1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_176 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1035_g233900.1 (Contig58.g462)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.09 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1047_g235130.1 (Contig1910.g16507)
 0.0 0.04 0.0 0.07 0.03 0.11 0.31 0.58 0.04 1.0 0.25 0.48 3.54 0.18 0.47 0.67 0.22 0.29 0.51 5.8 0.7 0.22 0.06 0.11 0.18 0.11 0.32
Sro1125_g243990.1 (Contig4623.g34505)
 0.1 1.13 0.54 0.65 0.38 0.37 2.12 0.78 0.28 4.14 4.24 0.87 12.35 0.82 3.16 4.37 1.55 3.58 3.45 23.38 2.4 1.04 0.39 3.12 2.68 1.24 3.69
Sro1126_g244090.1 (Contig1609.g14570)
 0.74 1.03 0.27 0.42 0.38 0.48 0.39 0.61 0.56 1.99 0.71 1.5 5.81 0.81 0.5 0.56 0.43 1.2 1.48 8.48 1.01 0.06 0.46 0.46 0.41 0.27 0.65
Sro1186_g250350.1 (Contig3178.g25121)
 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.53 0.0 0.79 0.96 0.25 0.43 0.0 0.0 0.0 0.15 1.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
Sro120_g058390.1 (Contig2411.g19717)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 2.3 0.47 0.06 5.47 0.12 0.12 0.12 0.05 0.07 0.09 4.23 0.11 0.01 0.01 0.0 0.0 0.05 0.07
Sro1291_g259940.1 (Contig4270.g32314)
 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.07 0.17 0.04 0.28 0.0 0.0 0.92 0.07 0.08 0.14 0.03 0.0 0.03 0.68 0.36 0.06 0.06 0.04 0.04 0.12 0.02
Sro12_g009360.1 (Contig2293.g18956)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro138_g064740.1 (Contig2021.g17296)
 0.15 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.06 0.05 0.05 0.09 0.02 0.04 0.01 0.23 0.01 0.0 0.29 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro1398_g269300.1 (Contig4711.g35042)
 0.02 0.04 0.0 0.0 0.05 0.03 0.03 0.24 0.02 0.17 0.0 0.06 0.89 0.0 0.02 0.06 0.0 0.15 0.21 0.69 0.13 0.01 0.01 0.0 0.12 0.0 0.01
0.06 0.47 0.55 0.33 0.28 0.28 1.23 0.33 0.91 1.71 1.39 1.43 4.56 1.01 1.29 1.87 1.05 0.84 1.08 3.73 1.78 0.99 0.5 1.05 1.23 1.15 1.1
Sro1422_g271270.1 (Contig4158.g31737)
 38.07 2.62 3.37 1.46 1.69 0.25 5.33 3.02 2.95 10.81 2.23 9.95 11.9 2.74 3.26 2.82 1.63 1.33 2.9 11.39 7.81 2.24 1.77 5.08 9.61 8.15 1.88
Sro1476_g275960.1 (Contig1982.g16971)
 0.22 0.39 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 0.09 2.55 0.09 0.02 0.03 0.05 0.02 0.0 4.83 0.19 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01
Sro1497_g277580.1 (Contig4331.g32652)
 5.04 0.76 2.57 2.36 1.4 0.9 1.95 3.48 3.51 8.66 2.72 13.33 16.65 2.72 2.95 2.25 1.5 4.14 3.93 17.89 7.15 3.8 1.4 1.33 0.68 1.46 2.41
Sro14_g010610.1 (Contig1128.g10810)
 0.03 1.96 2.32 0.58 3.44 0.02 0.71 0.83 1.17 1.65 0.31 0.15 10.14 0.1 0.29 1.31 0.05 0.07 0.15 11.42 0.18 0.15 1.41 0.72 0.71 0.3 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.06 0.73 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
Sro1573_g283460.1 (Contig1464.g13443)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.11 0.17 0.05 0.12 0.4 0.06 0.14 3.01 0.09 0.13 0.0 0.0 0.07 0.0 3.54 0.04 0.73 0.45 0.24 0.07 0.17 0.08
Sro157_g071340.1 (Contig2362.g19424)
 0.0 0.05 0.0 0.04 0.04 0.05 0.04 0.01 0.01 0.18 0.0 0.09 0.29 0.02 0.04 0.13 0.06 0.0 0.2 0.38 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
Sro1625_g286740.1 (Contig1487.g13589)
 7.72 19.57 16.2 6.68 9.66 0.7 2.31 3.75 2.84 5.86 3.13 7.87 9.44 5.3 2.33 1.4 2.37 5.27 4.31 9.45 2.3 2.13 1.58 2.37 0.77 1.64 2.3
7.5 7.42 8.16 3.85 4.14 0.79 1.82 2.55 2.23 7.41 0.69 13.26 11.14 6.06 1.17 0.56 1.46 4.7 3.97 15.46 3.02 1.0 1.49 2.41 0.75 0.72 2.27
Sro1751_g295270.1 (Contig3845.g29591)
 0.33 0.0 0.0 0.13 0.13 0.0 0.48 1.4 0.75 1.7 0.07 1.48 1.9 0.23 0.6 0.99 0.33 0.35 0.13 2.01 1.82 0.31 0.1 0.14 0.0 0.0 0.75
Sro1916_g305220.1 (Contig4310.g32502)
 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.33 0.0 0.03 2.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.26 0.07 0.05 0.02 0.09 0.06 0.09 0.0
Sro1916_g305250.1 (Contig4310.g32505)
 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.35 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.16 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1_g000910.1 (Contig3007.g24006)
 0.0 0.08 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.48 0.03 0.03 0.01 0.0 0.04 0.19 0.69 0.0 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
Sro201_g085080.1 (Contig2914.g23177)
 0.13 0.4 0.33 0.18 0.29 1.37 0.9 0.14 0.29 6.06 1.33 5.69 18.0 0.66 0.56 0.91 1.11 2.06 0.49 22.82 7.75 0.13 0.22 0.29 0.49 0.36 0.43
Sro2031_g311850.1 (Contig1930.g16632)
 0.04 0.0 0.14 0.15 0.36 0.05 0.01 0.05 0.04 0.15 0.24 0.05 0.46 0.07 0.09 0.2 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.04 0.09 0.04 0.22 0.06 0.06
Sro2040_g312180.1 (Contig3368.g26386)
 0.0 0.11 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.12 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0 0.01 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2049_g312520.1 (Contig754.g8568)
 114.14 3.71 4.12 2.73 2.19 5.76 10.24 9.23 15.65 30.79 11.44 29.1 81.75 9.79 8.97 8.61 6.73 6.72 14.16 85.89 16.12 10.53 7.97 6.27 11.73 6.51 9.52
Sro2398_g326100.1 (Contig2821.g22599)
 0.0 0.0 0.18 0.12 0.15 0.05 0.0 0.0 0.45 3.46 0.0 0.14 5.36 0.18 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 8.75 0.49 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01
Sro23_g016120.1 (Contig2259.g18762)
 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.12 0.12 0.09 3.93 0.08 0.01 0.08 0.0 0.04 0.0 3.45 0.18 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05
Sro247_g097930.1 (Contig3058.g24326)
 0.0 0.23 0.18 0.04 0.09 0.02 0.2 0.05 0.03 0.44 0.36 0.03 1.52 0.06 0.26 0.2 0.09 0.4 0.53 1.53 0.3 0.63 0.15 0.24 0.51 0.29 0.13
0.39 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.24 0.34 0.27 2.55 0.0 0.87 8.75 0.48 0.15 0.0 0.14 0.02 0.0 5.83 3.62 0.04 0.13 0.29 0.11 0.0 0.12
Sro2509_g329780.1 (Contig801.g8983)
 0.07 0.33 0.22 0.0 0.0 0.0 0.24 0.01 0.0 1.09 0.03 0.44 2.67 0.36 0.1 0.07 0.03 0.28 0.62 5.99 1.51 0.28 0.15 0.0 0.04 0.12 0.15
Sro250_g098980.1 (Contig1989.g17014)
 0.04 0.06 0.08 0.33 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.23 0.0 0.0 1.41 0.17 0.02 0.0 0.0 0.1 0.02 2.02 0.05 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro253_g099960.1 (Contig3900.g29914)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 2.83 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 5.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2572_g331640.1 (Contig2924.g23289)
 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.04 0.91 0.45 0.7 0.13 0.13 3.92 0.02 0.21 1.41 0.28 0.51 0.7 5.93 0.11 0.88 0.3 0.04 0.0 0.06 0.17
Sro266_g103100.1 (Contig1823.g16041)
 0.09 0.89 0.33 0.11 0.13 0.0 0.16 0.01 0.03 0.71 0.12 0.26 3.84 0.07 0.04 0.21 0.02 0.25 0.35 3.34 0.93 0.05 0.07 0.15 0.17 0.12 0.15
Sro267_g103390.1 (Contig4506.g33801)
 0.72 0.13 0.11 0.14 0.07 0.0 0.09 0.0 0.01 3.62 0.0 0.41 7.31 0.1 0.04 0.0 0.02 0.02 0.02 6.2 0.11 0.05 0.03 0.0 0.08 0.0 0.02
Sro280_g107140.1 (Contig1076.g10474)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.26 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2866_g338960.1 (Contig1002.g10103)
 0.0 0.66 0.34 0.44 0.27 0.18 0.19 0.08 0.06 5.48 0.45 1.01 42.44 1.38 0.8 1.68 0.85 0.21 0.04 44.19 0.55 0.2 0.31 0.27 0.27 0.39 0.65
0.23 0.5 1.16 0.38 0.15 0.16 0.08 0.06 0.27 1.1 0.33 0.41 2.42 0.11 0.22 0.08 0.09 0.24 0.23 9.09 0.73 0.2 0.24 0.26 0.0 0.32 0.3
Sro319_g116300.1 (Contig204.g2470)
 0.38 1.72 2.27 1.37 0.81 0.79 0.9 0.44 0.91 2.28 1.45 1.0 3.94 1.2 1.14 0.79 1.18 0.54 1.25 8.13 2.04 1.15 1.06 1.24 1.23 1.5 0.96
Sro341_g121570.1 (Contig3952.g30289)
 0.22 0.19 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.54 0.06 0.07 1.54 0.0 0.07 0.0 0.0 0.11 0.0 1.16 0.18 0.11 0.05 0.03 0.19 0.0 0.01
Sro443_g144120.1 (Contig715.g8258)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.2 0.11 0.0 0.64 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.08 0.66 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.06 0.24 0.08 0.05 0.31 0.69 0.57 0.59 0.46 0.37 1.17 0.11 0.26 0.24 0.07 0.26 0.24 0.87 0.35 0.21 0.51 0.08 0.03 0.25 0.22
Sro459_g147320.1 (Contig4657.g34672)
 3.86 1.03 0.83 0.34 0.19 0.6 1.63 3.49 4.82 5.47 1.63 4.36 11.46 0.79 0.93 0.76 2.01 0.29 0.38 29.45 4.16 3.09 2.2 1.9 5.7 4.03 1.36
Sro55_g032120.1 (Contig4458.g33486)
 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.24 0.09 0.0 0.75 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 1.52 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
Sro619_g176480.1 (Contig2168.g18159)
 2.21 0.15 0.04 0.1 0.0 0.28 0.24 1.0 0.28 1.93 0.35 2.33 2.43 0.99 0.45 0.25 0.04 0.04 0.38 4.09 1.77 0.56 0.11 0.47 0.25 0.09 0.27
Sro781_g201620.1 (Contig678.g7945)
 0.0 0.08 0.09 0.06 0.06 0.0 0.0 0.02 0.05 0.22 0.0 0.03 2.14 0.02 0.04 0.14 0.0 0.1 0.2 1.93 0.08 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro791_g203010.1 (Contig1638.g14767)
 0.35 0.17 0.0 0.5 0.0 0.0 0.08 0.06 0.3 0.35 0.1 0.19 3.35 0.03 0.06 0.04 0.18 0.03 0.0 2.45 0.76 0.08 0.11 0.08 0.29 0.0 0.04
Sro796_g203730.1 (Contig2034.g17471)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.2 0.02 0.18 0.0 0.06 0.33 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.1 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.66 0.19 0.57 0.29 0.16 1.0 0.13 0.07 0.38 0.0 0.37 0.06 3.26 0.55 0.0 0.04 0.28 0.03 0.1 0.19
0.0 0.79 0.72 0.41 0.17 0.08 0.27 0.6 0.12 0.7 0.31 0.58 0.75 0.55 0.38 0.37 0.08 0.19 0.2 0.89 0.48 0.06 0.09 0.24 0.0 0.0 0.16
Sro850_g210790.1 (Contig2035.g17501)
 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.14 0.33 0.46 0.41 1.21 0.62 2.41 2.4 0.59 0.53 0.26 0.32 0.17 0.23 2.47 1.4 0.32 0.29 0.03 0.26 0.34 0.25
Sro89_g046850.1 (Contig3846.g29606)
 0.0 0.28 0.12 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.27 0.0 0.16 0.93 0.04 0.02 0.53 0.0 0.09 0.12 0.67 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03
Sro97_g050000.1 (Contig689.g8054)
 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.2 0.0 0.03 5.52 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.4 8.03 0.22 0.14 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)