Heatmap: Cluster_301 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1063_g237050.1 (Contig4044.g31056)
0.3 4.17 4.81 4.57 4.09 0.51 1.15 2.98 3.47 7.49 6.57 5.29 0.92 2.22 3.18 6.9 14.25 3.14 9.74 8.69 10.89 2.94 2.47 4.62 10.25 7.86 9.38
Sro1099_g241120.1 (Contig806.g9000)
0.23 3.32 2.22 3.24 2.51 0.24 1.02 1.63 4.37 4.32 3.65 3.33 2.39 0.92 1.85 1.1 3.48 1.3 4.65 8.95 5.08 2.55 2.76 2.44 6.89 2.09 4.18
Sro1107_g242120.1 (Contig4615.g34440)
0.15 0.3 0.06 0.26 0.4 0.24 0.92 0.69 0.3 2.59 1.14 2.99 0.94 2.3 1.62 1.14 0.48 1.01 2.97 4.24 3.35 1.31 0.3 1.15 2.34 3.18 2.28
Sro1132_g244740.1 (Contig3735.g28642)
0.09 4.19 6.87 5.88 4.74 0.72 1.23 1.05 0.88 2.57 1.99 2.67 3.93 1.56 1.03 2.31 0.48 1.74 4.05 4.49 2.65 1.7 1.91 2.66 3.06 3.69 2.41
Sro1132_g244750.1 (Contig3735.g28643)
0.55 4.77 13.7 7.34 4.52 2.16 2.51 2.09 4.1 5.6 6.4 4.43 16.87 4.42 3.68 8.89 2.47 3.52 8.84 15.48 6.94 6.49 6.74 4.17 6.94 7.5 6.37
Sro116_g057190.1 (Contig2228.g18495)
0.0 0.08 0.35 0.12 0.24 0.03 0.12 0.19 0.0 2.47 2.96 1.04 0.0 0.12 0.19 0.51 7.54 0.03 4.81 1.46 4.56 0.49 0.2 0.0 0.25 2.98 4.42
Sro1192_g251110.1 (Contig331.g4407)
2.72 16.35 9.03 9.49 11.46 4.16 7.76 8.14 8.92 15.88 17.27 17.05 1.87 9.42 8.09 7.22 13.37 4.2 17.24 12.7 14.61 9.32 7.12 13.33 16.14 11.44 15.77
Sro1197_g251530.1 (Contig496.g6701)
0.12 4.02 3.21 3.06 4.58 2.31 2.8 1.91 5.26 7.7 8.25 8.18 5.53 6.03 5.84 9.97 2.14 3.59 10.71 11.1 9.54 5.53 5.98 3.99 5.61 6.13 8.11
Sro1295_g260280.1 (Contig1102.g10677)
28.4 3.19 1.29 3.65 3.77 1.82 0.43 2.35 2.3 15.17 9.73 10.39 1.44 2.92 2.16 1.61 46.83 0.86 23.4 8.04 14.72 9.56 1.53 3.24 5.58 14.26 20.91
Sro142_g066190.1 (Contig226.g2668)
0.47 21.39 12.95 8.94 10.48 0.78 0.77 2.73 2.71 6.2 5.13 6.9 1.41 4.21 3.23 5.73 3.52 4.19 8.93 7.71 7.69 4.9 2.88 1.02 1.54 2.97 6.47
Sro145_g067330.1 (Contig3646.g28179)
0.05 2.82 1.33 1.41 1.46 0.11 0.1 0.59 0.03 1.8 1.34 2.37 0.31 2.46 0.25 0.52 2.53 0.31 2.35 1.15 2.04 0.86 0.18 0.13 0.23 1.29 2.36
Sro157_g071190.1 (Contig2362.g19409)
0.3 0.23 0.0 0.0 0.18 0.16 0.5 0.17 1.29 2.7 1.51 2.56 0.05 1.68 0.3 0.63 1.54 0.22 3.85 1.98 2.62 1.42 1.46 1.21 0.4 2.13 1.87
Sro1741_g294640.1 (Contig4311.g32510)
1.78 33.53 31.36 25.8 27.15 7.3 10.34 15.0 9.06 25.62 27.07 23.68 12.82 15.25 16.75 24.51 19.26 16.53 33.57 30.09 27.9 24.74 11.07 16.08 16.27 21.57 33.42
Sro184_g079950.1 (Contig2216.g18398)
1.66 0.28 0.32 0.13 0.24 0.24 1.59 0.92 4.61 5.98 5.92 6.25 1.71 3.57 2.53 2.95 3.36 0.5 7.32 9.06 7.37 3.67 4.03 2.26 5.04 6.52 5.55
Sro1883_g303430.1 (Contig2852.g22885)
0.04 12.64 10.32 9.11 10.72 0.45 2.0 1.24 2.65 8.39 7.49 11.27 0.8 3.99 2.34 0.31 11.41 1.05 14.11 6.99 10.68 4.83 5.32 3.21 5.33 8.47 8.67
Sro2035_g312030.1 (Contig3136.g24891)
1.04 3.9 2.69 3.4 4.69 13.99 5.38 7.86 8.99 14.33 15.83 16.22 20.62 6.61 9.93 8.01 7.04 12.06 27.22 31.89 17.17 4.44 10.69 6.85 12.73 16.79 13.51
Sro208_g087020.1 (Contig351.g4773)
0.04 0.26 0.27 0.7 0.55 0.47 0.43 0.64 0.47 1.89 2.64 2.61 0.39 1.29 0.77 0.72 2.99 0.26 3.36 2.89 2.25 1.53 1.01 0.42 0.63 1.52 2.25
Sro216_g089570.1 (Contig227.g2734)
0.06 0.7 0.9 1.12 1.37 1.59 0.5 0.64 2.67 4.01 7.71 5.52 0.45 2.29 0.95 0.05 5.53 0.11 11.8 5.45 3.6 3.23 4.59 1.16 1.04 4.78 4.42
Sro2404_g326440.1 (Contig3181.g25132)
0.03 0.38 0.07 0.34 0.33 0.09 0.24 0.41 0.4 1.43 1.39 1.64 0.46 0.27 0.1 0.02 2.47 0.2 2.67 1.18 2.24 1.02 0.47 0.07 0.0 1.17 1.56
Sro25_g017370.1 (Contig1417.g13076)
0.24 0.41 0.51 0.21 0.28 15.86 4.75 10.02 9.31 11.71 13.95 14.37 9.24 3.38 12.55 10.63 13.35 12.29 15.29 16.84 12.3 8.78 9.57 7.05 7.25 19.8 15.09
Sro264_g102670.1 (Contig921.g9693)
0.04 0.54 0.3 0.25 0.55 0.12 0.1 2.06 0.28 2.2 2.5 1.38 0.25 0.28 0.61 3.27 5.15 0.89 3.95 1.88 1.24 3.15 0.88 0.15 0.36 0.68 3.98
Sro26_g017740.1 (Contig2432.g19945)
0.87 4.14 2.09 2.82 3.06 23.07 12.28 17.79 15.24 28.71 22.77 38.18 4.17 18.03 12.88 0.34 13.19 8.74 62.25 28.37 43.86 18.83 25.68 34.61 55.74 50.57 25.49
Sro271_g104560.1 (Contig2573.g20889)
0.37 3.73 3.2 2.57 2.24 25.41 15.53 9.95 15.7 21.22 10.48 20.55 11.66 16.59 16.13 3.42 12.58 13.75 23.5 27.23 37.72 20.82 17.97 22.45 32.09 39.4 20.21
Sro276_g106050.1 (Contig2556.g20785)
3.28 2.64 2.36 2.78 2.97 1.75 1.35 2.23 2.27 3.94 3.1 4.5 1.38 1.7 1.73 0.91 1.93 0.49 3.87 4.04 6.07 2.63 3.3 3.15 6.75 4.65 2.43
Sro2821_g337920.1 (Contig2953.g23405)
0.23 11.92 12.21 9.91 13.36 11.2 4.76 7.9 13.24 16.1 15.21 20.82 9.74 10.22 6.26 2.85 8.93 5.77 21.07 17.08 18.83 16.67 13.21 8.26 18.36 19.69 16.66
Sro282_g107480.1 (Contig1420.g13091)
0.04 0.22 0.29 0.08 0.08 0.09 1.22 2.48 0.52 3.16 2.03 2.53 0.62 0.14 0.97 3.29 2.83 3.05 9.46 4.96 2.86 0.47 0.45 1.65 5.62 1.44 3.54
Sro283_g107730.1 (Contig4255.g32204)
0.32 0.7 0.81 0.52 0.8 1.54 1.76 2.45 2.34 6.05 6.67 5.8 0.4 3.91 2.89 2.37 3.24 1.0 9.77 6.05 8.09 4.46 3.14 2.15 8.51 8.66 7.46
Sro2_g001200.1 (Contig467.g6278)
0.61 28.38 32.83 51.38 44.81 4.2 1.38 32.98 15.75 19.5 4.26 27.27 1.62 3.01 2.21 0.02 1.64 1.66 74.46 28.45 14.45 10.77 14.47 5.45 7.1 32.45 11.78
Sro301_g112020.1 (Contig455.g6150)
0.22 1.09 2.0 1.03 1.29 0.0 0.12 0.64 1.35 3.26 5.46 3.43 3.0 0.39 1.32 1.82 2.79 1.02 4.9 6.23 3.43 0.81 2.21 0.24 1.41 1.11 3.22
Sro320_g116480.1 (Contig3665.g28309)
0.1 0.79 0.23 0.2 0.38 0.25 0.6 1.16 1.15 5.11 8.99 6.34 0.91 2.88 1.89 1.93 3.4 0.8 4.08 1.47 8.66 1.66 1.75 1.86 1.31 1.35 5.6
Sro345_g122570.1 (Contig2266.g18816)
1.34 7.11 6.05 5.81 4.64 30.75 20.97 45.2 22.71 23.34 23.44 25.66 14.83 19.39 16.83 0.4 20.83 27.81 54.25 27.87 27.03 22.23 17.66 41.14 37.24 41.91 24.3
Sro405_g136070.1 (Contig597.g7432)
0.22 1.76 3.84 1.97 1.85 0.52 0.89 1.78 2.09 2.72 3.82 3.37 4.27 2.06 2.21 3.18 2.27 0.68 2.96 6.11 3.68 1.5 1.44 2.19 3.4 1.71 3.23
Sro405_g136100.1 (Contig597.g7435)
0.15 1.81 0.6 0.21 0.41 1.07 2.82 2.71 1.23 4.62 7.57 3.57 2.51 4.05 4.48 4.71 5.56 4.47 8.81 8.36 6.67 0.94 1.13 5.24 9.29 6.51 4.54
Sro460_g147460.1 (Contig3843.g29571)
0.05 7.55 5.75 6.26 6.43 1.13 2.79 4.48 1.61 9.13 10.42 9.47 2.8 7.49 5.45 10.02 7.16 6.8 15.55 15.33 11.69 4.36 2.56 5.92 8.91 8.68 8.67
Sro486_g152610.1 (Contig3152.g25000)
0.5 4.11 4.07 5.25 3.16 1.57 2.94 2.56 2.51 5.6 2.98 6.06 2.69 3.84 4.15 6.02 3.31 4.02 5.69 6.42 6.0 3.21 1.95 4.0 3.65 5.9 3.99
Sro487_g152870.1 (Contig367.g4963)
11.04 0.46 1.12 1.13 0.45 1.36 0.7 1.27 2.41 5.89 4.5 6.75 2.2 1.98 2.1 3.87 4.04 2.33 12.21 9.18 7.38 1.53 3.47 2.49 2.89 1.81 3.35
Sro490_g153440.1 (Contig328.g4364)
120.01 38.16 29.28 28.95 25.74 3.53 4.75 11.49 5.06 34.28 42.57 31.07 2.91 24.75 16.98 25.85 37.74 5.43 61.09 35.49 29.65 28.59 20.97 33.7 47.3 28.92 45.67
Sro493_g154200.1 (Contig1170.g11152)
0.28 0.18 0.04 0.04 0.23 0.02 0.2 0.27 0.8 2.77 2.68 2.85 0.48 1.0 0.55 1.47 4.33 0.55 6.11 4.44 3.4 1.8 0.75 0.08 0.45 1.98 1.99
Sro502_g155630.1 (Contig2629.g21329)
0.04 2.41 1.46 1.55 1.1 0.09 0.17 0.05 0.13 2.4 1.79 1.83 0.39 0.46 0.67 0.62 5.15 0.0 3.47 2.33 3.38 1.91 0.27 0.03 0.17 1.38 3.06
Sro513_g157880.1 (Contig214.g2550)
0.0 0.71 0.3 0.69 0.27 0.32 0.35 0.47 0.29 2.06 1.81 1.75 0.1 1.71 1.09 1.0 4.3 0.31 1.16 0.47 2.06 0.66 0.28 0.35 0.38 2.25 3.05
Sro513_g157920.1 (Contig214.g2554)
0.0 0.39 0.26 0.09 0.12 0.17 0.24 0.14 0.15 1.43 1.61 0.72 0.09 1.25 0.4 0.61 2.39 0.12 0.99 0.33 1.58 0.35 0.12 0.1 0.34 0.94 1.79
Sro526_g160510.1 (Contig842.g9296)
0.65 2.01 3.17 2.62 2.43 9.22 5.21 9.2 6.53 12.0 12.31 13.2 12.44 6.37 7.49 8.14 7.65 10.11 25.05 17.07 13.99 4.95 8.49 11.66 8.66 11.46 13.47
Sro545_g163800.1 (Contig1180.g11223)
0.81 4.12 2.66 4.18 4.27 3.06 4.16 5.5 6.28 16.53 22.23 16.51 3.02 12.64 6.97 5.7 19.3 5.08 20.63 9.79 20.3 7.53 2.79 7.3 15.99 13.09 17.75
Sro546_g164070.1 (Contig4069.g31184)
4.06 6.86 15.21 10.13 7.77 6.2 22.76 19.46 37.94 33.53 17.24 31.13 34.01 17.23 16.61 17.94 13.32 16.18 26.04 62.49 61.32 23.57 31.15 33.07 78.35 45.81 13.6
Sro548_g164410.1 (Contig1714.g15321)
0.06 2.8 1.19 1.32 1.73 1.03 1.21 0.46 1.31 4.33 3.36 4.85 2.03 3.28 1.91 1.74 3.16 2.44 3.96 5.08 6.01 3.34 1.02 2.39 1.85 3.7 4.26
Sro622_g176970.1 (Contig2850.g22858)
1.96 32.01 19.91 26.9 23.94 2.87 59.33 47.96 52.93 60.14 17.74 64.42 8.49 24.65 13.0 8.76 38.14 18.16 74.84 54.31 143.72 58.32 79.88 50.19 140.86 73.56 24.87
Sro622_g177050.1 (Contig2850.g22866)
0.07 3.26 4.18 1.42 1.87 3.96 8.43 3.44 8.16 8.79 8.3 9.96 3.49 3.76 4.04 3.21 3.13 2.17 13.04 11.13 9.35 9.29 10.59 13.58 23.24 12.45 9.01
Sro654_g182160.1 (Contig1277.g11906)
0.71 0.91 0.54 0.25 0.77 0.8 1.03 1.91 1.61 4.53 5.22 6.06 0.07 1.97 1.63 4.42 7.92 1.14 8.4 2.55 4.85 4.57 1.48 2.87 0.84 4.37 7.38
Sro66_g037220.1 (Contig399.g5392)
1.08 19.24 8.88 7.34 6.32 11.92 20.37 16.96 12.83 40.26 53.37 36.28 1.01 17.47 24.22 22.7 62.14 5.81 50.58 23.56 33.3 44.86 12.7 28.08 41.29 44.25 53.01
Sro692_g188060.1 (Contig950.g9814)
0.28 13.16 12.05 9.46 9.88 1.07 2.08 2.91 4.43 10.1 6.15 12.54 3.4 5.83 2.95 4.71 3.28 2.04 14.63 10.36 14.27 8.45 4.75 2.47 5.19 6.02 9.86
Sro717_g192040.1 (Contig1315.g12151)
0.09 0.67 0.64 0.7 0.27 0.23 0.72 0.6 0.4 3.14 7.07 3.22 2.07 1.3 1.59 1.8 1.63 0.21 3.79 4.9 3.36 0.65 0.66 1.54 2.83 2.31 3.86
Sro71_g039400.1 (Contig2582.g20963)
0.03 9.18 9.07 8.54 6.35 3.71 4.12 7.19 6.63 10.72 14.96 9.48 6.56 10.3 6.17 7.19 10.34 3.57 15.19 15.19 9.97 8.55 5.13 8.8 14.36 12.0 15.08
Sro748_g196660.1 (Contig148.g1636)
0.3 2.2 2.03 1.76 1.2 0.77 0.93 0.7 2.92 2.78 2.41 2.68 0.25 0.98 0.86 0.3 2.91 0.37 4.91 3.16 2.76 1.7 2.05 1.27 2.24 4.19 2.14
Sro75_g041360.1 (Contig2656.g21508)
6.28 19.99 31.84 78.93 63.9 16.9 18.47 80.41 49.07 88.46 179.66 162.41 56.38 17.13 36.81 4.95 80.47 33.91 232.86 188.05 149.91 29.76 38.41 39.2 72.92 63.81 94.6
2.06 2.26 4.85 8.58 5.17 18.72 3.19 12.15 9.27 23.51 22.18 42.63 8.44 5.47 9.73 0.27 12.53 20.65 40.61 46.27 35.09 5.07 9.77 6.61 2.13 17.07 21.26
Sro798_g204050.1 (Contig2431.g19910)
15.3 2.54 1.92 3.03 3.6 13.15 7.46 37.46 67.56 269.97 328.53 439.58 94.12 28.11 70.21 0.5 197.79 16.32 833.38 589.28 561.78 30.47 68.62 14.85 36.28 25.24 181.27
Sro808_g205440.1 (Contig630.g7653)
6.46 13.34 9.27 11.09 10.37 54.33 42.32 231.72 141.47 89.75 64.29 85.25 40.34 12.54 39.59 3.58 52.12 41.08 442.58 203.63 137.39 120.89 75.62 71.53 125.49 125.44 95.86
Sro841_g209490.1 (Contig2025.g17347)
1.06 0.92 1.34 0.71 0.65 0.79 1.77 1.06 0.59 6.67 1.15 11.91 1.07 6.21 1.8 3.91 3.88 1.97 5.34 5.05 8.36 2.17 1.01 2.81 5.25 3.35 3.0
Sro862_g212410.1 (Contig833.g9198)
4.87 0.64 0.74 0.45 0.43 0.86 1.81 1.81 2.09 3.29 3.15 4.21 2.42 1.4 2.61 2.58 2.11 0.76 2.94 6.11 2.92 0.81 2.2 3.07 2.43 1.51 3.52
Sro932_g221610.1 (Contig2857.g22904)
0.2 0.28 0.3 0.0 0.03 2.5 0.44 0.5 0.55 2.54 4.3 1.92 0.18 0.37 1.1 0.75 2.62 0.22 2.55 2.8 3.05 0.67 0.22 0.37 0.77 1.21 3.1
2.2 7.21 3.83 1.86 13.95 4.63 9.44 3.79 49.08 16.97 39.12 13.51 0.31 0.01 31.91 0.76 42.72 1.28 214.64 49.74 12.62 12.77 24.01 5.79 3.0 0.53 2.83
Sro97_g050040.1 (Contig689.g8058)
51.09 3.81 6.7 2.94 2.84 7.28 10.91 20.85 25.95 20.56 22.56 25.1 25.09 6.3 14.09 25.57 10.53 5.49 11.33 20.75 20.17 8.38 9.65 11.24 7.4 5.59 16.73
Sro99_g050850.1 (Contig1378.g12656)
0.1 2.37 2.16 1.93 1.85 2.48 2.07 1.22 2.91 3.97 4.37 4.45 2.63 3.08 2.14 1.97 3.02 3.93 6.62 6.14 4.56 4.48 3.3 3.03 6.82 5.15 3.79
Sro9_g007330.1 (Contig4120.g31501)
2.13 4.07 4.67 1.69 1.97 2.81 2.79 3.65 5.19 7.74 12.86 8.97 13.79 5.41 4.37 4.36 5.05 2.09 10.43 13.64 8.65 4.22 5.13 4.3 6.32 7.31 8.58

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)