Heatmap: Cluster_336 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro100_g051090.1 (Contig63.g514)
12.93 16.07 5.62 3.55 4.21 1.7 7.76 11.87 7.63 13.63 6.68 16.31 15.62 6.68 6.99 11.45 5.72 9.63 9.0 21.69 22.01 12.26 8.23 7.55 10.12 7.18 8.09
Sro100_g051100.1 (Contig63.g515)
7.43 2.51 1.67 0.92 1.05 2.32 3.9 4.51 3.13 7.68 4.55 11.15 9.81 4.84 4.56 6.7 2.54 5.74 5.57 13.14 13.66 3.24 2.72 4.77 6.29 4.01 5.18
Sro102_g052260.1 (Contig319.g4270)
0.45 2.91 2.58 3.44 1.85 6.17 8.18 5.27 4.36 9.74 7.36 11.66 10.23 7.48 8.75 10.01 5.75 5.23 7.54 13.93 12.21 1.7 2.82 8.88 12.9 10.15 8.07
Sro1045_g234970.1 (Contig324.g4306)
1.05 3.48 2.59 3.5 3.5 3.51 6.79 6.3 7.46 11.13 8.18 15.57 21.33 8.54 7.82 10.8 5.45 6.89 10.16 22.61 13.63 4.22 6.76 5.85 5.01 3.67 6.4
Sro1075_g238420.1 (Contig2078.g17751)
0.66 21.01 24.58 45.11 39.11 31.8 42.48 40.88 34.02 70.13 76.99 87.92 86.1 66.66 66.51 83.36 55.64 60.53 63.04 82.67 83.46 19.47 30.9 45.39 67.81 56.37 61.63
Sro109_g054440.1 (Contig4753.g35226)
0.08 0.82 1.78 0.34 0.23 0.88 2.26 1.65 1.2 4.74 3.74 6.19 4.59 2.6 3.82 2.72 3.06 2.65 3.66 5.79 5.1 1.97 1.6 2.7 5.57 2.94 2.54
Sro1186_g250360.1 (Contig3178.g25122)
0.12 8.31 10.71 10.93 7.07 13.51 12.41 8.18 9.47 23.34 24.1 32.39 31.0 9.97 23.58 34.5 19.13 15.31 19.68 25.21 29.31 3.64 8.3 10.55 17.96 11.46 22.26
Sro118_g057560.1 (Contig2714.g21826)
0.03 1.51 2.06 1.76 1.74 4.11 4.75 3.32 2.43 10.73 10.72 14.31 12.86 10.09 8.36 12.33 9.45 6.53 10.91 16.18 14.17 5.83 4.42 5.7 9.91 9.14 9.1
Sro1285_g259290.1 (Contig851.g9357)
2.75 0.78 0.86 0.43 0.53 2.8 4.95 3.67 4.51 9.26 12.04 12.56 13.92 4.29 7.22 6.49 7.62 3.12 7.56 16.81 11.46 2.54 2.89 4.89 8.18 3.79 6.72
Sro128_g061250.1 (Contig1654.g14901)
1.98 1.78 1.94 1.59 2.35 6.7 8.16 8.5 3.7 16.74 15.54 23.83 17.15 7.97 15.23 16.37 10.29 15.92 12.8 30.19 22.81 2.02 3.68 10.51 15.94 11.08 9.65
Sro1293_g260130.1 (Contig3749.g28724)
0.23 2.56 1.28 2.5 1.84 3.63 3.66 2.5 2.44 6.25 4.82 7.65 10.84 6.89 4.79 4.79 4.03 3.26 6.54 14.33 7.82 3.27 2.74 3.58 2.21 3.09 5.35
Sro1369_g266940.1 (Contig3578.g27665)
18.42 2.61 3.13 2.18 2.3 3.86 9.85 6.6 5.68 16.76 11.38 23.46 15.66 14.15 11.44 16.04 8.41 7.92 10.72 20.48 13.09 10.21 6.48 14.14 18.91 13.43 9.66
Sro143_g066670.1 (Contig3754.g28773)
0.04 2.89 2.13 3.42 1.54 4.88 5.07 3.65 2.75 7.3 8.22 7.08 11.35 5.57 7.97 6.22 7.75 8.34 12.58 16.37 7.67 4.25 2.32 6.03 9.21 8.38 6.05
Sro1442_g273000.1 (Contig3575.g27633)
0.53 1.66 1.06 0.97 0.43 3.79 10.69 8.22 8.42 11.38 7.63 13.41 15.79 11.05 9.35 8.73 7.34 7.33 9.48 15.94 15.3 2.01 2.62 10.21 19.31 8.2 5.94
Sro1479_g276110.1 (Contig408.g5551)
11.98 7.74 9.3 8.34 8.05 29.44 36.41 24.99 18.69 59.96 70.42 86.12 65.62 55.43 43.45 41.06 48.21 33.96 46.0 85.07 70.94 17.91 19.53 53.77 97.62 52.18 45.58
Sro1485_g276570.1 (Contig4245.g32138)
10.48 4.37 6.27 5.22 4.99 10.09 22.23 19.82 9.61 28.19 21.42 35.52 46.52 23.94 22.43 20.73 18.33 15.76 15.59 45.52 34.89 11.85 8.26 23.99 31.89 23.29 15.07
Sro152_g069490.1 (Contig69.g709)
0.47 0.46 0.81 0.24 0.22 1.31 3.63 3.19 1.83 8.05 6.99 11.25 10.39 9.42 6.64 6.92 7.82 4.8 7.92 14.98 11.55 2.63 1.91 3.05 7.77 6.15 5.63
Sro15_g011130.1 (Contig791.g8839)
1.0 3.17 3.54 3.79 2.38 5.53 14.17 13.23 8.12 21.07 17.76 24.73 39.01 11.59 15.08 18.07 12.55 12.91 14.73 40.62 26.32 5.65 3.9 13.18 23.7 11.19 11.07
Sro170_g075480.1 (Contig2525.g20621)
0.05 0.54 0.38 0.2 0.05 0.53 2.0 2.23 1.03 3.24 2.88 3.57 3.58 0.93 2.93 2.74 1.32 1.02 2.35 6.61 4.81 0.35 0.17 3.22 6.17 1.94 1.79
Sro176_g077400.1 (Contig203.g2427)
0.23 0.65 0.54 0.66 0.53 0.97 3.57 1.23 0.58 4.25 4.35 5.23 3.39 4.83 4.18 4.59 1.7 2.63 3.13 4.52 6.11 1.31 0.89 4.29 6.43 5.06 2.61
Sro1792_g297810.1 (Contig126.g1426)
2.34 1.27 1.38 1.79 1.72 3.9 9.36 5.83 3.99 13.46 8.58 18.57 9.5 8.02 8.2 7.68 9.49 7.0 7.73 14.47 17.42 0.26 3.08 10.61 21.91 9.89 7.9
Sro1799_g298400.1 (Contig3588.g27731)
8.03 13.8 15.94 21.78 13.78 14.72 36.28 25.92 20.94 43.8 44.39 52.09 45.73 31.12 39.69 49.83 34.0 35.36 24.57 53.24 75.4 15.37 19.91 66.26 49.64 36.51 28.44
Sro182_g079490.1 (Contig1301.g12085)
1.99 3.06 3.98 1.89 2.52 4.13 9.25 11.09 8.41 22.44 18.6 28.69 22.84 14.02 18.44 25.92 17.01 15.29 20.75 43.75 31.26 6.98 6.52 12.35 26.02 15.74 16.48
Sro184_g079890.1 (Contig2216.g18392)
0.13 1.57 2.11 1.31 1.34 1.78 3.2 1.91 2.52 6.33 4.87 10.61 9.3 4.78 4.47 5.47 4.59 2.54 4.36 11.76 8.81 2.58 2.57 3.17 3.99 2.26 3.68
Sro1967_g308350.1 (Contig1335.g12302)
6.24 1.1 0.52 1.0 0.64 3.51 5.24 3.56 3.41 9.36 8.76 13.59 9.1 5.4 6.83 5.56 5.01 5.71 5.56 9.7 6.87 1.99 2.46 2.98 5.57 4.1 5.23
Sro2010_g310770.1 (Contig3241.g25605)
0.13 0.42 0.07 0.07 0.09 3.06 4.92 4.82 2.28 5.54 4.03 6.74 8.22 1.28 5.27 4.01 2.36 5.35 4.85 15.77 8.92 1.36 1.44 4.03 8.09 2.41 4.3
Sro215_g089090.1 (Contig4439.g33333)
1.48 13.16 12.61 8.15 7.84 5.07 13.59 12.28 9.82 16.79 11.44 20.74 21.26 10.16 11.78 12.11 9.35 5.68 7.56 25.12 23.46 7.1 4.72 10.0 16.49 7.15 7.84
Sro2174_g317720.1 (Contig2241.g18607)
0.16 0.44 0.22 0.2 0.15 1.28 9.02 5.09 3.18 7.91 6.43 7.68 13.12 5.77 7.63 8.92 4.45 4.33 4.34 13.63 12.29 2.24 1.79 7.37 11.94 5.18 4.04
Sro2263_g321240.1 (Contig1877.g16379)
0.19 0.25 0.1 0.16 0.16 0.89 3.84 1.09 0.87 3.55 3.09 3.26 3.76 0.83 2.57 3.96 1.64 2.58 2.52 7.89 5.89 0.42 0.74 4.31 7.83 3.84 3.32
Sro2416_g326900.1 (Contig3821.g29343)
0.19 0.67 0.3 0.45 0.39 1.27 1.09 0.78 1.1 2.98 2.85 2.73 4.8 0.91 2.45 2.58 2.7 3.17 4.1 8.57 4.11 0.58 1.01 0.82 1.66 0.56 2.08
Sro2672_g334330.1 (Contig3678.g28401)
1.06 0.61 0.42 2.52 1.2 1.3 3.13 1.37 0.39 5.69 4.32 5.32 7.02 2.72 5.95 7.58 2.24 5.67 7.61 13.33 7.71 0.67 0.38 8.22 9.46 3.82 3.87
Sro2717_g335380.1 (Contig3434.g26738)
0.19 0.25 0.25 0.16 0.05 2.04 1.77 0.87 0.69 4.02 5.94 3.97 4.82 1.42 4.08 4.22 3.56 2.04 3.4 7.19 5.82 0.07 0.64 1.72 0.86 1.58 2.84
Sro279_g106670.1 (Contig3140.g24906)
0.03 0.57 0.85 0.87 0.39 0.99 1.86 1.34 1.36 2.71 2.31 4.05 5.5 2.25 2.23 2.28 1.13 1.08 2.86 5.24 3.45 0.62 0.74 1.22 1.36 1.37 1.5
Sro298_g111090.1 (Contig4399.g33040)
28.68 10.3 12.47 14.97 9.74 15.69 26.5 23.38 24.69 39.07 43.68 46.31 49.57 24.27 35.99 44.53 28.58 32.53 33.57 55.21 35.04 11.17 14.52 24.3 19.57 16.77 30.56
Sro29_g019030.1 (Contig1384.g12746)
0.75 1.37 1.58 1.24 1.03 4.71 10.41 6.71 5.89 18.09 16.52 21.54 29.63 19.03 17.56 26.08 15.63 9.85 10.72 32.89 28.07 9.1 4.08 10.48 26.08 14.7 11.24
Sro3075_g343290.1 (Contig4712.g35047)
0.13 1.7 0.51 1.15 0.83 1.13 3.81 3.51 1.89 4.53 4.57 5.16 3.61 3.5 3.4 3.65 3.57 2.52 3.96 5.47 4.56 1.28 0.79 4.42 7.67 3.86 2.76
Sro337_g120620.1 (Contig2800.g22520)
0.14 0.66 0.46 0.46 0.6 1.49 2.7 2.28 2.03 6.08 5.48 9.69 9.11 7.92 5.31 9.67 4.98 3.32 7.33 7.75 7.26 2.34 1.01 3.94 4.44 3.39 5.48
Sro355_g124990.1 (Contig2977.g23657)
2.32 1.82 1.91 0.99 1.19 3.0 8.73 8.83 6.1 12.86 12.43 20.08 16.52 6.27 9.93 13.65 6.91 3.93 7.61 19.28 12.83 3.18 3.03 9.36 10.19 5.85 7.58
0.06 0.76 0.61 1.06 0.4 3.04 2.56 2.08 1.13 5.72 4.31 6.9 13.5 6.64 5.24 4.89 6.39 3.79 4.99 14.83 6.03 0.73 1.09 2.49 2.08 3.62 4.5
Sro3944_g352060.1 (Contig4212.g32044)
0.0 0.0 0.22 0.63 0.41 0.67 1.32 0.26 0.45 3.3 2.61 5.44 4.79 2.33 2.96 3.51 2.67 2.66 2.95 4.67 4.74 0.0 0.33 1.51 1.73 1.93 1.98
0.0 0.73 1.21 1.19 1.3 0.71 1.8 0.42 0.84 3.83 3.47 5.4 5.53 3.81 3.03 3.47 2.55 3.0 3.47 6.72 4.37 0.38 0.3 1.86 2.49 0.93 2.23
Sro4504_g354170.1 (Contig756.g8603)
0.29 0.42 0.5 0.09 0.27 2.85 2.72 2.34 2.57 5.8 6.14 10.0 4.71 3.38 3.51 3.44 4.08 3.28 5.05 10.71 8.83 1.32 2.21 1.71 4.23 3.44 4.48
Sro453_g146150.1 (Contig1693.g15172)
14.09 7.0 8.32 7.46 5.93 5.3 8.62 5.21 5.08 13.47 14.03 17.13 23.76 9.0 12.35 15.4 11.2 7.43 10.32 22.92 10.92 3.44 4.41 11.87 8.37 5.97 9.79
Sro482_g151780.1 (Contig232.g2788)
0.81 1.39 0.71 1.32 1.33 5.12 6.55 3.1 1.25 11.33 7.64 15.49 7.93 5.14 8.04 6.97 6.38 4.09 4.27 14.03 10.64 0.92 1.47 6.47 7.65 4.25 5.88
Sro522_g159650.1 (Contig3319.g26051)
3.77 1.32 1.02 2.0 1.7 2.91 5.0 2.95 1.94 6.72 9.41 7.56 6.25 4.19 7.19 9.0 6.23 6.09 5.93 10.08 8.73 2.2 1.58 8.67 10.69 4.57 5.46
Sro537_g162280.1 (Contig1194.g11280)
1.37 7.64 9.68 8.86 6.04 6.94 9.89 14.93 6.71 13.27 13.2 17.03 17.84 11.55 12.62 17.04 10.13 8.52 8.21 19.06 16.28 4.54 4.86 10.55 9.43 7.08 8.43
Sro575_g169440.1 (Contig1981.g16962)
0.33 4.24 4.54 5.38 4.31 5.23 5.5 4.2 5.86 12.16 13.38 16.75 16.75 10.21 10.93 15.15 10.95 9.97 13.62 15.86 19.36 5.17 4.0 6.53 7.64 9.44 11.01
Sro616_g176010.1 (Contig2621.g21293)
1.08 2.28 2.57 2.33 1.1 2.36 12.39 6.23 4.89 18.57 12.92 20.3 15.4 6.75 10.75 17.35 6.48 6.39 10.8 32.98 28.76 4.3 4.05 13.29 30.4 9.38 9.46
Sro641_g180070.1 (Contig1098.g10651)
1.93 3.21 3.39 4.99 4.12 3.32 5.98 6.93 4.67 11.81 16.51 19.21 9.14 5.05 9.87 7.8 10.6 3.21 5.26 10.34 13.57 4.42 4.87 10.32 14.4 9.09 9.6
Sro652_g181820.1 (Contig2024.g17335)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 1.38 0.47 0.17 2.69 1.22 2.59 1.6 0.92 1.78 3.1 0.41 0.36 0.53 2.89 4.36 0.06 0.11 1.39 2.55 1.21 0.92
Sro677_g185820.1 (Contig3197.g25278)
0.39 4.24 3.15 3.34 1.89 2.05 8.43 4.8 3.85 13.1 11.54 16.11 14.95 9.31 7.97 8.85 11.45 7.91 10.52 23.72 13.23 4.27 4.67 10.35 16.89 9.33 8.35
Sro716_g191910.1 (Contig2471.g20215)
0.43 3.38 1.79 1.78 1.94 0.95 5.46 6.25 4.21 5.68 3.2 7.87 4.73 2.47 3.08 5.44 3.38 6.68 5.27 5.96 10.06 5.02 4.07 2.39 2.57 2.98 2.96
Sro720_g192590.1 (Contig2421.g19820)
0.82 1.8 3.06 4.2 3.56 10.6 10.38 7.25 10.16 24.52 20.15 34.62 22.69 20.39 17.58 21.46 14.75 17.78 24.42 24.6 31.46 4.22 5.62 8.23 18.53 12.81 17.6
Sro73_g040390.1 (Contig3929.g30140)
4.6 44.89 54.93 63.64 52.9 33.56 59.4 55.3 60.07 87.56 84.85 113.14 156.89 87.59 67.75 70.88 64.27 53.96 70.33 144.22 97.46 33.76 42.94 41.34 66.78 46.98 64.55
Sro76_g041730.1 (Contig184.g2151)
10.29 18.53 18.89 18.84 18.52 26.53 51.19 50.48 48.47 68.85 54.7 86.41 73.94 53.62 54.88 78.51 45.5 46.26 59.55 98.22 100.78 37.71 43.2 50.03 86.99 54.92 50.8
Sro80_g043090.1 (Contig92.g1053)
1.67 5.79 5.9 3.53 4.25 14.5 29.12 18.17 14.01 35.16 37.65 39.67 34.53 17.76 30.99 32.29 28.67 29.91 35.41 65.66 39.62 21.7 12.01 33.58 49.32 32.28 22.54
Sro900_g217870.1 (Contig2813.g22565)
1.48 8.35 8.29 6.38 4.82 6.03 6.53 7.36 4.93 9.89 8.05 11.15 16.1 11.96 9.02 10.24 9.79 15.6 20.57 15.66 12.74 6.88 5.44 9.82 11.03 10.49 7.68
Sro903_g218210.1 (Contig3909.g29961)
0.42 0.28 0.59 0.27 0.12 2.54 0.53 0.06 0.06 2.74 1.27 3.63 2.04 1.8 1.85 1.86 1.15 1.26 1.77 2.64 3.05 0.02 0.04 1.56 2.65 2.4 1.64
Sro93_g048720.1 (Contig3841.g29560)
1.04 5.24 8.35 6.22 7.51 9.4 10.91 12.62 8.22 15.92 9.86 22.37 21.6 15.41 17.56 24.97 9.27 10.02 12.36 20.65 22.83 3.19 5.74 15.45 19.53 12.33 12.08
Sro978_g227120.1 (Contig212.g2518)
7.94 1.11 0.73 0.92 0.44 0.88 3.78 4.44 2.21 7.48 5.1 13.68 10.08 2.11 3.97 4.53 3.03 2.03 3.45 14.51 8.88 1.14 2.47 4.2 3.81 2.8 4.27
Sro978_g227170.1 (Contig212.g2523)
0.69 8.99 8.0 7.6 7.02 10.5 10.99 8.22 11.64 18.22 14.98 20.59 27.7 19.6 14.73 18.97 16.35 12.3 16.32 25.8 19.35 9.52 8.57 8.97 6.48 9.45 13.56
Sro9_g007090.1 (Contig4120.g31477)
2.04 0.59 0.74 0.77 0.59 4.66 3.91 1.7 3.31 6.38 5.98 7.8 6.43 3.65 5.63 8.71 5.88 3.33 5.91 12.05 7.61 0.45 1.41 3.7 4.3 3.56 5.17

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)