Heatmap: Cluster_336 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro100_g051090.1 (Contig63.g514)
0.59 0.73 0.26 0.16 0.19 0.08 0.35 0.54 0.35 0.62 0.3 0.74 0.71 0.3 0.32 0.52 0.26 0.44 0.41 0.99 1.0 0.56 0.37 0.34 0.46 0.33 0.37
Sro100_g051100.1 (Contig63.g515)
0.54 0.18 0.12 0.07 0.08 0.17 0.29 0.33 0.23 0.56 0.33 0.82 0.72 0.35 0.33 0.49 0.19 0.42 0.41 0.96 1.0 0.24 0.2 0.35 0.46 0.29 0.38
Sro102_g052260.1 (Contig319.g4270)
0.03 0.21 0.19 0.25 0.13 0.44 0.59 0.38 0.31 0.7 0.53 0.84 0.73 0.54 0.63 0.72 0.41 0.38 0.54 1.0 0.88 0.12 0.2 0.64 0.93 0.73 0.58
Sro1045_g234970.1 (Contig324.g4306)
0.05 0.15 0.11 0.15 0.15 0.16 0.3 0.28 0.33 0.49 0.36 0.69 0.94 0.38 0.35 0.48 0.24 0.3 0.45 1.0 0.6 0.19 0.3 0.26 0.22 0.16 0.28
Sro1075_g238420.1 (Contig2078.g17751)
0.01 0.24 0.28 0.51 0.44 0.36 0.48 0.46 0.39 0.8 0.88 1.0 0.98 0.76 0.76 0.95 0.63 0.69 0.72 0.94 0.95 0.22 0.35 0.52 0.77 0.64 0.7
Sro109_g054440.1 (Contig4753.g35226)
0.01 0.13 0.29 0.05 0.04 0.14 0.36 0.27 0.19 0.77 0.6 1.0 0.74 0.42 0.62 0.44 0.49 0.43 0.59 0.94 0.82 0.32 0.26 0.44 0.9 0.47 0.41
Sro1186_g250360.1 (Contig3178.g25122)
0.0 0.24 0.31 0.32 0.2 0.39 0.36 0.24 0.27 0.68 0.7 0.94 0.9 0.29 0.68 1.0 0.55 0.44 0.57 0.73 0.85 0.11 0.24 0.31 0.52 0.33 0.65
Sro118_g057560.1 (Contig2714.g21826)
0.0 0.09 0.13 0.11 0.11 0.25 0.29 0.21 0.15 0.66 0.66 0.88 0.79 0.62 0.52 0.76 0.58 0.4 0.67 1.0 0.88 0.36 0.27 0.35 0.61 0.56 0.56
Sro1285_g259290.1 (Contig851.g9357)
0.16 0.05 0.05 0.03 0.03 0.17 0.29 0.22 0.27 0.55 0.72 0.75 0.83 0.26 0.43 0.39 0.45 0.19 0.45 1.0 0.68 0.15 0.17 0.29 0.49 0.23 0.4
Sro128_g061250.1 (Contig1654.g14901)
0.07 0.06 0.06 0.05 0.08 0.22 0.27 0.28 0.12 0.55 0.51 0.79 0.57 0.26 0.5 0.54 0.34 0.53 0.42 1.0 0.76 0.07 0.12 0.35 0.53 0.37 0.32
Sro1293_g260130.1 (Contig3749.g28724)
0.02 0.18 0.09 0.17 0.13 0.25 0.26 0.17 0.17 0.44 0.34 0.53 0.76 0.48 0.33 0.33 0.28 0.23 0.46 1.0 0.55 0.23 0.19 0.25 0.15 0.22 0.37
Sro1369_g266940.1 (Contig3578.g27665)
0.79 0.11 0.13 0.09 0.1 0.16 0.42 0.28 0.24 0.71 0.49 1.0 0.67 0.6 0.49 0.68 0.36 0.34 0.46 0.87 0.56 0.44 0.28 0.6 0.81 0.57 0.41
Sro143_g066670.1 (Contig3754.g28773)
0.0 0.18 0.13 0.21 0.09 0.3 0.31 0.22 0.17 0.45 0.5 0.43 0.69 0.34 0.49 0.38 0.47 0.51 0.77 1.0 0.47 0.26 0.14 0.37 0.56 0.51 0.37
Sro1442_g273000.1 (Contig3575.g27633)
0.03 0.09 0.06 0.05 0.02 0.2 0.55 0.43 0.44 0.59 0.4 0.69 0.82 0.57 0.48 0.45 0.38 0.38 0.49 0.83 0.79 0.1 0.14 0.53 1.0 0.42 0.31
Sro1479_g276110.1 (Contig408.g5551)
0.12 0.08 0.1 0.09 0.08 0.3 0.37 0.26 0.19 0.61 0.72 0.88 0.67 0.57 0.45 0.42 0.49 0.35 0.47 0.87 0.73 0.18 0.2 0.55 1.0 0.53 0.47
Sro1485_g276570.1 (Contig4245.g32138)
0.23 0.09 0.13 0.11 0.11 0.22 0.48 0.43 0.21 0.61 0.46 0.76 1.0 0.51 0.48 0.45 0.39 0.34 0.34 0.98 0.75 0.25 0.18 0.52 0.69 0.5 0.32
Sro152_g069490.1 (Contig69.g709)
0.03 0.03 0.05 0.02 0.01 0.09 0.24 0.21 0.12 0.54 0.47 0.75 0.69 0.63 0.44 0.46 0.52 0.32 0.53 1.0 0.77 0.18 0.13 0.2 0.52 0.41 0.38
Sro15_g011130.1 (Contig791.g8839)
0.02 0.08 0.09 0.09 0.06 0.14 0.35 0.33 0.2 0.52 0.44 0.61 0.96 0.29 0.37 0.45 0.31 0.32 0.36 1.0 0.65 0.14 0.1 0.32 0.58 0.28 0.27
Sro170_g075480.1 (Contig2525.g20621)
0.01 0.08 0.06 0.03 0.01 0.08 0.3 0.34 0.16 0.49 0.44 0.54 0.54 0.14 0.44 0.41 0.2 0.15 0.36 1.0 0.73 0.05 0.03 0.49 0.93 0.29 0.27
Sro176_g077400.1 (Contig203.g2427)
0.04 0.1 0.08 0.1 0.08 0.15 0.56 0.19 0.09 0.66 0.68 0.81 0.53 0.75 0.65 0.71 0.26 0.41 0.49 0.7 0.95 0.2 0.14 0.67 1.0 0.79 0.41
Sro1792_g297810.1 (Contig126.g1426)
0.11 0.06 0.06 0.08 0.08 0.18 0.43 0.27 0.18 0.61 0.39 0.85 0.43 0.37 0.37 0.35 0.43 0.32 0.35 0.66 0.79 0.01 0.14 0.48 1.0 0.45 0.36
Sro1799_g298400.1 (Contig3588.g27731)
0.11 0.18 0.21 0.29 0.18 0.2 0.48 0.34 0.28 0.58 0.59 0.69 0.61 0.41 0.53 0.66 0.45 0.47 0.33 0.71 1.0 0.2 0.26 0.88 0.66 0.48 0.38
Sro182_g079490.1 (Contig1301.g12085)
0.05 0.07 0.09 0.04 0.06 0.09 0.21 0.25 0.19 0.51 0.43 0.66 0.52 0.32 0.42 0.59 0.39 0.35 0.47 1.0 0.71 0.16 0.15 0.28 0.59 0.36 0.38
Sro184_g079890.1 (Contig2216.g18392)
0.01 0.13 0.18 0.11 0.11 0.15 0.27 0.16 0.21 0.54 0.41 0.9 0.79 0.41 0.38 0.47 0.39 0.22 0.37 1.0 0.75 0.22 0.22 0.27 0.34 0.19 0.31
Sro1967_g308350.1 (Contig1335.g12302)
0.46 0.08 0.04 0.07 0.05 0.26 0.39 0.26 0.25 0.69 0.64 1.0 0.67 0.4 0.5 0.41 0.37 0.42 0.41 0.71 0.51 0.15 0.18 0.22 0.41 0.3 0.38
Sro2010_g310770.1 (Contig3241.g25605)
0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.19 0.31 0.31 0.14 0.35 0.26 0.43 0.52 0.08 0.33 0.25 0.15 0.34 0.31 1.0 0.57 0.09 0.09 0.26 0.51 0.15 0.27
Sro215_g089090.1 (Contig4439.g33333)
0.06 0.52 0.5 0.32 0.31 0.2 0.54 0.49 0.39 0.67 0.46 0.83 0.85 0.4 0.47 0.48 0.37 0.23 0.3 1.0 0.93 0.28 0.19 0.4 0.66 0.28 0.31
Sro2174_g317720.1 (Contig2241.g18607)
0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.09 0.66 0.37 0.23 0.58 0.47 0.56 0.96 0.42 0.56 0.65 0.33 0.32 0.32 1.0 0.9 0.16 0.13 0.54 0.88 0.38 0.3
Sro2263_g321240.1 (Contig1877.g16379)
0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.11 0.49 0.14 0.11 0.45 0.39 0.41 0.48 0.1 0.33 0.5 0.21 0.33 0.32 1.0 0.75 0.05 0.09 0.55 0.99 0.49 0.42
Sro2416_g326900.1 (Contig3821.g29343)
0.02 0.08 0.03 0.05 0.05 0.15 0.13 0.09 0.13 0.35 0.33 0.32 0.56 0.11 0.29 0.3 0.32 0.37 0.48 1.0 0.48 0.07 0.12 0.1 0.19 0.07 0.24
Sro2672_g334330.1 (Contig3678.g28401)
0.08 0.05 0.03 0.19 0.09 0.1 0.23 0.1 0.03 0.43 0.32 0.4 0.53 0.2 0.45 0.57 0.17 0.43 0.57 1.0 0.58 0.05 0.03 0.62 0.71 0.29 0.29
Sro2717_g335380.1 (Contig3434.g26738)
0.03 0.03 0.04 0.02 0.01 0.28 0.25 0.12 0.1 0.56 0.83 0.55 0.67 0.2 0.57 0.59 0.5 0.28 0.47 1.0 0.81 0.01 0.09 0.24 0.12 0.22 0.4
Sro279_g106670.1 (Contig3140.g24906)
0.01 0.1 0.15 0.16 0.07 0.18 0.34 0.24 0.25 0.49 0.42 0.74 1.0 0.41 0.41 0.41 0.2 0.2 0.52 0.95 0.63 0.11 0.13 0.22 0.25 0.25 0.27
Sro298_g111090.1 (Contig4399.g33040)
0.52 0.19 0.23 0.27 0.18 0.28 0.48 0.42 0.45 0.71 0.79 0.84 0.9 0.44 0.65 0.81 0.52 0.59 0.61 1.0 0.63 0.2 0.26 0.44 0.35 0.3 0.55
Sro29_g019030.1 (Contig1384.g12746)
0.02 0.04 0.05 0.04 0.03 0.14 0.32 0.2 0.18 0.55 0.5 0.65 0.9 0.58 0.53 0.79 0.48 0.3 0.33 1.0 0.85 0.28 0.12 0.32 0.79 0.45 0.34
Sro3075_g343290.1 (Contig4712.g35047)
0.02 0.22 0.07 0.15 0.11 0.15 0.5 0.46 0.25 0.59 0.6 0.67 0.47 0.46 0.44 0.48 0.47 0.33 0.52 0.71 0.6 0.17 0.1 0.58 1.0 0.5 0.36
Sro337_g120620.1 (Contig2800.g22520)
0.01 0.07 0.05 0.05 0.06 0.15 0.28 0.24 0.21 0.63 0.57 1.0 0.94 0.82 0.55 1.0 0.51 0.34 0.76 0.8 0.75 0.24 0.1 0.41 0.46 0.35 0.57
Sro355_g124990.1 (Contig2977.g23657)
0.12 0.09 0.1 0.05 0.06 0.15 0.43 0.44 0.3 0.64 0.62 1.0 0.82 0.31 0.49 0.68 0.34 0.2 0.38 0.96 0.64 0.16 0.15 0.47 0.51 0.29 0.38
0.0 0.05 0.04 0.07 0.03 0.21 0.17 0.14 0.08 0.39 0.29 0.47 0.91 0.45 0.35 0.33 0.43 0.26 0.34 1.0 0.41 0.05 0.07 0.17 0.14 0.24 0.3
Sro3944_g352060.1 (Contig4212.g32044)
0.0 0.0 0.04 0.12 0.07 0.12 0.24 0.05 0.08 0.61 0.48 1.0 0.88 0.43 0.54 0.65 0.49 0.49 0.54 0.86 0.87 0.0 0.06 0.28 0.32 0.35 0.36
0.0 0.11 0.18 0.18 0.19 0.11 0.27 0.06 0.13 0.57 0.52 0.8 0.82 0.57 0.45 0.52 0.38 0.45 0.52 1.0 0.65 0.06 0.04 0.28 0.37 0.14 0.33
Sro4504_g354170.1 (Contig756.g8603)
0.03 0.04 0.05 0.01 0.03 0.27 0.25 0.22 0.24 0.54 0.57 0.93 0.44 0.32 0.33 0.32 0.38 0.31 0.47 1.0 0.82 0.12 0.21 0.16 0.39 0.32 0.42
Sro453_g146150.1 (Contig1693.g15172)
0.59 0.29 0.35 0.31 0.25 0.22 0.36 0.22 0.21 0.57 0.59 0.72 1.0 0.38 0.52 0.65 0.47 0.31 0.43 0.96 0.46 0.14 0.19 0.5 0.35 0.25 0.41
Sro482_g151780.1 (Contig232.g2788)
0.05 0.09 0.05 0.09 0.09 0.33 0.42 0.2 0.08 0.73 0.49 1.0 0.51 0.33 0.52 0.45 0.41 0.26 0.28 0.91 0.69 0.06 0.09 0.42 0.49 0.27 0.38
Sro522_g159650.1 (Contig3319.g26051)
0.35 0.12 0.1 0.19 0.16 0.27 0.47 0.28 0.18 0.63 0.88 0.71 0.58 0.39 0.67 0.84 0.58 0.57 0.56 0.94 0.82 0.21 0.15 0.81 1.0 0.43 0.51
Sro537_g162280.1 (Contig1194.g11280)
0.07 0.4 0.51 0.46 0.32 0.36 0.52 0.78 0.35 0.7 0.69 0.89 0.94 0.61 0.66 0.89 0.53 0.45 0.43 1.0 0.85 0.24 0.25 0.55 0.49 0.37 0.44
Sro575_g169440.1 (Contig1981.g16962)
0.02 0.22 0.23 0.28 0.22 0.27 0.28 0.22 0.3 0.63 0.69 0.87 0.87 0.53 0.56 0.78 0.57 0.51 0.7 0.82 1.0 0.27 0.21 0.34 0.39 0.49 0.57
Sro616_g176010.1 (Contig2621.g21293)
0.03 0.07 0.08 0.07 0.03 0.07 0.38 0.19 0.15 0.56 0.39 0.62 0.47 0.2 0.33 0.53 0.2 0.19 0.33 1.0 0.87 0.13 0.12 0.4 0.92 0.28 0.29
Sro641_g180070.1 (Contig1098.g10651)
0.1 0.17 0.18 0.26 0.21 0.17 0.31 0.36 0.24 0.61 0.86 1.0 0.48 0.26 0.51 0.41 0.55 0.17 0.27 0.54 0.71 0.23 0.25 0.54 0.75 0.47 0.5
Sro652_g181820.1 (Contig2024.g17335)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.32 0.11 0.04 0.62 0.28 0.59 0.37 0.21 0.41 0.71 0.1 0.08 0.12 0.66 1.0 0.01 0.02 0.32 0.59 0.28 0.21
Sro677_g185820.1 (Contig3197.g25278)
0.02 0.18 0.13 0.14 0.08 0.09 0.36 0.2 0.16 0.55 0.49 0.68 0.63 0.39 0.34 0.37 0.48 0.33 0.44 1.0 0.56 0.18 0.2 0.44 0.71 0.39 0.35
Sro716_g191910.1 (Contig2471.g20215)
0.04 0.34 0.18 0.18 0.19 0.09 0.54 0.62 0.42 0.56 0.32 0.78 0.47 0.25 0.31 0.54 0.34 0.66 0.52 0.59 1.0 0.5 0.4 0.24 0.26 0.3 0.29
Sro720_g192590.1 (Contig2421.g19820)
0.02 0.05 0.09 0.12 0.1 0.31 0.3 0.21 0.29 0.71 0.58 1.0 0.66 0.59 0.51 0.62 0.43 0.51 0.71 0.71 0.91 0.12 0.16 0.24 0.54 0.37 0.51
Sro73_g040390.1 (Contig3929.g30140)
0.03 0.29 0.35 0.41 0.34 0.21 0.38 0.35 0.38 0.56 0.54 0.72 1.0 0.56 0.43 0.45 0.41 0.34 0.45 0.92 0.62 0.22 0.27 0.26 0.43 0.3 0.41
Sro76_g041730.1 (Contig184.g2151)
0.1 0.18 0.19 0.19 0.18 0.26 0.51 0.5 0.48 0.68 0.54 0.86 0.73 0.53 0.54 0.78 0.45 0.46 0.59 0.97 1.0 0.37 0.43 0.5 0.86 0.54 0.5
Sro80_g043090.1 (Contig92.g1053)
0.03 0.09 0.09 0.05 0.06 0.22 0.44 0.28 0.21 0.54 0.57 0.6 0.53 0.27 0.47 0.49 0.44 0.46 0.54 1.0 0.6 0.33 0.18 0.51 0.75 0.49 0.34
Sro900_g217870.1 (Contig2813.g22565)
0.07 0.41 0.4 0.31 0.23 0.29 0.32 0.36 0.24 0.48 0.39 0.54 0.78 0.58 0.44 0.5 0.48 0.76 1.0 0.76 0.62 0.33 0.26 0.48 0.54 0.51 0.37
Sro903_g218210.1 (Contig3909.g29961)
0.12 0.08 0.16 0.08 0.03 0.7 0.15 0.02 0.02 0.75 0.35 1.0 0.56 0.5 0.51 0.51 0.32 0.35 0.49 0.73 0.84 0.01 0.01 0.43 0.73 0.66 0.45
Sro93_g048720.1 (Contig3841.g29560)
0.04 0.21 0.33 0.25 0.3 0.38 0.44 0.51 0.33 0.64 0.39 0.9 0.87 0.62 0.7 1.0 0.37 0.4 0.5 0.83 0.91 0.13 0.23 0.62 0.78 0.49 0.48
Sro978_g227120.1 (Contig212.g2518)
0.55 0.08 0.05 0.06 0.03 0.06 0.26 0.31 0.15 0.52 0.35 0.94 0.69 0.15 0.27 0.31 0.21 0.14 0.24 1.0 0.61 0.08 0.17 0.29 0.26 0.19 0.29
Sro978_g227170.1 (Contig212.g2523)
0.02 0.32 0.29 0.27 0.25 0.38 0.4 0.3 0.42 0.66 0.54 0.74 1.0 0.71 0.53 0.68 0.59 0.44 0.59 0.93 0.7 0.34 0.31 0.32 0.23 0.34 0.49
Sro9_g007090.1 (Contig4120.g31477)
0.17 0.05 0.06 0.06 0.05 0.39 0.32 0.14 0.27 0.53 0.5 0.65 0.53 0.3 0.47 0.72 0.49 0.28 0.49 1.0 0.63 0.04 0.12 0.31 0.36 0.3 0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)