Heatmap: Cluster_248 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1011_g230960.1 (Contig997.g10069)
0.35 0.11 0.15 0.1 0.07 0.7 1.69 1.25 2.54 3.67 1.46 4.79 6.32 4.64 2.46 4.89 1.89 3.25 3.09 6.88 4.61 1.57 1.44 0.62 1.09 1.6 1.15
Sro1093_g240390.1 (Contig384.g5165)
0.34 6.19 9.02 5.6 8.0 7.38 11.17 6.14 5.5 13.41 12.28 17.21 20.17 15.2 11.42 12.27 12.7 15.22 16.01 18.39 17.45 8.69 6.22 8.73 19.74 12.42 8.65
Sro1152_g246950.1 (Contig333.g4435)
2.28 2.08 2.63 2.97 2.55 7.78 14.24 8.48 12.83 23.23 15.53 27.4 34.56 20.03 19.66 39.37 13.89 19.21 25.39 34.05 39.45 12.12 9.63 18.1 26.34 18.65 15.4
Sro1153_g247050.1 (Contig4473.g33620)
0.33 0.16 0.41 0.46 0.38 1.19 3.49 0.94 6.92 6.96 4.83 8.43 15.33 12.5 6.23 10.95 8.83 5.94 6.4 14.41 10.28 2.99 3.67 1.48 3.48 3.09 1.82
Sro1162_g247940.1 (Contig2070.g17729)
0.26 2.68 3.41 2.67 2.53 3.55 5.8 2.74 4.1 12.77 8.82 18.68 13.67 14.03 8.47 10.12 8.85 4.31 9.04 15.53 16.77 6.05 4.24 7.9 11.34 9.75 7.91
Sro1168_g248520.1 (Contig1520.g13874)
0.16 0.27 0.46 0.28 0.4 3.4 6.04 2.68 2.13 10.97 4.35 13.86 10.53 10.67 6.9 5.28 4.67 3.0 6.2 14.82 14.1 2.8 1.79 5.45 11.12 6.23 5.13
Sro1176_g249240.1 (Contig4140.g31628)
0.15 3.66 3.32 3.49 2.86 1.13 4.5 5.15 4.98 6.56 4.15 8.82 9.91 5.33 4.35 3.31 3.02 3.3 5.42 11.25 9.28 4.33 4.06 3.52 5.05 4.8 3.7
Sro1186_g250400.1 (Contig3178.g25126)
0.09 0.08 0.18 0.07 0.0 0.17 0.82 0.23 1.39 1.91 1.03 2.58 3.26 2.79 1.42 2.31 1.48 2.16 2.73 2.61 3.19 0.57 0.79 0.45 0.33 1.01 0.49
0.11 0.61 1.5 1.89 1.94 8.1 4.32 1.9 6.0 7.71 3.3 10.78 13.62 5.93 5.29 8.06 2.15 4.94 6.72 12.87 12.48 3.27 2.65 3.0 7.49 4.03 4.19
Sro120_g058420.1 (Contig2411.g19720)
0.11 4.2 5.28 3.77 2.6 1.78 3.72 1.84 1.96 6.26 4.89 6.68 12.04 6.38 4.14 3.45 3.48 2.04 5.41 10.63 8.78 3.25 1.55 4.47 4.71 4.56 3.96
Sro1235_g255060.1 (Contig1411.g12964)
0.27 8.74 9.9 8.72 7.77 11.75 13.05 9.93 6.93 27.6 23.19 38.52 23.29 25.28 22.68 24.94 25.65 17.14 20.84 24.51 35.02 12.57 8.76 14.98 18.76 17.64 20.73
Sro1290_g259820.1 (Contig199.g2321)
0.17 1.97 2.25 1.81 1.16 3.67 3.03 2.21 2.92 4.76 5.24 6.04 10.37 5.36 5.65 5.93 4.85 4.02 4.07 9.16 6.49 1.6 1.86 3.24 4.28 2.57 2.8
Sro1515_g278970.1 (Contig1412.g12969)
0.71 1.71 0.59 1.31 0.51 0.46 2.45 1.57 2.21 5.12 2.59 7.82 7.99 5.01 2.17 3.13 4.41 2.9 4.12 9.96 5.2 1.18 2.0 2.78 5.28 4.1 2.3
Sro1534_g280500.1 (Contig2033.g17461)
0.39 8.8 6.78 6.89 6.67 6.07 10.04 4.95 13.33 17.76 8.2 22.95 19.0 11.46 7.42 7.52 8.14 6.58 15.12 25.1 22.06 7.37 8.76 6.98 12.12 9.55 6.78
Sro1552_g281810.1 (Contig3671.g28364)
0.66 3.08 3.42 3.83 4.07 5.93 6.25 1.85 5.64 12.87 8.9 16.79 21.4 14.96 9.88 13.38 10.31 4.81 8.58 19.39 16.82 3.28 4.7 4.18 8.95 5.67 7.06
Sro1577_g283610.1 (Contig4524.g33891)
0.63 3.43 2.95 4.58 4.35 2.94 6.73 5.43 9.58 13.22 9.53 20.47 16.24 12.44 8.88 9.5 9.07 6.78 12.74 18.5 16.98 7.41 5.93 8.19 14.05 10.1 7.28
Sro15_g010860.1 (Contig791.g8812)
7.79 5.79 5.03 6.95 5.96 6.93 12.77 7.69 10.42 22.36 12.33 30.24 27.56 19.39 14.05 12.86 9.9 8.72 12.46 25.89 36.3 8.51 10.77 14.62 24.08 12.13 9.9
Sro15_g011060.1 (Contig791.g8832)
2.16 10.35 13.75 16.98 14.38 31.77 28.62 18.86 23.61 37.01 33.65 47.87 48.82 30.18 34.69 33.11 27.21 37.9 42.7 46.07 41.53 15.94 18.86 21.1 22.47 17.62 27.38
Sro1601_g285120.1 (Contig4269.g32296)
0.11 0.21 0.17 0.08 0.03 2.21 1.06 0.19 0.35 2.62 2.25 2.46 6.46 1.29 1.96 2.36 2.66 2.11 3.29 6.62 3.83 0.99 0.6 1.51 3.35 1.75 1.52
Sro1607_g285630.1 (Contig4442.g33356)
0.0 1.7 3.5 1.28 0.78 1.91 6.94 3.36 5.46 6.97 7.4 9.8 13.03 7.06 7.77 8.6 7.09 8.45 5.61 13.66 9.91 3.12 3.27 5.16 7.6 4.4 4.73
Sro163_g073180.1 (Contig1793.g15851)
0.0 0.37 0.11 0.38 0.05 2.31 3.05 1.07 1.97 3.29 1.42 3.87 2.77 1.48 2.19 1.74 1.02 1.05 1.47 2.3 4.58 1.26 1.16 3.0 5.22 1.65 1.39
Sro1772_g296710.1 (Contig4653.g34638)
0.42 3.02 2.86 3.15 4.32 7.76 8.31 7.79 5.67 12.27 9.26 17.05 17.68 12.28 9.68 9.73 9.34 11.37 11.68 16.0 13.03 4.31 4.34 8.59 12.13 6.01 8.48
Sro1783_g297270.1 (Contig2385.g19566)
0.67 18.46 13.59 9.89 11.46 11.73 17.35 7.05 12.18 24.52 22.33 31.81 41.36 29.62 19.07 26.26 18.24 14.44 18.34 36.19 27.06 8.28 9.04 10.43 10.94 10.43 15.73
Sro1785_g297390.1 (Contig4132.g31597)
0.37 2.71 3.3 2.58 2.27 1.89 4.66 2.93 5.65 6.11 4.8 6.5 11.46 9.34 5.54 10.55 5.39 7.45 7.39 11.83 8.92 3.18 4.1 2.85 3.64 3.72 2.59
Sro178_g078100.1 (Contig275.g3535)
0.04 0.37 0.62 0.74 0.6 3.38 2.61 1.83 0.9 4.59 4.34 4.92 9.14 3.14 4.1 5.64 3.14 4.14 6.47 9.36 5.28 2.14 0.49 2.85 5.74 4.1 2.92
Sro1842_g301090.1 (Contig2247.g18624)
0.04 0.13 0.09 0.12 0.48 0.39 2.21 0.46 1.03 4.72 1.81 7.73 5.84 4.86 3.07 4.87 0.99 2.12 2.32 6.08 5.89 0.54 0.42 1.0 3.41 1.66 1.66
Sro185_g080430.1 (Contig1228.g11518)
0.53 12.37 15.95 16.45 14.36 16.75 17.52 11.72 10.69 26.7 19.09 43.24 37.45 22.56 19.55 17.23 16.39 12.2 20.12 38.03 35.46 15.08 8.05 19.67 39.65 19.26 14.65
Sro1863_g302330.1 (Contig1972.g16863)
3.54 7.58 5.27 4.76 4.89 15.54 22.09 15.53 16.39 32.74 18.01 41.84 31.79 20.99 22.21 24.34 16.39 22.91 29.2 39.85 42.84 13.3 9.89 16.07 34.79 23.36 18.68
Sro187_g081060.1 (Contig2990.g23779)
5.83 12.92 8.43 10.94 8.86 9.44 20.56 16.07 16.81 26.12 26.0 32.76 35.49 25.29 20.45 20.15 18.15 13.05 17.02 40.19 29.43 12.8 11.16 23.33 13.07 11.9 17.85
Sro194_g082880.1 (Contig237.g2883)
4.66 12.21 10.98 9.55 9.01 11.88 22.42 18.36 20.95 25.51 23.96 35.55 39.91 17.68 20.26 15.49 13.32 12.22 16.61 35.77 26.74 11.26 11.32 22.96 23.14 10.18 12.06
Sro194_g083050.1 (Contig237.g2900)
0.09 3.63 4.59 5.28 3.0 2.27 3.89 3.08 1.72 8.29 5.93 10.47 18.23 8.9 6.51 5.69 5.33 5.69 7.1 13.96 13.14 2.49 2.34 5.91 5.15 4.99 4.89
Sro2214_g319320.1 (Contig3124.g24813)
0.17 0.29 0.45 0.37 0.25 0.45 1.27 0.86 2.47 2.03 1.7 2.21 4.98 3.98 2.53 4.92 2.17 2.41 2.71 4.93 2.52 1.05 1.78 0.79 0.5 1.34 1.0
Sro229_g092890.1 (Contig429.g5793)
0.2 0.88 1.08 1.11 1.13 0.45 1.97 0.63 4.34 4.92 2.22 6.7 11.21 7.2 4.11 10.3 2.7 5.23 5.49 8.42 11.01 1.89 2.16 0.78 1.32 1.59 1.18
Sro2386_g325740.1 (Contig2766.g22276)
0.03 0.4 0.44 0.41 0.32 2.04 2.2 1.78 2.2 3.18 1.1 4.22 8.31 1.45 1.62 5.34 0.94 3.02 3.86 7.4 4.46 1.45 1.43 1.8 2.95 1.64 1.39
Sro23_g016030.1 (Contig2259.g18753)
0.23 1.84 0.86 1.06 1.43 5.35 4.75 2.29 4.82 5.89 3.63 9.03 13.97 8.35 5.02 4.37 3.97 3.16 3.32 9.53 7.77 2.55 2.05 4.66 7.97 4.01 3.05
Sro2660_g333950.1 (Contig2099.g17854)
0.44 4.76 5.15 3.58 4.83 2.38 6.91 6.42 9.14 11.09 6.56 14.21 12.89 16.06 8.14 7.62 6.89 3.81 7.33 13.65 16.43 5.55 6.42 8.65 9.76 6.06 6.21
Sro266_g103060.1 (Contig1823.g16037)
0.07 1.17 0.58 0.87 0.52 0.63 3.05 1.28 1.85 3.64 1.24 4.53 3.9 3.08 2.52 1.17 1.97 0.86 1.05 4.49 4.62 0.92 0.71 3.06 3.74 1.01 1.18
Sro26_g017590.1 (Contig2432.g19930)
4.13 2.19 0.63 2.82 1.81 3.27 6.69 3.04 4.83 10.95 6.76 19.5 11.86 15.63 6.86 6.32 7.31 4.45 6.09 10.35 13.55 5.31 3.64 7.94 11.23 5.79 4.66
Sro2853_g338670.1 (Contig1140.g10944)
18.87 6.88 7.69 7.33 6.01 11.54 13.03 9.52 10.83 19.18 24.19 27.03 24.12 17.22 20.89 19.76 15.01 9.17 14.3 19.13 23.27 9.09 6.47 22.05 15.98 11.19 17.13
Sro2_g001400.1 (Contig467.g6298)
1.97 9.27 5.73 13.37 6.29 12.17 7.03 5.32 7.27 16.52 11.05 20.51 17.86 19.35 8.75 10.53 6.83 4.87 10.85 19.97 19.52 4.48 3.75 8.97 12.89 12.28 12.42
Sro30_g019730.1 (Contig3962.g30373)
0.71 5.08 11.33 6.02 4.94 5.67 8.03 4.31 6.24 13.01 11.02 17.65 22.43 12.19 9.81 9.06 8.94 6.64 15.16 18.94 14.84 5.15 3.76 7.89 9.2 6.91 8.25
Sro323_g117270.1 (Contig364.g4908)
0.12 4.99 4.12 5.87 4.11 5.18 8.66 7.62 4.3 11.22 8.1 15.0 10.56 8.21 8.73 7.76 7.14 8.98 12.65 11.64 15.27 5.83 5.37 8.87 14.01 9.11 6.52
Sro324_g117500.1 (Contig590.g7388)
1.46 6.87 8.21 4.84 5.05 4.76 8.32 4.68 8.39 11.85 9.97 17.57 15.0 11.64 9.16 6.76 8.24 5.47 6.19 19.71 13.68 7.79 5.92 7.19 7.2 4.68 5.98
Sro359_g126060.1 (Contig295.g3867)
1.69 12.83 14.6 14.21 13.75 27.24 43.74 25.57 38.78 58.96 46.31 68.98 90.73 63.02 54.04 89.33 42.71 55.57 59.14 87.18 92.68 38.04 38.27 43.02 54.38 40.91 41.38
Sro39_g024390.1 (Contig234.g2859)
0.0 0.81 0.73 0.69 0.65 0.49 2.2 0.65 0.93 2.72 1.28 4.33 5.75 2.78 2.28 1.31 1.75 2.83 3.84 6.04 4.17 1.47 0.37 2.42 4.62 2.19 1.6
Sro3_g002830.1 (Contig3832.g29468)
0.27 2.09 1.63 1.76 2.0 3.55 3.22 2.6 3.02 5.57 5.67 6.62 10.9 6.62 5.72 6.8 3.68 4.59 5.71 12.14 7.52 1.9 1.75 2.05 3.32 2.2 3.43
Sro436_g142590.1 (Contig228.g2747)
0.78 4.85 3.61 3.92 2.92 3.58 8.57 5.73 7.53 11.35 10.47 14.23 18.44 10.92 9.92 10.19 7.32 7.85 10.52 20.26 11.88 5.57 5.02 9.81 5.93 5.14 7.53
Sro452_g145920.1 (Contig1249.g11671)
0.78 4.52 5.97 4.67 5.52 8.08 7.12 4.49 6.76 14.96 12.0 20.92 27.12 13.78 8.82 7.66 9.58 7.54 9.55 25.56 20.73 10.01 6.28 7.29 11.74 7.13 8.06
Sro462_g148060.1 (Contig196.g2285)
0.55 2.92 4.36 4.7 5.65 11.91 25.21 11.71 20.56 34.12 24.7 41.57 41.11 31.17 27.35 53.7 22.98 27.04 31.1 39.5 49.2 15.84 20.73 17.79 34.99 25.5 17.58
Sro49_g028570.1 (Contig2054.g17607)
0.03 0.23 0.09 0.04 0.1 0.85 1.63 0.64 0.87 3.53 1.81 4.81 5.3 4.92 2.12 2.51 2.09 1.21 2.45 4.96 5.14 1.05 0.55 1.55 3.06 1.81 1.57
Sro4_g003690.1 (Contig3815.g29287)
0.57 4.87 3.9 4.27 5.98 9.76 17.46 10.47 12.84 24.1 10.73 32.68 28.48 27.45 18.29 23.25 14.16 10.98 8.3 30.54 32.16 8.79 7.72 15.68 16.22 10.56 11.06
Sro518_g158770.1 (Contig3565.g27532)
0.41 12.23 25.11 17.05 14.81 12.59 19.37 13.94 26.2 28.92 19.21 32.1 32.49 31.69 21.91 23.75 22.32 15.96 28.08 42.03 38.67 18.35 24.16 16.29 26.49 21.93 16.49
Sro519_g158910.1 (Contig1321.g12208)
0.06 2.52 2.41 1.5 2.58 3.05 3.95 2.73 2.53 5.44 3.69 7.5 10.29 4.37 4.55 5.97 4.41 2.61 3.43 9.77 7.08 2.02 1.78 3.67 5.04 4.39 3.47
Sro56_g032610.1 (Contig3029.g24137)
0.87 2.38 4.04 2.54 3.0 8.29 11.29 4.93 7.29 14.31 14.14 19.82 14.9 14.44 12.73 11.48 12.26 7.24 11.52 21.27 18.01 10.22 6.8 7.72 14.01 11.23 9.56
Sro602_g173720.1 (Contig490.g6598)
0.07 0.7 0.45 0.15 0.23 1.37 1.2 0.45 0.48 2.41 1.76 2.69 5.25 2.77 2.14 2.03 1.94 1.85 3.5 6.57 3.65 0.61 0.37 1.33 1.46 1.28 1.24
Sro604_g174150.1 (Contig2463.g20169)
0.1 0.1 0.18 0.26 0.13 0.31 1.28 1.25 0.92 2.49 1.3 3.26 4.88 3.13 1.42 1.31 0.73 0.6 1.47 4.66 3.17 1.77 0.68 2.21 2.67 1.48 0.95
Sro610_g175130.1 (Contig255.g3139)
0.42 1.32 1.84 1.95 1.59 6.78 6.86 3.24 3.62 11.27 7.8 15.98 8.18 6.89 7.96 11.44 9.54 4.83 6.77 15.17 16.44 4.29 3.28 6.13 9.69 6.56 5.63
Sro671_g184880.1 (Contig562.g7145)
1.19 4.41 2.88 3.51 3.86 2.81 6.57 4.5 5.14 14.65 10.0 21.56 25.32 16.44 11.0 13.3 8.54 8.96 14.78 26.12 21.7 4.87 4.26 4.87 5.91 6.05 7.26
Sro715_g191820.1 (Contig4130.g31594)
0.36 6.06 8.57 6.65 4.85 4.58 7.01 3.62 3.97 11.09 8.73 12.35 15.87 9.33 8.05 10.77 4.48 6.37 11.01 16.9 17.03 6.36 4.73 7.3 14.34 6.89 7.93
Sro734_g194760.1 (Contig3769.g28954)
0.04 1.82 1.06 1.8 1.58 2.17 2.98 2.49 1.51 5.73 4.4 7.41 6.81 6.75 3.6 5.33 2.77 2.54 3.21 8.06 8.86 2.87 1.44 3.87 5.93 3.5 3.15
Sro79_g042660.1 (Contig1826.g16073)
0.12 5.14 10.07 8.34 6.4 5.51 13.12 5.25 9.5 23.3 18.14 31.96 20.46 25.17 17.52 23.15 15.08 11.12 18.45 27.02 32.69 11.41 10.88 12.01 29.36 20.62 12.92
Sro82_g044020.1 (Contig4032.g30993)
0.0 0.91 2.05 1.81 2.4 2.42 2.82 2.02 1.2 5.64 4.59 7.75 10.39 6.6 4.58 4.88 3.54 5.68 5.61 10.31 8.32 2.41 1.33 2.48 4.8 3.39 4.09
Sro864_g212670.1 (Contig2395.g19639)
0.13 3.63 7.66 3.48 3.6 3.86 15.48 8.28 13.74 19.23 15.64 25.66 25.04 18.65 15.5 21.63 12.72 17.06 14.52 25.46 31.53 7.6 10.06 14.7 17.04 17.0 13.16
Sro906_g218640.1 (Contig1704.g15263)
15.75 26.74 23.51 34.04 28.98 38.86 58.25 40.67 32.22 94.78 50.16 133.94 82.01 94.34 64.86 64.17 58.59 48.97 52.28 115.51 126.28 49.67 37.63 58.08 98.89 66.28 46.97
Sro922_g220440.1 (Contig2958.g23487)
6.77 3.76 2.85 3.24 3.89 11.31 15.58 8.61 12.81 26.55 21.79 38.41 27.6 25.66 20.64 24.62 16.29 14.04 23.22 35.54 33.38 13.65 10.83 20.46 32.38 22.3 14.6

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)