1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_176 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1035_g233900.1 (Contig58.g462)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.24 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1047_g235130.1 (Contig1910.g16507)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.05 0.1 0.01 0.17 0.04 0.08 0.61 0.03 0.08 0.12 0.04 0.05 0.09 1.0 0.12 0.04 0.01 0.02 0.03 0.02 0.05
Sro1125_g243990.1 (Contig4623.g34505)
 0.0 0.05 0.02 0.03 0.02 0.02 0.09 0.03 0.01 0.18 0.18 0.04 0.53 0.04 0.14 0.19 0.07 0.15 0.15 1.0 0.1 0.04 0.02 0.13 0.11 0.05 0.16
Sro1126_g244090.1 (Contig1609.g14570)
 0.09 0.12 0.03 0.05 0.04 0.06 0.05 0.07 0.07 0.24 0.08 0.18 0.69 0.09 0.06 0.07 0.05 0.14 0.17 1.0 0.12 0.01 0.05 0.05 0.05 0.03 0.08
Sro1186_g250350.1 (Contig3178.g25121)
 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.47 0.0 0.71 0.86 0.23 0.38 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
Sro120_g058390.1 (Contig2411.g19717)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.09 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.77 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
Sro1291_g259940.1 (Contig4270.g32314)
 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.18 0.04 0.31 0.0 0.0 1.0 0.08 0.09 0.15 0.04 0.0 0.03 0.73 0.39 0.07 0.07 0.04 0.04 0.13 0.02
Sro12_g009360.1 (Contig2293.g18956)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
Sro138_g064740.1 (Contig2021.g17296)
 0.53 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.02 0.05 0.01 0.2 0.17 0.17 0.3 0.07 0.14 0.03 0.77 0.03 0.0 1.0 0.05 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09
Sro1398_g269300.1 (Contig4711.g35042)
 0.03 0.04 0.0 0.0 0.05 0.04 0.03 0.27 0.02 0.2 0.0 0.07 1.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.17 0.24 0.77 0.15 0.01 0.01 0.0 0.13 0.0 0.01
0.01 0.1 0.12 0.07 0.06 0.06 0.27 0.07 0.2 0.38 0.3 0.31 1.0 0.22 0.28 0.41 0.23 0.18 0.24 0.82 0.39 0.22 0.11 0.23 0.27 0.25 0.24
Sro1422_g271270.1 (Contig4158.g31737)
 1.0 0.07 0.09 0.04 0.04 0.01 0.14 0.08 0.08 0.28 0.06 0.26 0.31 0.07 0.09 0.07 0.04 0.04 0.08 0.3 0.21 0.06 0.05 0.13 0.25 0.21 0.05
Sro1476_g275960.1 (Contig1982.g16971)
 0.05 0.08 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.02 0.53 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1497_g277580.1 (Contig4331.g32652)
 0.28 0.04 0.14 0.13 0.08 0.05 0.11 0.19 0.2 0.48 0.15 0.75 0.93 0.15 0.16 0.13 0.08 0.23 0.22 1.0 0.4 0.21 0.08 0.07 0.04 0.08 0.13
Sro14_g010610.1 (Contig1128.g10810)
 0.0 0.17 0.2 0.05 0.3 0.0 0.06 0.07 0.1 0.14 0.03 0.01 0.89 0.01 0.03 0.11 0.0 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.12 0.06 0.06 0.03 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.05 0.63 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
Sro1573_g283460.1 (Contig1464.g13443)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.01 0.03 0.11 0.02 0.04 0.85 0.03 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.01 0.21 0.13 0.07 0.02 0.05 0.02
Sro157_g071340.1 (Contig2362.g19424)
 0.0 0.13 0.0 0.11 0.11 0.14 0.1 0.02 0.03 0.47 0.0 0.25 0.76 0.05 0.12 0.35 0.16 0.0 0.54 1.0 0.29 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21
Sro1625_g286740.1 (Contig1487.g13589)
 0.39 1.0 0.83 0.34 0.49 0.04 0.12 0.19 0.15 0.3 0.16 0.4 0.48 0.27 0.12 0.07 0.12 0.27 0.22 0.48 0.12 0.11 0.08 0.12 0.04 0.08 0.12
0.49 0.48 0.53 0.25 0.27 0.05 0.12 0.16 0.14 0.48 0.04 0.86 0.72 0.39 0.08 0.04 0.09 0.3 0.26 1.0 0.2 0.06 0.1 0.16 0.05 0.05 0.15
Sro1751_g295270.1 (Contig3845.g29591)
 0.16 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.24 0.69 0.37 0.85 0.03 0.73 0.95 0.12 0.3 0.49 0.16 0.18 0.07 1.0 0.9 0.15 0.05 0.07 0.0 0.0 0.38
Sro1916_g305220.1 (Contig4310.g32502)
 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.16 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.04 0.02 0.01 0.04 0.03 0.04 0.0
Sro1916_g305250.1 (Contig4310.g32505)
 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.12 0.0 0.0 0.46 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1_g000910.1 (Contig3007.g24006)
 0.0 0.12 0.28 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.02 0.69 0.05 0.04 0.02 0.0 0.05 0.27 1.0 0.0 0.14 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
Sro201_g085080.1 (Contig2914.g23177)
 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.06 0.04 0.01 0.01 0.27 0.06 0.25 0.79 0.03 0.02 0.04 0.05 0.09 0.02 1.0 0.34 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02
Sro2031_g311850.1 (Contig1930.g16632)
 0.06 0.0 0.25 0.26 0.64 0.09 0.02 0.09 0.07 0.26 0.43 0.08 0.82 0.12 0.15 0.34 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.15 0.07 0.39 0.11 0.11
Sro2040_g312180.1 (Contig3368.g26386)
 0.0 0.2 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.2 0.0 0.03 0.18 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2049_g312520.1 (Contig754.g8568)
 1.0 0.03 0.04 0.02 0.02 0.05 0.09 0.08 0.14 0.27 0.1 0.25 0.72 0.09 0.08 0.08 0.06 0.06 0.12 0.75 0.14 0.09 0.07 0.05 0.1 0.06 0.08
Sro2398_g326100.1 (Contig2821.g22599)
 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.05 0.4 0.0 0.02 0.61 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro23_g016120.1 (Contig2259.g18762)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.03 0.02 1.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.88 0.05 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro247_g097930.1 (Contig3058.g24326)
 0.0 0.15 0.12 0.03 0.06 0.01 0.13 0.03 0.02 0.29 0.24 0.02 1.0 0.04 0.17 0.13 0.06 0.26 0.35 1.0 0.2 0.41 0.1 0.16 0.34 0.19 0.09
0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.04 0.03 0.29 0.0 0.1 1.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.67 0.41 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01
Sro2509_g329780.1 (Contig801.g8983)
 0.01 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.18 0.01 0.07 0.45 0.06 0.02 0.01 0.0 0.05 0.1 1.0 0.25 0.05 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02
Sro250_g098980.1 (Contig1989.g17014)
 0.02 0.03 0.04 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.7 0.09 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 1.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro253_g099960.1 (Contig3900.g29914)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2572_g331640.1 (Contig2924.g23289)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.15 0.08 0.12 0.02 0.02 0.66 0.0 0.04 0.24 0.05 0.09 0.12 1.0 0.02 0.15 0.05 0.01 0.0 0.01 0.03
Sro266_g103100.1 (Contig1823.g16041)
 0.02 0.23 0.09 0.03 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 0.19 0.03 0.07 1.0 0.02 0.01 0.05 0.0 0.06 0.09 0.87 0.24 0.01 0.02 0.04 0.04 0.03 0.04
Sro267_g103390.1 (Contig4506.g33801)
 0.1 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.49 0.0 0.06 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Sro280_g107140.1 (Contig1076.g10474)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.15 0.0 0.11 1.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.04 0.08 0.79 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2866_g338960.1 (Contig1002.g10103)
 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.02 0.96 0.03 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.03 0.05 0.13 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.12 0.04 0.04 0.27 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 1.0 0.08 0.02 0.03 0.03 0.0 0.04 0.03
Sro319_g116300.1 (Contig204.g2470)
 0.05 0.21 0.28 0.17 0.1 0.1 0.11 0.05 0.11 0.28 0.18 0.12 0.49 0.15 0.14 0.1 0.15 0.07 0.15 1.0 0.25 0.14 0.13 0.15 0.15 0.18 0.12
Sro341_g121570.1 (Contig3952.g30289)
 0.14 0.12 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.35 0.04 0.05 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.75 0.12 0.07 0.03 0.02 0.12 0.0 0.01
Sro443_g144120.1 (Contig715.g8258)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.31 0.17 0.0 0.97 0.0 0.08 0.12 0.0 0.0 0.12 1.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.05 0.2 0.07 0.04 0.27 0.59 0.49 0.5 0.39 0.32 1.0 0.09 0.22 0.21 0.06 0.22 0.2 0.74 0.3 0.18 0.43 0.06 0.03 0.21 0.19
Sro459_g147320.1 (Contig4657.g34672)
 0.13 0.04 0.03 0.01 0.01 0.02 0.06 0.12 0.16 0.19 0.06 0.15 0.39 0.03 0.03 0.03 0.07 0.01 0.01 1.0 0.14 0.1 0.07 0.06 0.19 0.14 0.05
Sro55_g032120.1 (Contig4458.g33486)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.06 0.0 0.49 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
Sro619_g176480.1 (Contig2168.g18159)
 0.54 0.04 0.01 0.02 0.0 0.07 0.06 0.24 0.07 0.47 0.09 0.57 0.59 0.24 0.11 0.06 0.01 0.01 0.09 1.0 0.43 0.14 0.03 0.11 0.06 0.02 0.07
Sro781_g201620.1 (Contig678.g7945)
 0.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.1 0.0 0.01 1.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.05 0.09 0.9 0.04 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro791_g203010.1 (Contig1638.g14767)
 0.11 0.05 0.0 0.15 0.0 0.0 0.02 0.02 0.09 0.11 0.03 0.06 1.0 0.01 0.02 0.01 0.05 0.01 0.0 0.73 0.23 0.02 0.03 0.02 0.09 0.0 0.01
Sro796_g203730.1 (Contig2034.g17471)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.27 0.02 0.25 0.0 0.08 0.46 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.03 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.2 0.06 0.17 0.09 0.05 0.31 0.04 0.02 0.12 0.0 0.11 0.02 1.0 0.17 0.0 0.01 0.09 0.01 0.03 0.06
0.0 0.89 0.81 0.46 0.19 0.09 0.3 0.68 0.13 0.79 0.35 0.65 0.84 0.62 0.43 0.42 0.09 0.22 0.22 1.0 0.54 0.07 0.1 0.27 0.0 0.0 0.18
Sro850_g210790.1 (Contig2035.g17501)
 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.13 0.19 0.17 0.49 0.25 0.98 0.97 0.24 0.21 0.11 0.13 0.07 0.09 1.0 0.57 0.13 0.12 0.01 0.1 0.14 0.1
Sro89_g046850.1 (Contig3846.g29606)
 0.0 0.3 0.12 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.0 0.17 1.0 0.04 0.02 0.57 0.0 0.09 0.13 0.72 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03
Sro97_g050000.1 (Contig689.g8054)
 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.15 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)