1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro106_g053410.1 (Contig1122.g10738)
 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.57 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro107_g053890.1 (Contig1548.g14064)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.07 0.15 0.13 0.1 1.0 0.06 0.03 0.01 0.14 0.01 0.14 0.96 0.21 0.45 0.08 0.03 0.05 0.2 0.12
Sro1099_g241170.1 (Contig806.g9005)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.45 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro112_g055530.1 (Contig1575.g14278)
 0.09 0.0 0.04 0.51 0.25 0.0 0.0 0.1 0.0 0.11 0.01 0.13 1.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.03 0.05 0.7 0.13 0.04 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01
Sro118_g057840.1 (Contig2714.g21854)
 0.18 0.34 0.08 0.1 0.11 0.17 0.19 0.08 0.95 0.46 0.02 0.42 0.32 0.37 0.07 0.01 0.07 0.0 0.0 0.17 0.85 0.82 0.65 0.36 1.0 0.75 0.44
Sro1215_g253210.1 (Contig2655.g21465)
 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.03 0.01 1.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
Sro1264_g257360.1 (Contig827.g9171)
 0.0 0.17 0.01 0.03 0.07 0.03 0.1 0.08 0.01 0.53 0.72 0.49 0.99 1.0 0.3 0.09 0.57 0.1 0.16 0.82 0.2 0.01 0.03 0.33 0.15 0.32 0.54
Sro1268_g257800.1 (Contig4283.g32368)
 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.07 0.03 0.05 1.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.5 0.02 0.01 0.01 0.04 0.0 0.03 0.01
Sro1311_g261780.1 (Contig1682.g15105)
 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.03 0.1 0.05 0.04 0.75 0.0 0.08 0.08 0.03 0.15 0.15 1.0 0.12 0.01 0.02 0.1 0.11 0.08 0.05
Sro131_g062310.1 (Contig67.g683)
 0.1 0.03 0.12 0.05 0.05 0.08 0.37 0.11 0.18 0.39 0.39 0.57 0.38 0.16 0.3 0.25 0.25 0.11 0.12 1.0 0.44 0.09 0.07 0.49 0.24 0.15 0.29
Sro1339_g264310.1 (Contig2212.g18356)
 0.0 0.06 0.02 0.03 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.27 1.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.83 0.16 0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.01
Sro1442_g273090.1 (Contig3575.g27642)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1451_g273860.1 (Contig4314.g32537)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.02 0.04 0.06 0.0 0.04 0.53 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.1 0.19 0.0 0.11 0.0
Sro1483_g276410.1 (Contig969.g9916)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1538_g280800.1 (Contig2921.g23246)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.29 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro154_g070130.1 (Contig2716.g21891)
 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.18 0.07 0.11 0.0 0.1 1.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.82 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro162_g072840.1 (Contig2670.g21620)
 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1711_g292860.1 (Contig3721.g28604)
 0.01 0.04 0.03 0.06 0.06 0.07 0.04 0.11 0.07 0.23 0.62 0.16 0.64 0.35 0.2 0.1 0.3 0.09 0.15 1.0 0.07 0.04 0.04 0.08 0.05 0.1 0.36
Sro177_g077890.1 (Contig795.g8915)
 0.01 0.05 0.04 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.08 0.08 0.02 0.45 0.0 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 1.0 0.03 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03
Sro1971_g308580.1 (Contig1202.g11322)
 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2131_g315870.1 (Contig2224.g18463)
 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.82 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.05 1.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro225_g091780.1 (Contig1661.g14976)
 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.04 0.14 0.06 0.0 0.01 1.0 0.02 0.02 0.05 0.04 0.01 0.0 0.6 0.04 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
Sro226_g091960.1 (Contig565.g7168)
 0.01 0.04 0.03 0.01 0.03 0.05 0.04 0.08 0.04 0.14 0.23 0.07 0.32 0.04 0.13 0.19 0.13 0.08 0.07 1.0 0.08 0.02 0.05 0.01 0.03 0.02 0.17
Sro23_g015950.1 (Contig2259.g18745)
 0.04 0.03 0.05 0.04 0.02 0.06 0.11 0.07 0.11 0.23 0.14 0.33 0.48 0.1 0.1 0.09 0.09 0.04 0.26 1.0 0.18 0.04 0.04 0.15 0.09 0.05 0.18
Sro2513_g329860.1 (Contig2220.g18454)
 0.0 0.04 0.01 0.03 0.02 0.02 0.04 0.01 0.01 0.08 0.03 0.05 0.55 0.05 0.04 0.06 0.05 0.04 0.02 1.0 0.11 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.04
Sro2533_g330460.1 (Contig379.g5092)
 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.07 0.06 0.01 0.01 0.1 0.05 0.06 0.27 0.03 0.07 0.07 0.03 0.04 0.13 1.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04
Sro274_g105420.1 (Contig1557.g14166)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.09 0.0 0.03 0.14 0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.0 0.13 0.0 0.0 0.41 0.44 0.13 0.01 0.0 0.03 0.04 0.01
Sro277_g106280.1 (Contig444.g5966)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.73 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.04
Sro284_g108000.1 (Contig177.g2087)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2905_g339950.1 (Contig4645.g34608)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3299_g346400.1 (Contig3585.g27695)
 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.06 0.46 0.0 0.04 0.0 0.03 0.01 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06
Sro32_g020900.1 (Contig3715.g28563)
 0.01 0.18 0.19 0.19 0.16 0.04 0.06 0.02 0.04 0.19 0.05 0.14 0.61 0.03 0.06 0.06 0.03 0.02 0.07 1.0 0.15 0.1 0.02 0.09 0.1 0.12 0.13
Sro3457_g348210.1 (Contig1352.g12479)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro348_g123120.1 (Contig2346.g19278)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
Sro349_g123610.1 (Contig1280.g11977)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.01 0.05 0.39 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3962_g352220.1 (Contig1123.g10766)
 0.0 0.62 0.16 0.24 0.11 0.88 0.17 0.44 0.66 0.3 0.29 0.22 1.0 0.0 0.34 0.44 0.3 0.0 0.03 0.94 0.33 0.56 0.3 0.3 0.15 0.16 0.25
Sro3_g002900.1 (Contig3832.g29475)
 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.2 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.03 0.74 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.4 0.16 0.31 0.0 0.17 0.0 0.0 0.2 0.0 0.04 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.27
Sro451_g145690.1 (Contig1599.g14513)
 0.0 0.2 0.12 0.08 0.07 0.07 0.01 0.03 0.03 0.07 0.02 0.01 0.6 0.04 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.04 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.06 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro481_g151620.1 (Contig3107.g24720)
 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.69 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro484_g152330.1 (Contig2684.g21704)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0 0.07 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.08 0.32 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro506_g156380.1 (Contig3494.g27115)
 0.01 0.53 0.3 0.18 0.15 0.1 0.15 0.25 0.16 0.22 0.14 0.21 1.0 0.13 0.21 0.09 0.22 0.06 0.05 0.64 0.44 0.34 0.29 0.22 0.33 0.19 0.13
Sro509_g157000.1 (Contig4289.g32393)
 0.0 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.11 0.0 0.04 0.74 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.04 1.0 0.08 0.1 0.05 0.03 0.01 0.03 0.0
Sro553_g165310.1 (Contig1023.g10207)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.98 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.11 1.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.15 0.02 0.05
Sro562_g166930.1 (Contig149.g1645)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.02 0.03 0.29 0.02 0.02 0.03 0.01 0.04 0.04 1.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro592_g172120.1 (Contig2562.g20814)
 0.03 0.11 0.2 0.03 0.05 0.04 0.1 0.14 0.09 0.14 0.17 0.05 1.0 0.07 0.18 0.14 0.17 0.09 0.12 0.55 0.15 0.12 0.1 0.06 0.05 0.03 0.15
0.0 0.45 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.97 0.41 1.0 0.0 0.17 0.0 0.15 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.32
Sro62_g035610.1 (Contig2718.g21942)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro639_g179760.1 (Contig197.g2297)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro66_g037350.1 (Contig399.g5405)
 0.01 0.08 0.04 0.04 0.02 0.05 0.15 0.1 0.04 0.21 0.17 0.15 0.96 0.11 0.17 0.16 0.12 0.15 0.11 1.0 0.2 0.07 0.03 0.18 0.19 0.11 0.28
Sro67_g037510.1 (Contig495.g6667)
 0.0 0.03 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.15 0.6 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.03 0.06 0.01 0.0 0.02 0.05 0.05 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.07 0.03 0.8 0.06 0.01 0.02 0.01 0.13 0.0 0.01
Sro69_g038400.1 (Contig4677.g34749)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.04 0.03 0.01 0.0 0.08 0.06 0.04 0.37 0.02 0.06 0.05 0.03 0.04 0.03 1.0 0.07 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.05
Sro701_g189850.1 (Contig2013.g17196)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.17 0.0 0.0 1.0 0.04 0.01 0.1 0.0 0.02 0.05 0.19 0.09 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro72_g039990.1 (Contig1459.g13398)
 0.02 0.11 0.05 0.1 0.04 0.02 0.11 0.0 0.01 0.3 0.12 0.27 1.0 0.18 0.12 0.2 0.01 0.02 0.03 0.81 0.37 0.06 0.01 0.01 0.07 0.15 0.05
Sro781_g201610.1 (Contig678.g7944)
 0.0 0.08 0.0 0.08 0.07 0.04 0.01 0.01 0.02 0.08 0.0 0.06 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.05 0.67 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro870_g213590.1 (Contig1807.g15929)
 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.01 0.05 0.67 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro9_g007480.1 (Contig4120.g31516)
 0.01 0.12 0.06 0.05 0.05 0.01 0.04 0.06 0.03 0.18 0.17 0.1 0.96 0.08 0.1 0.09 0.07 0.09 0.11 1.0 0.03 0.08 0.07 0.04 0.02 0.06 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)