Heatmap: Cluster_133 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1072_g238100.1 (Contig2124.g17940)	0.04	0.09	0.12	0.1	0.07	0.17	0.21	0.13	0.1	0.47	0.28	0.6	1.0	0.38	0.31	0.66	0.21	0.29	0.38	0.55	0.43	0.06	0.07	0.16	0.22	0.17	0.33
Sro109_g054600.1 (Contig4753.g35242)	0.02	0.21	0.12	0.14	0.16	0.2	0.3	0.2	0.21	0.44	0.33	0.5	1.0	0.56	0.43	0.66	0.24	0.29	0.42	0.74	0.64	0.22	0.18	0.2	0.19	0.22	0.37
Sro110_g054850.1 (Contig1501.g13708)	0.03	0.13	0.12	0.1	0.06	0.17	0.26	0.18	0.14	0.54	0.3	0.56	0.31	0.61	0.46	1.0	0.2	0.54	0.72	0.58	0.73	0.19	0.14	0.12	0.1	0.18	0.39
Sro111_g055440.1 (Contig567.g7221)	0.15	0.07	0.05	0.08	0.07	0.34	0.37	0.21	0.26	0.56	0.4	0.74	0.69	0.66	0.64	1.0	0.39	0.65	0.78	0.66	0.6	0.15	0.21	0.21	0.16	0.2	0.63
Sro1142_g245830.1 (Contig2104.g17872)	0.01	0.08	0.05	0.07	0.05	0.16	0.17	0.11	0.08	0.4	0.31	0.47	1.0	0.46	0.37	0.64	0.22	0.31	0.41	0.63	0.54	0.03	0.04	0.14	0.09	0.14	0.34
Sro1174_g249090.1 (Contig3404.g26598)	0.01	0.2	0.12	0.1	0.12	0.21	0.24	0.17	0.09	0.5	0.47	0.58	0.61	0.53	0.52	1.0	0.39	0.48	0.63	0.74	0.45	0.09	0.08	0.13	0.09	0.14	0.41
Sro117_g057390.1 (Contig3937.g30183)	0.02	0.21	0.15	0.16	0.09	0.17	0.2	0.12	0.08	0.49	0.37	0.55	1.0	0.48	0.39	0.58	0.23	0.35	0.52	0.56	0.56	0.04	0.07	0.2	0.2	0.17	0.46
Sro1229_g254470.1 (Contig3654.g28211)	0.02	0.16	0.12	0.07	0.07	0.24	0.2	0.15	0.11	0.59	0.5	0.67	0.65	0.6	0.6	1.0	0.31	0.63	0.96	0.85	0.59	0.15	0.09	0.17	0.06	0.2	0.51
Sro125_g060360.1 (Contig2833.g22747)	0.04	0.1	0.07	0.09	0.1	0.11	0.39	0.19	0.17	0.52	0.32	0.57	0.67	0.47	0.48	1.0	0.23	0.6	0.69	0.76	0.62	0.11	0.18	0.17	0.09	0.14	0.44
Sro128_g061290.1 (Contig1654.g14905)	0.05	0.12	0.05	0.11	0.07	0.27	0.28	0.15	0.09	0.66	0.62	0.75	1.0	0.67	0.56	0.84	0.34	0.58	0.75	0.95	0.75	0.1	0.08	0.18	0.11	0.19	0.57
Sro1582_g283810.1 (Contig2540.g20708)	0.04	0.12	0.18	0.22	0.16	0.17	0.27	0.37	0.31	0.42	0.37	0.44	1.0	0.48	0.41	0.65	0.28	0.44	0.46	0.57	0.56	0.18	0.21	0.14	0.06	0.09	0.39
Sro1617_g286300.1 (Contig2271.g18829)	0.04	0.25	0.24	0.14	0.16	0.25	0.3	0.25	0.28	0.5	0.36	0.54	1.0	0.45	0.44	0.6	0.26	0.46	0.59	0.85	0.55	0.32	0.28	0.19	0.13	0.13	0.46
Sro168_g074720.1 (Contig1642.g14803)	0.03	0.09	0.07	0.09	0.08	0.23	0.21	0.15	0.15	0.46	0.41	0.4	0.87	0.49	0.45	1.0	0.27	0.38	0.48	0.76	0.55	0.11	0.08	0.12	0.1	0.16	0.45
Sro1822_g299800.1 (Contig1026.g10232)	0.01	0.33	0.22	0.26	0.21	0.24	0.22	0.14	0.2	0.44	0.31	0.42	1.0	0.49	0.4	0.57	0.28	0.28	0.41	0.78	0.48	0.18	0.16	0.12	0.1	0.17	0.39
Sro182_g079350.1 (Contig1301.g12071)	0.16	0.17	0.3	0.21	0.18	0.27	0.44	0.35	0.44	0.5	0.33	0.57	1.0	0.52	0.49	0.78	0.3	0.57	0.57	0.66	0.56	0.29	0.41	0.27	0.32	0.22	0.46
Sro187_g080920.1 (Contig2990.g23765)	0.02	0.28	0.15	0.29	0.17	0.21	0.18	0.11	0.17	0.53	0.36	0.5	0.75	1.0	0.47	0.61	0.15	0.38	0.58	0.69	0.64	0.26	0.06	0.15	0.12	0.1	0.58
Sro189_g081580.1 (Contig744.g8522)	0.02	0.19	0.33	0.22	0.15	0.26	0.33	0.23	0.35	0.59	0.49	0.65	0.81	0.7	0.59	1.0	0.43	0.61	0.81	0.78	0.76	0.25	0.3	0.28	0.1	0.21	0.57
Sro2258_g321110.1 (Contig3445.g26798)	0.03	0.04	0.04	0.04	0.07	0.08	0.2	0.07	0.11	0.46	0.44	0.44	0.59	0.27	0.44	1.0	0.33	0.35	0.42	0.54	0.42	0.06	0.09	0.08	0.05	0.13	0.45
Sro22_g015150.1 (Contig426.g5739)	0.02	0.09	0.05	0.04	0.06	0.18	0.19	0.18	0.14	0.48	0.22	0.51	1.0	0.55	0.28	0.6	0.19	0.63	0.54	0.88	0.42	0.33	0.08	0.11	0.05	0.1	0.4
Sro2329_g323500.1 (Contig978.g9953)	0.2	0.07	0.05	0.1	0.08	0.37	0.2	0.16	0.15	0.73	0.46	1.0	0.96	1.0	0.56	0.73	0.47	0.54	0.57	0.9	0.79	0.16	0.16	0.12	0.09	0.24	0.54
Sro243_g096940.1 (Contig3073.g24518)	0.06	0.08	0.04	0.07	0.05	0.15	0.17	0.11	0.06	0.46	0.63	0.53	0.5	0.43	0.54	1.0	0.38	0.36	0.54	0.5	0.43	0.03	0.04	0.13	0.06	0.11	0.48
Sro260_g101550.1 (Contig1663.g15007)	0.03	0.22	0.34	0.27	0.28	0.23	0.28	0.22	0.21	0.52	0.51	0.63	0.75	0.47	0.59	1.0	0.35	0.62	0.75	0.58	0.55	0.13	0.18	0.26	0.22	0.25	0.58
Sro262_g102040.1 (Contig809.g9024)	0.02	0.24	0.25	0.29	0.21	0.26	0.26	0.22	0.19	0.45	0.35	0.5	1.0	0.49	0.45	0.54	0.34	0.3	0.41	0.79	0.55	0.11	0.18	0.18	0.26	0.25	0.53
Sro285_g108150.1 (Contig491.g6621)	0.03	0.38	0.31	0.47	0.47	0.33	0.33	0.25	0.14	0.62	0.51	0.74	0.65	0.57	0.57	1.0	0.53	0.64	0.85	0.95	0.62	0.08	0.12	0.17	0.1	0.17	0.55
Sro2882_g339250.1 (Contig3220.g25447)	0.03	0.06	0.08	0.11	0.09	0.08	0.2	0.1	0.13	0.39	0.39	0.36	1.0	0.64	0.45	0.63	0.44	0.47	0.63	0.84	0.67	0.1	0.12	0.24	0.23	0.34	0.28
Sro2_g001530.1 (Contig467.g6311)	0.16	0.18	0.27	0.25	0.16	0.19	0.22	0.11	0.18	0.54	0.58	0.6	0.86	0.5	0.53	1.0	0.44	0.44	0.76	0.71	0.73	0.08	0.12	0.18	0.09	0.21	0.46
Sro2_g001620.1 (Contig467.g6320)	0.01	0.14	0.11	0.13	0.09	0.29	0.28	0.16	0.1	0.55	0.29	0.66	0.75	0.61	0.5	1.0	0.22	0.53	0.66	0.63	0.61	0.08	0.08	0.19	0.08	0.15	0.5
Sro35_g022250.1 (Contig3323.g26102)	0.02	0.1	0.08	0.05	0.05	0.2	0.26	0.15	0.08	0.58	0.42	0.7	0.61	0.47	0.53	1.0	0.25	0.59	0.76	0.89	0.6	0.06	0.08	0.13	0.03	0.11	0.58
Sro417_g138730.1 (Contig2416.g19781)	0.02	0.28	0.24	0.19	0.18	0.34	0.28	0.13	0.1	0.52	0.45	0.57	0.75	0.48	0.46	0.63	0.41	0.49	0.6	1.0	0.55	0.16	0.1	0.23	0.18	0.23	0.44
Sro423_g139740.1 (Contig1760.g15611)	0.01	0.22	0.33	0.15	0.1	0.15	0.4	0.17	0.14	0.66	0.35	0.96	1.0	0.5	0.53	1.0	0.25	0.63	0.93	0.94	0.71	0.08	0.09	0.34	0.15	0.16	0.46
Sro461_g147780.1 (Contig3552.g27432)	0.06	0.19	0.13	0.13	0.17	0.08	0.15	0.15	0.13	0.46	0.36	0.62	0.59	0.31	0.42	1.0	0.2	0.34	0.46	0.54	0.48	0.08	0.09	0.05	0.05	0.11	0.37
Sro513_g157780.1 (Contig214.g2540)	0.02	0.19	0.14	0.17	0.14	0.17	0.26	0.16	0.14	0.53	0.53	0.51	0.66	0.58	0.57	1.0	0.34	0.64	0.84	0.78	0.62	0.17	0.14	0.24	0.1	0.21	0.52
Sro54_g032050.1 (Contig2430.g19893)	0.05	0.13	0.11	0.1	0.08	0.27	0.27	0.22	0.2	0.53	0.72	0.6	0.35	0.45	0.63	1.0	0.45	0.39	0.57	0.51	0.43	0.15	0.17	0.22	0.1	0.17	0.71
Sro57_g033450.2	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.23	0.16	0.09	0.05	0.64	0.55	0.72	0.67	0.78	0.59	1.0	0.37	0.55	0.89	0.86	0.73	0.05	0.06	0.11	0.02	0.15	0.58
Sro604_g174080.2	0.08	0.05	0.02	0.16	0.08	0.06	0.2	0.13	0.12	0.58	0.56	0.86	0.92	0.81	0.58	1.0	0.28	0.44	0.72	0.75	0.66	0.01	0.09	0.07	0.05	0.13	0.49
Sro649_g181220.1 (Contig1362.g12548)	0.03	0.24	0.18	0.22	0.18	0.28	0.25	0.18	0.14	0.55	0.53	0.57	1.0	0.61	0.56	0.84	0.36	0.64	0.8	0.89	0.46	0.11	0.1	0.18	0.1	0.22	0.54
Sro69_g038530.1 (Contig4677.g34762)	0.06	0.15	0.08	0.1	0.07	0.2	0.26	0.16	0.13	0.59	0.76	0.66	0.65	0.62	0.6	1.0	0.44	0.55	0.71	0.99	0.58	0.15	0.09	0.24	0.11	0.22	0.52
Sro6_g005290.1 (Contig175.g2034)	0.02	0.18	0.25	0.23	0.12	0.27	0.33	0.19	0.29	0.69	0.59	0.83	0.48	0.71	0.61	1.0	0.43	0.64	0.94	0.82	0.74	0.23	0.25	0.23	0.13	0.26	0.63
Sro714_g191680.1 (Contig596.g7421)	0.01	0.08	0.17	0.18	0.12	0.22	0.14	0.07	0.09	0.52	0.42	0.52	0.83	0.58	0.62	1.0	0.39	0.59	0.91	0.87	0.63	0.07	0.09	0.08	0.07	0.17	0.49
Sro747_g196480.1 (Contig4185.g31896)	0.04	0.04	0.02	0.04	0.03	0.11	0.17	0.1	0.06	0.44	0.37	0.44	0.48	0.56	0.45	1.0	0.27	0.47	0.57	0.47	0.6	0.05	0.05	0.11	0.04	0.14	0.35
Sro803_g204760.1 (Contig386.g5190)	0.02	0.22	0.31	0.29	0.21	0.26	0.22	0.19	0.21	0.39	0.35	0.39	1.0	0.28	0.33	0.38	0.27	0.29	0.36	0.49	0.41	0.13	0.14	0.14	0.16	0.14	0.45
Sro84_g044690.1 (Contig220.g2602)	0.05	0.23	0.16	0.18	0.13	0.26	0.3	0.18	0.19	0.53	0.45	0.61	1.0	0.55	0.44	0.68	0.35	0.37	0.56	0.77	0.53	0.18	0.13	0.2	0.18	0.25	0.4
Sro84_g044710.1 (Contig220.g2604)	0.05	0.07	0.06	0.06	0.04	0.19	0.18	0.13	0.12	0.46	0.38	0.58	1.0	0.49	0.35	0.61	0.31	0.38	0.47	0.69	0.47	0.04	0.09	0.2	0.1	0.17	0.32
Sro89_g046840.1 (Contig3846.g29605)	0.07	0.18	0.14	0.14	0.09	0.18	0.22	0.18	0.1	0.53	0.48	0.62	0.65	0.48	0.52	1.0	0.27	0.69	0.81	0.62	0.44	0.06	0.06	0.2	0.08	0.16	0.51
Sro965_g225610.1 (Contig945.g9790)	0.01	0.19	0.16	0.1	0.12	0.22	0.24	0.16	0.11	0.5	0.22	0.53	0.71	0.4	0.43	1.0	0.17	0.63	0.72	0.73	0.43	0.09	0.09	0.08	0.04	0.08	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)