Heatmap: Cluster_229 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1032_g233560.1 (Contig2177.g18184)	0.01	0.19	0.18	0.11	0.07	0.1	0.63	0.21	0.14	0.57	0.46	0.69	0.92	0.34	0.72	0.69	0.32	1.0	0.87	0.84	0.8	0.06	0.09	0.51	0.64	0.6	0.45
Sro1036_g234020.1 (Contig614.g7568)	0.01	0.16	0.1	0.1	0.11	0.15	0.27	0.17	0.1	0.51	0.53	0.69	0.43	0.51	0.42	0.38	0.44	0.5	1.0	0.96	0.6	0.19	0.07	0.37	0.25	0.33	0.31
Sro1051_g235700.1 (Contig3964.g30407)	0.04	0.1	0.1	0.06	0.08	0.18	0.38	0.33	0.28	0.63	0.69	0.71	0.43	0.76	0.66	0.81	0.51	0.77	0.7	0.77	1.0	0.53	0.26	0.29	0.19	0.48	0.54
Sro1087_g239810.1 (Contig998.g10088)	0.08	0.9	0.5	0.41	0.41	0.26	0.82	0.44	0.45	0.67	1.0	0.86	0.78	0.34	0.69	0.74	0.75	0.89	0.61	0.97	0.69	0.08	0.43	0.6	0.3	0.22	0.61
Sro1093_g240400.1 (Contig384.g5166)	0.09	0.3	0.36	0.34	0.35	0.29	0.5	0.51	0.43	0.63	0.79	0.78	0.79	0.71	0.65	0.68	0.59	0.57	0.7	1.0	0.66	0.26	0.32	0.41	0.16	0.22	0.63
Sro1189_g250680.3	0.07	0.16	0.08	0.06	0.11	0.25	0.49	0.33	0.3	0.73	0.75	0.91	0.52	0.79	0.64	0.76	0.56	0.76	0.82	1.0	0.8	0.34	0.3	0.37	0.17	0.41	0.69
Sro1189_g250690.1 (Contig972.g9926)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.17	0.18	0.13	0.69	0.85	0.92	0.52	0.84	0.48	0.36	0.13	0.43	0.94	1.0	0.85	0.12	0.1	0.21	0.04	0.4	0.56
Sro1409_g270180.1 (Contig1095.g10599)	0.0	0.08	0.13	0.12	0.06	0.35	0.21	0.36	0.23	0.45	0.53	0.43	1.0	0.52	0.52	0.72	0.35	0.56	0.92	0.94	0.6	0.3	0.18	0.24	0.3	0.39	0.39
Sro1496_g277520.1 (Contig2419.g19802)	0.47	0.16	0.23	0.13	0.09	0.17	0.37	0.33	0.28	0.59	0.6	0.71	0.65	0.58	0.57	0.54	0.36	0.71	0.63	1.0	0.66	0.25	0.27	0.37	0.19	0.28	0.57
Sro1572_g283400.1 (Contig2634.g21352)	0.05	0.32	0.19	0.12	0.14	0.28	0.55	0.46	0.4	0.58	0.67	0.69	0.89	0.41	0.59	0.68	0.51	0.83	0.64	1.0	0.61	0.15	0.29	0.19	0.19	0.25	0.51
Sro15_g011210.1 (Contig791.g8847)	0.01	0.32	0.22	0.27	0.19	0.21	0.67	0.51	0.38	0.64	1.0	0.88	0.74	0.47	0.71	0.58	0.58	0.8	0.77	0.96	0.85	0.22	0.32	0.61	0.4	0.32	0.66
Sro172_g076030.1 (Contig1453.g13312)	0.0	0.14	0.09	0.06	0.04	0.33	0.35	0.24	0.15	0.64	0.82	0.82	0.49	0.45	0.54	0.62	0.49	0.79	1.0	0.86	0.86	0.38	0.15	0.26	0.31	0.33	0.52
Sro172_g076080.1 (Contig1453.g13317)	0.0	0.1	0.05	0.05	0.05	0.19	0.39	0.28	0.24	0.41	0.5	0.38	0.67	0.61	0.46	0.45	0.34	0.6	0.58	1.0	0.48	0.39	0.23	0.2	0.12	0.17	0.38
Sro1730_g294110.1 (Contig2449.g20048)	0.1	0.65	0.43	0.3	0.4	0.31	0.85	0.57	0.61	0.75	0.91	0.8	0.76	0.73	0.82	0.81	0.76	0.95	0.89	1.0	0.76	0.32	0.63	0.6	0.27	0.28	0.7
Sro1732_g294170.1 (Contig1542.g14001)	0.07	0.08	0.05	0.04	0.05	0.28	0.44	0.33	0.35	0.67	0.53	0.84	0.75	0.92	0.48	0.6	0.51	0.6	1.0	0.87	0.9	0.46	0.4	0.53	0.41	0.43	0.53
Sro1794_g297960.1 (Contig4702.g34974)	0.05	0.2	0.08	0.14	0.09	0.22	0.59	0.6	0.4	0.57	0.81	0.71	0.66	0.41	0.62	0.62	0.51	0.77	0.63	1.0	0.78	0.24	0.28	0.57	0.46	0.35	0.52
Sro181_g078970.1 (Contig4257.g32224)	0.03	0.3	0.19	0.14	0.14	0.16	0.39	0.15	0.21	0.55	0.55	0.55	0.63	0.34	0.59	1.0	0.62	0.66	0.67	0.84	0.85	0.24	0.13	0.33	0.45	0.34	0.51
Sro182_g079310.1 (Contig1301.g12067)	0.07	0.23	0.1	0.07	0.08	0.33	0.84	0.69	0.56	0.74	0.86	0.76	0.62	0.66	0.8	0.77	0.67	1.0	0.77	0.88	0.97	0.36	0.58	0.57	0.32	0.32	0.74
Sro18_g012750.1 (Contig1351.g12435)	0.11	0.35	0.18	0.12	0.17	0.29	0.77	0.69	0.49	0.72	0.79	0.88	0.78	0.57	0.67	0.69	0.54	0.91	0.86	0.98	1.0	0.49	0.46	0.58	0.49	0.37	0.64
Sro203_g085540.1 (Contig1270.g11848)	0.21	0.4	0.31	0.15	0.15	0.25	0.75	0.78	0.65	0.57	1.0	0.48	0.46	0.49	0.79	0.73	0.69	0.7	0.67	0.72	0.7	0.4	0.66	0.76	0.32	0.34	0.72
Sro2137_g316000.1 (Contig702.g8139)	0.02	0.07	0.04	0.03	0.06	0.21	0.22	0.14	0.13	0.48	0.67	0.63	1.0	0.41	0.46	0.52	0.64	0.53	0.74	0.79	0.49	0.16	0.14	0.39	0.15	0.32	0.5
Sro250_g099050.1 (Contig1989.g17021)	0.06	0.46	0.3	0.2	0.23	0.27	0.72	0.73	0.59	0.78	0.93	0.87	0.55	0.57	0.78	0.72	0.57	1.0	0.98	0.98	0.97	0.24	0.54	0.72	0.28	0.31	0.81
Sro259_g101450.1 (Contig240.g2935)	0.1	0.15	0.11	0.09	0.1	0.14	0.3	0.42	0.35	0.51	0.43	0.58	0.79	0.33	0.4	0.42	0.3	0.61	0.84	1.0	0.58	0.44	0.23	0.26	0.12	0.16	0.34
Sro300_g111580.1 (Contig270.g3446)	0.05	0.27	0.07	0.16	0.0	0.06	0.63	0.18	0.24	0.51	0.72	0.45	0.5	0.16	0.64	0.88	0.76	0.93	0.41	1.0	0.78	0.08	0.05	0.6	0.59	0.5	0.44
Sro317_g115730.1 (Contig519.g6844)	0.07	0.36	0.19	0.18	0.22	0.27	0.64	0.59	0.41	0.7	0.94	0.69	0.69	0.83	0.79	0.75	0.53	0.91	0.97	1.0	0.67	0.43	0.38	0.58	0.14	0.27	0.74
Sro326_g118230.1 (Contig1080.g10511)	0.04	0.22	0.06	0.07	0.08	0.36	0.69	0.36	0.4	0.65	0.79	0.68	0.91	0.9	0.6	0.69	0.61	0.73	0.67	1.0	0.82	0.36	0.31	0.41	0.3	0.36	0.66
Sro330_g119010.1 (Contig55.g417)	0.01	0.3	0.23	0.31	0.21	0.19	0.49	0.36	0.38	0.66	0.74	0.92	0.54	0.34	0.5	0.54	0.46	0.6	0.89	0.95	1.0	0.4	0.32	0.43	0.2	0.29	0.56
Sro365_g127480.1 (Contig3612.g27922)	0.42	0.13	0.14	0.12	0.08	0.2	0.24	0.17	0.18	0.46	0.55	0.53	1.0	0.61	0.44	0.53	0.38	0.46	0.79	0.88	0.54	0.4	0.22	0.32	0.16	0.37	0.41
Sro3788_g351050.1 (Contig2801.g22533)	0.06	0.13	0.28	0.19	0.12	0.48	0.15	0.48	0.08	0.59	0.71	0.79	0.67	0.37	0.47	0.54	0.44	1.0	0.91	0.87	0.92	0.11	0.1	0.33	0.27	0.28	0.62
Sro3793_g351090.1 (Contig2378.g19546)	0.01	0.29	0.33	0.33	0.24	0.34	0.39	0.51	0.64	0.58	0.56	0.67	0.48	0.4	0.47	0.57	0.54	0.78	1.0	0.84	0.68	0.43	0.27	0.61	0.44	0.48	0.38
Sro385_g131610.1 (Contig3292.g25843)	0.0	0.16	0.13	0.11	0.1	0.3	0.27	0.6	0.15	0.57	0.56	0.43	0.38	0.25	0.54	0.69	0.61	0.59	1.0	0.99	0.81	0.34	0.19	0.27	0.38	0.34	0.61
Sro388_g132440.1 (Contig4393.g33018)	0.01	0.19	0.1	0.08	0.08	0.2	0.66	0.39	0.4	0.56	0.68	0.64	0.74	0.58	0.59	0.59	0.42	0.62	0.53	1.0	0.68	0.31	0.29	0.49	0.31	0.27	0.45
Sro417_g138720.1 (Contig2416.g19780)	0.01	0.37	0.11	0.15	0.12	0.17	0.48	0.36	0.33	0.49	1.0	0.48	0.37	0.64	0.57	0.48	0.41	0.48	0.55	0.63	0.48	0.26	0.24	0.44	0.18	0.19	0.58
Sro419_g139070.1 (Contig4415.g33168)	0.02	0.06	0.06	0.03	0.02	0.07	0.5	0.25	0.17	0.47	0.32	0.69	0.52	0.24	0.63	0.86	0.22	0.68	0.78	0.95	0.68	0.05	0.06	0.55	1.0	0.45	0.36
Sro419_g139080.1 (Contig4415.g33169)	0.03	0.09	0.08	0.04	0.03	0.26	0.59	0.38	0.18	0.58	0.58	0.58	0.65	0.34	0.77	0.81	0.38	0.85	0.69	1.0	0.96	0.11	0.05	0.66	0.8	0.67	0.56
Sro489_g153310.1 (Contig402.g5440)	0.03	0.19	0.12	0.06	0.07	0.21	0.74	0.52	0.43	0.74	0.51	1.0	0.33	0.56	0.65	0.74	0.37	0.89	0.85	0.44	0.91	0.71	0.49	0.41	0.32	0.37	0.58
Sro4_g003060.1 (Contig3815.g29224)	0.39	0.1	0.07	0.07	0.07	0.23	0.52	0.34	0.41	0.59	0.76	0.52	0.82	0.79	0.61	0.6	0.49	0.69	0.72	1.0	0.69	0.38	0.29	0.4	0.39	0.34	0.51
Sro518_g158790.1 (Contig3565.g27534)	0.12	0.21	0.11	0.08	0.09	0.31	0.88	0.64	0.56	0.74	0.87	0.82	0.68	0.65	0.81	0.99	0.56	0.95	0.9	1.0	0.83	0.47	0.48	0.57	0.38	0.42	0.73
Sro528_g160790.1 (Contig1695.g15193)	0.03	0.35	0.21	0.11	0.11	0.19	0.85	0.66	0.52	0.7	0.85	0.85	0.7	0.65	0.71	0.83	0.5	1.0	0.85	0.99	0.87	0.21	0.4	0.65	0.37	0.31	0.56
Sro576_g169510.1 (Contig2441.g19995)	0.02	0.23	0.12	0.09	0.12	0.31	0.73	0.71	0.45	0.71	0.82	0.91	0.69	0.73	0.74	0.74	0.55	0.94	0.83	1.0	0.96	0.31	0.37	0.48	0.25	0.27	0.66
Sro58_g033560.1 (Contig64.g550)	0.12	0.21	0.17	0.11	0.11	0.32	0.48	0.39	0.48	0.58	0.69	0.79	1.0	0.39	0.51	0.5	0.41	0.4	0.5	0.97	0.68	0.45	0.4	0.55	0.24	0.22	0.5
Sro595_g172700.1 (Contig4483.g33688)	0.36	0.05	0.1	0.07	0.08	0.33	0.2	0.3	0.21	0.48	0.66	0.65	1.0	0.49	0.52	0.49	0.5	0.51	0.71	0.86	0.54	0.18	0.19	0.26	0.16	0.27	0.49
Sro60_g034870.2	0.02	0.2	0.18	0.18	0.14	0.23	0.33	0.38	0.43	0.6	0.86	1.0	0.96	0.71	0.53	0.37	0.53	0.55	0.78	0.88	0.72	0.25	0.27	0.33	0.17	0.33	0.6
Sro61_g035140.1 (Contig3112.g24767)	0.06	0.25	0.11	0.09	0.14	0.25	0.67	0.44	0.45	0.73	0.68	0.89	0.65	0.45	0.74	1.0	0.49	0.8	0.88	0.95	0.91	0.71	0.45	0.54	0.21	0.39	0.73
Sro648_g181030.1 (Contig423.g5674)	0.13	0.13	0.09	0.05	0.04	0.17	0.81	0.76	0.58	0.73	0.67	0.93	0.48	0.38	0.53	0.48	0.44	0.52	0.65	1.0	0.89	0.81	0.52	0.49	0.18	0.22	0.52
Sro648_g181040.1 (Contig423.g5675)	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.14	0.34	0.26	0.18	0.56	0.48	0.66	0.59	0.57	0.47	1.0	0.41	0.68	0.8	0.88	0.74	0.56	0.2	0.29	0.27	0.36	0.48
Sro700_g189630.1 (Contig1498.g13680)	0.5	0.1	0.09	0.03	0.05	0.11	0.44	0.46	0.29	0.75	0.55	0.93	0.3	0.42	0.63	0.7	0.46	0.44	0.76	0.48	1.0	0.63	0.26	0.36	0.44	0.38	0.48
Sro757_g197940.1 (Contig322.g4283)	0.01	0.07	0.04	0.02	0.04	0.08	0.33	0.17	0.21	0.38	0.23	0.37	0.57	0.52	0.27	0.29	0.18	0.44	0.47	1.0	0.51	0.34	0.23	0.13	0.1	0.18	0.28
Sro760_g198440.1 (Contig3371.g26405)	0.01	0.21	0.18	0.14	0.14	0.33	0.38	0.49	0.29	0.6	0.75	0.8	1.0	0.44	0.63	0.73	0.56	0.44	0.66	0.93	0.68	0.3	0.2	0.39	0.19	0.26	0.62
Sro779_g201230.2	0.1	0.24	0.13	0.13	0.14	0.25	0.58	0.69	0.6	0.63	1.0	0.7	0.99	0.55	0.67	0.57	0.62	0.54	0.61	0.77	0.76	0.28	0.36	0.53	0.22	0.29	0.61
Sro842_g209700.1 (Contig6.g78)	0.04	0.11	0.2	0.08	0.06	0.14	0.37	0.66	0.33	0.62	0.83	0.64	0.69	0.75	0.61	0.7	0.64	0.86	0.86	1.0	0.85	0.15	0.22	0.42	0.3	0.42	0.58
Sro916_g219780.1 (Contig1577.g14325)	0.18	0.1	0.1	0.03	0.02	0.11	0.3	0.56	0.31	0.63	0.39	0.65	0.32	0.21	0.89	0.86	1.0	0.77	0.36	0.22	0.82	0.03	0.34	0.48	0.16	0.21	0.9
Sro955_g224400.1 (Contig4455.g33466)	0.03	0.21	0.12	0.1	0.12	0.24	0.35	0.26	0.29	0.51	0.74	0.57	1.0	0.38	0.55	0.56	0.65	0.63	0.81	0.83	0.5	0.56	0.29	0.41	0.17	0.36	0.56
Sro96_g049510.1 (Contig3763.g28877)	0.0	0.06	0.04	0.0	0.04	0.14	0.7	0.16	0.18	0.42	0.82	0.28	0.56	0.08	0.6	1.0	0.39	0.7	0.47	0.74	0.63	0.05	0.04	0.6	0.54	0.47	0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)