Heatmap: Cluster_255 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro104_g052720.1 (Contig1278.g11915)
0.75 1.63 0.71 2.74 3.37 5.75 15.04 6.33 3.44 22.54 18.09 29.34 19.31 31.94 23.73 34.94 18.62 14.75 10.02 20.14 27.78 6.56 4.78 13.25 11.02 10.52 10.99
Sro1069_g237620.1 (Contig3505.g27161)
0.1 0.06 0.03 0.02 0.04 0.12 1.12 1.01 0.1 2.52 1.17 3.1 1.39 2.59 2.12 2.79 1.48 2.35 1.38 3.23 5.21 0.98 0.25 1.26 1.31 2.18 1.55
Sro107_g053980.1 (Contig1548.g14073)
0.13 0.05 0.0 0.04 0.05 0.17 1.14 0.48 0.1 2.27 0.81 3.18 1.5 1.42 1.43 3.25 1.15 1.02 0.74 3.12 5.67 0.06 0.06 1.68 1.3 1.09 1.01
Sro1091_g240230.1 (Contig2884.g23024)
0.24 2.63 6.4 1.73 0.91 2.07 8.22 4.47 3.16 11.03 8.77 14.27 5.24 16.78 8.45 9.4 8.99 8.45 6.14 11.54 19.72 9.07 4.78 9.03 8.77 12.3 6.21
Sro125_g060040.1 (Contig2833.g22715)
0.27 2.6 4.52 2.32 2.36 4.15 4.42 1.19 2.16 6.56 3.62 7.12 7.68 6.39 4.23 5.98 3.76 4.2 5.17 10.25 12.73 4.01 1.81 4.27 7.27 4.97 3.57
Sro1267_g257720.1 (Contig3174.g25105)
0.45 0.4 0.17 0.23 0.22 0.47 3.01 1.19 1.09 5.56 3.88 6.91 4.12 13.65 5.31 8.95 5.77 2.32 1.53 6.2 9.28 1.23 0.84 3.28 3.94 4.23 3.09
Sro137_g064520.1 (Contig3969.g30467)
0.33 0.89 0.58 0.73 0.54 4.01 5.25 3.52 1.68 11.2 8.22 16.53 5.62 15.32 9.89 13.41 8.0 8.25 6.27 9.53 16.9 4.25 3.08 6.91 6.42 7.86 7.23
Sro137_g064550.1 (Contig3969.g30470)
0.15 0.57 3.02 0.72 0.22 0.93 2.76 2.24 0.7 6.52 5.18 7.29 4.67 5.2 5.49 7.61 4.88 5.61 4.85 8.81 13.36 4.06 1.39 3.72 4.14 6.23 6.29
Sro142_g066340.1 (Contig226.g2683)
0.0 1.63 0.9 0.68 0.82 3.75 10.3 3.99 2.78 11.81 10.07 13.44 13.09 22.87 9.16 11.38 7.7 9.38 7.85 14.25 17.6 4.2 2.8 10.0 13.7 8.66 7.67
Sro150_g068840.1 (Contig1519.g13847)
0.26 0.66 4.33 0.61 0.54 0.82 6.18 4.59 1.48 15.18 14.51 19.11 8.34 11.73 14.16 27.71 12.28 15.06 12.28 21.02 24.42 5.37 1.91 11.22 16.01 12.33 9.15
Sro151_g069180.1 (Contig294.g3844)
6.47 4.49 2.53 1.76 2.69 4.25 6.0 4.36 2.59 17.79 8.58 21.21 13.45 25.39 12.52 19.73 11.66 7.57 7.31 17.98 27.98 9.37 3.45 4.75 2.66 5.54 10.24
Sro1527_g279840.1 (Contig3630.g28054)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.06 0.22 0.5 1.55 0.79 1.9 1.28 1.12 1.38 3.45 0.61 0.65 0.84 1.54 4.22 0.2 0.33 1.21 1.2 0.8 0.59
Sro154_g070030.1 (Contig2716.g21881)
0.1 0.75 0.42 0.87 0.74 0.46 2.57 0.82 0.47 4.79 3.13 6.13 3.66 6.8 3.26 3.08 3.33 2.03 2.7 7.18 7.45 1.29 0.46 2.31 5.07 2.92 2.45
Sro156_g070820.1 (Contig473.g6420)
0.33 0.6 0.58 0.98 1.07 0.53 1.13 0.86 0.78 3.76 2.62 4.16 3.37 5.63 2.08 3.33 2.9 2.18 4.08 4.86 5.6 1.98 0.8 1.07 0.99 2.38 2.05
Sro1570_g283250.1 (Contig4602.g34362)
0.6 1.05 1.34 0.64 1.8 2.51 7.87 5.58 4.87 17.19 8.63 21.62 14.99 41.34 13.37 22.82 10.52 9.3 11.18 23.04 34.96 15.06 7.23 8.11 14.78 17.27 9.57
Sro1649_g288640.1 (Contig3529.g27274)
9.09 0.32 0.32 0.04 0.22 1.53 4.5 1.38 1.45 5.51 2.74 6.34 4.35 7.87 4.29 5.82 2.74 6.93 7.44 5.62 10.89 2.13 0.69 4.54 5.34 5.52 2.44
Sro169_g075040.1 (Contig4412.g33124)
0.65 0.65 0.47 0.1 0.41 1.25 4.89 3.67 2.48 12.27 7.72 19.4 8.92 12.82 9.02 13.71 7.85 7.4 10.33 12.94 24.03 8.77 3.99 7.24 10.83 13.92 7.77
Sro174_g076480.1 (Contig4298.g32432)
0.04 0.41 0.26 0.39 0.25 0.69 2.7 0.87 1.57 4.22 3.34 6.36 5.71 5.06 3.03 3.04 4.86 2.94 3.16 8.09 6.15 1.89 1.27 3.12 3.95 3.61 2.48
Sro1789_g297680.1 (Contig4569.g34132)
0.09 0.1 0.34 0.25 0.46 0.25 1.35 0.96 0.77 3.94 1.22 5.59 3.69 2.7 1.88 2.21 2.79 2.64 2.77 6.62 7.9 0.65 0.27 1.17 1.8 2.58 1.35
Sro185_g080340.1 (Contig1228.g11509)
0.18 1.69 0.88 0.72 0.93 1.18 2.76 3.15 1.03 3.74 2.31 4.02 3.96 3.2 2.3 2.32 1.23 2.29 2.09 4.9 8.07 1.83 0.8 2.12 1.99 1.83 2.65
Sro1860_g302130.1 (Contig183.g2121)
0.3 0.89 0.99 0.56 0.65 0.08 0.75 1.15 0.99 3.46 1.25 5.77 2.89 2.14 1.55 2.3 2.36 3.03 1.73 4.92 8.15 1.34 0.7 2.72 2.15 2.4 1.82
1.21 0.37 0.68 0.07 0.22 0.22 0.64 0.47 0.62 1.7 0.81 2.13 1.03 1.09 0.93 1.83 0.92 1.42 0.91 1.84 3.92 0.72 0.21 0.63 0.99 0.66 0.67
Sro19_g013730.1 (Contig446.g6037)
5.39 16.73 7.15 6.39 9.59 28.45 39.98 33.32 21.83 71.2 61.25 98.26 53.94 90.37 68.03 60.67 47.87 56.83 44.88 63.35 98.31 36.13 38.23 66.67 99.61 72.98 44.51
Sro202_g085500.1 (Contig1673.g15057)
0.15 0.89 0.35 0.24 0.38 1.86 2.18 0.76 0.67 4.91 3.08 5.57 2.55 3.73 3.51 3.68 2.34 2.52 3.39 5.42 7.33 0.87 1.03 2.35 3.92 3.1 2.87
Sro2085_g313810.1 (Contig3037.g24217)
0.18 0.28 0.34 0.12 0.56 2.65 8.77 3.78 2.27 11.5 6.11 14.46 12.63 19.11 7.74 8.03 5.37 8.64 8.51 16.62 16.94 3.7 1.63 8.47 12.7 8.75 5.02
Sro236_g095060.1 (Contig1410.g12944)
0.13 2.59 1.4 2.02 1.69 1.19 4.69 1.86 0.69 7.65 4.19 8.61 6.49 11.33 4.81 5.43 4.68 3.81 4.08 12.34 16.47 3.96 0.95 6.27 8.23 7.19 4.45
Sro23_g015890.1 (Contig2259.g18739)
0.16 0.23 0.38 0.11 0.1 1.28 5.26 4.06 1.09 8.65 4.78 8.72 6.96 11.42 6.54 6.72 4.07 6.64 5.42 13.17 17.92 5.29 1.67 6.46 8.9 9.09 4.96
Sro246_g097850.1 (Contig171.g1969)
0.05 1.18 1.63 1.85 1.54 0.64 4.69 2.68 1.79 6.01 2.87 6.73 5.51 7.39 4.62 6.51 3.21 3.4 4.45 9.66 11.93 3.9 1.61 4.69 8.02 4.15 2.47
Sro250_g098870.1 (Contig1989.g17003)
1.27 0.87 0.97 0.46 0.45 2.34 5.38 3.3 2.08 8.32 6.22 9.27 3.73 9.65 5.97 6.33 6.38 6.19 6.01 11.81 14.62 6.05 2.65 6.57 4.56 6.31 5.15
Sro250_g098990.1 (Contig1989.g17015)
0.14 0.3 0.53 2.98 1.55 0.35 2.92 2.52 1.36 6.0 2.06 7.84 4.19 6.45 4.03 5.52 2.27 5.07 3.22 11.72 12.57 5.63 1.9 5.08 6.92 7.11 2.9
0.2 1.01 0.37 1.13 1.06 1.48 2.72 0.87 0.81 4.35 4.13 5.4 5.13 6.92 3.42 3.96 3.18 2.92 3.39 5.55 4.81 0.61 0.66 2.02 1.78 1.86 2.47
Sro2742_g336030.1 (Contig4261.g32251)
0.03 1.94 1.32 2.42 2.37 2.27 2.42 0.66 1.79 6.2 7.15 7.62 10.28 9.39 5.48 8.08 4.86 5.65 7.75 11.45 9.6 2.84 1.96 1.43 1.42 1.85 2.97
Sro285_g108070.1 (Contig491.g6613)
0.46 0.08 0.16 0.05 0.11 0.26 1.43 0.8 0.42 3.85 3.27 4.73 2.07 6.18 2.91 3.86 2.13 2.55 2.06 3.95 7.1 0.47 0.25 2.83 1.85 1.44 1.81
Sro32_g021040.1 (Contig3715.g28577)
0.06 0.53 0.71 0.57 0.72 0.36 1.69 1.04 0.59 2.04 0.9 2.03 1.71 2.11 1.35 2.26 1.02 0.67 1.11 2.24 3.98 0.98 0.76 1.62 2.71 1.54 1.19
Sro32_g021130.1 (Contig3715.g28586)
0.03 0.15 0.1 0.09 0.27 0.46 2.47 0.89 0.46 4.22 0.74 5.14 2.35 4.36 2.52 3.91 1.4 2.95 2.3 5.36 6.98 0.86 0.77 2.02 5.05 3.15 1.86
Sro332_g119290.1 (Contig1165.g11116)
222.19 40.73 56.79 26.24 28.64 78.26 147.14 112.73 85.38 167.05 148.79 219.58 112.01 170.52 150.65 114.48 116.04 154.07 121.08 146.2 239.42 58.86 98.3 200.4 224.6 122.34 87.49
Sro408_g136890.1 (Contig3193.g25224)
0.03 0.19 0.0 0.29 0.73 1.33 4.06 1.68 0.45 4.73 4.31 6.28 5.77 11.45 5.56 8.28 4.96 2.19 2.78 6.86 6.16 0.96 0.36 3.19 4.19 2.43 2.78
Sro408_g136900.1 (Contig3193.g25225)
0.12 0.0 0.0 0.18 0.17 0.77 2.73 0.64 0.04 3.2 2.51 3.46 3.87 8.48 2.95 4.29 2.51 1.57 1.94 3.81 4.46 1.45 0.05 3.65 2.85 1.68 1.28
Sro414_g138300.1 (Contig453.g6105)
0.46 1.39 6.04 1.25 1.27 4.75 9.27 6.76 5.3 19.57 15.46 26.15 14.27 16.45 15.75 22.66 13.34 14.49 14.18 23.18 33.06 9.63 5.3 12.52 17.18 16.53 13.36
Sro453_g146070.1 (Contig1693.g15164)
0.22 1.37 5.37 1.6 0.81 0.78 3.98 3.7 1.6 12.59 10.06 15.75 10.67 7.57 11.91 18.41 9.42 15.27 11.39 22.89 22.98 4.3 2.13 9.34 10.28 11.15 10.94
Sro457_g146880.1 (Contig1832.g16117)
0.11 0.24 0.06 0.09 0.04 0.75 1.98 0.47 0.48 2.99 1.27 3.79 3.28 5.07 2.73 4.57 1.3 1.58 1.96 4.14 4.47 0.82 0.29 1.58 1.99 1.72 0.91
Sro495_g154400.1 (Contig3243.g25620)
0.04 0.53 1.43 0.38 0.34 0.48 1.88 1.35 0.46 4.72 3.74 6.05 2.57 4.91 3.36 5.34 4.16 2.78 3.69 7.11 8.19 2.92 1.25 2.84 4.12 3.94 3.48
Sro514_g158050.1 (Contig3991.g30646)
0.04 0.13 0.28 0.0 0.26 0.36 1.89 0.56 0.18 2.95 1.54 4.7 1.62 3.1 2.34 2.6 1.28 1.72 0.92 2.58 4.35 0.12 0.16 1.21 1.5 1.44 1.14
Sro54_g031850.1 (Contig2430.g19873)
0.07 0.26 0.15 0.17 0.16 1.48 4.12 1.92 1.28 6.02 3.88 7.24 6.86 11.42 4.59 4.73 3.37 5.45 5.56 10.43 7.72 3.14 1.33 4.49 3.52 2.72 3.89
Sro675_g185500.1 (Contig1040.g10288)
3.14 1.36 0.73 0.89 2.52 4.38 9.11 10.6 4.5 26.5 8.0 36.8 10.25 39.59 18.27 25.77 12.95 21.79 9.01 19.47 49.36 7.19 4.88 9.78 14.38 10.71 5.53
Sro696_g188840.1 (Contig116.g1324)
5.44 1.99 1.54 1.96 2.45 4.15 26.75 26.0 9.56 37.49 12.92 49.8 15.55 54.22 22.18 20.65 9.74 27.24 17.31 35.31 74.85 13.95 11.29 42.16 68.91 31.85 8.96
Sro70_g038840.1 (Contig3352.g26231)
0.57 0.79 0.37 0.09 0.21 3.69 7.79 3.86 2.5 9.34 3.96 12.12 4.16 16.29 6.31 2.7 4.84 8.53 7.46 11.95 17.23 8.16 2.91 8.74 11.34 9.25 3.42
Sro756_g197790.1 (Contig3619.g27995)
0.45 1.91 0.73 1.53 1.62 0.75 5.91 5.25 2.11 10.36 5.52 10.38 6.03 13.68 7.94 12.28 6.92 7.62 5.01 10.08 18.35 4.24 2.22 7.64 14.92 10.17 5.59
Sro767_g199540.1 (Contig2377.g19542)
0.14 3.35 0.89 2.99 2.64 2.61 10.51 5.17 3.18 18.71 8.48 21.31 19.16 26.38 13.14 20.62 9.86 11.45 6.43 22.87 23.15 7.61 3.76 9.83 12.73 8.89 6.73
Sro807_g205320.1 (Contig531.g6918)
0.32 0.81 0.45 1.22 1.05 1.4 2.9 1.51 1.34 7.17 5.05 8.62 5.3 11.55 6.6 8.44 4.21 5.61 4.75 9.66 8.0 3.32 1.32 1.85 2.72 3.19 4.66
Sro80_g043000.1 (Contig92.g1044)
0.04 0.1 0.0 0.06 0.05 0.18 0.65 0.25 0.05 1.85 1.07 1.96 3.37 3.73 1.73 2.44 1.67 1.61 1.78 3.0 2.97 1.02 0.15 0.57 0.7 1.67 0.9
Sro900_g217800.1 (Contig2813.g22558)
0.04 0.03 0.47 0.1 0.21 0.14 1.32 0.52 0.43 3.32 1.97 3.6 2.07 3.42 2.7 4.55 3.44 1.8 2.11 5.49 6.39 1.0 0.52 1.79 3.52 3.66 1.81
Sro92_g047970.1 (Contig486.g6557)
0.05 0.69 0.4 0.35 0.22 1.15 2.54 0.54 0.34 4.44 2.43 5.54 3.61 7.01 3.52 3.73 2.72 2.49 2.68 7.7 6.92 1.03 0.56 2.48 5.17 3.51 2.42
Sro94_g048830.1 (Contig150.g1673)
3.13 0.38 0.26 0.08 0.21 0.96 3.67 1.09 1.1 5.31 2.7 7.47 3.71 9.11 3.39 3.92 1.67 6.29 4.95 5.13 8.81 2.21 0.5 3.3 4.56 3.34 2.09

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)