1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_330 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1027_g233020.1 (Contig109.g1253)
 1.03 0.9 1.92 3.39 2.8 10.45 32.46 25.7 13.93 44.88 45.96 57.72 51.29 24.52 46.58 64.88 33.97 37.91 28.93 71.85 55.48 1.43 8.34 28.67 43.24 16.82 29.22
Sro105_g053300.1 (Contig544.g7019)
 2.36 0.1 0.09 0.27 0.3 3.07 5.63 5.2 2.42 8.33 10.34 9.39 7.5 1.9 9.96 11.74 4.8 7.09 7.8 11.97 12.04 0.84 0.85 6.64 8.1 4.22 6.87
Sro110_g054830.1 (Contig1501.g13706)
 0.94 3.64 1.29 2.99 2.69 0.87 3.42 2.86 1.39 6.23 5.43 8.04 5.0 3.94 5.45 9.24 3.79 8.25 5.41 5.85 6.04 1.86 1.27 3.15 2.34 2.41 5.52
Sro1136_g245230.1 (Contig1812.g15975)
 1.27 13.32 8.77 10.77 13.27 25.26 40.45 35.66 16.74 45.78 71.56 42.9 35.82 33.08 66.66 82.43 52.23 62.28 51.35 39.99 59.37 20.45 14.23 45.8 27.15 29.75 61.99
Sro1149_g246530.1 (Contig1585.g14397)
 0.13 0.49 0.55 0.56 0.19 1.42 10.93 7.44 3.26 8.88 11.78 8.02 17.88 13.66 16.24 19.76 8.82 12.74 6.85 18.78 11.98 1.24 2.66 15.34 24.25 11.44 7.93
Sro1193_g251220.1 (Contig4499.g33745)
 0.02 1.48 1.03 0.75 0.86 4.08 6.92 5.7 2.68 7.56 10.38 5.9 12.63 8.35 11.15 13.03 6.41 9.91 8.7 14.87 10.86 5.31 2.33 8.83 12.07 8.79 7.87
Sro1197_g251570.1 (Contig496.g6705)
 0.07 0.13 0.0 0.16 0.0 3.88 9.3 3.68 1.86 12.18 9.03 15.29 3.84 7.76 13.77 19.77 7.81 10.74 4.57 13.19 13.49 0.12 0.6 8.1 13.23 6.27 9.66
Sro135_g063800.1 (Contig2231.g18525)
 0.45 2.33 1.7 1.03 0.99 3.01 12.49 5.32 4.55 14.28 15.27 15.34 30.77 12.23 15.34 36.92 9.13 14.61 19.02 22.04 16.62 5.02 2.99 15.61 8.76 6.78 19.25
Sro1433_g272220.1 (Contig1680.g15090)
 0.05 1.0 0.49 0.61 1.06 0.45 1.28 0.58 0.75 3.67 2.16 4.41 5.2 3.31 3.03 4.84 2.24 4.33 4.47 7.2 4.57 2.16 0.24 1.84 2.26 1.61 3.02
Sro1442_g273050.1 (Contig3575.g27638)
 0.15 0.22 0.06 0.0 0.0 0.34 5.25 2.49 1.18 7.89 6.44 6.69 11.21 9.18 9.96 16.56 6.45 7.15 3.06 13.17 12.39 1.87 0.8 8.68 17.59 5.94 7.52
Sro1546_g281440.1 (Contig1075.g10451)
 0.97 0.47 0.32 0.03 0.08 0.61 7.29 4.2 2.57 8.01 7.16 9.37 4.01 3.37 11.56 17.58 4.95 9.08 5.06 6.52 11.79 0.39 1.73 5.92 4.98 4.73 7.35
Sro1604_g285390.1 (Contig23.g166)
 0.03 0.59 0.3 0.25 0.28 2.93 4.79 3.07 0.82 5.45 3.74 4.47 9.16 8.01 4.42 5.14 4.5 5.23 4.01 7.75 7.62 1.32 1.07 4.66 8.8 3.69 4.02
Sro1611_g285900.1 (Contig2477.g20237)
 0.03 0.11 0.06 0.17 0.26 0.52 2.45 1.51 1.13 3.6 3.38 3.84 5.01 2.42 3.95 4.69 2.9 2.96 3.42 7.77 4.44 0.58 0.43 2.71 3.58 1.57 3.0
Sro1701_g292210.1 (Contig516.g6814)
 0.05 0.15 0.21 0.48 0.35 2.02 2.43 4.55 1.61 6.93 10.03 5.56 2.22 2.76 11.96 15.34 7.11 8.15 12.53 6.24 12.25 1.54 1.26 4.12 3.69 7.41 14.19
Sro170_g075310.1 (Contig2525.g20604)
 0.2 2.63 1.17 1.4 1.61 0.35 3.21 2.87 1.03 4.34 3.24 5.11 4.83 3.36 4.95 9.95 2.17 4.77 5.3 5.07 7.12 2.32 0.69 2.66 3.84 2.98 3.85
Sro1787_g297470.1 (Contig4564.g34100)
 0.5 0.39 0.28 0.28 0.32 1.17 4.09 1.47 1.45 5.39 5.64 5.47 8.46 4.06 6.37 8.88 4.27 4.1 4.04 9.9 8.03 0.42 0.96 5.71 10.54 4.15 4.4
Sro1869_g302660.1 (Contig2175.g18177)
 0.59 0.49 0.66 0.38 0.33 1.0 6.3 3.68 1.65 5.01 4.3 4.08 8.46 3.3 8.67 9.38 2.84 6.37 4.44 10.12 6.64 4.9 1.38 8.61 11.4 7.36 4.48
Sro1888_g303640.1 (Contig4582.g34237)
 0.51 7.08 3.58 2.26 2.29 10.16 16.88 17.84 13.05 21.39 25.58 19.14 28.28 23.25 23.84 23.17 19.13 22.08 19.64 33.6 25.85 13.53 9.03 20.73 30.56 15.64 22.05
Sro190_g081710.1 (Contig3488.g27046)
 0.16 0.81 0.76 0.28 0.36 1.28 4.27 1.91 1.55 5.57 3.47 8.17 10.95 4.65 4.45 6.59 2.78 4.15 4.92 13.8 7.47 1.63 1.3 4.01 6.99 4.31 3.54
Sro1950_g307370.1 (Contig2536.g20694)
 0.35 0.48 0.28 0.0 0.1 1.6 3.31 2.33 0.63 5.5 7.28 7.39 12.82 3.39 6.65 8.49 6.1 7.29 9.73 13.19 5.51 2.5 0.22 3.95 6.18 3.72 5.35
Sro1_g000560.1 (Contig3007.g23971)
 1.44 3.23 1.67 5.22 3.73 11.72 18.79 13.57 5.07 22.8 16.97 28.24 20.65 20.68 23.7 37.61 7.43 23.75 22.54 23.68 29.99 12.22 2.91 18.51 23.19 20.12 20.93
Sro2001_g310330.1 (Contig2691.g21734)
 0.04 3.62 6.33 5.29 3.98 2.81 6.1 6.63 1.98 8.0 8.85 7.29 16.45 4.96 9.19 11.53 5.22 10.21 7.35 12.91 8.57 3.97 1.62 7.95 8.41 6.27 9.37
Sro2074_g313500.1 (Contig2765.g22269)
 0.04 0.07 0.11 0.17 0.1 0.59 1.55 1.29 0.46 2.62 2.25 2.62 1.97 1.8 3.92 7.35 1.4 2.06 1.46 1.59 3.43 0.27 0.13 1.95 0.95 1.38 2.58
Sro210_g087490.1 (Contig2488.g20366)
 0.08 0.36 0.43 0.43 0.29 0.81 3.0 2.74 0.95 3.25 3.28 3.22 3.38 1.79 4.79 9.43 1.94 3.33 3.02 4.89 3.46 0.67 0.65 2.81 1.92 1.89 2.84
Sro218_g090220.1 (Contig1136.g10923)
 0.23 1.4 1.44 1.97 1.68 4.18 5.54 3.18 2.52 6.68 8.02 10.02 9.67 4.47 9.67 9.13 4.65 4.52 5.08 8.42 6.45 0.84 0.94 5.23 5.83 3.16 7.05
Sro229_g093070.1 (Contig429.g5811)
 0.03 0.58 0.14 0.17 0.22 0.27 1.17 0.89 0.12 2.16 1.66 1.77 2.7 1.74 1.88 4.06 1.56 2.35 1.98 3.46 3.22 0.39 0.18 1.28 1.9 0.47 2.68
Sro235_g094820.1 (Contig114.g1317)
 0.59 3.28 3.11 1.37 1.87 8.36 15.12 11.81 5.62 15.2 14.39 19.22 26.91 15.5 16.64 12.92 11.26 12.05 14.13 22.66 15.96 8.53 4.59 20.0 22.53 14.48 11.36
Sro245_g097560.1 (Contig3087.g24627)
 1.09 3.99 2.39 2.15 2.34 10.4 13.44 7.42 4.95 25.57 20.67 29.64 29.21 21.33 27.77 46.05 15.99 44.91 44.4 30.34 35.43 8.63 4.42 21.02 27.78 24.33 27.89
Sro246_g097640.1 (Contig171.g1948)
 0.15 1.38 1.16 0.55 0.74 3.39 5.14 2.96 1.82 6.14 4.21 6.05 5.94 5.76 5.12 6.88 4.03 6.76 6.34 9.18 10.47 2.25 1.11 3.02 5.65 4.47 5.32
Sro2518_g330070.1 (Contig631.g7663)
 0.32 0.82 1.12 0.53 0.41 2.62 11.14 8.44 5.34 14.67 12.18 18.11 10.67 2.4 12.7 17.26 7.84 10.8 8.33 14.0 21.96 1.09 2.41 13.8 18.58 10.43 10.78
Sro253_g100010.1 (Contig3900.g29919)
 0.52 3.4 2.65 4.23 2.12 3.67 5.25 2.84 3.18 5.6 4.66 6.36 12.52 4.02 6.63 10.41 2.21 4.85 7.06 11.11 7.19 2.72 2.32 4.7 3.95 2.87 4.14
Sro2566_g331440.1 (Contig4388.g32988)
 0.11 1.55 0.77 1.08 1.7 4.69 6.68 3.76 3.99 8.88 6.81 10.6 12.13 7.65 9.29 12.88 5.7 8.53 6.69 13.74 13.63 4.31 3.31 5.25 9.5 5.52 6.87
Sro25_g016970.1 (Contig1417.g13036)
 0.55 3.24 3.18 2.54 2.24 3.55 11.32 9.26 5.19 16.04 15.59 19.46 21.45 13.26 15.95 30.27 9.88 14.37 11.23 25.09 20.29 4.6 4.18 12.68 11.78 9.22 15.22
Sro2717_g335400.1 (Contig3434.g26740)
 0.07 0.9 1.39 0.68 0.73 2.06 4.47 2.85 1.8 6.09 8.26 6.19 4.38 4.41 7.65 11.47 4.26 6.13 7.65 6.73 8.22 3.23 2.06 4.65 6.04 5.24 7.46
Sro2771_g336750.1 (Contig542.g6992)
 0.01 1.48 1.34 0.96 0.94 0.41 3.32 2.61 1.98 3.01 3.87 2.93 4.14 1.85 3.67 5.03 1.64 4.08 3.33 6.4 4.03 1.2 1.87 2.62 3.44 2.46 3.81
Sro2816_g337750.1 (Contig3061.g24361)
 0.02 0.36 0.33 0.45 0.43 0.7 1.51 0.48 0.44 2.08 1.91 2.3 4.47 1.43 2.38 4.09 1.24 2.05 1.86 4.42 2.95 1.19 0.3 0.5 1.94 0.73 1.83
Sro299_g111280.1 (Contig1218.g11430)
 0.11 0.27 0.19 0.1 0.11 2.2 4.49 2.1 2.1 6.23 4.35 6.76 10.93 9.01 5.93 7.41 3.1 5.91 3.27 10.07 6.14 1.27 0.97 4.0 5.91 3.04 5.32
Sro3203_g345180.1 (Contig1759.g15607)
 0.08 3.44 3.62 1.71 1.45 10.92 10.12 6.87 6.04 12.41 14.57 12.97 23.97 8.99 13.37 12.38 10.3 15.34 14.89 20.73 16.74 9.65 5.73 10.66 22.23 11.33 12.87
Sro324_g117590.1 (Contig590.g7397)
 0.89 1.12 1.13 0.8 0.52 3.38 6.56 6.24 2.61 9.09 9.99 11.69 10.05 5.73 9.45 12.04 5.8 7.03 7.06 12.14 11.35 1.6 1.68 6.16 7.4 5.36 6.4
Sro337_g120470.1 (Contig2800.g22505)
 0.1 0.72 0.6 1.21 0.47 2.21 5.68 3.66 1.81 8.05 10.93 10.09 8.28 8.04 10.72 14.91 9.88 8.68 10.17 12.23 9.85 2.88 1.18 6.97 9.84 5.86 8.94
Sro339_g120960.1 (Contig3791.g29102)
 0.13 0.11 0.07 0.0 0.04 0.3 1.04 0.4 0.33 1.54 0.8 1.63 1.76 1.29 1.0 2.62 1.1 2.25 1.53 2.33 2.04 0.37 0.2 0.38 1.65 0.49 0.77
Sro339_g121070.1 (Contig3791.g29113)
 0.21 0.97 0.31 0.78 0.9 0.97 3.65 2.08 1.66 4.49 5.0 4.17 7.01 3.54 6.33 8.72 5.08 3.32 4.02 7.71 6.24 2.53 1.17 3.89 4.39 2.91 4.48
Sro347_g122890.1 (Contig477.g6457)
 0.06 0.28 0.14 0.04 0.26 0.45 1.33 0.41 0.46 3.49 1.74 2.63 3.98 1.2 3.32 3.98 2.06 5.09 4.96 7.52 4.76 0.75 0.26 0.8 2.94 0.88 3.42
Sro3491_g348560.1 (Contig2068.g17716)
 0.13 0.47 0.72 0.97 0.99 5.3 6.59 5.07 1.83 9.09 11.33 7.16 11.57 6.32 10.95 13.39 6.66 11.49 11.82 13.11 10.17 4.9 2.2 5.51 7.41 7.04 9.02
Sro365_g127330.1 (Contig3612.g27907)
 0.0 0.25 0.05 0.14 0.09 0.17 0.62 0.14 0.11 0.66 0.51 0.59 1.79 0.65 0.84 1.01 0.39 0.93 0.81 1.59 1.16 0.21 0.03 0.43 0.38 0.52 0.49
Sro393_g133480.1 (Contig2258.g18679)
 0.18 0.59 0.35 0.37 0.27 0.85 4.06 2.82 1.21 5.04 5.46 5.7 5.93 4.14 4.44 5.09 3.57 4.21 4.33 6.79 7.06 3.24 1.06 5.01 8.6 5.78 4.73
Sro40_g024810.1 (Contig335.g4488)
 0.03 0.11 0.16 0.1 0.0 0.19 0.68 0.46 0.25 0.91 0.45 0.74 1.2 0.5 1.23 0.79 0.76 1.14 1.08 2.08 0.72 0.6 0.08 0.94 0.68 0.52 0.82
Sro448_g145120.1 (Contig3664.g28287)
 0.07 0.5 0.28 0.11 0.16 0.38 2.02 0.63 0.4 1.64 1.18 1.96 3.03 1.61 2.49 3.74 0.87 2.4 2.05 3.47 2.49 0.93 0.38 2.23 3.3 2.05 1.21
Sro453_g146010.1 (Contig1693.g15158)
 0.07 1.44 0.61 1.01 1.22 3.38 8.38 4.65 3.85 8.87 10.81 10.1 4.13 6.83 10.94 17.37 6.37 15.09 10.53 8.82 7.82 3.33 2.78 5.52 6.85 6.24 11.87
Sro503_g155810.1 (Contig635.g7693)
 0.21 0.69 0.71 0.42 0.36 2.63 6.12 5.15 1.83 7.09 6.76 6.06 9.06 5.69 7.26 10.55 3.53 6.67 6.22 10.51 9.85 5.04 1.26 4.84 7.62 5.31 5.48
Sro543_g163570.1 (Contig1245.g11643)
 0.0 0.4 0.0 0.08 0.22 0.78 5.82 2.31 1.54 7.95 9.83 10.33 5.48 2.73 8.27 14.33 6.88 9.25 5.76 7.92 8.89 0.74 0.54 6.95 7.77 5.35 6.26
Sro5_g004290.1 (Contig4001.g30744)
 0.0 0.68 0.45 0.4 0.44 0.85 4.38 2.69 1.04 5.79 4.6 6.71 12.01 2.63 5.94 9.21 2.97 5.69 5.66 13.21 7.6 2.0 0.63 4.83 6.95 3.96 5.02
Sro5_g004740.1 (Contig4001.g30789)
 0.11 0.42 0.47 0.05 0.18 0.77 8.86 8.33 7.92 5.47 7.83 5.23 12.76 1.66 7.4 10.52 5.58 12.22 8.26 13.1 7.42 2.46 4.2 6.06 9.1 4.8 7.63
Sro6_g005110.1 (Contig175.g2016)
 0.09 0.55 0.52 0.15 0.26 0.83 3.22 3.53 1.36 6.32 6.81 7.86 6.38 5.02 4.91 7.2 3.44 12.21 9.61 9.8 8.05 0.78 0.73 5.15 7.1 6.45 7.47
Sro750_g197000.1 (Contig993.g10035)
 0.41 2.11 2.15 1.61 1.02 2.01 4.81 2.56 0.87 7.22 6.33 11.58 13.98 6.31 7.95 12.01 4.7 3.64 7.22 11.79 10.61 4.27 1.37 6.5 6.35 5.51 7.14
Sro782_g201790.1 (Contig2391.g19603)
 0.07 0.59 0.23 0.22 0.21 2.15 3.63 3.05 2.12 3.45 5.22 2.86 7.24 2.76 5.38 6.64 3.54 3.33 4.47 7.21 4.39 3.09 1.41 3.65 4.13 2.98 3.89
Sro819_g207130.1 (Contig8.g99)
 0.46 3.54 3.04 2.85 2.92 6.75 9.54 6.46 3.97 13.1 14.05 14.0 20.03 8.61 15.78 13.24 8.76 13.15 15.32 19.4 14.82 1.88 2.46 10.16 11.05 8.95 14.87
Sro831_g208380.1 (Contig2214.g18380)
 0.2 1.61 0.78 0.45 0.41 2.33 2.33 1.36 0.68 3.08 2.5 3.17 2.34 1.94 2.45 2.76 1.89 3.92 3.02 3.62 3.41 0.54 0.69 2.57 1.86 1.9 2.85
Sro846_g210190.1 (Contig3685.g28435)
 0.02 0.15 0.08 0.08 0.09 0.46 1.49 0.51 0.7 3.64 1.79 3.43 5.74 1.54 3.0 4.87 1.68 2.1 1.27 6.35 4.02 0.03 0.12 1.92 4.28 1.74 3.12
Sro898_g217550.1 (Contig2959.g23511)
 0.04 0.17 0.0 0.02 0.0 2.19 2.5 1.07 0.59 2.34 1.84 3.0 2.1 0.47 2.28 3.59 1.48 2.21 1.02 2.37 2.94 0.08 0.17 2.5 1.88 1.69 1.93
Sro901_g218040.1 (Contig2989.g23748)
 0.03 0.42 0.18 0.47 0.12 0.14 1.13 0.84 0.42 2.72 2.09 2.62 5.38 3.14 2.87 5.98 1.02 3.61 2.56 6.15 3.67 0.15 0.37 1.51 1.41 1.36 2.91
Sro965_g225620.1 (Contig945.g9791)
 0.92 4.76 2.97 1.62 2.2 7.57 16.23 16.85 8.89 26.87 28.05 26.69 33.72 16.25 31.89 58.55 23.69 40.98 31.39 47.28 36.55 9.92 8.24 26.46 35.41 23.2 32.13

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)