Heatmap: Cluster_138 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1036_g234070.1 (Contig614.g7573)
0.1 0.02 0.01 0.01 0.02 0.09 0.28 0.27 0.17 0.54 0.4 0.8 0.69 0.26 0.41 0.43 0.24 0.48 0.27 1.0 0.48 0.24 0.1 0.35 0.31 0.28 0.31
Sro1111_g242420.1 (Contig1174.g11201)
0.18 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.01 0.02 0.34 0.23 0.9 0.07 0.02 0.26 1.0 0.05 0.02 0.11 0.15 0.77 0.01 0.14 0.01 0.01 0.05 0.07
Sro118_g057690.1 (Contig2714.g21839)
0.65 0.03 0.04 0.04 0.03 0.06 0.22 0.11 0.16 0.55 0.34 0.97 0.57 0.08 0.27 0.42 0.1 0.15 0.13 1.0 0.86 0.06 0.08 0.08 0.09 0.05 0.17
Sro11_g008480.1 (Contig724.g8322)
0.47 0.02 0.0 0.0 0.0 0.72 0.4 0.29 0.35 0.67 0.46 1.0 0.52 0.38 0.55 0.84 0.33 0.25 0.46 0.63 0.86 0.17 0.31 0.53 0.29 0.21 0.66
Sro11_g008500.1 (Contig724.g8324)
0.55 0.4 0.25 0.15 0.16 0.13 0.53 0.47 0.46 0.62 0.61 0.81 0.69 0.4 0.53 1.0 0.37 0.33 0.45 0.8 0.74 0.21 0.4 0.52 0.24 0.19 0.54
Sro11_g008720.1 (Contig724.g8346)
0.19 0.03 0.02 0.02 0.01 0.08 0.39 0.29 0.16 0.55 0.31 0.65 0.44 0.25 0.39 0.33 0.17 0.48 0.5 1.0 0.77 0.14 0.11 0.32 0.3 0.22 0.26
0.01 0.16 0.14 0.13 0.14 0.14 0.35 0.15 0.11 0.56 0.35 0.6 0.58 0.39 0.52 1.0 0.3 0.45 0.58 0.57 0.95 0.22 0.08 0.32 0.62 0.26 0.4
Sro1287_g259440.1 (Contig248.g3030)
0.23 0.18 0.19 0.11 0.12 0.13 0.39 0.29 0.16 0.72 0.59 0.81 0.55 0.61 0.65 0.58 0.66 0.46 0.56 1.0 0.89 0.15 0.11 0.35 0.64 0.48 0.46
Sro1337_g264150.1 (Contig951.g9837)
0.19 0.05 0.15 0.06 0.03 0.06 0.29 0.19 0.2 0.56 0.19 0.73 0.39 0.63 0.43 1.0 0.21 0.31 0.31 0.66 0.75 0.2 0.16 0.2 0.25 0.22 0.25
Sro133_g063000.1 (Contig2274.g18859)
0.22 0.02 0.04 0.02 0.01 0.18 0.59 0.59 0.24 0.81 0.39 0.88 0.53 0.69 0.69 0.59 0.39 0.45 0.39 0.82 1.0 0.44 0.16 0.53 0.75 0.47 0.46
Sro1357_g265730.1 (Contig2181.g18197)
0.06 0.24 0.19 0.22 0.21 0.18 0.89 0.94 0.69 0.74 0.43 1.0 0.69 0.56 0.63 0.58 0.28 0.43 0.51 0.94 0.93 0.37 0.38 0.4 0.7 0.48 0.33
Sro1361_g266210.1 (Contig3089.g24636)
0.27 0.05 0.07 0.03 0.03 0.09 0.41 0.17 0.26 0.59 0.94 1.0 0.74 0.22 0.6 0.84 0.29 0.23 0.21 0.51 0.96 0.07 0.15 0.33 0.26 0.2 0.43
Sro1440_g272900.1 (Contig840.g9268)
0.04 0.05 0.08 0.07 0.04 0.19 0.42 0.76 0.36 0.8 0.84 1.0 0.37 0.37 0.8 0.74 0.33 0.54 0.54 0.68 0.96 0.23 0.09 0.55 0.35 0.27 0.56
Sro1460_g274660.1 (Contig332.g4418)
0.1 0.01 0.02 0.08 0.07 0.15 0.39 0.37 0.12 0.44 0.21 0.44 0.65 0.28 0.31 0.22 0.16 0.17 0.17 1.0 0.54 0.19 0.08 0.3 0.34 0.21 0.15
Sro1658_g289150.1 (Contig4672.g34733)
0.07 0.07 0.07 0.07 0.06 0.21 0.35 0.44 0.28 0.68 0.59 0.94 0.57 0.25 0.56 0.52 0.35 0.51 0.61 1.0 0.77 0.14 0.11 0.46 0.31 0.25 0.51
Sro165_g073830.1 (Contig381.g5124)
0.03 0.03 0.05 0.05 0.03 0.05 0.49 0.33 0.16 0.71 0.69 1.0 0.38 0.22 0.72 0.92 0.18 0.43 0.23 0.72 0.84 0.03 0.02 0.71 0.59 0.38 0.57
Sro16_g011530.1 (Contig916.g9590)
0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.18 0.28 0.3 0.19 0.52 0.41 0.7 0.1 0.31 0.53 1.0 0.2 0.35 0.35 0.15 0.71 0.12 0.15 0.31 0.23 0.23 0.47
Sro177_g077750.1 (Contig795.g8901)
0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.13 0.34 0.19 0.15 0.61 0.46 1.0 0.29 0.22 0.37 0.43 0.3 0.32 0.4 0.91 0.8 0.16 0.11 0.21 0.2 0.2 0.37
Sro1839_g300900.1 (Contig1409.g12920)
0.06 0.07 0.04 0.06 0.05 0.16 0.65 0.64 0.35 0.64 0.77 1.0 0.23 0.35 0.57 0.45 0.29 0.52 0.29 0.51 0.67 0.07 0.14 0.56 0.47 0.33 0.38
Sro185_g080400.1 (Contig1228.g11515)
0.12 0.23 0.19 0.24 0.2 0.34 0.6 0.5 0.46 0.69 0.69 1.0 0.56 0.52 0.65 0.6 0.47 0.62 0.64 0.77 0.76 0.34 0.41 0.55 0.3 0.41 0.49
Sro1870_g302730.1 (Contig3934.g30165)
0.04 0.13 0.15 0.11 0.11 0.16 0.49 0.45 0.29 0.55 0.89 0.67 0.81 0.31 0.69 0.82 0.45 0.44 0.41 0.9 1.0 0.22 0.22 0.39 0.56 0.26 0.46
Sro18_g013180.1 (Contig1351.g12478)
0.06 0.09 0.08 0.07 0.07 0.24 0.59 0.4 0.36 0.71 0.73 1.0 0.63 0.45 0.57 0.52 0.47 0.41 0.53 0.94 0.88 0.42 0.31 0.49 0.37 0.31 0.52
Sro203_g085600.1 (Contig1270.g11854)
0.11 0.21 0.18 0.14 0.13 0.19 0.7 0.54 0.44 0.7 0.67 0.88 0.55 0.41 0.55 0.51 0.49 0.55 0.65 1.0 0.82 0.5 0.37 0.47 0.16 0.22 0.49
Sro207_g086850.1 (Contig755.g8588)
0.09 0.11 0.08 0.11 0.16 0.07 0.38 0.54 0.29 0.53 0.28 0.72 0.65 0.35 0.46 0.31 0.14 0.57 0.77 1.0 0.61 0.19 0.16 0.26 0.35 0.22 0.26
Sro207_g086930.1 (Contig755.g8596)
0.14 0.05 0.03 0.02 0.02 0.16 0.46 0.29 0.24 0.57 0.46 0.73 0.54 0.25 0.38 0.43 0.32 0.45 0.47 1.0 0.65 0.31 0.18 0.4 0.34 0.24 0.38
Sro209_g087400.1 (Contig4070.g31211)
0.5 0.01 0.01 0.0 0.01 0.09 0.13 0.16 0.11 0.6 0.2 0.84 0.48 0.53 0.36 1.0 0.14 0.49 0.55 0.61 0.67 0.14 0.05 0.08 0.06 0.16 0.21
Sro2104_g314730.1 (Contig873.g9428)
0.74 0.1 0.15 0.07 0.04 0.17 0.34 0.28 0.31 0.5 1.0 0.77 0.25 0.12 0.69 0.74 0.48 0.1 0.04 0.33 0.75 0.12 0.27 0.86 0.47 0.18 0.49
Sro2113_g315070.1 (Contig664.g7842)
0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.07 0.4 0.25 0.28 0.56 0.19 0.74 0.43 0.36 0.4 0.42 0.18 0.31 0.4 1.0 0.74 0.38 0.11 0.14 0.26 0.14 0.22
Sro214_g088730.1 (Contig282.g3658)
0.54 0.06 0.05 0.04 0.05 0.07 0.2 0.11 0.13 0.43 0.55 1.0 0.89 0.08 0.35 0.51 0.21 0.06 0.12 0.42 0.77 0.07 0.16 0.1 0.04 0.1 0.26
Sro214_g088740.1 (Contig282.g3659)
0.6 0.09 0.08 0.1 0.13 0.05 0.32 0.19 0.29 0.53 0.36 1.0 0.62 0.24 0.27 0.4 0.27 0.33 0.25 0.78 0.55 0.23 0.23 0.22 0.11 0.18 0.24
Sro2150_g316680.1 (Contig4565.g34111)
0.05 0.05 0.05 0.04 0.03 0.12 0.57 0.43 0.45 0.69 0.42 1.0 0.52 0.42 0.41 0.4 0.27 0.45 0.49 0.91 0.75 0.33 0.3 0.3 0.26 0.23 0.37
Sro217_g089700.1 (Contig1718.g15344)
0.61 0.25 0.25 0.25 0.21 0.21 0.46 0.47 0.51 0.68 0.55 0.87 0.77 0.4 0.46 0.49 0.39 0.51 0.68 1.0 0.98 0.5 0.36 0.33 0.32 0.28 0.4
Sro2194_g318530.1 (Contig3813.g29203)
0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.21 0.25 0.22 0.03 0.68 0.51 0.84 0.64 0.46 0.67 0.89 0.28 0.31 0.32 1.0 0.7 0.11 0.04 0.47 0.41 0.31 0.27
Sro250_g099090.1 (Contig1989.g17025)
0.05 0.04 0.04 0.02 0.03 0.19 0.59 0.31 0.19 0.67 0.32 0.67 0.42 0.36 0.43 0.53 0.22 0.39 0.55 0.76 1.0 0.29 0.11 0.23 0.35 0.26 0.24
Sro2546_g330840.1 (Contig2878.g22999)
0.2 0.03 0.04 0.03 0.04 0.08 0.31 0.11 0.05 0.58 0.31 0.83 0.34 0.07 0.42 0.55 0.16 0.21 0.18 1.0 0.92 0.05 0.03 0.21 0.22 0.08 0.22
Sro261_g101720.1 (Contig3068.g24444)
0.19 0.04 0.03 0.02 0.01 0.19 0.46 0.41 0.26 0.65 0.44 0.88 0.44 0.3 0.51 0.44 0.3 0.45 0.47 1.0 0.72 0.14 0.13 0.42 0.31 0.3 0.35
Sro26_g017560.1 (Contig2432.g19927)
0.09 0.05 0.04 0.04 0.02 0.14 0.22 0.28 0.18 0.68 0.32 0.75 0.37 0.53 0.37 0.71 0.33 0.4 0.48 1.0 0.89 0.29 0.07 0.47 0.85 0.28 0.35
Sro275_g105800.1 (Contig3464.g26882)
0.07 0.09 0.0 0.07 0.07 0.04 0.12 0.08 0.01 0.58 0.47 1.0 0.03 0.42 0.35 0.72 0.32 0.07 0.03 0.04 0.75 0.03 0.03 0.24 0.16 0.28 0.15
Sro2815_g337730.1 (Contig4348.g32792)
0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.27 0.94 0.87 0.33 0.75 0.48 0.8 0.48 0.55 0.74 0.6 0.36 1.0 0.75 0.9 0.75 0.17 0.25 0.7 0.98 0.67 0.41
Sro294_g110120.1 (Contig215.g2560)
0.02 0.03 0.04 0.02 0.03 0.18 0.68 0.3 0.24 0.66 0.2 0.99 0.79 0.45 0.43 1.0 0.16 0.51 0.47 0.65 0.83 0.24 0.24 0.14 0.34 0.1 0.31
Sro2986_g341670.1 (Contig224.g2649)
0.0 0.11 0.22 0.1 0.06 0.08 0.33 0.33 0.29 0.68 0.41 0.85 1.0 0.32 0.35 0.5 0.27 0.48 0.52 0.82 0.9 0.26 0.1 0.33 0.36 0.22 0.33
Sro361_g126560.1 (Contig1094.g10581)
0.0 0.11 0.14 0.05 0.13 0.08 0.39 0.52 0.18 0.44 0.67 0.56 0.26 0.18 0.6 1.0 0.45 0.2 0.22 0.2 0.65 0.11 0.12 0.56 0.46 0.32 0.38
Sro386_g131920.1 (Contig4061.g31133)
0.14 0.37 0.46 0.27 0.3 0.19 0.42 0.46 0.22 0.65 0.95 0.87 0.79 0.22 0.66 0.85 0.37 0.56 0.62 0.96 1.0 0.38 0.2 0.48 0.58 0.31 0.53
Sro3_g002420.1 (Contig3832.g29427)
0.02 0.13 0.26 0.27 0.15 0.05 0.22 0.15 0.17 0.47 0.7 0.54 0.08 0.06 0.48 0.6 0.17 0.17 0.25 0.2 1.0 0.07 0.14 0.13 0.1 0.07 0.4
Sro419_g139100.1 (Contig4415.g33171)
0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.1 0.23 0.18 0.04 0.43 0.36 0.46 0.16 0.24 0.52 1.0 0.27 0.28 0.23 0.28 0.87 0.08 0.03 0.23 0.46 0.31 0.43
Sro41_g025300.1 (Contig169.g1936)
0.12 0.06 0.05 0.04 0.04 0.05 0.1 0.08 0.06 0.4 0.86 0.71 0.22 0.06 0.61 1.0 0.11 0.16 0.14 0.26 0.77 0.12 0.06 0.04 0.02 0.07 0.44
Sro431_g141470.1 (Contig2042.g17550)
0.13 0.25 0.22 0.29 0.24 0.23 0.5 0.44 0.26 0.73 1.0 0.9 0.35 0.41 0.69 0.76 0.57 0.54 0.44 0.55 0.86 0.11 0.21 0.67 0.41 0.42 0.59
Sro46_g027300.1 (Contig1636.g14720)
0.1 0.01 0.02 0.01 0.03 0.11 0.29 0.21 0.09 0.66 0.19 1.0 0.23 0.44 0.35 0.74 0.09 0.38 0.38 0.4 0.7 0.18 0.08 0.1 0.18 0.12 0.28
Sro473_g150100.1 (Contig2918.g23230)
0.18 0.04 0.02 0.01 0.02 0.19 0.29 0.23 0.19 0.68 0.89 0.79 0.25 0.29 0.9 0.83 0.42 0.55 0.23 0.36 1.0 0.12 0.06 0.55 0.57 0.42 0.59
Sro473_g150120.1 (Contig2918.g23232)
0.16 0.09 0.07 0.05 0.04 0.18 0.37 0.3 0.23 0.65 0.66 0.87 0.17 0.36 0.66 0.65 0.25 0.32 0.14 0.23 1.0 0.07 0.09 0.44 0.14 0.21 0.5
Sro485_g152470.1 (Contig1932.g16647)
0.04 0.1 0.11 0.08 0.05 0.23 0.34 0.45 0.37 0.62 0.55 0.86 0.85 0.32 0.44 0.53 0.42 0.42 0.56 1.0 0.85 0.27 0.21 0.35 0.35 0.33 0.39
Sro489_g153270.1 (Contig402.g5436)
0.09 0.1 0.04 0.07 0.05 0.14 0.97 0.5 0.26 0.86 0.8 1.0 0.17 0.68 0.51 0.24 0.34 0.11 0.21 0.36 0.71 0.12 0.12 0.3 0.17 0.21 0.36
Sro4_g003340.1 (Contig3815.g29252)
0.2 0.0 0.01 0.01 0.01 0.09 0.22 0.17 0.1 0.5 0.39 1.0 0.09 0.09 0.41 0.52 0.13 0.08 0.09 0.33 0.71 0.18 0.07 0.04 0.0 0.03 0.27
Sro504_g155990.1 (Contig4263.g32265)
0.01 0.12 0.04 0.05 0.06 0.29 0.34 0.15 0.13 0.58 0.4 0.64 0.27 0.6 0.6 1.0 0.45 0.46 0.5 0.39 0.96 0.37 0.19 0.43 0.42 0.58 0.41
Sro56_g032640.1 (Contig3029.g24140)
0.06 0.1 0.07 0.13 0.09 0.19 0.51 0.48 0.32 0.52 0.39 0.84 0.61 0.44 0.41 0.29 0.26 0.74 1.0 0.9 0.46 0.14 0.12 0.73 0.37 0.28 0.28
Sro642_g180120.1 (Contig442.g5930)
0.03 0.06 0.09 0.13 0.13 0.1 0.43 0.4 0.21 0.62 0.43 1.0 0.48 0.25 0.7 0.88 0.35 0.34 0.21 0.71 0.7 0.16 0.09 0.18 0.05 0.04 0.42
Sro662_g183290.1 (Contig3613.g27923)
0.2 0.02 0.01 0.03 0.03 0.06 0.22 0.14 0.09 0.62 0.32 0.98 0.36 0.08 0.45 0.55 0.16 0.19 0.15 0.98 1.0 0.11 0.03 0.15 0.15 0.09 0.24
Sro761_g198510.1 (Contig3384.g26460)
0.06 0.09 0.0 0.02 0.0 0.05 0.34 0.24 0.14 0.56 0.25 0.72 0.34 0.31 0.49 0.55 0.19 0.28 0.28 0.51 1.0 0.21 0.11 0.36 0.43 0.29 0.3
Sro796_g203820.1 (Contig2034.g17480)
0.45 0.41 0.6 0.35 0.38 0.11 0.48 0.54 0.28 0.58 0.48 1.0 0.26 0.42 0.55 0.35 0.24 0.76 0.49 0.31 0.94 0.04 0.33 0.84 0.45 0.41 0.32
Sro7_g006300.1 (Contig389.g5283)
0.12 0.14 0.09 0.07 0.1 0.13 0.41 0.34 0.15 0.64 1.0 0.84 0.14 0.33 0.68 0.73 0.45 0.36 0.29 0.37 0.81 0.08 0.1 0.68 0.28 0.22 0.49
Sro802_g204740.1 (Contig712.g8241)
0.12 0.0 0.0 0.11 0.04 0.06 0.33 0.24 0.13 0.59 0.27 0.73 0.9 0.37 0.38 0.3 0.14 0.18 0.11 1.0 0.68 0.11 0.07 0.31 0.55 0.24 0.23
Sro821_g207350.1 (Contig535.g6942)
0.0 0.01 0.13 0.01 0.01 0.03 0.13 0.09 0.04 0.46 0.32 0.57 0.3 0.51 0.39 1.0 0.46 0.22 0.3 0.52 0.6 0.16 0.11 0.14 0.21 0.24 0.23
Sro843_g209780.1 (Contig42.g289)
0.44 0.05 0.04 0.04 0.02 0.09 0.29 0.31 0.12 0.74 0.54 1.0 0.16 0.31 0.64 0.97 0.32 0.48 0.41 0.36 0.84 0.17 0.09 0.38 0.2 0.19 0.45
Sro869_g213430.1 (Contig2492.g20419)
0.46 0.09 0.11 0.12 0.1 0.28 0.49 0.44 0.35 0.66 0.77 0.92 0.71 0.33 0.64 0.64 0.56 0.44 0.53 1.0 0.79 0.24 0.28 0.51 0.4 0.26 0.53
Sro87_g046250.1 (Contig2014.g17233)
0.11 0.08 0.1 0.11 0.08 0.37 0.65 0.51 0.28 0.66 0.58 0.84 0.72 0.41 0.73 0.42 0.38 0.51 0.49 1.0 0.58 0.23 0.19 0.51 0.36 0.26 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)