Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1023_g232540.1 (Contig1305.g12110)	0.18	0.05	0.06	0.02	0.01	0.06	0.27	0.35	0.13	0.98	0.17	0.38	0.76	0.21	0.14	0.09	0.05	0.32	0.45	1.0	0.69	0.29	0.06	0.36	0.43	0.26	0.14
Sro103_g052480.1 (Contig308.g4045)	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.15	0.24	0.12	0.08	0.75	0.37	0.36	1.0	0.46	0.39	0.47	0.29	0.22	0.33	0.86	0.38	0.15	0.09	0.22	0.35	0.29	0.23
Sro106_g053490.1 (Contig1122.g10746)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.55	0.04	0.01	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1171_g248870.1 (Contig4470.g33571)	0.01	0.08	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.52	0.01	0.05	1.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.03	0.08	0.91	0.07	0.03	0.1	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro1242_g255520.1 (Contig1008.g10132)	0.06	0.0	0.09	0.0	0.04	0.0	0.01	0.35	0.03	1.0	0.05	0.04	0.89	0.03	0.03	0.0	0.0	0.08	0.11	0.44	0.62	0.03	0.01	0.08	0.0	0.01	0.01
Sro1305_g261200.2	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.52	0.0	0.05	0.67	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.0	1.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1305_g261210.1 (Contig1643.g14835)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.02	0.01	0.04	0.0	0.56	0.01	0.04	0.79	0.01	0.03	0.01	0.0	0.02	0.01	1.0	0.09	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Sro1353_g265370.1 (Contig3065.g24429)	0.04	0.17	0.27	0.04	0.12	0.07	0.16	0.14	0.07	0.74	0.21	0.26	0.99	0.17	0.3	0.46	0.29	0.41	0.73	1.0	0.41	0.34	0.11	0.1	0.28	0.23	0.21
Sro1392_g268840.1 (Contig2185.g18219)	0.0	0.05	0.07	0.06	0.04	0.21	0.31	0.17	0.14	0.88	0.37	0.31	1.0	0.3	0.41	0.3	0.32	0.34	0.21	0.82	0.42	0.16	0.08	0.3	0.49	0.31	0.32
Sro1392_g268870.1 (Contig2185.g18222)	0.04	0.28	0.09	0.06	0.0	0.05	0.07	0.0	0.01	1.0	0.08	0.12	0.12	0.0	0.09	0.0	0.11	0.0	0.03	0.18	0.61	0.19	0.01	0.09	0.15	0.03	0.16
Sro144_g067140.1 (Contig3873.g29813)	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	1.0	0.07	0.24	0.08	0.0	0.03	0.03	0.05	0.1	0.05	0.03	0.55	0.1	0.18	0.0	0.04	0.0	0.03
Sro144_g067150.1 (Contig3873.g29814)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.4	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1455_g274110.1 (Contig3944.g30235)	0.09	0.08	0.07	0.06	0.08	0.06	0.15	0.25	0.11	0.58	0.23	0.28	0.94	0.33	0.24	0.46	0.16	0.19	0.48	1.0	0.35	0.14	0.08	0.13	0.19	0.15	0.18
Sro1577_g283570.1 (Contig4524.g33887)	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.32	0.14	0.09	1.0	0.42	0.43	0.56	0.4	0.54	1.0	0.39	0.64	0.46	0.75	0.57	0.03	0.07	0.27	0.41	0.27	0.3
Sro1613_g286020.1 (Contig3025.g24109)	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.12	0.45	0.2	0.16	1.0	0.44	0.6	0.44	0.4	0.63	0.52	0.29	0.35	0.34	0.5	0.56	0.14	0.09	0.45	0.38	0.33	0.3
Sro1629_g287130.1 (Contig3822.g29354)	0.01	0.04	0.04	0.0	0.03	0.16	0.22	0.24	0.1	0.84	0.68	0.24	1.0	0.35	0.48	0.53	0.16	0.6	0.39	1.0	0.66	0.28	0.06	0.37	0.61	0.49	0.41
Sro1629_g287140.1 (Contig3822.g29355)	0.03	0.04	0.07	0.05	0.05	0.09	0.26	0.17	0.2	0.8	0.41	0.25	0.8	0.26	0.45	0.57	0.28	0.54	0.42	1.0	0.64	0.44	0.12	0.39	0.72	0.41	0.32
Sro1693_g291650.1 (Contig4594.g34332)	0.04	0.23	0.23	0.06	0.13	0.13	0.19	0.08	0.1	1.0	0.23	0.3	0.05	0.04	0.35	0.46	0.05	0.07	0.21	0.06	0.76	0.08	0.09	0.28	0.37	0.09	0.12
Sro1847_g301420.1 (Contig3114.g24780)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.43	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Sro1891_g303750.1 (Contig3442.g26772)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1899_g304190.1 (Contig3691.g28465)	0.01	0.07	0.03	0.02	0.02	0.07	0.17	0.13	0.07	0.76	0.17	0.35	0.36	0.13	0.15	0.19	0.14	0.25	0.26	1.0	0.4	0.24	0.07	0.13	0.14	0.16	0.11
Sro189_g081640.1 (Contig744.g8528)	0.02	0.14	0.1	0.18	0.27	0.26	0.47	0.17	0.23	1.0	0.5	0.76	0.57	0.7	0.45	0.55	0.36	0.75	0.34	0.8	0.71	0.21	0.19	0.39	0.72	0.31	0.29
Sro200_g084760.1 (Contig201.g2367)	0.35	0.19	0.62	0.1	0.18	0.02	0.15	0.19	0.24	0.97	0.14	0.33	0.3	0.21	0.23	0.34	0.23	0.1	0.26	1.0	0.9	0.24	0.1	0.11	0.1	0.06	0.19
Sro200_g084790.1 (Contig201.g2370)	0.23	0.02	0.05	0.0	0.0	0.04	0.18	0.02	0.04	0.84	0.19	0.4	0.94	0.14	0.19	0.18	0.09	0.11	0.03	1.0	0.66	0.0	0.02	0.24	0.48	0.15	0.1
Sro2149_g316650.2	0.24	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.58	0.0	0.3	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro216_g089430.1 (Contig227.g2720)	0.04	0.2	0.09	0.0	0.04	0.1	0.26	0.19	0.29	0.95	0.29	0.59	1.0	0.34	0.3	0.51	0.17	0.22	0.21	0.82	0.62	0.23	0.12	0.11	0.1	0.12	0.18
Sro2195_g318540.1 (Contig600.g7475)	0.08	0.08	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.35	0.24	0.08	0.14	0.06	0.03	0.03	0.06	0.2	0.6	0.07	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08
Sro242_g096690.1 (Contig554.g7087)	0.03	0.44	0.33	0.22	0.18	0.14	0.52	0.59	0.3	0.96	0.79	0.46	0.19	0.35	0.58	0.69	0.47	0.09	0.37	0.2	0.78	0.08	0.23	1.0	0.75	0.3	0.42
Sro249_g098690.1 (Contig4691.g34873)	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.0	1.0	0.88	0.11	0.09	0.88	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.17	0.83	0.2	0.03	0.11	0.0	0.0	0.0	0.03
Sro320_g116600.1 (Contig3665.g28321)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.07	0.03	0.01	1.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.68	0.11	0.03	0.01	0.0	0.08	0.0
Sro3369_g347300.1 (Contig3610.g27888)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro3544_g349100.1 (Contig2148.g18095)	0.32	0.13	0.07	0.12	0.08	0.06	0.17	0.12	0.19	1.0	0.22	0.27	0.07	0.19	0.2	0.28	0.16	0.05	0.13	0.12	0.89	0.0	0.13	0.21	0.24	0.18	0.18
Sro3615_g349720.1 (Contig2920.g23239)	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.13	0.12	0.61	0.0	0.0	0.96	0.0	0.01	0.06	0.0	0.15	0.0	1.0	0.03	0.02	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro363_g126990.1 (Contig698.g8138)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.15	0.05	0.0	1.0	0.0	0.47	0.19	0.05	0.11	0.0	0.0	0.11	0.0	0.31	0.48	0.0	0.02	0.16	0.0	0.37	0.05
Sro4061_g352711.1	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.02	0.08	0.79	0.0	0.0	0.03	0.04	0.03	0.01
Sro4061_g352711.2	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.02	0.08	0.79	0.0	0.0	0.03	0.04	0.03	0.01
Sro426_g140450.1 (Contig1720.g15390)	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.19	0.48	0.31	0.18	0.98	0.28	0.45	0.31	0.58	0.5	0.43	0.28	0.19	0.22	0.45	0.82	0.1	0.06	0.75	1.0	0.35	0.29
Sro435_g142310.1 (Contig492.g6637)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.02	0.02	0.04	0.3	0.0	0.01	0.27	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
Sro477_g150750.2	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.17	0.26	0.1	0.04	1.0	0.26	0.57	0.63	0.22	0.49	0.47	0.15	0.28	0.41	0.67	0.65	0.05	0.03	0.3	0.21	0.3	0.28
Sro492_g153820.1 (Contig2481.g20308)	0.13	0.16	0.16	0.14	0.19	0.07	0.12	0.06	0.05	1.0	0.35	0.37	0.37	0.35	0.29	0.33	0.3	0.15	0.21	0.51	0.54	0.14	0.03	0.36	0.4	0.2	0.19
Sro512_g157570.1 (Contig4754.g35257)	0.09	0.35	0.15	0.06	0.08	0.33	0.22	0.19	0.21	0.95	0.15	0.45	1.0	0.34	0.33	0.12	0.27	0.22	0.28	0.88	0.59	0.14	0.11	0.18	0.27	0.15	0.18
Sro524_g159930.1 (Contig202.g2390)	0.0	0.07	0.09	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.44	0.0	0.05	0.27	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro546_g164000.1 (Contig4069.g31177)	0.02	0.11	0.05	0.06	0.06	0.13	0.39	0.34	0.26	1.0	0.4	0.57	0.37	0.53	0.38	0.47	0.38	0.52	0.7	0.63	0.64	0.54	0.24	0.32	0.28	0.4	0.38
Sro546_g164060.1 (Contig4069.g31183)	0.0	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.08	0.02	0.03	0.51	0.06	0.26	1.0	0.07	0.12	0.03	0.07	0.06	0.2	0.71	0.11	0.04	0.04	0.12	0.09	0.07	0.08
Sro568_g168200.1 (Contig267.g3371)	0.07	0.19	0.22	0.04	0.0	0.03	0.15	0.76	0.13	1.0	0.15	0.31	0.18	0.18	0.15	0.27	0.0	0.6	0.4	0.35	0.63	0.25	0.04	0.07	0.42	0.14	0.19
Sro618_g176240.1 (Contig3757.g28817)	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.01	0.19	1.0	0.0	0.4	0.7	0.11	0.07	0.0	0.03	0.06	0.05	0.78	0.43	0.07	0.01	0.03	0.08	0.05	0.02
Sro636_g179230.1 (Contig84.g900)	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.43	0.28	0.17	0.29	1.0	0.3	0.38	0.77	0.46	0.38	0.59	0.35	0.34	0.39	0.86	0.63	0.16	0.17	0.21	0.38	0.32	0.24
Sro678_g185970.1 (Contig2726.g21982)	0.14	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.1	0.0	0.37	0.31	0.13	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro712_g191370.1 (Contig2484.g20342)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.04	0.07	1.0	0.0	0.37	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.74	0.46	0.13	0.11	0.05	0.0	0.07	0.0	0.02
Sro743_g196040.1 (Contig2729.g22002)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.17	0.08	0.11	0.02	1.0	0.03	0.17	0.31	0.16	0.1	0.09	0.08	0.18	0.19	0.63	0.38	0.08	0.13	0.04	0.15	0.08	0.08
Sro76_g041761.1	0.01	0.0	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.09	1.0	0.02	0.07	0.14	0.02	0.05	0.08	0.04	0.21	0.28	0.14	0.67	0.03	0.03	0.11	0.11	0.13	0.05
Sro801_g204540.1 (Contig2787.g22419)	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.11	0.05	0.07	0.52	0.28	0.28	0.47	0.15	0.12	0.11	0.23	0.25	0.22	1.0	0.36	0.08	0.04	0.11	0.01	0.14	0.09
Sro815_g206510.1 (Contig3639.g28099)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.35	0.04	0.02	0.85	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02
Sro841_g209630.1 (Contig2025.g17361)	0.0	0.0	0.09	0.08	0.0	0.0	0.03	0.04	0.03	0.4	0.02	0.08	0.04	0.01	0.02	0.04	0.0	0.06	0.04	1.0	0.06	0.03	0.04	0.0	0.0	0.03	0.01
Sro90_g047520.1 (Contig124.g1414)	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.23	0.58	0.22	1.0	0.27	0.52	0.26	0.03	0.39	0.39	0.35	0.48	0.48	0.54	0.44	0.18	0.06	0.31	0.68	0.18	0.38
Sro936_g222110.1 (Contig2485.g20358)	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	1.0	0.03	0.07	0.65	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01	0.74	0.14	0.06	0.05	0.05	0.01	0.01	0.03
Sro99_g050780.1 (Contig1378.g12649)	0.39	0.0	0.02	0.01	0.0	0.03	0.09	0.04	0.05	0.52	0.07	0.04	1.0	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.48	0.1	0.23	0.05	0.17	0.06	0.02	0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)