Heatmap: Cluster_280 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1042_g234700.1 (Contig734.g8418)
0.05 0.19 0.14 0.21 0.13 0.62 0.33 0.32 0.16 0.79 0.64 0.91 0.25 0.72 0.71 0.8 0.44 0.43 0.65 0.25 0.68 0.01 0.14 0.14 0.07 0.12 1.0
Sro1072_g238090.1 (Contig2124.g17939)
0.01 0.67 0.48 0.61 0.31 0.34 0.46 0.15 0.09 0.78 0.55 1.0 0.78 0.44 0.51 0.71 0.46 0.54 0.76 0.84 0.63 0.02 0.06 0.35 0.27 0.27 0.66
Sro1102_g241550.1 (Contig3075.g24532)
0.07 0.08 0.06 0.04 0.04 0.25 0.27 0.17 0.12 0.57 0.24 0.64 0.32 0.46 0.41 1.0 0.27 0.6 0.66 0.45 0.56 0.06 0.08 0.15 0.16 0.21 0.42
Sro117_g057300.1 (Contig3937.g30174)
0.03 0.49 0.18 0.28 0.27 0.06 0.19 0.17 0.14 0.65 0.95 0.79 0.88 1.0 0.34 0.16 0.61 0.22 0.21 0.51 0.52 0.24 0.09 0.36 0.12 0.19 0.59
Sro125_g060210.1 (Contig2833.g22732)
0.6 0.42 0.16 0.34 0.2 0.49 0.33 0.24 0.19 0.92 0.87 0.92 0.51 1.0 0.55 0.59 0.45 0.64 0.91 0.99 0.61 0.09 0.16 0.3 0.14 0.3 0.91
Sro126_g060620.1 (Contig82.g879)
0.84 0.32 0.23 0.31 0.24 0.17 0.32 0.17 0.08 0.89 0.94 0.83 0.63 1.0 0.52 0.37 0.7 0.32 0.64 0.86 0.96 0.05 0.06 0.72 0.86 0.42 0.74
Sro12_g009460.1 (Contig2293.g18966)
0.02 0.21 0.08 0.14 0.15 0.04 0.16 0.12 0.1 0.49 0.7 0.49 0.33 1.0 0.28 0.08 0.58 0.15 0.21 0.23 0.22 0.19 0.05 0.32 0.28 0.26 0.51
Sro1402_g269600.1 (Contig3746.g28714)
0.09 0.86 0.57 0.32 0.35 0.5 0.54 0.6 0.25 0.65 0.39 0.92 0.23 0.54 0.45 0.56 0.15 0.72 1.0 0.28 0.4 0.03 0.23 0.17 0.03 0.05 0.81
Sro1450_g273800.1 (Contig4095.g31284)
0.01 0.15 0.1 0.2 0.1 0.07 0.1 0.13 0.08 0.54 0.63 0.69 0.26 1.0 0.28 0.08 0.26 0.09 0.21 0.35 0.19 0.04 0.04 0.26 0.12 0.25 0.55
0.01 0.11 0.08 0.13 0.01 0.38 0.14 0.06 0.04 0.52 0.46 0.66 0.17 1.0 0.26 0.17 0.13 0.05 0.16 0.1 0.19 0.01 0.06 0.14 0.03 0.1 0.73
Sro1457_g274320.1 (Contig749.g8548)
0.01 0.09 0.09 0.12 0.09 0.11 0.14 0.12 0.14 0.5 0.51 0.58 0.38 0.53 0.43 1.0 0.43 0.37 0.61 0.56 0.65 0.12 0.12 0.16 0.22 0.22 0.38
Sro1474_g275730.1 (Contig1848.g16178)
0.02 0.3 0.27 0.36 0.28 0.43 0.22 0.14 0.07 0.71 0.44 0.91 0.59 0.6 0.5 1.0 0.34 0.56 0.95 0.72 0.63 0.07 0.06 0.17 0.05 0.11 0.56
Sro1608_g285660.1 (Contig1220.g11472)
0.05 0.97 0.54 0.51 0.29 0.8 0.33 0.25 0.12 0.93 0.53 0.81 0.36 0.74 0.62 1.0 0.39 0.52 0.62 0.51 0.49 0.03 0.11 0.22 0.07 0.16 0.98
Sro1672_g290150.1 (Contig1489.g13621)
0.02 0.08 0.05 0.08 0.02 0.02 0.36 0.09 0.07 0.61 0.51 0.58 0.22 0.93 0.3 0.29 0.39 0.26 0.71 0.43 0.37 0.03 0.05 0.5 0.2 0.22 1.0
Sro175_g076910.1 (Contig1856.g16207)
0.06 0.78 0.55 0.58 0.59 0.46 0.38 0.3 0.32 0.72 0.57 0.76 0.37 0.68 0.67 1.0 0.43 0.47 0.68 0.55 0.68 0.07 0.23 0.22 0.13 0.23 0.8
Sro1764_g296070.1 (Contig4076.g31243)
0.01 0.12 0.09 0.09 0.09 0.08 0.14 0.16 0.06 0.69 0.84 1.0 0.71 0.86 0.41 0.12 0.28 0.56 0.56 0.98 0.54 0.07 0.07 0.3 0.36 0.25 0.56
Sro1774_g296800.1 (Contig549.g7040)
0.0 1.0 0.44 0.43 0.39 0.34 0.25 0.34 0.26 0.75 0.5 0.74 0.59 0.58 0.44 0.32 0.27 0.31 0.61 0.69 0.76 0.15 0.18 0.29 0.17 0.24 0.71
Sro17_g012180.1 (Contig269.g3397)
0.01 0.5 0.48 0.32 0.21 0.51 0.48 0.22 0.17 0.74 0.37 1.0 0.68 0.65 0.39 0.5 0.31 0.72 0.75 0.66 0.58 0.1 0.17 0.37 0.43 0.27 0.62
Sro1819_g299670.1 (Contig1484.g13566)
0.01 0.63 0.39 0.46 0.4 0.51 0.42 0.31 0.25 0.83 0.59 0.82 0.9 0.65 0.63 1.0 0.44 0.33 0.53 0.7 0.9 0.11 0.18 0.21 0.2 0.16 0.79
Sro1944_g306910.1 (Contig4559.g34039)
0.04 0.15 0.08 0.22 0.08 0.27 0.15 0.13 0.22 0.84 0.97 0.95 0.67 0.91 0.36 0.19 0.37 0.37 0.83 1.0 0.3 0.11 0.1 0.37 0.1 0.16 0.95
Sro196_g083670.1 (Contig3206.g25363)
0.01 0.15 0.24 0.23 0.19 0.22 0.29 0.17 0.25 0.44 0.4 0.52 0.61 0.42 0.47 1.0 0.37 0.41 0.54 0.57 0.51 0.16 0.2 0.25 0.37 0.3 0.4
Sro19_g013260.1 (Contig446.g5990)
0.0 0.23 0.2 0.11 0.09 0.49 0.3 0.22 0.22 0.65 0.45 0.64 1.0 0.53 0.49 0.93 0.22 0.7 0.76 0.66 0.67 0.11 0.08 0.18 0.15 0.17 0.62
Sro2034_g311970.1 (Contig3527.g27257)
0.36 0.36 0.18 0.32 0.28 0.13 0.15 0.18 0.15 0.74 0.56 0.7 0.19 1.0 0.35 0.17 0.5 0.34 0.4 0.29 0.28 0.1 0.13 0.29 0.06 0.13 0.72
Sro2256_g321050.1 (Contig1739.g15496)
0.06 0.29 0.27 0.31 0.22 0.46 0.34 0.32 0.19 0.79 0.83 1.0 0.5 0.61 0.64 0.7 0.56 0.31 0.55 0.71 0.59 0.08 0.14 0.32 0.12 0.23 0.75
Sro2256_g321080.1 (Contig1739.g15499)
0.1 0.29 0.58 0.67 0.29 0.24 0.22 0.15 0.12 0.67 0.6 1.0 0.5 0.28 0.6 0.57 0.1 0.26 0.88 0.67 0.57 0.01 0.08 0.16 0.06 0.1 0.63
Sro2396_g325980.1 (Contig3316.g26023)
0.1 0.23 0.35 0.1 0.06 0.43 0.24 0.15 0.06 0.62 0.78 0.75 0.2 0.36 0.38 0.41 0.31 0.6 1.0 0.31 0.24 0.02 0.04 0.17 0.02 0.05 0.85
Sro276_g106120.1 (Contig2556.g20792)
0.02 1.0 0.84 0.33 0.41 0.63 0.47 0.45 0.18 0.76 0.51 0.81 0.3 0.45 0.61 0.83 0.3 0.56 0.67 0.74 0.59 0.06 0.16 0.25 0.39 0.23 0.88
0.0 0.05 0.18 0.04 0.01 0.48 0.23 0.15 0.04 0.68 0.3 0.79 0.35 0.57 0.31 0.26 0.22 0.55 1.0 0.59 0.3 0.01 0.05 0.09 0.14 0.07 0.75
Sro328_g118530.1 (Contig3574.g27608)
0.0 0.17 0.14 0.17 0.11 0.55 0.16 0.13 0.03 0.61 1.0 0.63 0.05 0.91 0.42 0.25 0.34 0.2 0.28 0.1 0.32 0.01 0.03 0.22 0.04 0.24 0.84
Sro329_g118840.1 (Contig2017.g17254)
0.06 0.69 0.35 0.41 0.23 0.57 0.48 0.35 0.19 0.75 0.43 1.0 0.23 0.47 0.44 0.38 0.25 0.79 0.97 0.34 0.31 0.03 0.17 0.21 0.06 0.04 0.71
Sro33_g021730.1 (Contig2613.g21194)
0.0 0.88 0.53 0.23 0.28 0.46 0.32 0.27 0.17 0.76 0.36 0.61 0.26 0.81 0.45 0.43 0.35 0.58 1.0 0.31 0.55 0.04 0.11 0.32 0.12 0.16 0.86
Sro353_g124380.1 (Contig1923.g16572)
0.07 0.22 0.22 0.18 0.11 0.31 0.28 0.19 0.22 0.49 0.42 0.5 0.5 0.46 0.46 1.0 0.38 0.37 0.45 0.74 0.58 0.14 0.18 0.13 0.13 0.22 0.39
Sro353_g124390.1 (Contig1923.g16573)
0.05 0.58 0.46 0.41 0.34 0.18 0.36 0.3 0.2 0.54 0.56 0.54 0.44 0.52 0.54 1.0 0.59 0.39 0.5 0.73 0.55 0.17 0.27 0.14 0.22 0.23 0.45
Sro368_g128020.1 (Contig2761.g22241)
0.06 0.34 0.27 0.35 0.2 0.17 0.24 0.08 0.04 0.65 0.43 0.53 0.58 1.0 0.32 0.13 0.62 0.15 0.3 0.46 0.31 0.02 0.02 0.45 0.33 0.29 0.76
Sro371_g128630.1 (Contig736.g8441)
0.03 0.22 0.15 0.12 0.11 0.42 0.27 0.24 0.15 0.62 1.0 0.81 0.27 0.73 0.49 0.4 0.39 0.35 0.59 0.33 0.37 0.07 0.12 0.22 0.07 0.18 0.7
Sro387_g132020.1 (Contig424.g5687)
0.02 0.64 0.24 0.49 0.52 0.67 0.36 0.25 0.09 0.78 0.73 0.78 0.35 0.56 0.69 0.91 0.44 0.5 0.67 0.44 0.58 0.04 0.08 0.14 0.08 0.18 1.0
Sro421_g139510.1 (Contig1157.g11064)
0.08 0.32 0.13 0.15 0.16 0.63 0.4 0.37 0.21 0.87 0.51 1.0 0.58 0.81 0.55 0.49 0.43 0.54 0.76 0.67 0.39 0.05 0.17 0.16 0.1 0.13 0.98
Sro42_g025800.1 (Contig312.g4157)
0.01 0.11 0.2 0.25 0.17 0.19 0.36 0.21 0.2 0.72 0.67 0.67 0.63 1.0 0.4 0.21 0.41 0.35 0.52 0.82 0.48 0.15 0.12 0.55 0.5 0.46 0.75
Sro448_g145130.1 (Contig3664.g28288)
0.05 0.26 0.16 0.18 0.13 0.4 0.33 0.23 0.11 0.92 0.74 1.0 0.89 0.89 0.37 0.24 0.5 0.51 0.85 0.74 0.48 0.07 0.11 0.37 0.07 0.21 0.86
Sro460_g147620.1 (Contig3843.g29587)
0.02 0.43 0.18 0.28 0.1 0.34 0.23 0.22 0.09 0.89 0.99 0.79 0.21 0.94 0.4 0.3 0.34 0.74 0.89 0.23 0.11 0.02 0.09 0.11 0.21 0.43 1.0
Sro478_g150920.1 (Contig272.g3490)
0.03 0.38 0.26 0.09 0.31 0.1 0.29 0.12 0.19 0.5 0.31 0.59 0.29 0.44 0.47 1.0 0.39 0.17 0.87 0.52 0.61 0.11 0.13 0.17 0.31 0.25 0.3
Sro489_g153220.1 (Contig402.g5431)
0.01 0.21 0.15 0.27 0.14 0.33 0.21 0.36 0.22 0.78 0.52 1.0 0.38 0.82 0.45 0.22 0.75 0.5 0.66 0.5 0.46 0.14 0.15 0.14 0.15 0.17 0.87
Sro528_g160830.1 (Contig1695.g15197)
0.04 0.81 0.73 0.57 0.44 0.61 0.39 0.32 0.24 0.86 0.66 0.98 0.66 1.0 0.53 0.44 0.36 0.47 0.66 0.63 0.61 0.2 0.19 0.38 0.17 0.24 0.95
Sro554_g165500.1 (Contig3803.g29149)
0.05 0.14 0.13 0.18 0.09 0.33 0.28 0.2 0.13 0.59 0.38 0.63 0.27 0.56 0.32 0.26 0.17 0.54 1.0 0.39 0.39 0.02 0.08 0.24 0.14 0.16 0.71
Sro576_g169570.1 (Contig2441.g20001)
0.06 0.13 0.1 0.09 0.05 0.24 0.3 0.16 0.07 0.57 0.41 0.57 0.27 0.4 0.42 1.0 0.17 0.31 0.59 0.37 0.68 0.02 0.05 0.14 0.17 0.12 0.48
Sro596_g172880.1 (Contig2605.g21092)
0.14 0.41 0.32 0.35 0.19 0.34 0.32 0.2 0.12 0.75 0.53 1.0 0.28 0.89 0.3 0.24 0.2 0.29 0.48 0.22 0.19 0.04 0.16 0.23 0.17 0.19 0.9
Sro611_g175270.1 (Contig1882.g16408)
0.04 0.72 0.34 0.42 0.25 0.55 0.36 0.27 0.16 0.83 0.52 0.99 0.42 1.0 0.54 0.59 0.31 0.51 0.77 0.58 0.44 0.08 0.15 0.28 0.09 0.23 0.85
Sro649_g181230.1 (Contig1362.g12549)
0.01 0.66 0.39 0.6 0.39 0.47 0.34 0.26 0.12 0.84 0.86 0.8 0.3 1.0 0.72 0.77 0.45 0.68 0.94 0.45 0.59 0.03 0.12 0.27 0.07 0.23 0.87
Sro725_g193290.1 (Contig3530.g27281)
0.04 0.51 0.62 0.27 0.21 0.35 0.44 0.34 0.12 0.61 0.18 0.76 0.26 0.44 0.36 0.43 0.08 0.78 1.0 0.27 0.53 0.01 0.14 0.17 0.02 0.06 0.54
Sro73_g040340.1 (Contig3929.g30135)
0.02 0.13 0.09 0.07 0.07 0.33 0.16 0.16 0.11 0.46 0.41 0.47 0.2 0.41 0.27 0.16 0.25 0.41 1.0 0.2 0.19 0.02 0.12 0.07 0.03 0.08 0.6
Sro757_g197990.1 (Contig322.g4288)
0.03 0.1 0.05 0.08 0.05 0.56 0.2 0.23 0.1 0.73 0.98 1.0 0.32 0.92 0.5 0.47 0.19 0.61 0.9 0.23 0.55 0.0 0.11 0.16 0.02 0.09 0.95
Sro75_g041390.1 (Contig2656.g21511)
0.63 0.2 0.08 0.12 0.1 0.05 0.14 0.1 0.12 0.61 0.76 0.67 0.67 0.9 0.3 0.13 0.4 0.24 0.35 1.0 0.5 0.07 0.11 0.28 0.08 0.17 0.59
Sro763_g198970.1 (Contig4662.g34701)
0.04 1.0 0.66 0.55 0.45 0.55 0.42 0.33 0.21 0.69 0.3 0.79 0.64 0.59 0.46 0.41 0.18 0.65 0.78 0.77 0.43 0.1 0.18 0.25 0.03 0.04 0.72
Sro787_g202350.1 (Contig4626.g34520)
0.24 0.32 0.41 0.43 0.3 0.24 0.23 0.13 0.14 0.78 0.94 1.0 0.67 0.8 0.5 0.43 0.66 0.35 0.58 0.82 0.59 0.07 0.07 0.34 0.26 0.28 0.72
Sro7_g006420.1 (Contig389.g5295)
0.03 0.57 0.45 0.4 0.37 0.51 0.37 0.32 0.22 0.78 0.75 0.8 0.36 0.93 0.75 1.0 0.5 0.46 0.64 0.39 0.63 0.08 0.16 0.19 0.05 0.19 0.95
Sro815_g206590.1 (Contig3639.g28107)
0.09 0.08 0.08 0.16 0.02 0.66 0.27 0.08 0.05 0.61 0.44 1.0 0.23 0.48 0.24 0.22 0.35 0.21 0.24 0.27 0.47 0.01 0.01 0.43 0.27 0.29 0.69
Sro957_g224580.1 (Contig192.g2255)
0.01 0.23 0.35 0.12 0.1 0.52 0.39 0.19 0.14 0.83 0.62 1.0 0.3 0.56 0.35 0.33 0.24 0.81 0.86 0.57 0.43 0.04 0.09 0.33 0.08 0.09 0.89
Sro99_g050750.1 (Contig1378.g12646)
0.01 0.09 0.06 0.07 0.04 0.23 0.19 0.05 0.02 0.56 0.53 0.59 0.64 0.58 0.26 0.13 0.23 0.47 0.52 1.0 0.28 0.05 0.05 0.17 0.17 0.33 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)