Heatmap: Cluster_248 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1011_g230960.1 (Contig997.g10069)
0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.1 0.25 0.18 0.37 0.53 0.21 0.7 0.92 0.67 0.36 0.71 0.27 0.47 0.45 1.0 0.67 0.23 0.21 0.09 0.16 0.23 0.17
Sro1093_g240390.1 (Contig384.g5165)
0.02 0.31 0.45 0.28 0.4 0.37 0.55 0.3 0.27 0.66 0.61 0.85 1.0 0.75 0.57 0.61 0.63 0.75 0.79 0.91 0.86 0.43 0.31 0.43 0.98 0.62 0.43
Sro1152_g246950.1 (Contig333.g4435)
0.06 0.05 0.07 0.08 0.06 0.2 0.36 0.22 0.33 0.59 0.39 0.69 0.88 0.51 0.5 1.0 0.35 0.49 0.64 0.86 1.0 0.31 0.24 0.46 0.67 0.47 0.39
Sro1153_g247050.1 (Contig4473.g33620)
0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.08 0.23 0.06 0.45 0.45 0.32 0.55 1.0 0.82 0.41 0.71 0.58 0.39 0.42 0.94 0.67 0.19 0.24 0.1 0.23 0.2 0.12
Sro1162_g247940.1 (Contig2070.g17729)
0.01 0.14 0.18 0.14 0.14 0.19 0.31 0.15 0.22 0.68 0.47 1.0 0.73 0.75 0.45 0.54 0.47 0.23 0.48 0.83 0.9 0.32 0.23 0.42 0.61 0.52 0.42
Sro1168_g248520.1 (Contig1520.g13874)
0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.23 0.41 0.18 0.14 0.74 0.29 0.94 0.71 0.72 0.47 0.36 0.32 0.2 0.42 1.0 0.95 0.19 0.12 0.37 0.75 0.42 0.35
Sro1176_g249240.1 (Contig4140.g31628)
0.01 0.33 0.3 0.31 0.25 0.1 0.4 0.46 0.44 0.58 0.37 0.78 0.88 0.47 0.39 0.29 0.27 0.29 0.48 1.0 0.82 0.39 0.36 0.31 0.45 0.43 0.33
Sro1186_g250400.1 (Contig3178.g25126)
0.03 0.02 0.06 0.02 0.0 0.05 0.25 0.07 0.43 0.59 0.32 0.79 1.0 0.85 0.44 0.71 0.45 0.66 0.84 0.8 0.98 0.17 0.24 0.14 0.1 0.31 0.15
0.01 0.04 0.11 0.14 0.14 0.6 0.32 0.14 0.44 0.57 0.24 0.79 1.0 0.44 0.39 0.59 0.16 0.36 0.49 0.95 0.92 0.24 0.19 0.22 0.55 0.3 0.31
Sro120_g058420.1 (Contig2411.g19720)
0.01 0.35 0.44 0.31 0.22 0.15 0.31 0.15 0.16 0.52 0.41 0.55 1.0 0.53 0.34 0.29 0.29 0.17 0.45 0.88 0.73 0.27 0.13 0.37 0.39 0.38 0.33
Sro1235_g255060.1 (Contig1411.g12964)
0.01 0.23 0.26 0.23 0.2 0.3 0.34 0.26 0.18 0.72 0.6 1.0 0.6 0.66 0.59 0.65 0.67 0.45 0.54 0.64 0.91 0.33 0.23 0.39 0.49 0.46 0.54
Sro1290_g259820.1 (Contig199.g2321)
0.02 0.19 0.22 0.17 0.11 0.35 0.29 0.21 0.28 0.46 0.51 0.58 1.0 0.52 0.54 0.57 0.47 0.39 0.39 0.88 0.63 0.15 0.18 0.31 0.41 0.25 0.27
Sro1515_g278970.1 (Contig1412.g12969)
0.07 0.17 0.06 0.13 0.05 0.05 0.25 0.16 0.22 0.51 0.26 0.79 0.8 0.5 0.22 0.31 0.44 0.29 0.41 1.0 0.52 0.12 0.2 0.28 0.53 0.41 0.23
Sro1534_g280500.1 (Contig2033.g17461)
0.02 0.35 0.27 0.27 0.27 0.24 0.4 0.2 0.53 0.71 0.33 0.91 0.76 0.46 0.3 0.3 0.32 0.26 0.6 1.0 0.88 0.29 0.35 0.28 0.48 0.38 0.27
Sro1552_g281810.1 (Contig3671.g28364)
0.03 0.14 0.16 0.18 0.19 0.28 0.29 0.09 0.26 0.6 0.42 0.78 1.0 0.7 0.46 0.63 0.48 0.22 0.4 0.91 0.79 0.15 0.22 0.2 0.42 0.27 0.33
Sro1577_g283610.1 (Contig4524.g33891)
0.03 0.17 0.14 0.22 0.21 0.14 0.33 0.27 0.47 0.65 0.47 1.0 0.79 0.61 0.43 0.46 0.44 0.33 0.62 0.9 0.83 0.36 0.29 0.4 0.69 0.49 0.36
Sro15_g010860.1 (Contig791.g8812)
0.21 0.16 0.14 0.19 0.16 0.19 0.35 0.21 0.29 0.62 0.34 0.83 0.76 0.53 0.39 0.35 0.27 0.24 0.34 0.71 1.0 0.23 0.3 0.4 0.66 0.33 0.27
Sro15_g011060.1 (Contig791.g8832)
0.04 0.21 0.28 0.35 0.29 0.65 0.59 0.39 0.48 0.76 0.69 0.98 1.0 0.62 0.71 0.68 0.56 0.78 0.87 0.94 0.85 0.33 0.39 0.43 0.46 0.36 0.56
Sro1601_g285120.1 (Contig4269.g32296)
0.02 0.03 0.03 0.01 0.0 0.33 0.16 0.03 0.05 0.4 0.34 0.37 0.98 0.19 0.3 0.36 0.4 0.32 0.5 1.0 0.58 0.15 0.09 0.23 0.51 0.26 0.23
Sro1607_g285630.1 (Contig4442.g33356)
0.0 0.12 0.26 0.09 0.06 0.14 0.51 0.25 0.4 0.51 0.54 0.72 0.95 0.52 0.57 0.63 0.52 0.62 0.41 1.0 0.73 0.23 0.24 0.38 0.56 0.32 0.35
Sro163_g073180.1 (Contig1793.g15851)
0.0 0.07 0.02 0.07 0.01 0.44 0.58 0.2 0.38 0.63 0.27 0.74 0.53 0.28 0.42 0.33 0.2 0.2 0.28 0.44 0.88 0.24 0.22 0.57 1.0 0.32 0.27
Sro1772_g296710.1 (Contig4653.g34638)
0.02 0.17 0.16 0.18 0.24 0.44 0.47 0.44 0.32 0.69 0.52 0.96 1.0 0.69 0.55 0.55 0.53 0.64 0.66 0.9 0.74 0.24 0.25 0.49 0.69 0.34 0.48
Sro1783_g297270.1 (Contig2385.g19566)
0.02 0.45 0.33 0.24 0.28 0.28 0.42 0.17 0.29 0.59 0.54 0.77 1.0 0.72 0.46 0.63 0.44 0.35 0.44 0.88 0.65 0.2 0.22 0.25 0.26 0.25 0.38
Sro1785_g297390.1 (Contig4132.g31597)
0.03 0.23 0.28 0.22 0.19 0.16 0.39 0.25 0.48 0.52 0.41 0.55 0.97 0.79 0.47 0.89 0.46 0.63 0.62 1.0 0.75 0.27 0.35 0.24 0.31 0.31 0.22
Sro178_g078100.1 (Contig275.g3535)
0.0 0.04 0.07 0.08 0.06 0.36 0.28 0.2 0.1 0.49 0.46 0.53 0.98 0.34 0.44 0.6 0.34 0.44 0.69 1.0 0.56 0.23 0.05 0.3 0.61 0.44 0.31
Sro1842_g301090.1 (Contig2247.g18624)
0.01 0.02 0.01 0.02 0.06 0.05 0.29 0.06 0.13 0.61 0.23 1.0 0.76 0.63 0.4 0.63 0.13 0.27 0.3 0.79 0.76 0.07 0.05 0.13 0.44 0.21 0.21
Sro185_g080430.1 (Contig1228.g11518)
0.01 0.29 0.37 0.38 0.33 0.39 0.41 0.27 0.25 0.62 0.44 1.0 0.87 0.52 0.45 0.4 0.38 0.28 0.47 0.88 0.82 0.35 0.19 0.45 0.92 0.45 0.34
Sro1863_g302330.1 (Contig1972.g16863)
0.08 0.18 0.12 0.11 0.11 0.36 0.52 0.36 0.38 0.76 0.42 0.98 0.74 0.49 0.52 0.57 0.38 0.53 0.68 0.93 1.0 0.31 0.23 0.38 0.81 0.55 0.44
Sro187_g081060.1 (Contig2990.g23779)
0.14 0.32 0.21 0.27 0.22 0.23 0.51 0.4 0.42 0.65 0.65 0.82 0.88 0.63 0.51 0.5 0.45 0.32 0.42 1.0 0.73 0.32 0.28 0.58 0.33 0.3 0.44
Sro194_g082880.1 (Contig237.g2883)
0.12 0.31 0.28 0.24 0.23 0.3 0.56 0.46 0.52 0.64 0.6 0.89 1.0 0.44 0.51 0.39 0.33 0.31 0.42 0.9 0.67 0.28 0.28 0.58 0.58 0.25 0.3
Sro194_g083050.1 (Contig237.g2900)
0.0 0.2 0.25 0.29 0.16 0.12 0.21 0.17 0.09 0.45 0.33 0.57 1.0 0.49 0.36 0.31 0.29 0.31 0.39 0.77 0.72 0.14 0.13 0.32 0.28 0.27 0.27
Sro2214_g319320.1 (Contig3124.g24813)
0.03 0.06 0.09 0.07 0.05 0.09 0.25 0.17 0.5 0.41 0.34 0.44 1.0 0.8 0.51 0.99 0.44 0.48 0.54 0.99 0.51 0.21 0.36 0.16 0.1 0.27 0.2
Sro229_g092890.1 (Contig429.g5793)
0.02 0.08 0.1 0.1 0.1 0.04 0.18 0.06 0.39 0.44 0.2 0.6 1.0 0.64 0.37 0.92 0.24 0.47 0.49 0.75 0.98 0.17 0.19 0.07 0.12 0.14 0.11
Sro2386_g325740.1 (Contig2766.g22276)
0.0 0.05 0.05 0.05 0.04 0.24 0.26 0.21 0.26 0.38 0.13 0.51 1.0 0.17 0.19 0.64 0.11 0.36 0.46 0.89 0.54 0.17 0.17 0.22 0.36 0.2 0.17
Sro23_g016030.1 (Contig2259.g18753)
0.02 0.13 0.06 0.08 0.1 0.38 0.34 0.16 0.34 0.42 0.26 0.65 1.0 0.6 0.36 0.31 0.28 0.23 0.24 0.68 0.56 0.18 0.15 0.33 0.57 0.29 0.22
Sro2660_g333950.1 (Contig2099.g17854)
0.03 0.29 0.31 0.22 0.29 0.14 0.42 0.39 0.56 0.68 0.4 0.86 0.78 0.98 0.5 0.46 0.42 0.23 0.45 0.83 1.0 0.34 0.39 0.53 0.59 0.37 0.38
Sro266_g103060.1 (Contig1823.g16037)
0.02 0.25 0.12 0.19 0.11 0.14 0.66 0.28 0.4 0.79 0.27 0.98 0.85 0.67 0.55 0.25 0.43 0.19 0.23 0.97 1.0 0.2 0.15 0.66 0.81 0.22 0.26
Sro26_g017590.1 (Contig2432.g19930)
0.21 0.11 0.03 0.14 0.09 0.17 0.34 0.16 0.25 0.56 0.35 1.0 0.61 0.8 0.35 0.32 0.37 0.23 0.31 0.53 0.69 0.27 0.19 0.41 0.58 0.3 0.24
Sro2853_g338670.1 (Contig1140.g10944)
0.7 0.25 0.28 0.27 0.22 0.43 0.48 0.35 0.4 0.71 0.89 1.0 0.89 0.64 0.77 0.73 0.56 0.34 0.53 0.71 0.86 0.34 0.24 0.82 0.59 0.41 0.63
Sro2_g001400.1 (Contig467.g6298)
0.1 0.45 0.28 0.65 0.31 0.59 0.34 0.26 0.35 0.81 0.54 1.0 0.87 0.94 0.43 0.51 0.33 0.24 0.53 0.97 0.95 0.22 0.18 0.44 0.63 0.6 0.61
Sro30_g019730.1 (Contig3962.g30373)
0.03 0.23 0.51 0.27 0.22 0.25 0.36 0.19 0.28 0.58 0.49 0.79 1.0 0.54 0.44 0.4 0.4 0.3 0.68 0.84 0.66 0.23 0.17 0.35 0.41 0.31 0.37
Sro323_g117270.1 (Contig364.g4908)
0.01 0.33 0.27 0.38 0.27 0.34 0.57 0.5 0.28 0.73 0.53 0.98 0.69 0.54 0.57 0.51 0.47 0.59 0.83 0.76 1.0 0.38 0.35 0.58 0.92 0.6 0.43
Sro324_g117500.1 (Contig590.g7388)
0.07 0.35 0.42 0.25 0.26 0.24 0.42 0.24 0.43 0.6 0.51 0.89 0.76 0.59 0.46 0.34 0.42 0.28 0.31 1.0 0.69 0.39 0.3 0.36 0.37 0.24 0.3
Sro359_g126060.1 (Contig295.g3867)
0.02 0.14 0.16 0.15 0.15 0.29 0.47 0.28 0.42 0.64 0.5 0.74 0.98 0.68 0.58 0.96 0.46 0.6 0.64 0.94 1.0 0.41 0.41 0.46 0.59 0.44 0.45
Sro39_g024390.1 (Contig234.g2859)
0.0 0.13 0.12 0.11 0.11 0.08 0.36 0.11 0.15 0.45 0.21 0.72 0.95 0.46 0.38 0.22 0.29 0.47 0.64 1.0 0.69 0.24 0.06 0.4 0.76 0.36 0.26
Sro3_g002830.1 (Contig3832.g29468)
0.02 0.17 0.13 0.14 0.17 0.29 0.27 0.21 0.25 0.46 0.47 0.54 0.9 0.55 0.47 0.56 0.3 0.38 0.47 1.0 0.62 0.16 0.14 0.17 0.27 0.18 0.28
Sro436_g142590.1 (Contig228.g2747)
0.04 0.24 0.18 0.19 0.14 0.18 0.42 0.28 0.37 0.56 0.52 0.7 0.91 0.54 0.49 0.5 0.36 0.39 0.52 1.0 0.59 0.27 0.25 0.48 0.29 0.25 0.37
Sro452_g145920.1 (Contig1249.g11671)
0.03 0.17 0.22 0.17 0.2 0.3 0.26 0.17 0.25 0.55 0.44 0.77 1.0 0.51 0.33 0.28 0.35 0.28 0.35 0.94 0.76 0.37 0.23 0.27 0.43 0.26 0.3
Sro462_g148060.1 (Contig196.g2285)
0.01 0.05 0.08 0.09 0.11 0.22 0.47 0.22 0.38 0.64 0.46 0.77 0.77 0.58 0.51 1.0 0.43 0.5 0.58 0.74 0.92 0.3 0.39 0.33 0.65 0.47 0.33
Sro49_g028570.1 (Contig2054.g17607)
0.01 0.04 0.02 0.01 0.02 0.16 0.31 0.12 0.17 0.67 0.34 0.91 1.0 0.93 0.4 0.47 0.39 0.23 0.46 0.94 0.97 0.2 0.1 0.29 0.58 0.34 0.3
Sro4_g003690.1 (Contig3815.g29287)
0.02 0.15 0.12 0.13 0.18 0.3 0.53 0.32 0.39 0.74 0.33 1.0 0.87 0.84 0.56 0.71 0.43 0.34 0.25 0.93 0.98 0.27 0.24 0.48 0.5 0.32 0.34
Sro518_g158770.1 (Contig3565.g27532)
0.01 0.29 0.6 0.41 0.35 0.3 0.46 0.33 0.62 0.69 0.46 0.76 0.77 0.75 0.52 0.57 0.53 0.38 0.67 1.0 0.92 0.44 0.57 0.39 0.63 0.52 0.39
Sro519_g158910.1 (Contig1321.g12208)
0.01 0.24 0.23 0.15 0.25 0.3 0.38 0.27 0.25 0.53 0.36 0.73 1.0 0.42 0.44 0.58 0.43 0.25 0.33 0.95 0.69 0.2 0.17 0.36 0.49 0.43 0.34
Sro56_g032610.1 (Contig3029.g24137)
0.04 0.11 0.19 0.12 0.14 0.39 0.53 0.23 0.34 0.67 0.66 0.93 0.7 0.68 0.6 0.54 0.58 0.34 0.54 1.0 0.85 0.48 0.32 0.36 0.66 0.53 0.45
Sro602_g173720.1 (Contig490.g6598)
0.01 0.11 0.07 0.02 0.04 0.21 0.18 0.07 0.07 0.37 0.27 0.41 0.8 0.42 0.33 0.31 0.3 0.28 0.53 1.0 0.56 0.09 0.06 0.2 0.22 0.19 0.19
Sro604_g174150.1 (Contig2463.g20169)
0.02 0.02 0.04 0.05 0.03 0.06 0.26 0.26 0.19 0.51 0.27 0.67 1.0 0.64 0.29 0.27 0.15 0.12 0.3 0.96 0.65 0.36 0.14 0.45 0.55 0.3 0.2
Sro610_g175130.1 (Contig255.g3139)
0.03 0.08 0.11 0.12 0.1 0.41 0.42 0.2 0.22 0.69 0.47 0.97 0.5 0.42 0.48 0.7 0.58 0.29 0.41 0.92 1.0 0.26 0.2 0.37 0.59 0.4 0.34
Sro671_g184880.1 (Contig562.g7145)
0.05 0.17 0.11 0.13 0.15 0.11 0.25 0.17 0.2 0.56 0.38 0.83 0.97 0.63 0.42 0.51 0.33 0.34 0.57 1.0 0.83 0.19 0.16 0.19 0.23 0.23 0.28
Sro715_g191820.1 (Contig4130.g31594)
0.02 0.36 0.5 0.39 0.28 0.27 0.41 0.21 0.23 0.65 0.51 0.73 0.93 0.55 0.47 0.63 0.26 0.37 0.65 0.99 1.0 0.37 0.28 0.43 0.84 0.4 0.47
Sro734_g194760.1 (Contig3769.g28954)
0.0 0.21 0.12 0.2 0.18 0.25 0.34 0.28 0.17 0.65 0.5 0.84 0.77 0.76 0.41 0.6 0.31 0.29 0.36 0.91 1.0 0.32 0.16 0.44 0.67 0.4 0.36
Sro79_g042660.1 (Contig1826.g16073)
0.0 0.16 0.31 0.26 0.2 0.17 0.4 0.16 0.29 0.71 0.55 0.98 0.63 0.77 0.54 0.71 0.46 0.34 0.56 0.83 1.0 0.35 0.33 0.37 0.9 0.63 0.4
Sro82_g044020.1 (Contig4032.g30993)
0.0 0.09 0.2 0.17 0.23 0.23 0.27 0.19 0.12 0.54 0.44 0.75 1.0 0.64 0.44 0.47 0.34 0.55 0.54 0.99 0.8 0.23 0.13 0.24 0.46 0.33 0.39
Sro864_g212670.1 (Contig2395.g19639)
0.0 0.12 0.24 0.11 0.11 0.12 0.49 0.26 0.44 0.61 0.5 0.81 0.79 0.59 0.49 0.69 0.4 0.54 0.46 0.81 1.0 0.24 0.32 0.47 0.54 0.54 0.42
Sro906_g218640.1 (Contig1704.g15263)
0.12 0.2 0.18 0.25 0.22 0.29 0.43 0.3 0.24 0.71 0.37 1.0 0.61 0.7 0.48 0.48 0.44 0.37 0.39 0.86 0.94 0.37 0.28 0.43 0.74 0.49 0.35
Sro922_g220440.1 (Contig2958.g23487)
0.18 0.1 0.07 0.08 0.1 0.29 0.41 0.22 0.33 0.69 0.57 1.0 0.72 0.67 0.54 0.64 0.42 0.37 0.6 0.93 0.87 0.36 0.28 0.53 0.84 0.58 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)