1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_280 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1042_g234700.1 (Contig734.g8418)
 0.15 0.56 0.43 0.62 0.38 1.86 0.99 0.97 0.48 2.37 1.92 2.73 0.76 2.16 2.12 2.4 1.32 1.28 1.96 0.74 2.04 0.03 0.42 0.43 0.21 0.37 3.0
Sro1072_g238090.1 (Contig2124.g17939)
 0.12 7.02 5.05 6.37 3.29 3.62 4.88 1.57 0.97 8.21 5.77 10.51 8.15 4.62 5.33 7.48 4.8 5.73 7.96 8.8 6.6 0.24 0.65 3.67 2.85 2.82 6.97
Sro1102_g241550.1 (Contig3075.g24532)
 1.74 2.11 1.53 1.09 1.01 6.37 7.07 4.42 3.0 14.71 6.17 16.6 8.16 11.97 10.47 25.79 6.93 15.37 17.12 11.53 14.48 1.42 1.96 3.81 4.1 5.37 10.72
Sro117_g057300.1 (Contig3937.g30174)
 0.35 4.9 1.8 2.79 2.75 0.63 1.9 1.73 1.37 6.55 9.61 7.91 8.83 10.06 3.4 1.65 6.16 2.22 2.14 5.14 5.21 2.44 0.94 3.64 1.18 1.89 5.9
Sro125_g060210.1 (Contig2833.g22732)
 12.35 8.71 3.31 7.01 4.17 10.12 6.89 4.91 3.89 18.98 17.96 19.09 10.67 20.73 11.32 12.32 9.23 13.34 18.77 20.47 12.65 1.91 3.25 6.17 2.99 6.3 18.78
Sro126_g060620.1 (Contig82.g879)
 4.0 1.5 1.08 1.48 1.16 0.83 1.51 0.81 0.38 4.21 4.48 3.94 3.0 4.74 2.49 1.75 3.32 1.51 3.05 4.09 4.58 0.22 0.29 3.43 4.09 2.01 3.49
Sro12_g009460.1 (Contig2293.g18966)
 0.29 2.54 0.92 1.74 1.79 0.49 1.89 1.47 1.27 5.92 8.48 5.95 3.96 12.16 3.38 0.98 7.04 1.77 2.56 2.79 2.62 2.3 0.6 3.87 3.35 3.14 6.14
Sro1402_g269600.1 (Contig3746.g28714)
 0.75 7.5 5.01 2.76 3.06 4.36 4.72 5.22 2.22 5.7 3.37 8.06 2.04 4.7 3.98 4.92 1.35 6.27 8.76 2.47 3.52 0.25 2.06 1.46 0.28 0.45 7.1
Sro1450_g273800.1 (Contig4095.g31284)
 0.03 0.84 0.55 1.13 0.57 0.41 0.58 0.78 0.45 3.12 3.62 3.96 1.53 5.78 1.6 0.45 1.52 0.54 1.2 2.0 1.11 0.24 0.24 1.52 0.71 1.44 3.2
0.06 0.48 0.36 0.57 0.04 1.7 0.63 0.25 0.17 2.32 2.07 2.94 0.74 4.49 1.16 0.77 0.6 0.22 0.72 0.45 0.86 0.05 0.29 0.62 0.14 0.44 3.29
Sro1457_g274320.1 (Contig749.g8548)
 0.41 5.55 5.29 7.77 5.84 6.83 8.6 7.27 8.54 30.95 31.73 36.25 23.87 33.26 27.04 62.26 26.71 22.73 38.27 34.82 40.33 7.69 7.78 9.82 13.8 13.49 23.94
Sro1474_g275730.1 (Contig1848.g16178)
 0.35 5.27 4.67 6.26 4.94 7.63 3.84 2.48 1.28 12.42 7.67 15.99 10.4 10.51 8.8 17.59 5.94 9.82 16.74 12.75 11.08 1.28 1.12 3.03 0.91 1.97 9.82
Sro1608_g285660.1 (Contig1220.g11472)
 0.96 18.45 10.36 9.73 5.46 15.15 6.22 4.81 2.24 17.66 10.14 15.35 6.91 13.99 11.82 19.04 7.46 9.87 11.88 9.7 9.25 0.52 2.07 4.1 1.35 3.08 18.63
Sro1672_g290150.1 (Contig1489.g13621)
 0.07 0.26 0.18 0.28 0.08 0.08 1.22 0.31 0.24 2.1 1.74 2.0 0.74 3.21 1.04 0.99 1.36 0.91 2.45 1.48 1.28 0.09 0.18 1.73 0.7 0.75 3.44
Sro175_g076910.1 (Contig1856.g16207)
 1.44 17.53 12.42 13.12 13.3 10.35 8.65 6.81 7.14 16.29 12.73 17.11 8.36 15.38 15.08 22.5 9.74 10.58 15.31 12.32 15.37 1.63 5.07 5.02 2.97 5.13 17.93
Sro1764_g296070.1 (Contig4076.g31243)
 0.03 0.51 0.38 0.37 0.4 0.35 0.61 0.67 0.26 2.97 3.61 4.28 3.03 3.67 1.75 0.52 1.18 2.39 2.39 4.21 2.32 0.3 0.32 1.29 1.55 1.06 2.41
Sro1774_g296800.1 (Contig549.g7040)
 0.02 5.08 2.26 2.2 1.97 1.71 1.3 1.73 1.34 3.8 2.57 3.75 3.01 2.96 2.21 1.61 1.4 1.57 3.08 3.49 3.85 0.76 0.92 1.47 0.88 1.2 3.63
Sro17_g012180.1 (Contig269.g3397)
 0.3 16.27 15.66 10.32 6.74 16.64 15.85 7.16 5.71 24.27 12.02 32.74 22.15 21.25 12.88 16.53 10.19 23.61 24.44 21.49 18.98 3.41 5.7 12.15 14.03 9.0 20.44
Sro1819_g299670.1 (Contig1484.g13566)
 0.46 21.71 13.59 15.91 13.75 17.41 14.48 10.69 8.47 28.52 20.42 28.3 31.06 22.48 21.67 34.46 15.25 11.4 18.42 24.19 30.94 3.8 6.32 7.12 7.02 5.52 27.24
Sro1944_g306910.1 (Contig4559.g34039)
 0.1 0.4 0.2 0.58 0.2 0.72 0.39 0.34 0.59 2.2 2.56 2.49 1.76 2.39 0.94 0.51 0.98 0.97 2.18 2.63 0.78 0.3 0.26 0.97 0.28 0.42 2.51
Sro196_g083670.1 (Contig3206.g25363)
 0.4 10.4 16.3 15.41 12.98 15.06 19.27 11.57 16.64 29.47 26.83 34.59 41.21 28.49 31.57 67.13 25.1 27.63 36.01 38.0 34.45 10.64 13.51 16.95 24.79 20.32 26.69
Sro19_g013260.1 (Contig446.g5990)
 0.17 12.15 10.59 5.52 4.46 25.52 15.89 11.57 11.64 33.83 23.7 33.38 52.24 27.5 25.57 48.69 11.75 36.37 39.67 34.68 35.14 5.51 4.44 9.55 7.9 8.83 32.42
Sro2034_g311970.1 (Contig3527.g27257)
 3.67 3.69 1.87 3.29 2.92 1.36 1.5 1.87 1.51 7.58 5.72 7.18 1.96 10.26 3.63 1.75 5.14 3.46 4.11 3.0 2.89 0.98 1.35 2.99 0.59 1.31 7.34
Sro2256_g321050.1 (Contig1739.g15496)
 1.42 7.24 6.82 7.65 5.53 11.46 8.39 7.93 4.79 19.72 20.7 24.88 12.48 15.27 15.89 17.43 13.89 7.76 13.6 17.58 14.66 2.09 3.47 7.97 3.04 5.81 18.73
Sro2256_g321080.1 (Contig1739.g15499)
 0.71 2.08 4.24 4.89 2.09 1.72 1.62 1.12 0.88 4.9 4.37 7.27 3.64 2.05 4.35 4.12 0.73 1.92 6.4 4.87 4.11 0.06 0.57 1.18 0.44 0.72 4.57
Sro2396_g325980.1 (Contig3316.g26023)
 0.37 0.89 1.33 0.4 0.22 1.64 0.9 0.57 0.21 2.36 2.97 2.87 0.76 1.36 1.46 1.56 1.2 2.3 3.83 1.19 0.93 0.08 0.16 0.66 0.06 0.2 3.24
Sro276_g106120.1 (Contig2556.g20792)
 0.36 15.54 13.13 5.14 6.35 9.79 7.24 6.92 2.73 11.75 8.0 12.59 4.69 7.0 9.48 12.98 4.74 8.7 10.37 11.44 9.1 0.88 2.54 3.91 6.06 3.59 13.62
0.07 0.78 2.69 0.65 0.11 7.25 3.53 2.24 0.58 10.34 4.61 12.05 5.36 8.7 4.8 3.93 3.33 8.38 15.24 8.91 4.65 0.14 0.79 1.43 2.2 1.03 11.39
Sro328_g118530.1 (Contig3574.g27608)
 0.08 6.43 5.18 6.21 3.95 20.47 5.73 4.75 1.05 22.46 36.9 23.12 1.73 33.59 15.32 9.29 12.63 7.2 10.28 3.76 11.83 0.27 1.25 8.19 1.63 9.01 30.81
Sro329_g118840.1 (Contig2017.g17254)
 0.41 4.68 2.38 2.79 1.58 3.87 3.22 2.38 1.31 5.08 2.9 6.77 1.53 3.17 2.99 2.55 1.72 5.34 6.55 2.32 2.07 0.2 1.16 1.42 0.4 0.3 4.79
Sro33_g021730.1 (Contig2613.g21194)
 0.02 3.29 2.0 0.87 1.04 1.73 1.21 1.01 0.63 2.86 1.36 2.27 0.97 3.03 1.68 1.6 1.31 2.18 3.75 1.15 2.08 0.16 0.42 1.18 0.45 0.6 3.21
Sro353_g124380.1 (Contig1923.g16572)
 2.18 6.65 6.45 5.22 3.22 9.09 8.26 5.66 6.38 14.37 12.48 14.86 14.82 13.47 13.69 29.57 11.27 10.84 13.17 21.78 17.23 4.07 5.38 3.9 3.76 6.45 11.46
Sro353_g124390.1 (Contig1923.g16573)
 1.34 15.99 12.79 11.4 9.57 5.12 9.91 8.26 5.7 14.98 15.44 15.11 12.21 14.47 15.08 27.8 16.3 10.86 13.78 20.27 15.17 4.79 7.63 3.95 5.99 6.5 12.58
Sro368_g128020.1 (Contig2761.g22241)
 1.13 5.98 4.75 6.15 3.52 2.92 4.16 1.4 0.78 11.36 7.43 9.25 10.21 17.48 5.59 2.2 10.79 2.68 5.2 8.1 5.4 0.41 0.36 7.86 5.86 4.99 13.34
Sro371_g128630.1 (Contig736.g8441)
 0.38 2.98 2.04 1.64 1.49 5.74 3.78 3.34 2.08 8.6 13.78 11.16 3.71 10.05 6.78 5.57 5.37 4.85 8.11 4.57 5.1 1.03 1.72 3.06 0.96 2.46 9.66
Sro387_g132020.1 (Contig424.g5687)
 0.48 17.86 6.83 13.77 14.67 18.69 10.13 7.1 2.48 21.76 20.59 22.0 9.93 15.76 19.36 25.44 12.35 14.15 18.79 12.29 16.27 1.0 2.32 3.86 2.14 5.05 28.07
Sro421_g139510.1 (Contig1157.g11064)
 1.07 4.16 1.7 1.94 2.01 8.1 5.19 4.73 2.67 11.2 6.55 12.86 7.45 10.46 7.06 6.25 5.48 7.01 9.83 8.62 4.98 0.68 2.18 2.03 1.27 1.63 12.62
Sro42_g025800.1 (Contig312.g4157)
 0.11 1.05 1.87 2.3 1.57 1.73 3.37 1.95 1.89 6.62 6.16 6.2 5.78 9.24 3.7 1.92 3.83 3.27 4.77 7.56 4.44 1.39 1.09 5.11 4.59 4.27 6.98
Sro448_g145130.1 (Contig3664.g28288)
 0.18 0.86 0.53 0.6 0.43 1.3 1.08 0.76 0.36 2.98 2.41 3.26 2.9 2.9 1.21 0.79 1.63 1.67 2.77 2.4 1.58 0.22 0.34 1.2 0.24 0.7 2.78
Sro460_g147620.1 (Contig3843.g29587)
 0.12 2.64 1.09 1.72 0.59 2.1 1.41 1.37 0.59 5.53 6.14 4.92 1.3 5.87 2.46 1.86 2.13 4.63 5.52 1.46 0.71 0.13 0.54 0.66 1.28 2.66 6.22
Sro478_g150920.1 (Contig272.g3490)
 0.36 4.69 3.14 1.13 3.77 1.24 3.6 1.48 2.37 6.1 3.76 7.23 3.56 5.4 5.77 12.32 4.77 2.09 10.76 6.38 7.5 1.35 1.65 2.05 3.83 3.09 3.74
Sro489_g153220.1 (Contig402.g5431)
 0.08 1.22 0.85 1.6 0.82 1.94 1.2 2.07 1.26 4.56 3.05 5.83 2.22 4.8 2.64 1.29 4.39 2.92 3.83 2.92 2.68 0.82 0.88 0.81 0.86 0.99 5.08
Sro528_g160830.1 (Contig1695.g15197)
 0.86 19.76 17.81 13.93 10.61 14.85 9.48 7.75 5.83 20.94 15.99 23.8 16.17 24.35 12.9 10.73 8.84 11.49 16.1 15.45 14.89 4.95 4.58 9.22 4.03 5.85 23.11
Sro554_g165500.1 (Contig3803.g29149)
 0.97 2.83 2.72 3.81 1.94 6.88 5.75 4.1 2.77 12.41 8.01 13.05 5.67 11.59 6.57 5.48 3.64 11.3 20.85 8.17 8.06 0.38 1.57 4.97 3.0 3.38 14.78
Sro576_g169570.1 (Contig2441.g20001)
 0.63 1.44 1.03 0.98 0.49 2.54 3.26 1.75 0.71 6.06 4.35 6.08 2.85 4.26 4.47 10.72 1.82 3.28 6.27 3.95 7.25 0.2 0.58 1.48 1.82 1.28 5.1
Sro596_g172880.1 (Contig2605.g21092)
 0.51 1.54 1.22 1.31 0.72 1.28 1.22 0.74 0.45 2.84 2.0 3.77 1.05 3.37 1.14 0.92 0.77 1.09 1.81 0.84 0.7 0.15 0.61 0.85 0.63 0.7 3.41
Sro611_g175270.1 (Contig1882.g16408)
 0.55 9.49 4.42 5.53 3.31 7.25 4.81 3.51 2.06 10.89 6.84 13.0 5.52 13.2 7.11 7.84 4.13 6.68 10.1 7.71 5.81 1.1 2.04 3.75 1.13 2.99 11.2
Sro649_g181230.1 (Contig1362.g12549)
 0.24 13.62 8.14 12.44 8.07 9.65 7.01 5.37 2.45 17.38 17.68 16.56 6.14 20.64 14.9 15.95 9.29 13.94 19.37 9.32 12.15 0.66 2.44 5.54 1.38 4.78 18.01
Sro725_g193290.1 (Contig3530.g27281)
 0.33 3.94 4.73 2.05 1.62 2.69 3.36 2.63 0.96 4.69 1.41 5.85 1.99 3.39 2.8 3.29 0.58 5.96 7.69 2.1 4.06 0.06 1.06 1.28 0.18 0.45 4.16
Sro73_g040340.1 (Contig3929.g30135)
 0.48 3.3 2.33 1.84 1.62 8.31 4.08 4.1 2.7 11.4 10.23 11.64 4.88 10.22 6.68 4.09 6.28 10.13 24.97 4.98 4.79 0.57 2.99 1.68 0.77 1.98 15.08
Sro757_g197990.1 (Contig322.g4288)
 0.24 0.78 0.37 0.57 0.37 4.21 1.51 1.76 0.78 5.51 7.38 7.51 2.4 6.95 3.77 3.53 1.44 4.56 6.76 1.73 4.14 0.01 0.83 1.2 0.12 0.7 7.13
Sro75_g041390.1 (Contig2656.g21511)
 15.95 5.13 2.1 3.14 2.45 1.25 3.53 2.63 2.95 15.39 19.22 16.85 16.94 22.62 7.48 3.28 10.01 6.05 8.95 25.24 12.62 1.86 2.68 7.05 2.02 4.35 14.89
Sro763_g198970.1 (Contig4662.g34701)
 1.87 47.02 31.23 25.8 21.38 25.72 19.72 15.31 9.7 32.27 14.23 37.2 30.24 27.85 21.77 19.16 8.33 30.56 36.51 36.38 20.42 4.56 8.28 11.98 1.58 2.06 33.84
Sro787_g202350.1 (Contig4626.g34520)
 4.49 6.14 7.74 8.24 5.73 4.64 4.4 2.4 2.76 14.91 17.95 19.12 12.77 15.31 9.48 8.14 12.6 6.63 11.03 15.62 11.33 1.28 1.37 6.53 5.04 5.29 13.84
Sro7_g006420.1 (Contig389.g5295)
 0.69 15.66 12.47 11.02 10.04 14.05 10.14 8.73 5.96 21.48 20.61 21.91 9.82 25.4 20.71 27.44 13.83 12.69 17.5 10.73 17.3 2.11 4.32 5.26 1.48 5.35 25.98
Sro815_g206590.1 (Contig3639.g28107)
 0.32 0.26 0.25 0.55 0.06 2.23 0.9 0.28 0.17 2.06 1.48 3.36 0.76 1.6 0.81 0.74 1.17 0.69 0.8 0.91 1.58 0.04 0.04 1.46 0.89 0.99 2.32
Sro957_g224580.1 (Contig192.g2255)
 0.14 3.33 4.97 1.78 1.42 7.4 5.6 2.73 2.0 11.88 8.88 14.34 4.29 8.07 4.99 4.8 3.51 11.64 12.39 8.19 6.18 0.57 1.26 4.78 1.13 1.24 12.79
Sro99_g050750.1 (Contig1378.g12646)
 0.03 0.31 0.22 0.24 0.14 0.8 0.64 0.18 0.07 1.93 1.82 2.02 2.19 1.98 0.88 0.46 0.79 1.63 1.8 3.44 0.97 0.17 0.16 0.58 0.57 1.14 1.73

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)