1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1023_g232540.1 (Contig1305.g12110)
 0.71 0.19 0.24 0.09 0.04 0.22 1.06 1.37 0.49 3.79 0.66 1.47 2.94 0.81 0.53 0.35 0.2 1.22 1.75 3.85 2.67 1.1 0.22 1.38 1.67 1.0 0.55
Sro103_g052480.1 (Contig308.g4045)
 0.08 0.18 0.1 0.34 0.2 1.07 1.7 0.85 0.54 5.4 2.68 2.57 7.18 3.3 2.8 3.39 2.08 1.56 2.4 6.16 2.76 1.11 0.63 1.61 2.5 2.09 1.64
Sro106_g053490.1 (Contig1122.g10746)
 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 2.88 0.23 0.07 2.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 5.2 0.14 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1171_g248870.1 (Contig4470.g33571)
 0.03 0.2 0.0 0.09 0.06 0.0 0.01 0.05 0.01 1.25 0.03 0.12 2.43 0.0 0.02 0.0 0.02 0.08 0.2 2.21 0.16 0.06 0.25 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro1242_g255520.1 (Contig1008.g10132)
 0.1 0.0 0.13 0.0 0.06 0.0 0.02 0.53 0.05 1.53 0.08 0.06 1.36 0.04 0.04 0.0 0.0 0.11 0.17 0.67 0.95 0.05 0.02 0.12 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 2.55 0.0 0.24 3.26 0.0 0.08 0.05 0.0 0.1 0.02 4.89 0.29 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro1305_g261210.1 (Contig1643.g14835)
 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.07 0.05 0.17 0.01 2.66 0.03 0.17 3.76 0.06 0.16 0.05 0.0 0.09 0.05 4.73 0.41 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.14
Sro1353_g265370.1 (Contig3065.g24429)
 0.21 0.89 1.38 0.2 0.6 0.34 0.79 0.7 0.37 3.76 1.09 1.33 5.02 0.86 1.51 2.32 1.48 2.09 3.71 5.07 2.06 1.72 0.58 0.5 1.42 1.17 1.04
Sro1392_g268840.1 (Contig2185.g18219)
 0.05 0.5 0.66 0.51 0.4 1.93 2.82 1.52 1.31 8.02 3.42 2.88 9.16 2.75 3.78 2.79 2.97 3.1 1.93 7.52 3.83 1.48 0.76 2.74 4.51 2.8 2.91
Sro1392_g268870.1 (Contig2185.g18222)
 0.21 1.58 0.49 0.32 0.0 0.3 0.4 0.0 0.07 5.61 0.45 0.65 0.65 0.0 0.5 0.0 0.6 0.0 0.14 1.02 3.42 1.08 0.03 0.51 0.82 0.18 0.87
Sro144_g067140.1 (Contig3873.g29813)
 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 1.43 0.1 0.34 0.12 0.0 0.04 0.04 0.08 0.15 0.08 0.04 0.79 0.15 0.26 0.0 0.06 0.0 0.05
Sro144_g067150.1 (Contig3873.g29814)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1455_g274110.1 (Contig3944.g30235)
 0.94 0.85 0.69 0.63 0.85 0.63 1.61 2.65 1.15 6.08 2.4 2.98 9.9 3.41 2.52 4.82 1.66 1.99 5.05 10.48 3.71 1.5 0.85 1.37 1.97 1.56 1.85
Sro1577_g283570.1 (Contig4524.g33887)
 0.21 0.36 0.27 0.32 0.24 3.15 7.28 3.29 2.15 22.94 9.71 9.79 12.98 9.12 12.53 23.04 9.07 14.76 10.61 17.36 13.04 0.68 1.52 6.18 9.53 6.33 7.03
Sro1613_g286020.1 (Contig3025.g24109)
 0.06 0.16 0.15 0.13 0.09 0.71 2.73 1.23 0.98 6.13 2.71 3.66 2.7 2.48 3.87 3.16 1.77 2.13 2.11 3.07 3.43 0.87 0.56 2.76 2.31 2.05 1.82
Sro1629_g287130.1 (Contig3822.g29354)
 0.07 0.2 0.23 0.0 0.15 0.88 1.17 1.31 0.56 4.54 3.68 1.29 5.38 1.88 2.57 2.83 0.86 3.21 2.08 5.36 3.54 1.53 0.34 1.98 3.3 2.63 2.21
Sro1629_g287140.1 (Contig3822.g29355)
 0.22 0.36 0.55 0.36 0.41 0.72 2.05 1.39 1.57 6.38 3.26 1.97 6.38 2.1 3.57 4.57 2.23 4.31 3.33 7.99 5.12 3.55 0.96 3.15 5.75 3.3 2.55
Sro1693_g291650.1 (Contig4594.g34332)
 0.09 0.54 0.54 0.13 0.3 0.32 0.45 0.19 0.23 2.38 0.55 0.7 0.13 0.1 0.83 1.1 0.12 0.17 0.5 0.13 1.8 0.2 0.22 0.68 0.88 0.23 0.29
Sro1847_g301420.1 (Contig3114.g24780)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.35 0.0 0.0 2.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Sro1891_g303750.1 (Contig3442.g26772)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1899_g304190.1 (Contig3691.g28465)
 0.13 0.68 0.26 0.23 0.19 0.63 1.64 1.24 0.66 7.31 1.69 3.34 3.48 1.29 1.46 1.8 1.38 2.43 2.49 9.68 3.9 2.33 0.69 1.29 1.37 1.53 1.1
Sro189_g081640.1 (Contig744.g8528)
 0.27 2.34 1.64 2.91 4.3 4.28 7.55 2.82 3.79 16.17 8.04 12.25 9.2 11.3 7.3 8.84 5.83 12.13 5.48 12.98 11.53 3.45 3.0 6.32 11.59 5.0 4.74
Sro200_g084760.1 (Contig201.g2367)
 2.48 1.31 4.36 0.69 1.3 0.15 1.03 1.33 1.71 6.88 1.02 2.33 2.15 1.51 1.61 2.41 1.6 0.73 1.82 7.08 6.36 1.71 0.74 0.79 0.73 0.44 1.34
Sro200_g084790.1 (Contig201.g2370)
 0.73 0.07 0.16 0.0 0.0 0.12 0.55 0.06 0.11 2.62 0.6 1.24 2.92 0.44 0.59 0.55 0.28 0.35 0.09 3.12 2.07 0.01 0.07 0.75 1.5 0.46 0.32
0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro216_g089430.1 (Contig227.g2720)
 0.14 0.77 0.34 0.0 0.16 0.38 1.02 0.73 1.14 3.71 1.11 2.3 3.89 1.33 1.17 1.99 0.67 0.86 0.84 3.21 2.4 0.88 0.49 0.43 0.37 0.47 0.7
Sro2195_g318540.1 (Contig600.g7475)
 0.09 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.09 0.0 0.38 0.26 0.09 0.15 0.07 0.03 0.04 0.07 0.22 0.65 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08
Sro242_g096690.1 (Contig554.g7087)
 0.04 0.54 0.4 0.27 0.23 0.17 0.64 0.73 0.37 1.19 0.97 0.56 0.23 0.44 0.72 0.85 0.58 0.11 0.45 0.25 0.96 0.09 0.28 1.23 0.92 0.37 0.51
Sro249_g098690.1 (Contig4691.g34873)
 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.41 0.36 0.04 0.04 0.36 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.34 0.08 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro320_g116600.1 (Contig3665.g28321)
 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.2 0.09 0.04 2.78 0.0 0.19 0.0 0.04 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 1.88 0.3 0.08 0.03 0.0 0.21 0.01
Sro3369_g347300.1 (Contig3610.g27888)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3544_g349100.1 (Contig2148.g18095)
 4.63 1.84 1.08 1.8 1.18 0.93 2.53 1.77 2.73 14.69 3.16 3.97 1.09 2.81 2.96 4.05 2.39 0.67 1.89 1.8 13.03 0.04 1.92 3.05 3.47 2.65 2.58
Sro3615_g349720.1 (Contig2920.g23239)
 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.08 0.39 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.63 0.02 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro363_g126990.1 (Contig698.g8138)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.0 0.41 0.0 0.19 0.08 0.02 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.2 0.0 0.01 0.07 0.0 0.15 0.02
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 0.0 0.0 0.05 0.03 0.04 0.03 0.03 0.09 0.03 0.13 1.25 0.0 0.0 0.04 0.06 0.04 0.01
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 0.0 0.0 0.05 0.03 0.04 0.03 0.03 0.09 0.03 0.13 1.25 0.0 0.0 0.04 0.06 0.04 0.01
Sro426_g140450.1 (Contig1720.g15390)
 0.23 0.31 0.52 0.59 0.57 2.39 6.24 3.96 2.27 12.67 3.61 5.8 3.97 7.45 6.49 5.54 3.64 2.46 2.85 5.83 10.63 1.34 0.76 9.66 12.89 4.47 3.78
Sro435_g142310.1 (Contig492.g6637)
 0.3 0.25 1.71 1.54 2.51 0.54 2.2 2.36 4.37 36.34 0.46 1.43 33.18 0.36 0.4 1.16 1.81 0.4 0.68 120.97 1.29 1.02 1.07 0.77 1.43 1.57 0.92
0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.49 0.77 0.28 0.12 2.92 0.76 1.66 1.84 0.64 1.43 1.37 0.42 0.81 1.2 1.96 1.9 0.14 0.08 0.89 0.62 0.89 0.82
Sro492_g153820.1 (Contig2481.g20308)
 2.32 2.86 2.76 2.42 3.36 1.27 2.08 1.05 0.92 17.72 6.14 6.51 6.52 6.16 5.12 5.87 5.29 2.74 3.67 9.08 9.58 2.46 0.59 6.41 7.12 3.6 3.35
Sro512_g157570.1 (Contig4754.g35257)
 0.36 1.38 0.59 0.24 0.31 1.31 0.88 0.76 0.84 3.76 0.58 1.78 3.94 1.34 1.3 0.49 1.07 0.87 1.11 3.45 2.34 0.57 0.42 0.69 1.07 0.61 0.7
Sro524_g159930.1 (Contig202.g2390)
 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro546_g164000.1 (Contig4069.g31177)
 0.13 0.79 0.34 0.44 0.43 0.92 2.84 2.48 1.91 7.34 2.9 4.2 2.7 3.87 2.81 3.43 2.81 3.81 5.14 4.64 4.71 3.93 1.8 2.33 2.06 2.93 2.79
Sro546_g164060.1 (Contig4069.g31183)
 0.0 0.18 0.17 0.17 0.06 0.03 0.34 0.07 0.14 2.07 0.26 1.05 4.04 0.27 0.48 0.14 0.27 0.23 0.8 2.87 0.45 0.15 0.17 0.47 0.37 0.27 0.33
Sro568_g168200.1 (Contig267.g3371)
 0.15 0.41 0.47 0.08 0.0 0.05 0.33 1.64 0.28 2.15 0.32 0.66 0.39 0.38 0.33 0.58 0.0 1.3 0.86 0.75 1.37 0.54 0.09 0.14 0.9 0.29 0.41
Sro618_g176240.1 (Contig3757.g28817)
 0.16 0.09 0.0 0.0 0.0 0.08 0.11 0.02 0.57 2.99 0.0 1.18 2.11 0.33 0.22 0.0 0.08 0.18 0.16 2.34 1.3 0.22 0.04 0.1 0.25 0.14 0.06
Sro636_g179230.1 (Contig84.g900)
 0.15 0.31 0.17 0.06 0.23 2.77 1.81 1.08 1.91 6.48 1.91 2.47 4.97 2.96 2.44 3.8 2.28 2.17 2.52 5.58 4.06 1.05 1.08 1.33 2.48 2.07 1.52
Sro678_g185970.1 (Contig2726.g21982)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro712_g191370.1 (Contig2484.g20342)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.33 0.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.25 0.15 0.04 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01
Sro743_g196040.1 (Contig2729.g22002)
 0.34 0.0 0.0 0.0 0.05 0.75 0.33 0.47 0.07 4.27 0.13 0.74 1.34 0.67 0.44 0.4 0.33 0.76 0.81 2.71 1.62 0.32 0.57 0.15 0.65 0.36 0.32
0.01 0.0 0.11 0.03 0.04 0.03 0.13 0.08 0.2 2.3 0.04 0.16 0.32 0.06 0.11 0.19 0.1 0.48 0.65 0.33 1.55 0.08 0.06 0.26 0.24 0.31 0.12
Sro801_g204540.1 (Contig2787.g22419)
 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.3 0.13 0.2 1.41 0.77 0.74 1.27 0.39 0.33 0.29 0.62 0.68 0.6 2.69 0.96 0.23 0.1 0.29 0.03 0.36 0.24
Sro815_g206510.1 (Contig3639.g28099)
 0.22 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.15 0.12 0.16 6.06 0.73 0.4 14.74 0.17 0.25 0.39 0.41 0.12 0.05 17.24 0.09 0.1 0.11 0.22 0.06 0.06 0.33
Sro841_g209630.1 (Contig2025.g17361)
 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.2 0.01 0.04 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.5 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01
Sro90_g047520.1 (Contig124.g1414)
 0.03 0.26 0.04 0.18 0.04 0.38 1.03 2.55 0.96 4.37 1.18 2.26 1.13 0.12 1.68 1.71 1.51 2.11 2.09 2.37 1.91 0.8 0.27 1.36 2.99 0.79 1.65
Sro936_g222110.1 (Contig2485.g20358)
 0.47 0.09 0.12 0.09 0.12 0.07 0.15 0.05 0.09 7.57 0.26 0.55 4.94 0.06 0.14 0.16 0.09 0.02 0.05 5.62 1.03 0.45 0.41 0.37 0.04 0.1 0.2
Sro99_g050780.1 (Contig1378.g12649)
 4.81 0.0 0.19 0.17 0.0 0.31 1.09 0.52 0.65 6.51 0.92 0.48 12.47 0.93 0.55 0.25 0.17 0.09 0.07 5.99 1.31 2.85 0.66 2.08 0.76 0.27 0.76

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)