1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_255 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro104_g052720.1 (Contig1278.g11915)
 0.02 0.05 0.02 0.08 0.1 0.16 0.43 0.18 0.1 0.65 0.52 0.84 0.55 0.91 0.68 1.0 0.53 0.42 0.29 0.58 0.8 0.19 0.14 0.38 0.32 0.3 0.31
Sro1069_g237620.1 (Contig3505.g27161)
 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.22 0.19 0.02 0.48 0.22 0.6 0.27 0.5 0.41 0.54 0.28 0.45 0.26 0.62 1.0 0.19 0.05 0.24 0.25 0.42 0.3
Sro107_g053980.1 (Contig1548.g14073)
 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.2 0.08 0.02 0.4 0.14 0.56 0.27 0.25 0.25 0.57 0.2 0.18 0.13 0.55 1.0 0.01 0.01 0.3 0.23 0.19 0.18
Sro1091_g240230.1 (Contig2884.g23024)
 0.01 0.13 0.32 0.09 0.05 0.1 0.42 0.23 0.16 0.56 0.44 0.72 0.27 0.85 0.43 0.48 0.46 0.43 0.31 0.59 1.0 0.46 0.24 0.46 0.44 0.62 0.31
Sro125_g060040.1 (Contig2833.g22715)
 0.02 0.2 0.35 0.18 0.19 0.33 0.35 0.09 0.17 0.52 0.28 0.56 0.6 0.5 0.33 0.47 0.3 0.33 0.41 0.81 1.0 0.31 0.14 0.34 0.57 0.39 0.28
Sro1267_g257720.1 (Contig3174.g25105)
 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.03 0.22 0.09 0.08 0.41 0.28 0.51 0.3 1.0 0.39 0.66 0.42 0.17 0.11 0.45 0.68 0.09 0.06 0.24 0.29 0.31 0.23
Sro137_g064520.1 (Contig3969.g30467)
 0.02 0.05 0.03 0.04 0.03 0.24 0.31 0.21 0.1 0.66 0.49 0.98 0.33 0.91 0.59 0.79 0.47 0.49 0.37 0.56 1.0 0.25 0.18 0.41 0.38 0.47 0.43
Sro137_g064550.1 (Contig3969.g30470)
 0.01 0.04 0.23 0.05 0.02 0.07 0.21 0.17 0.05 0.49 0.39 0.55 0.35 0.39 0.41 0.57 0.37 0.42 0.36 0.66 1.0 0.3 0.1 0.28 0.31 0.47 0.47
Sro142_g066340.1 (Contig226.g2683)
 0.0 0.07 0.04 0.03 0.04 0.16 0.45 0.17 0.12 0.52 0.44 0.59 0.57 1.0 0.4 0.5 0.34 0.41 0.34 0.62 0.77 0.18 0.12 0.44 0.6 0.38 0.34
Sro150_g068840.1 (Contig1519.g13847)
 0.01 0.02 0.16 0.02 0.02 0.03 0.22 0.17 0.05 0.55 0.52 0.69 0.3 0.42 0.51 1.0 0.44 0.54 0.44 0.76 0.88 0.19 0.07 0.41 0.58 0.45 0.33
Sro151_g069180.1 (Contig294.g3844)
 0.23 0.16 0.09 0.06 0.1 0.15 0.21 0.16 0.09 0.64 0.31 0.76 0.48 0.91 0.45 0.71 0.42 0.27 0.26 0.64 1.0 0.34 0.12 0.17 0.1 0.2 0.37
Sro1527_g279840.1 (Contig3630.g28054)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.25 0.05 0.12 0.37 0.19 0.45 0.3 0.27 0.33 0.82 0.14 0.15 0.2 0.36 1.0 0.05 0.08 0.29 0.28 0.19 0.14
Sro154_g070030.1 (Contig2716.g21881)
 0.01 0.1 0.06 0.12 0.1 0.06 0.34 0.11 0.06 0.64 0.42 0.82 0.49 0.91 0.44 0.41 0.45 0.27 0.36 0.96 1.0 0.17 0.06 0.31 0.68 0.39 0.33
Sro156_g070820.1 (Contig473.g6420)
 0.06 0.11 0.1 0.17 0.19 0.09 0.2 0.15 0.14 0.67 0.47 0.74 0.6 1.0 0.37 0.59 0.52 0.39 0.73 0.86 1.0 0.35 0.14 0.19 0.18 0.42 0.36
Sro1570_g283250.1 (Contig4602.g34362)
 0.01 0.03 0.03 0.02 0.04 0.06 0.19 0.13 0.12 0.42 0.21 0.52 0.36 1.0 0.32 0.55 0.25 0.22 0.27 0.56 0.85 0.36 0.17 0.2 0.36 0.42 0.23
Sro1649_g288640.1 (Contig3529.g27274)
 0.84 0.03 0.03 0.0 0.02 0.14 0.41 0.13 0.13 0.51 0.25 0.58 0.4 0.72 0.39 0.53 0.25 0.64 0.68 0.52 1.0 0.2 0.06 0.42 0.49 0.51 0.22
Sro169_g075040.1 (Contig4412.g33124)
 0.03 0.03 0.02 0.0 0.02 0.05 0.2 0.15 0.1 0.51 0.32 0.81 0.37 0.53 0.38 0.57 0.33 0.31 0.43 0.54 1.0 0.36 0.17 0.3 0.45 0.58 0.32
Sro174_g076480.1 (Contig4298.g32432)
 0.01 0.05 0.03 0.05 0.03 0.09 0.33 0.11 0.19 0.52 0.41 0.79 0.71 0.63 0.37 0.38 0.6 0.36 0.39 1.0 0.76 0.23 0.16 0.39 0.49 0.45 0.31
Sro1789_g297680.1 (Contig4569.g34132)
 0.01 0.01 0.04 0.03 0.06 0.03 0.17 0.12 0.1 0.5 0.15 0.71 0.47 0.34 0.24 0.28 0.35 0.33 0.35 0.84 1.0 0.08 0.03 0.15 0.23 0.33 0.17
Sro185_g080340.1 (Contig1228.g11509)
 0.02 0.21 0.11 0.09 0.11 0.15 0.34 0.39 0.13 0.46 0.29 0.5 0.49 0.4 0.29 0.29 0.15 0.28 0.26 0.61 1.0 0.23 0.1 0.26 0.25 0.23 0.33
Sro1860_g302130.1 (Contig183.g2121)
 0.04 0.11 0.12 0.07 0.08 0.01 0.09 0.14 0.12 0.42 0.15 0.71 0.36 0.26 0.19 0.28 0.29 0.37 0.21 0.6 1.0 0.16 0.09 0.33 0.26 0.29 0.22
0.31 0.09 0.17 0.02 0.06 0.06 0.16 0.12 0.16 0.43 0.21 0.54 0.26 0.28 0.24 0.47 0.24 0.36 0.23 0.47 1.0 0.18 0.05 0.16 0.25 0.17 0.17
Sro19_g013730.1 (Contig446.g6037)
 0.05 0.17 0.07 0.06 0.1 0.29 0.4 0.33 0.22 0.71 0.61 0.99 0.54 0.91 0.68 0.61 0.48 0.57 0.45 0.64 0.99 0.36 0.38 0.67 1.0 0.73 0.45
Sro202_g085500.1 (Contig1673.g15057)
 0.02 0.12 0.05 0.03 0.05 0.25 0.3 0.1 0.09 0.67 0.42 0.76 0.35 0.51 0.48 0.5 0.32 0.34 0.46 0.74 1.0 0.12 0.14 0.32 0.53 0.42 0.39
Sro2085_g313810.1 (Contig3037.g24217)
 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.14 0.46 0.2 0.12 0.6 0.32 0.76 0.66 1.0 0.41 0.42 0.28 0.45 0.45 0.87 0.89 0.19 0.09 0.44 0.66 0.46 0.26
Sro236_g095060.1 (Contig1410.g12944)
 0.01 0.16 0.09 0.12 0.1 0.07 0.28 0.11 0.04 0.46 0.25 0.52 0.39 0.69 0.29 0.33 0.28 0.23 0.25 0.75 1.0 0.24 0.06 0.38 0.5 0.44 0.27
Sro23_g015890.1 (Contig2259.g18739)
 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.07 0.29 0.23 0.06 0.48 0.27 0.49 0.39 0.64 0.36 0.38 0.23 0.37 0.3 0.73 1.0 0.3 0.09 0.36 0.5 0.51 0.28
Sro246_g097850.1 (Contig171.g1969)
 0.0 0.1 0.14 0.16 0.13 0.05 0.39 0.22 0.15 0.5 0.24 0.56 0.46 0.62 0.39 0.55 0.27 0.29 0.37 0.81 1.0 0.33 0.13 0.39 0.67 0.35 0.21
Sro250_g098870.1 (Contig1989.g17003)
 0.09 0.06 0.07 0.03 0.03 0.16 0.37 0.23 0.14 0.57 0.43 0.63 0.25 0.66 0.41 0.43 0.44 0.42 0.41 0.81 1.0 0.41 0.18 0.45 0.31 0.43 0.35
Sro250_g098990.1 (Contig1989.g17015)
 0.01 0.02 0.04 0.24 0.12 0.03 0.23 0.2 0.11 0.48 0.16 0.62 0.33 0.51 0.32 0.44 0.18 0.4 0.26 0.93 1.0 0.45 0.15 0.4 0.55 0.57 0.23
0.03 0.15 0.05 0.16 0.15 0.21 0.39 0.13 0.12 0.63 0.6 0.78 0.74 1.0 0.49 0.57 0.46 0.42 0.49 0.8 0.7 0.09 0.1 0.29 0.26 0.27 0.36
Sro2742_g336030.1 (Contig4261.g32251)
 0.0 0.17 0.12 0.21 0.21 0.2 0.21 0.06 0.16 0.54 0.62 0.67 0.9 0.82 0.48 0.71 0.42 0.49 0.68 1.0 0.84 0.25 0.17 0.13 0.12 0.16 0.26
Sro285_g108070.1 (Contig491.g6613)
 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.2 0.11 0.06 0.54 0.46 0.67 0.29 0.87 0.41 0.54 0.3 0.36 0.29 0.56 1.0 0.07 0.04 0.4 0.26 0.2 0.26
Sro32_g021040.1 (Contig3715.g28577)
 0.02 0.13 0.18 0.14 0.18 0.09 0.42 0.26 0.15 0.51 0.23 0.51 0.43 0.53 0.34 0.57 0.26 0.17 0.28 0.56 1.0 0.25 0.19 0.41 0.68 0.39 0.3
Sro32_g021130.1 (Contig3715.g28586)
 0.0 0.02 0.01 0.01 0.04 0.07 0.35 0.13 0.07 0.6 0.11 0.74 0.34 0.63 0.36 0.56 0.2 0.42 0.33 0.77 1.0 0.12 0.11 0.29 0.72 0.45 0.27
Sro332_g119290.1 (Contig1165.g11116)
 0.93 0.17 0.24 0.11 0.12 0.33 0.61 0.47 0.36 0.7 0.62 0.92 0.47 0.71 0.63 0.48 0.48 0.64 0.51 0.61 1.0 0.25 0.41 0.84 0.94 0.51 0.37
Sro408_g136890.1 (Contig3193.g25224)
 0.0 0.02 0.0 0.03 0.06 0.12 0.35 0.15 0.04 0.41 0.38 0.55 0.5 1.0 0.49 0.72 0.43 0.19 0.24 0.6 0.54 0.08 0.03 0.28 0.37 0.21 0.24
Sro408_g136900.1 (Contig3193.g25225)
 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.09 0.32 0.08 0.0 0.38 0.3 0.41 0.46 1.0 0.35 0.51 0.3 0.18 0.23 0.45 0.53 0.17 0.01 0.43 0.34 0.2 0.15
Sro414_g138300.1 (Contig453.g6105)
 0.01 0.04 0.18 0.04 0.04 0.14 0.28 0.2 0.16 0.59 0.47 0.79 0.43 0.5 0.48 0.69 0.4 0.44 0.43 0.7 1.0 0.29 0.16 0.38 0.52 0.5 0.4
Sro453_g146070.1 (Contig1693.g15164)
 0.01 0.06 0.23 0.07 0.04 0.03 0.17 0.16 0.07 0.55 0.44 0.69 0.46 0.33 0.52 0.8 0.41 0.66 0.5 1.0 1.0 0.19 0.09 0.41 0.45 0.49 0.48
Sro457_g146880.1 (Contig1832.g16117)
 0.02 0.05 0.01 0.02 0.01 0.15 0.39 0.09 0.1 0.59 0.25 0.75 0.65 1.0 0.54 0.9 0.26 0.31 0.39 0.82 0.88 0.16 0.06 0.31 0.39 0.34 0.18
Sro495_g154400.1 (Contig3243.g25620)
 0.01 0.06 0.17 0.05 0.04 0.06 0.23 0.16 0.06 0.58 0.46 0.74 0.31 0.6 0.41 0.65 0.51 0.34 0.45 0.87 1.0 0.36 0.15 0.35 0.5 0.48 0.43
Sro514_g158050.1 (Contig3991.g30646)
 0.01 0.03 0.06 0.0 0.06 0.08 0.4 0.12 0.04 0.63 0.33 1.0 0.35 0.66 0.5 0.55 0.27 0.37 0.2 0.55 0.93 0.03 0.03 0.26 0.32 0.31 0.24
Sro54_g031850.1 (Contig2430.g19873)
 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.13 0.36 0.17 0.11 0.53 0.34 0.63 0.6 1.0 0.4 0.41 0.29 0.48 0.49 0.91 0.68 0.28 0.12 0.39 0.31 0.24 0.34
Sro675_g185500.1 (Contig1040.g10288)
 0.06 0.03 0.01 0.02 0.05 0.09 0.18 0.21 0.09 0.54 0.16 0.75 0.21 0.8 0.37 0.52 0.26 0.44 0.18 0.39 1.0 0.15 0.1 0.2 0.29 0.22 0.11
Sro696_g188840.1 (Contig116.g1324)
 0.07 0.03 0.02 0.03 0.03 0.06 0.36 0.35 0.13 0.5 0.17 0.67 0.21 0.72 0.3 0.28 0.13 0.36 0.23 0.47 1.0 0.19 0.15 0.56 0.92 0.43 0.12
Sro70_g038840.1 (Contig3352.g26231)
 0.03 0.05 0.02 0.0 0.01 0.21 0.45 0.22 0.15 0.54 0.23 0.7 0.24 0.95 0.37 0.16 0.28 0.5 0.43 0.69 1.0 0.47 0.17 0.51 0.66 0.54 0.2
Sro756_g197790.1 (Contig3619.g27995)
 0.02 0.1 0.04 0.08 0.09 0.04 0.32 0.29 0.12 0.56 0.3 0.57 0.33 0.75 0.43 0.67 0.38 0.42 0.27 0.55 1.0 0.23 0.12 0.42 0.81 0.55 0.3
Sro767_g199540.1 (Contig2377.g19542)
 0.01 0.13 0.03 0.11 0.1 0.1 0.4 0.2 0.12 0.71 0.32 0.81 0.73 1.0 0.5 0.78 0.37 0.43 0.24 0.87 0.88 0.29 0.14 0.37 0.48 0.34 0.25
Sro807_g205320.1 (Contig531.g6918)
 0.03 0.07 0.04 0.11 0.09 0.12 0.25 0.13 0.12 0.62 0.44 0.75 0.46 1.0 0.57 0.73 0.36 0.49 0.41 0.84 0.69 0.29 0.11 0.16 0.24 0.28 0.4
Sro80_g043000.1 (Contig92.g1044)
 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.05 0.17 0.07 0.01 0.5 0.29 0.53 0.9 1.0 0.46 0.65 0.45 0.43 0.48 0.8 0.8 0.27 0.04 0.15 0.19 0.45 0.24
Sro900_g217800.1 (Contig2813.g22558)
 0.01 0.0 0.07 0.02 0.03 0.02 0.21 0.08 0.07 0.52 0.31 0.56 0.32 0.54 0.42 0.71 0.54 0.28 0.33 0.86 1.0 0.16 0.08 0.28 0.55 0.57 0.28
Sro92_g047970.1 (Contig486.g6557)
 0.01 0.09 0.05 0.04 0.03 0.15 0.33 0.07 0.04 0.58 0.32 0.72 0.47 0.91 0.46 0.48 0.35 0.32 0.35 1.0 0.9 0.13 0.07 0.32 0.67 0.46 0.31
Sro94_g048830.1 (Contig150.g1673)
 0.34 0.04 0.03 0.01 0.02 0.1 0.4 0.12 0.12 0.58 0.3 0.82 0.41 1.0 0.37 0.43 0.18 0.69 0.54 0.56 0.97 0.24 0.06 0.36 0.5 0.37 0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)