Heatmap: Cluster_330 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1027_g233020.1 (Contig109.g1253)
0.01 0.01 0.03 0.05 0.04 0.15 0.45 0.36 0.19 0.62 0.64 0.8 0.71 0.34 0.65 0.9 0.47 0.53 0.4 1.0 0.77 0.02 0.12 0.4 0.6 0.23 0.41
Sro105_g053300.1 (Contig544.g7019)
0.2 0.01 0.01 0.02 0.03 0.25 0.47 0.43 0.2 0.69 0.86 0.78 0.62 0.16 0.83 0.98 0.4 0.59 0.65 0.99 1.0 0.07 0.07 0.55 0.67 0.35 0.57
Sro110_g054830.1 (Contig1501.g13706)
0.1 0.39 0.14 0.32 0.29 0.09 0.37 0.31 0.15 0.67 0.59 0.87 0.54 0.43 0.59 1.0 0.41 0.89 0.59 0.63 0.65 0.2 0.14 0.34 0.25 0.26 0.6
Sro1136_g245230.1 (Contig1812.g15975)
0.02 0.16 0.11 0.13 0.16 0.31 0.49 0.43 0.2 0.56 0.87 0.52 0.43 0.4 0.81 1.0 0.63 0.76 0.62 0.49 0.72 0.25 0.17 0.56 0.33 0.36 0.75
Sro1149_g246530.1 (Contig1585.g14397)
0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.06 0.45 0.31 0.13 0.37 0.49 0.33 0.74 0.56 0.67 0.81 0.36 0.53 0.28 0.77 0.49 0.05 0.11 0.63 1.0 0.47 0.33
Sro1193_g251220.1 (Contig4499.g33745)
0.0 0.1 0.07 0.05 0.06 0.27 0.47 0.38 0.18 0.51 0.7 0.4 0.85 0.56 0.75 0.88 0.43 0.67 0.59 1.0 0.73 0.36 0.16 0.59 0.81 0.59 0.53
Sro1197_g251570.1 (Contig496.g6705)
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.2 0.47 0.19 0.09 0.62 0.46 0.77 0.19 0.39 0.7 1.0 0.4 0.54 0.23 0.67 0.68 0.01 0.03 0.41 0.67 0.32 0.49
Sro135_g063800.1 (Contig2231.g18525)
0.01 0.06 0.05 0.03 0.03 0.08 0.34 0.14 0.12 0.39 0.41 0.42 0.83 0.33 0.42 1.0 0.25 0.4 0.52 0.6 0.45 0.14 0.08 0.42 0.24 0.18 0.52
Sro1433_g272220.1 (Contig1680.g15090)
0.01 0.14 0.07 0.08 0.15 0.06 0.18 0.08 0.1 0.51 0.3 0.61 0.72 0.46 0.42 0.67 0.31 0.6 0.62 1.0 0.64 0.3 0.03 0.26 0.31 0.22 0.42
Sro1442_g273050.1 (Contig3575.g27638)
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.3 0.14 0.07 0.45 0.37 0.38 0.64 0.52 0.57 0.94 0.37 0.41 0.17 0.75 0.7 0.11 0.05 0.49 1.0 0.34 0.43
Sro1546_g281440.1 (Contig1075.g10451)
0.06 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.41 0.24 0.15 0.46 0.41 0.53 0.23 0.19 0.66 1.0 0.28 0.52 0.29 0.37 0.67 0.02 0.1 0.34 0.28 0.27 0.42
Sro1604_g285390.1 (Contig23.g166)
0.0 0.06 0.03 0.03 0.03 0.32 0.52 0.34 0.09 0.6 0.41 0.49 1.0 0.87 0.48 0.56 0.49 0.57 0.44 0.85 0.83 0.14 0.12 0.51 0.96 0.4 0.44
Sro1611_g285900.1 (Contig2477.g20237)
0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.07 0.31 0.19 0.15 0.46 0.43 0.49 0.64 0.31 0.51 0.6 0.37 0.38 0.44 1.0 0.57 0.07 0.06 0.35 0.46 0.2 0.39
Sro1701_g292210.1 (Contig516.g6814)
0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.13 0.16 0.3 0.1 0.45 0.65 0.36 0.14 0.18 0.78 1.0 0.46 0.53 0.82 0.41 0.8 0.1 0.08 0.27 0.24 0.48 0.92
Sro170_g075310.1 (Contig2525.g20604)
0.02 0.26 0.12 0.14 0.16 0.04 0.32 0.29 0.1 0.44 0.33 0.51 0.49 0.34 0.5 1.0 0.22 0.48 0.53 0.51 0.72 0.23 0.07 0.27 0.39 0.3 0.39
Sro1787_g297470.1 (Contig4564.g34100)
0.05 0.04 0.03 0.03 0.03 0.11 0.39 0.14 0.14 0.51 0.54 0.52 0.8 0.39 0.6 0.84 0.41 0.39 0.38 0.94 0.76 0.04 0.09 0.54 1.0 0.39 0.42
Sro1869_g302660.1 (Contig2175.g18177)
0.05 0.04 0.06 0.03 0.03 0.09 0.55 0.32 0.15 0.44 0.38 0.36 0.74 0.29 0.76 0.82 0.25 0.56 0.39 0.89 0.58 0.43 0.12 0.76 1.0 0.65 0.39
Sro1888_g303640.1 (Contig4582.g34237)
0.02 0.21 0.11 0.07 0.07 0.3 0.5 0.53 0.39 0.64 0.76 0.57 0.84 0.69 0.71 0.69 0.57 0.66 0.58 1.0 0.77 0.4 0.27 0.62 0.91 0.47 0.66
Sro190_g081710.1 (Contig3488.g27046)
0.01 0.06 0.06 0.02 0.03 0.09 0.31 0.14 0.11 0.4 0.25 0.59 0.79 0.34 0.32 0.48 0.2 0.3 0.36 1.0 0.54 0.12 0.09 0.29 0.51 0.31 0.26
Sro1950_g307370.1 (Contig2536.g20694)
0.03 0.04 0.02 0.0 0.01 0.12 0.25 0.18 0.05 0.42 0.55 0.56 0.97 0.26 0.5 0.64 0.46 0.55 0.74 1.0 0.42 0.19 0.02 0.3 0.47 0.28 0.41
Sro1_g000560.1 (Contig3007.g23971)
0.04 0.09 0.04 0.14 0.1 0.31 0.5 0.36 0.13 0.61 0.45 0.75 0.55 0.55 0.63 1.0 0.2 0.63 0.6 0.63 0.8 0.33 0.08 0.49 0.62 0.53 0.56
Sro2001_g310330.1 (Contig2691.g21734)
0.0 0.22 0.38 0.32 0.24 0.17 0.37 0.4 0.12 0.49 0.54 0.44 1.0 0.3 0.56 0.7 0.32 0.62 0.45 0.78 0.52 0.24 0.1 0.48 0.51 0.38 0.57
Sro2074_g313500.1 (Contig2765.g22269)
0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.08 0.21 0.18 0.06 0.36 0.31 0.36 0.27 0.25 0.53 1.0 0.19 0.28 0.2 0.22 0.47 0.04 0.02 0.27 0.13 0.19 0.35
Sro210_g087490.1 (Contig2488.g20366)
0.01 0.04 0.05 0.05 0.03 0.09 0.32 0.29 0.1 0.34 0.35 0.34 0.36 0.19 0.51 1.0 0.21 0.35 0.32 0.52 0.37 0.07 0.07 0.3 0.2 0.2 0.3
Sro218_g090220.1 (Contig1136.g10923)
0.02 0.14 0.14 0.2 0.17 0.42 0.55 0.32 0.25 0.67 0.8 1.0 0.97 0.45 0.97 0.91 0.46 0.45 0.51 0.84 0.64 0.08 0.09 0.52 0.58 0.32 0.7
Sro229_g093070.1 (Contig429.g5811)
0.01 0.14 0.04 0.04 0.06 0.07 0.29 0.22 0.03 0.53 0.41 0.44 0.66 0.43 0.46 1.0 0.38 0.58 0.49 0.85 0.79 0.1 0.04 0.32 0.47 0.12 0.66
Sro235_g094820.1 (Contig114.g1317)
0.02 0.12 0.12 0.05 0.07 0.31 0.56 0.44 0.21 0.56 0.53 0.71 1.0 0.58 0.62 0.48 0.42 0.45 0.53 0.84 0.59 0.32 0.17 0.74 0.84 0.54 0.42
Sro245_g097560.1 (Contig3087.g24627)
0.02 0.09 0.05 0.05 0.05 0.23 0.29 0.16 0.11 0.56 0.45 0.64 0.63 0.46 0.6 1.0 0.35 0.98 0.96 0.66 0.77 0.19 0.1 0.46 0.6 0.53 0.61
Sro246_g097640.1 (Contig171.g1948)
0.01 0.13 0.11 0.05 0.07 0.32 0.49 0.28 0.17 0.59 0.4 0.58 0.57 0.55 0.49 0.66 0.38 0.65 0.61 0.88 1.0 0.21 0.11 0.29 0.54 0.43 0.51
Sro2518_g330070.1 (Contig631.g7663)
0.01 0.04 0.05 0.02 0.02 0.12 0.51 0.38 0.24 0.67 0.55 0.82 0.49 0.11 0.58 0.79 0.36 0.49 0.38 0.64 1.0 0.05 0.11 0.63 0.85 0.48 0.49
Sro253_g100010.1 (Contig3900.g29919)
0.04 0.27 0.21 0.34 0.17 0.29 0.42 0.23 0.25 0.45 0.37 0.51 1.0 0.32 0.53 0.83 0.18 0.39 0.56 0.89 0.57 0.22 0.18 0.38 0.32 0.23 0.33
Sro2566_g331440.1 (Contig4388.g32988)
0.01 0.11 0.06 0.08 0.12 0.34 0.49 0.27 0.29 0.65 0.5 0.77 0.88 0.56 0.68 0.94 0.41 0.62 0.49 1.0 0.99 0.31 0.24 0.38 0.69 0.4 0.5
Sro25_g016970.1 (Contig1417.g13036)
0.02 0.11 0.11 0.08 0.07 0.12 0.37 0.31 0.17 0.53 0.51 0.64 0.71 0.44 0.53 1.0 0.33 0.47 0.37 0.83 0.67 0.15 0.14 0.42 0.39 0.3 0.5
Sro2717_g335400.1 (Contig3434.g26740)
0.01 0.08 0.12 0.06 0.06 0.18 0.39 0.25 0.16 0.53 0.72 0.54 0.38 0.38 0.67 1.0 0.37 0.53 0.67 0.59 0.72 0.28 0.18 0.41 0.53 0.46 0.65
Sro2771_g336750.1 (Contig542.g6992)
0.0 0.23 0.21 0.15 0.15 0.06 0.52 0.41 0.31 0.47 0.6 0.46 0.65 0.29 0.57 0.79 0.26 0.64 0.52 1.0 0.63 0.19 0.29 0.41 0.54 0.38 0.6
Sro2816_g337750.1 (Contig3061.g24361)
0.01 0.08 0.07 0.1 0.1 0.16 0.34 0.11 0.1 0.47 0.43 0.51 1.0 0.32 0.53 0.91 0.28 0.46 0.42 0.99 0.66 0.27 0.07 0.11 0.43 0.16 0.41
Sro299_g111280.1 (Contig1218.g11430)
0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.2 0.41 0.19 0.19 0.57 0.4 0.62 1.0 0.82 0.54 0.68 0.28 0.54 0.3 0.92 0.56 0.12 0.09 0.37 0.54 0.28 0.49
Sro3203_g345180.1 (Contig1759.g15607)
0.0 0.14 0.15 0.07 0.06 0.46 0.42 0.29 0.25 0.52 0.61 0.54 1.0 0.38 0.56 0.52 0.43 0.64 0.62 0.87 0.7 0.4 0.24 0.44 0.93 0.47 0.54
Sro324_g117590.1 (Contig590.g7397)
0.07 0.09 0.09 0.07 0.04 0.28 0.54 0.51 0.21 0.75 0.82 0.96 0.83 0.47 0.78 0.99 0.48 0.58 0.58 1.0 0.93 0.13 0.14 0.51 0.61 0.44 0.53
Sro337_g120470.1 (Contig2800.g22505)
0.01 0.05 0.04 0.08 0.03 0.15 0.38 0.25 0.12 0.54 0.73 0.68 0.56 0.54 0.72 1.0 0.66 0.58 0.68 0.82 0.66 0.19 0.08 0.47 0.66 0.39 0.6
Sro339_g120960.1 (Contig3791.g29102)
0.05 0.04 0.03 0.0 0.02 0.12 0.4 0.15 0.13 0.59 0.31 0.62 0.67 0.49 0.38 1.0 0.42 0.86 0.58 0.89 0.78 0.14 0.08 0.14 0.63 0.19 0.29
Sro339_g121070.1 (Contig3791.g29113)
0.02 0.11 0.04 0.09 0.1 0.11 0.42 0.24 0.19 0.52 0.57 0.48 0.8 0.41 0.73 1.0 0.58 0.38 0.46 0.88 0.72 0.29 0.13 0.45 0.5 0.33 0.51
Sro347_g122890.1 (Contig477.g6457)
0.01 0.04 0.02 0.01 0.03 0.06 0.18 0.05 0.06 0.46 0.23 0.35 0.53 0.16 0.44 0.53 0.27 0.68 0.66 1.0 0.63 0.1 0.03 0.11 0.39 0.12 0.46
Sro3491_g348560.1 (Contig2068.g17716)
0.01 0.04 0.05 0.07 0.07 0.4 0.49 0.38 0.14 0.68 0.85 0.53 0.86 0.47 0.82 1.0 0.5 0.86 0.88 0.98 0.76 0.37 0.16 0.41 0.55 0.53 0.67
Sro365_g127330.1 (Contig3612.g27907)
0.0 0.14 0.03 0.08 0.05 0.09 0.35 0.08 0.06 0.37 0.29 0.33 1.0 0.36 0.47 0.56 0.22 0.52 0.45 0.88 0.65 0.12 0.01 0.24 0.21 0.29 0.28
Sro393_g133480.1 (Contig2258.g18679)
0.02 0.07 0.04 0.04 0.03 0.1 0.47 0.33 0.14 0.59 0.64 0.66 0.69 0.48 0.52 0.59 0.41 0.49 0.5 0.79 0.82 0.38 0.12 0.58 1.0 0.67 0.55
Sro40_g024810.1 (Contig335.g4488)
0.01 0.06 0.08 0.05 0.0 0.09 0.33 0.22 0.12 0.44 0.22 0.36 0.58 0.24 0.59 0.38 0.37 0.55 0.52 1.0 0.35 0.29 0.04 0.45 0.33 0.25 0.39
Sro448_g145120.1 (Contig3664.g28287)
0.02 0.13 0.07 0.03 0.04 0.1 0.54 0.17 0.11 0.44 0.32 0.52 0.81 0.43 0.66 1.0 0.23 0.64 0.55 0.93 0.67 0.25 0.1 0.59 0.88 0.55 0.32
Sro453_g146010.1 (Contig1693.g15158)
0.0 0.08 0.03 0.06 0.07 0.19 0.48 0.27 0.22 0.51 0.62 0.58 0.24 0.39 0.63 1.0 0.37 0.87 0.61 0.51 0.45 0.19 0.16 0.32 0.39 0.36 0.68
Sro503_g155810.1 (Contig635.g7693)
0.02 0.07 0.07 0.04 0.03 0.25 0.58 0.49 0.17 0.67 0.64 0.57 0.86 0.54 0.69 1.0 0.33 0.63 0.59 1.0 0.93 0.48 0.12 0.46 0.72 0.5 0.52
Sro543_g163570.1 (Contig1245.g11643)
0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.05 0.41 0.16 0.11 0.55 0.69 0.72 0.38 0.19 0.58 1.0 0.48 0.65 0.4 0.55 0.62 0.05 0.04 0.48 0.54 0.37 0.44
Sro5_g004290.1 (Contig4001.g30744)
0.0 0.05 0.03 0.03 0.03 0.06 0.33 0.2 0.08 0.44 0.35 0.51 0.91 0.2 0.45 0.7 0.22 0.43 0.43 1.0 0.58 0.15 0.05 0.37 0.53 0.3 0.38
Sro5_g004740.1 (Contig4001.g30789)
0.01 0.03 0.04 0.0 0.01 0.06 0.68 0.64 0.6 0.42 0.6 0.4 0.97 0.13 0.56 0.8 0.43 0.93 0.63 1.0 0.57 0.19 0.32 0.46 0.69 0.37 0.58
Sro6_g005110.1 (Contig175.g2016)
0.01 0.05 0.04 0.01 0.02 0.07 0.26 0.29 0.11 0.52 0.56 0.64 0.52 0.41 0.4 0.59 0.28 1.0 0.79 0.8 0.66 0.06 0.06 0.42 0.58 0.53 0.61
Sro750_g197000.1 (Contig993.g10035)
0.03 0.15 0.15 0.12 0.07 0.14 0.34 0.18 0.06 0.52 0.45 0.83 1.0 0.45 0.57 0.86 0.34 0.26 0.52 0.84 0.76 0.31 0.1 0.46 0.45 0.39 0.51
Sro782_g201790.1 (Contig2391.g19603)
0.01 0.08 0.03 0.03 0.03 0.3 0.5 0.42 0.29 0.48 0.72 0.39 1.0 0.38 0.74 0.92 0.49 0.46 0.62 1.0 0.61 0.43 0.2 0.5 0.57 0.41 0.54
Sro819_g207130.1 (Contig8.g99)
0.02 0.18 0.15 0.14 0.15 0.34 0.48 0.32 0.2 0.65 0.7 0.7 1.0 0.43 0.79 0.66 0.44 0.66 0.77 0.97 0.74 0.09 0.12 0.51 0.55 0.45 0.74
Sro831_g208380.1 (Contig2214.g18380)
0.05 0.41 0.2 0.12 0.1 0.6 0.59 0.35 0.17 0.79 0.64 0.81 0.6 0.49 0.62 0.7 0.48 1.0 0.77 0.92 0.87 0.14 0.18 0.66 0.48 0.48 0.73
Sro846_g210190.1 (Contig3685.g28435)
0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.07 0.23 0.08 0.11 0.57 0.28 0.54 0.9 0.24 0.47 0.77 0.27 0.33 0.2 1.0 0.63 0.0 0.02 0.3 0.67 0.27 0.49
Sro898_g217550.1 (Contig2959.g23511)
0.01 0.05 0.0 0.01 0.0 0.61 0.69 0.3 0.16 0.65 0.51 0.84 0.58 0.13 0.63 1.0 0.41 0.61 0.28 0.66 0.82 0.02 0.05 0.7 0.52 0.47 0.54
Sro901_g218040.1 (Contig2989.g23748)
0.0 0.07 0.03 0.08 0.02 0.02 0.18 0.14 0.07 0.44 0.34 0.43 0.87 0.51 0.47 0.97 0.17 0.59 0.42 1.0 0.6 0.02 0.06 0.25 0.23 0.22 0.47
Sro965_g225620.1 (Contig945.g9791)
0.02 0.08 0.05 0.03 0.04 0.13 0.28 0.29 0.15 0.46 0.48 0.46 0.58 0.28 0.54 1.0 0.4 0.7 0.54 0.81 0.62 0.17 0.14 0.45 0.6 0.4 0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)