Heatmap: Cluster_133 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1072_g238100.1 (Contig2124.g17940)
7.87 17.45 24.62 19.74 14.35 34.02 41.81 25.09 20.87 94.85 55.62 119.96 200.04 76.26 62.14 132.46 42.06 58.91 76.21 110.04 86.82 11.15 13.21 31.2 44.46 33.87 66.04
Sro109_g054600.1 (Contig4753.g35242)
0.64 5.85 3.44 4.13 4.67 5.75 8.42 5.56 6.04 12.41 9.44 14.16 28.51 15.86 12.24 18.69 6.85 8.21 12.05 21.15 18.13 6.29 5.17 5.71 5.32 6.14 10.42
Sro110_g054850.1 (Contig1501.g13708)
0.42 1.66 1.52 1.21 0.75 2.11 3.28 2.25 1.72 6.83 3.81 7.08 3.92 7.65 5.72 12.55 2.49 6.82 9.06 7.33 9.19 2.37 1.76 1.53 1.26 2.22 4.89
Sro111_g055440.1 (Contig567.g7221)
4.25 1.89 1.37 2.13 2.0 9.61 10.39 5.85 7.25 15.69 11.15 20.58 19.29 18.47 17.76 27.89 10.97 18.17 21.77 18.36 16.79 4.08 5.8 5.84 4.45 5.53 17.5
Sro1142_g245830.1 (Contig2104.g17872)
0.24 3.75 2.45 3.09 2.15 7.31 7.64 4.88 3.59 18.19 14.35 21.32 45.58 20.89 16.98 29.38 9.9 13.98 18.79 28.92 24.79 1.34 1.82 6.38 4.13 6.33 15.3
Sro1174_g249090.1 (Contig3404.g26598)
0.37 5.3 3.23 2.69 3.12 5.38 6.09 4.35 2.45 12.84 12.11 14.9 15.78 13.62 13.55 25.91 10.14 12.42 16.34 19.05 11.68 2.35 2.06 3.45 2.32 3.65 10.73
Sro117_g057390.1 (Contig3937.g30183)
0.29 3.56 2.59 2.67 1.54 2.84 3.41 2.07 1.31 8.38 6.4 9.53 17.19 8.18 6.76 9.96 3.93 6.07 8.93 9.58 9.69 0.67 1.25 3.35 3.47 2.94 7.9
Sro1229_g254470.1 (Contig3654.g28211)
0.27 2.93 2.2 1.18 1.19 4.42 3.6 2.79 1.97 10.61 8.99 12.0 11.78 10.89 10.86 18.04 5.53 11.43 17.36 15.37 10.61 2.74 1.7 3.13 1.11 3.64 9.16
Sro125_g060360.1 (Contig2833.g22747)
0.52 1.39 1.01 1.21 1.41 1.5 5.52 2.65 2.48 7.35 4.56 8.12 9.46 6.72 6.85 14.18 3.2 8.56 9.76 10.84 8.85 1.62 2.5 2.44 1.25 1.92 6.21
Sro128_g061290.1 (Contig1654.g14905)
1.31 3.12 1.27 2.73 1.84 6.88 7.09 3.89 2.35 16.64 15.63 18.94 25.24 16.92 14.09 21.16 8.65 14.61 18.85 24.0 18.93 2.61 1.96 4.52 2.7 4.8 14.5
Sro1582_g283810.1 (Contig2540.g20708)
9.31 26.27 38.64 46.27 34.64 36.01 57.39 79.9 66.22 89.17 78.5 95.0 214.74 103.57 87.79 139.31 59.42 94.01 98.06 123.18 121.17 38.72 44.21 29.91 13.9 20.23 83.98
Sro1617_g286300.1 (Contig2271.g18829)
1.14 7.12 6.85 4.09 4.67 7.12 8.39 7.2 7.91 14.02 10.09 15.19 28.31 12.71 12.46 17.07 7.43 12.95 16.57 24.2 15.65 9.19 7.85 5.38 3.61 3.8 12.98
Sro168_g074720.1 (Contig1642.g14803)
1.2 3.44 2.56 3.35 3.2 8.86 7.98 5.9 5.74 17.63 15.76 15.43 33.38 18.71 17.43 38.47 10.29 14.7 18.45 29.4 21.11 4.21 3.21 4.63 3.99 6.2 17.38
Sro1822_g299800.1 (Contig1026.g10232)
0.67 19.84 13.6 15.7 12.74 14.49 13.43 8.58 11.99 26.53 18.91 25.37 60.63 29.43 24.13 34.51 16.81 16.99 24.65 47.11 29.33 11.04 9.71 7.43 5.77 10.4 23.53
Sro182_g079350.1 (Contig1301.g12071)
15.28 16.64 28.88 20.06 17.03 26.47 42.28 33.76 42.71 47.71 31.67 54.78 96.36 49.63 46.74 74.78 29.35 55.37 54.45 63.33 53.77 28.0 39.62 26.45 30.47 21.18 43.87
Sro187_g080920.1 (Contig2990.g23765)
0.16 2.67 1.47 2.73 1.58 1.98 1.71 1.06 1.64 5.07 3.38 4.71 7.08 9.49 4.47 5.8 1.47 3.58 5.48 6.54 6.07 2.43 0.58 1.46 1.16 0.93 5.47
Sro189_g081580.1 (Contig744.g8522)
1.17 9.42 15.85 10.85 7.41 12.68 15.84 11.34 17.09 28.81 23.72 31.78 39.46 33.87 28.63 48.72 20.91 29.9 39.28 38.24 37.05 12.41 14.51 13.47 4.99 9.99 28.0
Sro2258_g321110.1 (Contig3445.g26798)
0.63 0.88 0.9 0.98 1.51 1.82 4.61 1.54 2.45 10.42 9.99 9.9 13.33 6.16 10.09 22.71 7.55 7.9 9.54 12.28 9.63 1.44 2.16 1.89 1.11 3.01 10.26
Sro22_g015150.1 (Contig426.g5739)
0.64 2.86 1.47 1.38 1.84 5.61 6.17 5.82 4.43 15.34 7.03 16.16 31.83 17.38 9.07 19.02 5.95 19.93 17.24 28.0 13.39 10.64 2.53 3.51 1.57 3.13 12.85
Sro2329_g323500.1 (Contig978.g9953)
3.13 1.17 0.85 1.6 1.23 5.92 3.11 2.54 2.4 11.63 7.28 15.84 15.25 15.9 8.92 11.61 7.47 8.66 8.98 14.25 12.48 2.47 2.54 1.97 1.39 3.81 8.55
Sro243_g096940.1 (Contig3073.g24518)
3.46 5.19 2.48 4.35 2.81 8.91 10.27 6.59 3.53 27.9 38.49 32.72 30.88 26.36 33.03 61.3 23.29 21.96 33.22 30.55 26.35 1.94 2.73 7.99 3.43 6.97 29.48
Sro260_g101550.1 (Contig1663.g15007)
1.04 7.42 11.52 9.28 9.58 7.9 9.55 7.46 7.3 17.84 17.35 21.55 25.59 16.07 20.08 34.19 12.04 21.32 25.7 19.76 18.65 4.51 6.27 8.98 7.46 8.55 19.97
Sro262_g102040.1 (Contig809.g9024)
0.62 6.88 7.32 8.47 6.08 7.65 7.58 6.43 5.55 13.05 10.39 14.66 29.27 14.44 13.1 15.77 9.9 8.68 11.9 23.24 16.17 3.21 5.3 5.19 7.51 7.32 15.43
Sro285_g108150.1 (Contig491.g6621)
0.63 9.49 7.83 11.81 11.66 8.28 8.27 6.2 3.5 15.45 12.81 18.5 16.27 14.35 14.2 24.98 13.17 15.93 21.33 23.69 15.6 1.99 3.03 4.16 2.42 4.2 13.69
Sro2882_g339250.1 (Contig3220.g25447)
0.75 1.5 1.84 2.66 2.28 1.97 4.76 2.34 3.16 9.61 9.62 8.79 24.41 15.65 11.09 15.48 10.68 11.56 15.32 20.46 16.42 2.34 2.87 5.87 5.5 8.27 6.81
Sro2_g001530.1 (Contig467.g6311)
9.5 10.62 15.38 14.36 9.5 11.19 12.55 6.64 10.49 31.39 33.82 34.74 49.83 28.78 30.78 57.86 25.63 25.62 44.1 41.2 42.02 4.79 6.74 10.56 5.41 12.12 26.63
Sro2_g001620.1 (Contig467.g6320)
0.15 3.53 2.9 3.17 2.18 7.35 6.99 4.17 2.64 13.94 7.34 16.76 19.06 15.49 12.66 25.31 5.61 13.36 16.63 16.02 15.5 2.08 1.92 4.92 1.96 3.8 12.54
Sro35_g022250.1 (Contig3323.g26102)
0.16 0.94 0.72 0.45 0.51 1.88 2.42 1.41 0.79 5.45 3.99 6.62 5.8 4.48 5.01 9.47 2.35 5.57 7.2 8.4 5.72 0.61 0.73 1.22 0.3 1.03 5.47
Sro417_g138730.1 (Contig2416.g19781)
0.34 3.86 3.31 2.62 2.52 4.74 3.86 1.88 1.37 7.23 6.23 7.97 10.37 6.65 6.41 8.74 5.74 6.83 8.39 13.91 7.64 2.26 1.4 3.23 2.52 3.17 6.11
Sro423_g139740.1 (Contig1760.g15611)
0.11 2.43 3.76 1.72 1.09 1.65 4.51 1.88 1.55 7.42 3.9 10.81 11.26 5.68 5.92 11.25 2.83 7.04 10.42 10.55 7.99 0.85 1.05 3.82 1.66 1.85 5.19
Sro461_g147780.1 (Contig3552.g27432)
0.77 2.41 1.58 1.65 2.09 0.96 1.95 1.92 1.67 5.86 4.56 7.84 7.48 3.89 5.31 12.6 2.48 4.27 5.79 6.78 6.08 0.98 1.12 0.67 0.59 1.36 4.72
Sro513_g157780.1 (Contig214.g2540)
1.14 9.77 7.12 8.67 7.03 8.57 13.18 8.01 7.24 27.03 26.63 25.81 33.25 29.3 29.0 50.56 17.31 32.6 42.42 39.39 31.42 8.84 6.86 12.17 5.16 10.63 26.33
Sro54_g032050.1 (Contig2430.g19893)
2.58 6.94 5.63 5.52 4.34 14.57 14.54 11.54 10.69 28.21 38.16 31.94 18.72 23.7 33.63 53.09 23.95 20.96 30.49 26.99 22.81 7.73 9.07 11.54 5.5 9.08 37.43
0.24 0.32 0.17 0.23 0.31 1.83 1.26 0.73 0.42 5.19 4.5 5.81 5.46 6.34 4.77 8.12 2.97 4.49 7.19 6.94 5.95 0.44 0.48 0.88 0.17 1.2 4.73
1.01 0.61 0.27 1.91 1.01 0.74 2.49 1.56 1.4 7.06 6.78 10.53 11.22 9.9 7.05 12.2 3.37 5.33 8.78 9.14 8.03 0.13 1.13 0.81 0.6 1.62 5.97
Sro649_g181220.1 (Contig1362.g12548)
1.95 17.83 13.69 16.12 13.1 20.52 18.19 13.52 10.41 40.79 38.93 41.91 74.08 45.41 41.63 61.94 26.93 47.24 59.62 66.04 34.22 8.49 7.16 13.59 7.19 16.13 40.17
Sro69_g038530.1 (Contig4677.g34762)
1.29 3.31 1.75 2.22 1.48 4.46 5.94 3.69 2.9 13.37 17.13 14.98 14.73 14.05 13.49 22.55 9.83 12.33 15.91 22.31 13.05 3.43 2.02 5.46 2.59 5.06 11.8
Sro6_g005290.1 (Contig175.g2034)
0.48 3.89 5.44 5.16 2.6 5.9 7.35 4.27 6.5 15.36 13.01 18.34 10.65 15.7 13.41 22.16 9.62 14.12 20.83 18.21 16.29 5.09 5.46 5.0 2.77 5.71 13.85
Sro714_g191680.1 (Contig596.g7421)
0.1 1.27 2.75 2.98 1.93 3.6 2.3 1.09 1.46 8.57 6.94 8.5 13.65 9.6 10.1 16.42 6.34 9.72 14.91 14.29 10.36 1.07 1.48 1.23 1.11 2.82 7.99
Sro747_g196480.1 (Contig4185.g31896)
2.21 2.13 0.92 2.35 1.84 6.65 10.6 5.9 3.9 26.46 22.69 26.97 28.92 33.78 27.55 60.64 16.55 28.79 34.58 28.43 36.2 3.13 3.14 6.93 2.24 8.48 21.32
Sro803_g204760.1 (Contig386.g5190)
3.97 36.05 51.19 49.1 35.61 42.72 35.99 32.1 34.84 65.16 57.62 65.38 166.84 46.29 54.88 63.19 44.67 48.57 60.47 81.77 68.5 21.0 23.97 24.06 25.94 22.64 75.53
Sro84_g044690.1 (Contig220.g2602)
1.13 5.56 3.83 4.49 3.26 6.44 7.33 4.45 4.63 12.89 10.91 14.99 24.45 13.47 10.84 16.7 8.49 9.05 13.74 18.9 13.04 4.48 3.17 4.94 4.4 6.04 9.67
Sro84_g044710.1 (Contig220.g2604)
1.17 1.68 1.39 1.47 0.96 4.65 4.25 3.1 2.78 10.98 9.23 14.03 24.01 11.68 8.49 14.59 7.56 9.09 11.3 16.56 11.21 1.08 2.05 4.8 2.3 4.05 7.68
Sro89_g046840.1 (Contig3846.g29605)
1.69 4.53 3.56 3.56 2.42 4.63 5.67 4.56 2.69 13.77 12.53 16.1 16.72 12.48 13.32 25.86 7.01 17.91 21.07 15.92 11.48 1.59 1.64 5.11 2.02 4.15 13.16
Sro965_g225610.1 (Contig945.g9790)
0.18 3.26 2.75 1.74 2.04 3.66 4.11 2.71 1.8 8.48 3.8 8.88 11.94 6.67 7.29 16.87 2.86 10.64 12.19 12.39 7.32 1.57 1.59 1.38 0.72 1.33 8.15

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)