 1.0 0.46 0.7 0.3 0.41 0.56 0.9 0.81 0.41
Sro271_g104560.1 (Contig2573.g20889)
0.01 0.09 0.08 0.07 0.06 0.64 0.39 0.25 0.4 0.54 0.27 0.52 0.3 0.42 0.41 0.09 0.32 0.35 0.6 0.69 0.96 0.53 0.46 0.57 0.81 1.0 0.51
Sro276_g106050.1 (Contig2556.g20785)
0.49 0.39 0.35 0.41 0.44 0.26 0.2 0.33 0.34 0.58 0.46 0.67 0.2 0.25 0.26 0.13 0.29 0.07 0.57 0.6 0.9 0.39 0.49 0.47 1.0 0.69 0.36
Sro2821_g337920.1 (Contig2953.g23405)
0.01 0.57 0.58 0.47 0.63 0.53 0.23 0.38 0.63 0.76 0.72 0.99 0.46 0.49 0.3 0.14 0.42 0.27 1.0 0.81 0.89 0.79 0.63 0.39 0.87 0.93 0.79
Sro282_g107480.1 (Contig1420.g13091)
0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.13 0.26 0.05 0.33 0.21 0.27 0.07 0.02 0.1 0.35 0.3 0.32 1.0 0.52 0.3 0.05 0.05 0.17 0.59 0.15 0.37
Sro283_g107730.1 (Contig4255.g32204)
0.03 0.07 0.08 0.05 0.08 0.16 0.18 0.25 0.24 0.62 0.68 0.59 0.04 0.4 0.3 0.24 0.33 0.1 1.0 0.62 0.83 0.46 0.32 0.22 0.87 0.89 0.76
Sro2_g001200.1 (Contig467.g6278)
0.01 0.38 0.44 0.69 0.6 0.06 0.02 0.44 0.21 0.26 0.06 0.37 0.02 0.04 0.03 0.0 0.02 0.02 1.0 0.38 0.19 0.14 0.19 0.07 0.1 0.44 0.16
Sro301_g112020.1 (Contig455.g6150)
0.03 0.18 0.32 0.17 0.21 0.0 0.02 0.1 0.22 0.52 0.88 0.55 0.48 0.06 0.21 0.29 0.45 0.16 0.79 1.0 0.55 0.13 0.36 0.04 0.23 0.18 0.52
Sro320_g116480.1 (Contig3665.g28309)
0.01 0.09 0.03 0.02 0.04 0.03 0.07 0.13 0.13 0.57 1.0 0.7 0.1 0.32 0.21 0.22 0.38 0.09 0.45 0.16 0.96 0.18 0.19 0.21 0.15 0.15 0.62
Sro345_g122570.1 (Contig2266.g18816)
0.02 0.13 0.11 0.11 0.09 0.57 0.39 0.83 0.42 0.43 0.43 0.47 0.27 0.36 0.31 0.01 0.38 0.51 1.0 0.51 0.5 0.41 0.33 0.76 0.69 0.77 0.45
Sro405_g136070.1 (Contig597.g7432)
0.04 0.29 0.63 0.32 0.3 0.08 0.15 0.29 0.34 0.45 0.63 0.55 0.7 0.34 0.36 0.52 0.37 0.11 0.48 1.0 0.6 0.25 0.24 0.36 0.56 0.28 0.53
Sro405_g136100.1 (Contig597.g7435)
0.02 0.19 0.06 0.02 0.04 0.12 0.3 0.29 0.13 0.5 0.82 0.38 0.27 0.44 0.48 0.51 0.6 0.48 0.95 0.9 0.72 0.1 0.12 0.56 1.0 0.7 0.49
Sro460_g147460.1 (Contig3843.g29571)
0.0 0.49 0.37 0.4 0.41 0.07 0.18 0.29 0.1 0.59 0.67 0.61 0.18 0.48 0.35 0.64 0.46 0.44 1.0 0.99 0.75 0.28 0.16 0.38 0.57 0.56 0.56
Sro486_g152610.1 (Contig3152.g25000)
0.08 0.64 0.63 0.82 0.49 0.24 0.46 0.4 0.39 0.87 0.46 0.94 0.42 0.6 0.65 0.94 0.52 0.63 0.89 1.0 0.93 0.5 0.3 0.62 0.57 0.92 0.62
Sro487_g152870.1 (Contig367.g4963)
0.9 0.04 0.09 0.09 0.04 0.11 0.06 0.1 0.2 0.48 0.37 0.55 0.18 0.16 0.17 0.32 0.33 0.19 1.0 0.75 0.6 0.13 0.28 0.2 0.24 0.15 0.27
Sro490_g153440.1 (Contig328.g4364)
1.0 0.32 0.24 0.24 0.21 0.03 0.04 0.1 0.04 0.29 0.35 0.26 0.02 0.21 0.14 0.22 0.31 0.05 0.51 0.3 0.25 0.24 0.17 0.28 0.39 0.24 0.38
Sro493_g154200.1 (Contig1170.g11152)
0.05 0.03 0.01 0.01 0.04 0.0 0.03 0.04 0.13 0.45 0.44 0.47 0.08 0.16 0.09 0.24 0.71 0.09 1.0 0.73 0.56 0.29 0.12 0.01 0.07 0.32 0.33
Sro502_g155630.1 (Contig2629.g21329)
0.01 0.47 0.28 0.3 0.21 0.02 0.03 0.01 0.02 0.47 0.35 0.35 0.08 0.09 0.13 0.12 1.0 0.0 0.67 0.45 0.66 0.37 0.05 0.01 0.03 0.27 0.59
Sro513_g157880.1 (Contig214.g2550)
0.0 0.17 0.07 0.16 0.06 0.07 0.08 0.11 0.07 0.48 0.42 0.41 0.02 0.4 0.25 0.23 1.0 0.07 0.27 0.11 0.48 0.15 0.07 0.08 0.09 0.52 0.71
Sro513_g157920.1 (Contig214.g2554)
0.0 0.16 0.11 0.04 0.05 0.07 0.1 0.06 0.06 0.6 0.67 0.3 0.04 0.52 0.17 0.26 1.0 0.05 0.41 0.14 0.66 0.14 0.05 0.04 0.14 0.39 0.75
Sro526_g160510.1 (Contig842.g9296)
0.03 0.08 0.13 0.1 0.1 0.37 0.21 0.37 0.26 0.48 0.49 0.53 0.5 0.25 0.3 0.32 0.31 0.4 1.0 0.68 0.56 0.2 0.34 0.47 0.35 0.46 0.54
Sro545_g163800.1 (Contig1180.g11223)
0.04 0.19 0.12 0.19 0.19 0.14 0.19 0.25 0.28 0.74 1.0 0.74 0.14 0.57 0.31 0.26 0.87 0.23 0.93 0.44 0.91 0.34 0.13 0.33 0.72 0.59 0.8
Sro546_g164070.1 (Contig4069.g31184)
0.05 0.09 0.19 0.13 0.1 0.08 0.29 0.25 0.48 0.43 0.22 0.4 0.43 0.22 0.21 0.23 0.17 0.21 0.33 0.8 0.78 0.3 0.4 0.42 1.0 0.58 0.17
Sro548_g164410.1 (Contig1714.g15321)
0.01 0.46 0.2 0.22 0.29 0.17 0.2 0.08 0.22 0.72 0.56 0.81 0.34 0.55 0.32 0.29 0.53 0.41 0.66 0.84 1.0 0.56 0.17 0.4 0.31 0.62 0.71
Sro622_g176970.1 (Contig2850.g22858)
0.01 0.22 0.14 0.19 0.17 0.02 0.41 0.33 0.37 0.42 0.12 0.45 0.06 0.17 0.09 0.06 0.27 0.13 0.52 0.38 1.0 0.41 0.56 0.35 0.98 0.51 0.17
Sro622_g177050.1 (Contig2850.g22866)
0.0 0.14 0.18 0.06 0.08 0.17 0.36 0.15 0.35 0.38 0.36 0.43 0.15 0.16 0.17 0.14 0.13 0.09 0.56 0.48 0.4 0.4 0.46 0.58 1.0 0.54 0.39
Sro654_g182160.1 (Contig1277.g11906)
0.08 0.11 0.06 0.03 0.09 0.1 0.12 0.23 0.19 0.54 0.62 0.72 0.01 0.23 0.19 0.53 0.94 0.14 1.0 0.3 0.58 0.54 0.18 0.34 0.1 0.52 0.88
Sro66_g037220.1 (Contig399.g5392)
0.02 0.31 0.14 0.12 0.1 0.19 0.33 0.27 0.21 0.65 0.86 0.58 0.02 0.28 0.39 0.37 1.0 0.09 0.81 0.38 0.54 0.72 0.2 0.45 0.66 0.71 0.85
Sro692_g188060.1 (Contig950.g9814)
0.02 0.9 0.82 0.65 0.68 0.07 0.14 0.2 0.3 0.69 0.42 0.86 0.23 0.4 0.2 0.32 0.22 0.14 1.0 0.71 0.98 0.58 0.32 0.17 0.35 0.41 0.67
Sro717_g192040.1 (Contig1315.g12151)
0.01 0.09 0.09 0.1 0.04 0.03 0.1 0.09 0.06 0.44 1.0 0.46 0.29 0.18 0.22 0.26 0.23 0.03 0.54 0.69 0.47 0.09 0.09 0.22 0.4 0.33 0.55
Sro71_g039400.1 (Contig2582.g20963)
0.0 0.6 0.6 0.56 0.42 0.24 0.27 0.47 0.44 0.71 0.98 0.62 0.43 0.68 0.41 0.47 0.68 0.24 1.0 1.0 0.66 0.56 0.34 0.58 0.94 0.79 0.99
Sro748_g196660.1 (Contig148.g1636)
0.06 0.45 0.41 0.36 0.24 0.16 0.19 0.14 0.6 0.57 0.49 0.55 0.05 0.2 0.18 0.06 0.59 0.07 1.0 0.64 0.56 0.35 0.42 0.26 0.46 0.85 0.44
Sro75_g041360.1 (Contig2656.g21508)
0.03 0.09 0.14 0.34 0.27 0.07 0.08 0.35 0.21 0.38 0.77 0.7 0.24 0.07 0.16 0.02 0.35 0.15 1.0 0.81 0.64 0.13 0.16 0.17 0.31 0.27 0.41
0.04 0.05 0.1 0.19 0.11 0.4 0.07 0.26 0.2 0.51 0.48 0.92 0.18 0.12 0.21 0.01 0.27 0.45 0.88 1.0 0.76 0.11 0.21 0.14 0.05 0.37 0.46
Sro798_g204050.1 (Contig2431.g19910)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.08 0.32 0.39 0.53 0.11 0.03 0.08 0.0 0.24 0.02 1.0 0.71 0.67 0.04 0.08 0.02 0.04 0.03 0.22
Sro808_g205440.1 (Contig630.g7653)
0.01 0.03 0.02 0.03 0.02 0.12 0.1 0.52 0.32 0.2 0.15 0.19 0.09 0.03 0.09 0.01 0.12 0.09 1.0 0.46 0.31 0.27 0.17 0.16 0.28 0.28 0.22
Sro841_g209490.1 (Contig2025.g17347)
0.09 0.08 0.11 0.06 0.05 0.07 0.15 0.09 0.05 0.56 0.1 1.0 0.09 0.52 0.15 0.33 0.33 0.17 0.45 0.42 0.7 0.18 0.09 0.24 0.44 0.28 0.25
Sro862_g212410.1 (Contig833.g9198)
0.8 0.1 0.12 0.07 0.07 0.14 0.3 0.3 0.34 0.54 0.52 0.69 0.4 0.23 0.43 0.42 0.35 0.12 0.48 1.0 0.48 0.13 0.36 0.5 0.4 0.25 0.58
Sro932_g221610.1 (Contig2857.g22904)
0.05 0.06 0.07 0.0 0.01 0.58 0.1 0.12 0.13 0.59 1.0 0.45 0.04 0.09 0.25 0.17 0.61 0.05 0.59 0.65 0.71 0.16 0.05 0.09 0.18 0.28 0.72
0.01 0.03 0.02 0.01 0.06 0.02 0.04 0.02 0.23 0.08 0.18 0.06 0.0 0.0 0.15 0.0 0.2 0.01 1.0 0.23 0.06 0.06 0.11 0.03 0.01 0.0 0.01
Sro97_g050040.1 (Contig689.g8058)
1.0 0.07 0.13 0.06 0.06 0.14 0.21 0.41 0.51 0.4 0.44 0.49 0.49 0.12 0.28 0.5 0.21 0.11 0.22 0.41 0.39 0.16 0.19 0.22 0.14 0.11 0.33
Sro99_g050850.1 (Contig1378.g12656)
0.01 0.35 0.32 0.28 0.27 0.36 0.3 0.18 0.43 0.58 0.64 0.65 0.39 0.45 0.31 0.29 0.44 0.58 0.97 0.9 0.67 0.66 0.48 0.44 1.0 0.75 0.56
Sro9_g007330.1 (Contig4120.g31501)
0.15 0.3 0.34 0.12 0.14 0.2 0.2 0.26 0.38 0.56 0.93 0.65 1.0 0.39 0.32 0.32 0.37 0.15 0.76 0.99 0.63 0.31 0.37 0.31 0.46 0.53 0.62

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)