1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro106_g053410.1 (Contig1122.g10738)
 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.66 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro107_g053890.1 (Contig1548.g14064)
 0.02 0.17 0.19 0.09 0.08 0.59 0.14 0.13 0.99 2.07 1.9 1.44 14.22 0.84 0.49 0.21 1.93 0.12 1.93 13.59 2.92 6.45 1.19 0.41 0.66 2.78 1.75
Sro1099_g241170.1 (Contig806.g9005)
 0.12 0.41 0.24 0.17 0.19 0.09 0.16 0.1 0.23 4.22 0.13 2.01 29.54 0.33 0.16 0.36 0.11 0.03 0.73 65.14 1.82 0.22 0.2 0.09 0.25 0.1 0.21
Sro112_g055530.1 (Contig1575.g14278)
 0.27 0.0 0.11 1.5 0.73 0.0 0.01 0.3 0.01 0.33 0.02 0.38 2.93 0.03 0.13 0.06 0.0 0.08 0.16 2.06 0.38 0.12 0.02 0.0 0.13 0.0 0.02
Sro118_g057840.1 (Contig2714.g21854)
 0.27 0.51 0.12 0.15 0.17 0.26 0.3 0.12 1.45 0.7 0.02 0.63 0.48 0.56 0.11 0.02 0.11 0.0 0.0 0.26 1.29 1.25 0.99 0.55 1.51 1.14 0.67
Sro1215_g253210.1 (Contig2655.g21465)
 0.12 0.14 0.59 0.17 0.23 0.06 0.03 0.37 0.1 1.22 0.57 0.19 16.81 1.15 0.31 0.06 0.06 0.0 0.0 10.95 0.08 0.52 0.07 0.1 0.1 0.0 0.08
Sro1264_g257360.1 (Contig827.g9171)
 0.0 0.82 0.04 0.15 0.31 0.12 0.46 0.4 0.05 2.52 3.42 2.3 4.7 4.73 1.41 0.42 2.68 0.49 0.76 3.87 0.97 0.04 0.13 1.54 0.71 1.49 2.57
Sro1268_g257800.1 (Contig4283.g32368)
 0.03 0.15 0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.15 0.27 0.11 0.21 3.86 0.05 0.12 0.07 0.02 0.02 0.0 1.94 0.09 0.04 0.04 0.17 0.0 0.12 0.03
Sro1311_g261780.1 (Contig1682.g15105)
 0.06 0.08 0.08 0.0 0.03 0.01 0.79 0.23 0.18 0.69 0.37 0.25 5.14 0.01 0.56 0.55 0.2 1.05 1.03 6.89 0.85 0.04 0.12 0.66 0.77 0.58 0.35
Sro131_g062310.1 (Contig67.g683)
 0.6 0.19 0.76 0.32 0.29 0.52 2.25 0.65 1.07 2.4 2.39 3.52 2.32 1.01 1.84 1.55 1.53 0.66 0.71 6.14 2.69 0.58 0.45 2.98 1.5 0.92 1.79
Sro1339_g264310.1 (Contig2212.g18356)
 0.0 0.26 0.08 0.13 0.0 0.03 0.16 0.0 0.0 0.4 0.0 1.15 4.2 0.02 0.08 0.0 0.0 0.22 0.1 3.49 0.68 0.05 0.0 0.09 0.18 0.03 0.04
Sro1442_g273090.1 (Contig3575.g27642)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1451_g273860.1 (Contig4314.g32537)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.01 0.03 0.04 0.0 0.02 0.34 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.07 0.0
Sro1483_g276410.1 (Contig969.g9916)
 0.03 0.13 0.11 0.0 0.03 0.0 0.03 0.15 0.24 1.0 0.09 0.06 11.08 0.09 0.08 0.03 0.0 2.61 2.34 20.78 0.03 0.05 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02
Sro1538_g280800.1 (Contig2921.g23246)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.59 0.08 0.09 3.5 0.0 0.01 0.13 0.0 0.0 0.1 12.26 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1
Sro154_g070130.1 (Contig2716.g21891)
 0.12 0.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02 0.64 0.25 0.39 0.0 0.37 3.62 0.07 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 2.96 0.27 0.24 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro162_g072840.1 (Contig2670.g21620)
 0.0 0.08 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 2.83 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 2.55 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1711_g292860.1 (Contig3721.g28604)
 0.5 4.25 2.51 6.06 6.15 6.94 4.3 10.94 6.86 22.33 59.24 15.74 61.04 33.43 19.41 9.48 28.64 8.65 14.44 95.66 7.09 3.77 3.85 7.56 4.43 9.19 34.21
Sro177_g077890.1 (Contig795.g8915)
 0.1 0.58 0.51 0.2 0.27 0.04 0.24 0.25 0.22 0.96 1.04 0.22 5.61 0.05 0.49 0.43 0.46 0.4 0.45 12.46 0.42 0.36 0.14 0.06 0.0 0.1 0.42
Sro1971_g308580.1 (Contig1202.g11322)
 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2131_g315870.1 (Contig2224.g18463)
 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.93 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09 0.06 1.14 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro225_g091780.1 (Contig1661.g14976)
 0.0 0.03 0.1 0.16 0.12 0.0 0.09 0.25 0.89 0.41 0.02 0.09 6.44 0.14 0.11 0.32 0.23 0.08 0.01 3.87 0.26 0.39 0.07 0.01 0.02 0.05 0.05
Sro226_g091960.1 (Contig565.g7168)
 0.16 1.18 0.94 0.38 0.76 1.38 1.07 2.23 1.21 3.8 6.39 2.01 8.78 0.96 3.53 5.21 3.67 2.09 1.8 27.29 2.28 0.68 1.43 0.28 0.73 0.56 4.62
Sro23_g015950.1 (Contig2259.g18745)
 0.79 0.63 1.18 0.76 0.53 1.21 2.44 1.41 2.32 4.87 2.98 7.02 10.43 2.22 2.1 1.96 1.98 0.81 5.66 21.59 3.97 0.77 0.9 3.19 2.05 1.06 3.96
Sro2513_g329860.1 (Contig2220.g18454)
 0.04 0.95 0.16 0.77 0.61 0.47 0.87 0.22 0.28 2.04 0.69 1.15 13.45 1.13 1.01 1.44 1.13 0.86 0.6 24.63 2.71 0.23 0.3 0.49 0.04 0.31 0.97
Sro2533_g330460.1 (Contig379.g5092)
 0.07 0.1 0.34 0.35 0.23 1.03 0.79 0.1 0.09 1.35 0.68 0.88 3.82 0.47 0.91 0.99 0.35 0.58 1.76 13.99 0.91 0.01 0.02 0.25 0.01 0.19 0.61
Sro274_g105420.1 (Contig1557.g14166)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.67 0.02 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.27 0.29 0.09 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01
Sro277_g106280.1 (Contig444.g5966)
 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 1.39 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.55 0.39 0.0 7.86 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.31 10.72 0.03 0.0 0.0 0.08 0.27 0.0 0.48
Sro284_g108000.1 (Contig177.g2087)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2905_g339950.1 (Contig4645.g34608)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3299_g346400.1 (Contig3585.g27695)
 0.12 0.21 0.3 0.0 0.0 0.18 0.0 0.04 0.0 0.48 0.0 0.39 2.86 0.0 0.25 0.0 0.18 0.09 0.0 6.2 0.49 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.35
Sro32_g020900.1 (Contig3715.g28563)
 0.09 2.12 2.26 2.25 1.84 0.42 0.75 0.18 0.44 2.23 0.61 1.66 7.17 0.37 0.69 0.71 0.38 0.24 0.85 11.66 1.77 1.19 0.28 1.0 1.13 1.38 1.51
Sro3457_g348210.1 (Contig1352.g12479)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro348_g123120.1 (Contig2346.g19278)
 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 2.56 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01
Sro349_g123610.1 (Contig1280.g11977)
 0.1 0.16 0.0 0.07 0.0 0.0 0.15 0.07 0.0 1.57 0.1 0.99 7.38 0.13 0.15 0.03 0.14 0.08 0.02 18.69 0.72 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.03
Sro3962_g352220.1 (Contig1123.g10766)
 0.0 1.58 0.41 0.62 0.27 2.25 0.43 1.13 1.69 0.76 0.75 0.57 2.55 0.0 0.87 1.11 0.76 0.0 0.08 2.39 0.83 1.44 0.77 0.77 0.39 0.4 0.63
Sro3_g002900.1 (Contig3832.g29475)
 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.1 0.49 2.42 0.0 0.0 0.03 0.03 0.19 0.06 1.79 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro451_g145690.1 (Contig1599.g14513)
 0.01 1.72 1.01 0.7 0.57 0.58 0.05 0.23 0.28 0.57 0.15 0.09 5.0 0.37 0.15 0.01 0.24 0.01 0.01 8.38 0.37 0.39 0.09 0.0 0.04 0.12 0.09
0.0 0.0 0.19 0.0 0.2 0.07 0.0 0.0 0.09 0.36 0.5 0.0 7.82 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 5.28 0.04 0.21 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro481_g151620.1 (Contig3107.g24720)
 4.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 8.54 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 12.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro484_g152330.1 (Contig2684.g21704)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.05 0.72 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.23 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro506_g156380.1 (Contig3494.g27115)
 0.03 1.95 1.12 0.66 0.54 0.38 0.55 0.91 0.61 0.81 0.53 0.76 3.71 0.48 0.79 0.34 0.82 0.24 0.19 2.36 1.61 1.25 1.06 0.83 1.23 0.71 0.47
Sro509_g157000.1 (Contig4289.g32393)
 0.0 0.2 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.16 0.0 0.05 1.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.06 1.39 0.11 0.13 0.07 0.05 0.02 0.05 0.0
Sro553_g165310.1 (Contig1023.g10207)
 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 3.64 0.0 0.09 0.0 0.0 0.19 0.42 3.71 0.08 0.11 0.0 0.0 0.55 0.07 0.19
Sro562_g166930.1 (Contig149.g1645)
 0.02 0.83 0.14 0.08 0.12 0.21 0.4 0.31 0.61 2.6 0.89 1.29 12.79 1.03 0.9 1.3 0.42 1.66 1.64 44.14 1.74 0.19 0.13 0.67 0.15 0.61 0.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro592_g172120.1 (Contig2562.g20814)
 0.14 0.48 0.84 0.14 0.21 0.18 0.4 0.57 0.4 0.6 0.7 0.23 4.21 0.28 0.78 0.59 0.71 0.38 0.5 2.3 0.62 0.49 0.43 0.24 0.21 0.11 0.64
0.0 0.22 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.49 0.21 0.5 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.16
Sro62_g035610.1 (Contig2718.g21942)
 0.0 0.05 0.06 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.21 0.05 0.0 7.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.8 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro639_g179760.1 (Contig197.g2297)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro66_g037350.1 (Contig399.g5405)
 0.13 1.28 0.66 0.65 0.32 0.7 2.2 1.51 0.64 3.23 2.59 2.21 14.57 1.7 2.57 2.44 1.82 2.26 1.6 15.15 2.99 1.11 0.41 2.74 2.84 1.67 4.22
Sro67_g037510.1 (Contig495.g6667)
 0.0 0.07 0.14 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.08 0.01 2.18 0.03 0.02 0.0 0.0 0.05 0.34 1.31 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.07 0.11 0.03 0.01 0.03 0.1 0.1 0.0 0.0 1.99 0.05 0.03 0.01 0.0 0.13 0.06 1.59 0.12 0.03 0.03 0.03 0.26 0.0 0.01
Sro69_g038400.1 (Contig4677.g34749)
 0.0 0.37 0.36 0.11 0.63 1.35 1.0 0.48 0.14 2.93 1.96 1.47 12.79 0.7 2.16 1.81 0.93 1.23 1.07 34.58 2.42 0.4 0.06 0.47 0.34 0.59 1.73
Sro701_g189850.1 (Contig2013.g17196)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.11 0.0 0.0 0.63 0.03 0.01 0.06 0.0 0.02 0.03 0.12 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro72_g039990.1 (Contig1459.g13398)
 0.06 0.27 0.12 0.24 0.1 0.04 0.28 0.01 0.03 0.76 0.29 0.67 2.49 0.46 0.29 0.5 0.02 0.04 0.09 2.01 0.93 0.14 0.02 0.02 0.18 0.36 0.12
Sro781_g201610.1 (Contig678.g7944)
 0.0 0.32 0.0 0.29 0.28 0.14 0.03 0.03 0.06 0.32 0.0 0.24 3.79 0.0 0.07 0.0 0.0 0.31 0.2 2.55 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro870_g213590.1 (Contig1807.g15929)
 0.1 0.3 0.19 0.12 0.05 0.0 0.45 0.02 0.26 1.27 0.25 0.96 12.29 0.06 0.05 0.1 0.0 0.09 0.05 18.41 1.5 0.11 0.07 0.21 0.19 0.27 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro9_g007480.1 (Contig4120.g31516)
 0.49 4.08 2.1 1.53 1.58 0.49 1.47 1.85 0.98 5.84 5.64 3.15 31.46 2.71 3.23 3.04 2.16 3.01 3.51 32.94 0.89 2.77 2.24 1.33 0.74 2.1 3.36

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)