1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_229 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1032_g233560.1 (Contig2177.g18184)
 0.01 0.33 0.31 0.18 0.12 0.17 1.07 0.36 0.24 0.96 0.78 1.17 1.56 0.58 1.22 1.17 0.55 1.71 1.49 1.44 1.36 0.11 0.16 0.86 1.09 1.02 0.77
Sro1036_g234020.1 (Contig614.g7568)
 0.04 0.99 0.59 0.58 0.69 0.93 1.64 1.04 0.58 3.1 3.22 4.21 2.63 3.07 2.57 2.33 2.68 3.04 6.08 5.85 3.62 1.16 0.43 2.23 1.51 2.0 1.89
Sro1051_g235700.1 (Contig3964.g30407)
 0.52 1.43 1.48 0.93 1.21 2.61 5.51 4.84 4.06 9.2 9.97 10.33 6.25 10.98 9.64 11.72 7.39 11.2 10.17 11.22 14.54 7.66 3.85 4.16 2.83 6.98 7.87
Sro1087_g239810.1 (Contig998.g10088)
 1.28 14.38 7.95 6.54 6.54 4.09 13.07 7.05 7.17 10.72 16.0 13.79 12.53 5.47 10.98 11.77 12.06 14.18 9.81 15.53 11.03 1.24 6.86 9.6 4.8 3.49 9.81
Sro1093_g240400.1 (Contig384.g5166)
 1.79 5.76 6.83 6.53 6.53 5.47 9.41 9.57 8.13 12.01 14.91 14.78 14.88 13.46 12.22 12.82 11.1 10.85 13.31 18.94 12.53 4.89 6.11 7.69 3.01 4.1 12.01
0.74 1.63 0.82 0.6 1.19 2.56 5.08 3.45 3.15 7.63 7.81 9.45 5.45 8.18 6.65 7.93 5.84 7.9 8.53 10.39 8.27 3.49 3.14 3.89 1.73 4.21 7.13
Sro1189_g250690.1 (Contig972.g9926)
 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.81 0.82 0.59 3.22 3.94 4.29 2.43 3.88 2.24 1.65 0.62 1.98 4.36 4.64 3.95 0.57 0.45 0.96 0.16 1.88 2.61
Sro1409_g270180.1 (Contig1095.g10599)
 0.03 1.61 2.64 2.53 1.26 7.16 4.32 7.45 4.67 9.26 11.0 8.9 20.59 10.74 10.7 14.8 7.11 11.52 18.93 19.32 12.32 6.22 3.8 4.96 6.26 8.02 8.02
Sro1496_g277520.1 (Contig2419.g19802)
 20.29 7.16 10.0 5.54 4.14 7.26 16.07 14.48 12.38 25.84 26.36 30.87 28.25 25.32 25.03 23.44 15.51 31.07 27.31 43.59 28.94 10.94 11.91 16.08 8.25 12.19 25.02
Sro1572_g283400.1 (Contig2634.g21352)
 1.47 8.64 5.08 3.21 3.89 7.57 14.98 12.44 10.86 15.58 18.05 18.76 24.11 11.18 16.09 18.5 13.76 22.37 17.39 27.09 16.44 4.18 7.96 5.04 5.19 6.68 13.84
Sro15_g011210.1 (Contig791.g8847)
 0.23 5.67 3.93 4.83 3.34 3.76 11.99 9.16 6.72 11.41 17.92 15.77 13.29 8.45 12.73 10.43 10.38 14.28 13.85 17.18 15.3 4.0 5.74 10.95 7.12 5.7 11.75
Sro172_g076030.1 (Contig1453.g13312)
 0.01 0.66 0.43 0.31 0.21 1.57 1.7 1.17 0.74 3.06 3.93 3.94 2.38 2.17 2.59 2.97 2.35 3.79 4.81 4.13 4.16 1.81 0.73 1.23 1.51 1.61 2.48
Sro172_g076080.1 (Contig1453.g13317)
 0.08 2.07 0.9 1.03 0.99 3.69 7.68 5.65 4.84 8.23 9.93 7.56 13.33 12.19 9.18 9.0 6.71 11.94 11.44 19.86 9.44 7.71 4.66 3.97 2.4 3.46 7.6
Sro1730_g294110.1 (Contig2449.g20048)
 3.87 24.84 16.35 11.63 15.18 11.97 32.35 21.83 23.48 28.53 34.59 30.39 28.94 27.91 31.32 30.93 29.12 36.15 34.01 38.22 28.95 12.35 24.11 23.02 10.5 10.64 26.76
Sro1732_g294170.1 (Contig1542.g14001)
 5.87 7.03 4.83 3.41 4.51 24.87 38.9 29.25 30.84 59.47 47.22 74.53 67.2 82.14 42.98 53.38 45.67 53.87 89.24 77.87 80.57 41.02 35.42 47.15 36.76 38.02 47.12
Sro1794_g297960.1 (Contig4702.g34974)
 3.42 12.27 4.88 9.02 5.86 13.74 37.04 37.38 24.66 35.47 50.33 44.21 41.29 25.68 38.36 38.67 31.87 47.78 39.18 62.28 48.51 15.2 17.4 35.49 28.9 21.72 32.37
Sro181_g078970.1 (Contig4257.g32224)
 0.27 2.39 1.54 1.12 1.14 1.3 3.19 1.23 1.69 4.47 4.49 4.42 5.09 2.77 4.74 8.1 4.98 5.33 5.46 6.82 6.86 1.98 1.08 2.68 3.65 2.73 4.14
Sro182_g079310.1 (Contig1301.g12067)
 0.68 2.14 0.93 0.6 0.7 2.97 7.67 6.3 5.06 6.71 7.88 6.97 5.63 6.06 7.26 7.05 6.14 9.12 7.04 7.99 8.85 3.27 5.3 5.23 2.94 2.89 6.78
Sro18_g012750.1 (Contig1351.g12435)
 1.25 3.98 2.04 1.34 1.89 3.22 8.69 7.81 5.53 8.1 8.89 9.87 8.75 6.38 7.5 7.79 6.08 10.28 9.65 11.0 11.26 5.56 5.18 6.57 5.48 4.18 7.17
Sro203_g085540.1 (Contig1270.g11848)
 7.07 13.05 10.21 4.82 5.07 8.35 24.55 25.71 21.48 18.83 32.95 15.78 15.29 16.24 26.01 23.94 22.72 23.06 21.99 23.7 23.1 13.21 21.74 24.99 10.57 11.22 23.67
Sro2137_g316000.1 (Contig702.g8139)
 0.31 0.88 0.57 0.35 0.76 2.7 2.78 1.84 1.61 6.23 8.58 8.14 12.85 5.3 5.93 6.65 8.18 6.85 9.53 10.14 6.26 2.09 1.86 5.07 1.93 4.11 6.39
Sro250_g099050.1 (Contig1989.g17021)
 0.4 3.25 2.11 1.41 1.67 1.9 5.12 5.19 4.17 5.54 6.65 6.19 3.89 4.08 5.54 5.12 4.06 7.12 7.0 6.95 6.93 1.7 3.85 5.16 2.02 2.23 5.75
Sro259_g101450.1 (Contig240.g2935)
 0.61 0.96 0.71 0.56 0.6 0.89 1.93 2.68 2.2 3.26 2.7 3.7 5.04 2.09 2.53 2.65 1.92 3.9 5.32 6.35 3.7 2.77 1.45 1.68 0.77 0.99 2.13
Sro300_g111580.1 (Contig270.g3446)
 0.13 0.66 0.17 0.39 0.0 0.14 1.51 0.44 0.57 1.23 1.72 1.07 1.2 0.38 1.54 2.13 1.82 2.24 0.98 2.41 1.87 0.2 0.11 1.44 1.42 1.21 1.07
Sro317_g115730.1 (Contig519.g6844)
 1.63 7.98 4.06 4.01 4.76 5.91 14.09 12.94 8.96 15.35 20.67 15.1 15.08 18.27 17.37 16.37 11.71 19.93 21.22 21.9 14.68 9.45 8.23 12.72 3.08 5.97 16.22
Sro326_g118230.1 (Contig1080.g10511)
 0.25 1.37 0.4 0.45 0.47 2.28 4.33 2.27 2.54 4.08 5.02 4.28 5.76 5.68 3.81 4.33 3.84 4.59 4.26 6.32 5.18 2.27 1.95 2.62 1.89 2.26 4.16
Sro330_g119010.1 (Contig55.g417)
 0.08 1.85 1.42 1.92 1.29 1.17 3.01 2.22 2.36 4.04 4.55 5.65 3.31 2.06 3.08 3.29 2.84 3.71 5.5 5.86 6.15 2.44 1.97 2.63 1.24 1.77 3.45
Sro365_g127480.1 (Contig3612.g27922)
 2.69 0.81 0.9 0.79 0.51 1.29 1.55 1.11 1.16 2.95 3.5 3.41 6.4 3.89 2.8 3.39 2.46 2.92 5.07 5.65 3.46 2.59 1.44 2.06 1.03 2.36 2.63
Sro3788_g351050.1 (Contig2801.g22533)
 0.38 0.75 1.63 1.1 0.69 2.8 0.91 2.85 0.5 3.48 4.2 4.67 3.94 2.18 2.76 3.21 2.58 5.89 5.33 5.13 5.42 0.67 0.61 1.92 1.59 1.68 3.63
Sro3793_g351090.1 (Contig2378.g19546)
 0.23 4.98 5.74 5.77 4.15 5.88 6.69 8.75 10.98 10.07 9.61 11.56 8.27 6.89 8.18 9.81 9.33 13.52 17.25 14.57 11.66 7.41 4.69 10.6 7.56 8.32 6.59
Sro385_g131610.1 (Contig3292.g25843)
 0.01 0.5 0.41 0.36 0.31 0.96 0.85 1.92 0.49 1.82 1.78 1.37 1.22 0.82 1.72 2.19 1.95 1.88 3.2 3.16 2.59 1.08 0.6 0.87 1.22 1.1 1.95
Sro388_g132440.1 (Contig4393.g33018)
 0.12 2.55 1.35 1.1 1.09 2.74 8.83 5.23 5.29 7.56 9.06 8.52 9.97 7.71 7.92 7.89 5.63 8.27 7.1 13.4 9.11 4.18 3.87 6.56 4.11 3.65 5.98
Sro417_g138720.1 (Contig2416.g19780)
 0.23 8.22 2.51 3.3 2.79 3.78 10.79 8.15 7.27 10.92 22.36 10.76 8.34 14.31 12.65 10.65 9.26 10.66 12.21 14.0 10.64 5.71 5.37 9.8 3.92 4.28 12.94
Sro419_g139070.1 (Contig4415.g33168)
 0.14 0.54 0.51 0.3 0.21 0.62 4.34 2.18 1.5 4.15 2.77 6.07 4.52 2.1 5.49 7.52 1.91 5.98 6.87 8.3 5.93 0.39 0.5 4.87 8.77 3.95 3.15
Sro419_g139080.1 (Contig4415.g33169)
 0.27 0.82 0.81 0.38 0.26 2.49 5.67 3.66 1.68 5.53 5.53 5.51 6.22 3.22 7.33 7.78 3.63 8.18 6.63 9.58 9.15 1.02 0.44 6.36 7.67 6.37 5.39
Sro489_g153310.1 (Contig402.g5440)
 0.31 1.89 1.18 0.56 0.71 2.04 7.32 5.21 4.3 7.3 5.03 9.92 3.23 5.56 6.49 7.36 3.63 8.85 8.4 4.32 9.03 7.0 4.88 4.07 3.21 3.72 5.74
Sro4_g003060.1 (Contig3815.g29224)
 18.21 4.74 3.19 3.25 3.26 10.51 23.99 15.9 18.8 27.34 35.12 24.16 37.61 36.38 28.27 27.74 22.69 31.73 33.36 46.1 31.71 17.6 13.35 18.33 17.79 15.72 23.73
Sro518_g158790.1 (Contig3565.g27534)
 1.81 3.24 1.65 1.19 1.41 4.87 13.63 9.91 8.62 11.39 13.51 12.72 10.54 9.98 12.53 15.27 8.68 14.63 13.93 15.47 12.8 7.23 7.45 8.79 5.84 6.43 11.33
Sro528_g160790.1 (Contig1695.g15193)
 0.24 2.96 1.76 0.94 0.96 1.57 7.15 5.59 4.41 5.93 7.18 7.22 5.92 5.51 6.0 6.99 4.23 8.45 7.2 8.39 7.37 1.77 3.41 5.52 3.16 2.63 4.72
Sro576_g169510.1 (Contig2441.g19995)
 1.28 12.79 6.63 5.15 6.61 17.55 41.19 39.72 25.21 39.63 46.2 50.91 38.68 40.93 41.77 41.29 31.05 52.71 46.79 56.13 53.76 17.52 20.86 26.93 13.97 15.13 37.02
Sro58_g033560.1 (Contig64.g550)
 2.56 4.54 3.75 2.46 2.43 7.06 10.46 8.55 10.57 12.69 15.18 17.31 21.99 8.64 11.16 11.09 9.08 8.71 11.09 21.31 15.0 9.91 8.7 12.19 5.33 4.83 10.93
Sro595_g172700.1 (Contig4483.g33688)
 17.72 2.65 4.76 3.46 3.77 16.37 9.89 14.79 10.5 23.77 32.68 32.24 49.27 24.27 25.45 23.96 24.78 25.08 35.15 42.49 26.43 8.83 9.6 12.94 7.73 13.49 24.04
0.18 1.94 1.72 1.75 1.37 2.26 3.16 3.71 4.12 5.76 8.27 9.64 9.25 6.82 5.09 3.6 5.14 5.34 7.52 8.46 6.94 2.37 2.58 3.16 1.64 3.23 5.79
Sro61_g035140.1 (Contig3112.g24767)
 0.43 1.68 0.72 0.61 0.96 1.66 4.49 2.96 3.01 4.87 4.5 5.93 4.33 3.0 4.9 6.65 3.23 5.31 5.87 6.32 6.07 4.73 2.99 3.6 1.39 2.57 4.85
Sro648_g181030.1 (Contig423.g5674)
 1.34 1.36 0.89 0.53 0.39 1.77 8.3 7.75 5.91 7.44 6.82 9.51 4.87 3.84 5.37 4.87 4.53 5.33 6.59 10.21 9.12 8.25 5.28 5.03 1.87 2.28 5.27
Sro648_g181040.1 (Contig423.g5675)
 0.13 0.43 0.11 0.14 0.21 1.25 3.06 2.34 1.65 4.99 4.29 5.87 5.28 5.08 4.25 8.95 3.68 6.08 7.19 7.84 6.63 5.03 1.79 2.63 2.44 3.18 4.33
Sro700_g189630.1 (Contig1498.g13680)
 2.4 0.46 0.42 0.15 0.22 0.5 2.07 2.17 1.37 3.56 2.6 4.42 1.43 2.01 3.01 3.35 2.2 2.09 3.64 2.29 4.76 3.02 1.25 1.73 2.11 1.79 2.31
Sro757_g197940.1 (Contig322.g4283)
 0.07 0.51 0.28 0.13 0.26 0.53 2.32 1.2 1.48 2.63 1.62 2.54 3.95 3.62 1.84 2.0 1.23 3.06 3.27 6.92 3.51 2.34 1.62 0.93 0.68 1.27 1.94
Sro760_g198440.1 (Contig3371.g26405)
 0.16 2.48 2.16 1.7 1.6 3.88 4.42 5.71 3.47 7.06 8.85 9.46 11.76 5.15 7.39 8.55 6.62 5.22 7.71 10.96 8.01 3.52 2.3 4.62 2.24 3.09 7.28
0.7 1.62 0.88 0.9 0.95 1.69 3.93 4.71 4.05 4.24 6.78 4.74 6.74 3.7 4.55 3.85 4.21 3.66 4.12 5.24 5.13 1.91 2.47 3.62 1.49 1.98 4.13
Sro842_g209700.1 (Contig6.g78)
 0.24 0.73 1.4 0.58 0.38 0.96 2.53 4.47 2.27 4.27 5.64 4.4 4.74 5.12 4.16 4.74 4.35 5.9 5.89 6.83 5.79 1.02 1.53 2.9 2.06 2.85 3.95
Sro916_g219780.1 (Contig1577.g14325)
 0.04 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.06 0.11 0.06 0.13 0.08 0.13 0.06 0.04 0.18 0.17 0.2 0.15 0.07 0.04 0.16 0.01 0.07 0.1 0.03 0.04 0.18
Sro955_g224400.1 (Contig4455.g33466)
 0.45 3.29 1.83 1.51 1.86 3.77 5.39 4.05 4.47 7.87 11.36 8.71 15.4 5.86 8.43 8.55 10.02 9.64 12.52 12.74 7.66 8.68 4.49 6.29 2.64 5.5 8.64
Sro96_g049510.1 (Contig3763.g28877)
 0.0 0.18 0.14 0.0 0.13 0.43 2.2 0.51 0.55 1.32 2.56 0.86 1.76 0.25 1.88 3.13 1.23 2.19 1.49 2.33 1.97 0.16 0.14 1.89 1.68 1.49 1.86

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)