1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_138 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1036_g234070.1 (Contig614.g7573)
 1.37 0.32 0.19 0.19 0.23 1.18 3.8 3.63 2.33 7.39 5.5 10.93 9.45 3.54 5.58 5.85 3.35 6.52 3.74 13.68 6.55 3.24 1.37 4.8 4.2 3.79 4.17
Sro1111_g242420.1 (Contig1174.g11201)
 14.86 1.65 1.59 0.92 0.84 1.29 3.01 1.0 1.54 28.47 19.03 75.85 6.23 1.31 21.77 84.31 3.81 1.97 9.58 12.86 65.32 0.5 11.86 0.73 0.44 4.08 5.92
Sro118_g057690.1 (Contig2714.g21839)
 59.83 2.68 3.79 3.44 3.0 5.95 19.9 10.44 14.61 50.44 31.71 89.56 52.33 7.21 24.62 38.83 9.54 13.49 11.51 91.92 79.22 5.21 7.67 7.62 8.24 4.53 15.37
Sro11_g008480.1 (Contig724.g8322)
 0.74 0.02 0.0 0.0 0.0 1.15 0.64 0.46 0.56 1.07 0.73 1.6 0.83 0.6 0.88 1.34 0.53 0.4 0.74 1.0 1.37 0.27 0.49 0.85 0.46 0.33 1.05
Sro11_g008500.1 (Contig724.g8324)
 4.1 2.99 1.87 1.11 1.17 0.96 3.91 3.47 3.43 4.56 4.48 5.98 5.13 2.99 3.9 7.4 2.71 2.44 3.36 5.95 5.49 1.54 2.92 3.87 1.74 1.4 4.02
Sro11_g008720.1 (Contig724.g8346)
 2.87 0.43 0.26 0.24 0.16 1.27 5.95 4.39 2.37 8.35 4.79 9.99 6.67 3.84 5.95 5.06 2.66 7.31 7.68 15.28 11.77 2.21 1.71 4.86 4.54 3.42 3.99
0.16 2.23 1.97 1.8 1.92 2.01 4.87 2.12 1.57 7.79 4.84 8.31 8.09 5.43 7.25 13.89 4.24 6.23 8.1 7.89 13.24 3.0 1.11 4.43 8.65 3.68 5.49
Sro1287_g259440.1 (Contig248.g3030)
 1.09 0.85 0.88 0.51 0.57 0.59 1.81 1.37 0.72 3.38 2.76 3.8 2.57 2.84 3.04 2.69 3.11 2.15 2.64 4.67 4.18 0.72 0.52 1.65 3.0 2.25 2.15
Sro1337_g264150.1 (Contig951.g9837)
 1.94 0.48 1.53 0.59 0.34 0.57 2.99 1.97 2.04 5.67 1.99 7.42 3.98 6.42 4.41 10.21 2.14 3.16 3.13 6.7 7.65 2.07 1.64 2.06 2.54 2.26 2.53
Sro133_g063000.1 (Contig2274.g18859)
 3.5 0.27 0.58 0.36 0.17 2.92 9.63 9.6 3.88 13.11 6.38 14.31 8.59 11.18 11.22 9.49 6.26 7.34 6.29 13.32 16.19 7.07 2.67 8.55 12.17 7.67 7.37
Sro1357_g265730.1 (Contig2181.g18197)
 1.44 6.04 4.61 5.4 5.22 4.37 22.0 23.17 17.03 18.33 10.5 24.65 16.99 13.74 15.62 14.37 6.8 10.66 12.47 23.07 22.94 9.07 9.47 9.84 17.31 11.84 8.26
Sro1361_g266210.1 (Contig3089.g24636)
 10.19 1.93 2.49 1.17 1.16 3.5 15.72 6.41 9.72 22.21 35.82 37.92 28.15 8.39 22.75 32.02 11.1 8.87 8.09 19.39 36.28 2.68 5.57 12.61 9.8 7.69 16.34
Sro1440_g272900.1 (Contig840.g9268)
 1.89 2.58 4.02 3.2 1.81 8.88 19.86 36.04 17.16 38.2 40.16 47.63 17.71 17.82 37.9 35.04 15.76 25.8 25.59 32.44 45.85 10.88 4.39 26.11 16.53 12.89 26.66
Sro1460_g274660.1 (Contig332.g4418)
 2.45 0.19 0.48 1.83 1.65 3.72 9.35 8.81 2.89 10.49 4.94 10.61 15.72 6.82 7.38 5.27 3.74 4.16 4.04 24.08 13.05 4.51 2.04 7.31 8.12 5.03 3.58
Sro1658_g289150.1 (Contig4672.g34733)
 3.77 3.68 3.92 3.7 3.41 11.59 19.54 24.87 15.96 38.26 33.24 53.03 31.79 13.9 31.32 29.06 19.65 28.55 34.41 56.22 43.01 7.91 6.26 25.88 17.66 14.0 28.91
Sro165_g073830.1 (Contig381.g5124)
 0.16 0.15 0.28 0.26 0.14 0.28 2.61 1.76 0.87 3.81 3.72 5.38 2.06 1.17 3.88 4.96 0.95 2.33 1.25 3.87 4.5 0.18 0.1 3.84 3.16 2.03 3.04
Sro16_g011530.1 (Contig916.g9590)
 0.79 0.68 0.96 1.09 0.49 6.13 9.67 10.43 6.72 18.15 14.04 24.26 3.49 10.84 18.5 34.62 7.07 11.95 12.24 5.19 24.61 4.0 5.18 10.83 8.0 7.82 16.28
Sro177_g077750.1 (Contig795.g8901)
 0.14 0.14 0.06 0.07 0.11 0.6 1.54 0.87 0.67 2.72 2.07 4.48 1.3 0.97 1.65 1.94 1.32 1.42 1.79 4.09 3.6 0.71 0.48 0.95 0.89 0.9 1.65
Sro1839_g300900.1 (Contig1409.g12920)
 2.65 3.11 1.86 2.61 2.38 7.23 28.73 28.03 15.22 27.97 33.89 43.93 10.31 15.51 24.99 19.62 12.67 23.01 12.84 22.34 29.59 3.04 6.12 24.64 20.57 14.68 16.77
Sro185_g080400.1 (Contig1228.g11515)
 6.2 11.58 9.41 12.01 9.94 17.09 29.93 24.62 22.97 34.17 34.28 49.73 27.99 25.88 32.39 29.98 23.29 30.97 31.6 38.41 38.02 17.14 20.62 27.55 15.15 20.21 24.56
Sro1870_g302730.1 (Contig3934.g30165)
 1.6 5.59 6.76 4.75 4.76 6.88 21.57 19.78 12.85 24.13 38.89 29.19 35.43 13.71 30.33 36.06 19.91 19.19 18.12 39.21 43.75 9.79 9.8 16.96 24.58 11.45 20.28
Sro18_g013180.1 (Contig1351.g12478)
 0.71 1.06 1.02 0.81 0.9 3.0 7.23 4.88 4.41 8.74 8.95 12.33 7.72 5.61 7.07 6.44 5.83 5.11 6.52 11.58 10.86 5.17 3.77 6.04 4.6 3.8 6.37
Sro203_g085600.1 (Contig1270.g11854)
 2.72 5.38 4.58 3.69 3.31 5.01 18.06 14.02 11.28 18.16 17.36 22.74 14.1 10.55 14.26 13.12 12.66 14.07 16.71 25.79 21.08 12.86 9.51 12.13 4.08 5.61 12.52
Sro207_g086850.1 (Contig755.g8588)
 1.25 1.6 1.16 1.54 2.31 1.03 5.31 7.56 4.07 7.47 3.89 10.16 9.13 4.86 6.49 4.39 2.01 8.06 10.76 14.03 8.54 2.7 2.21 3.58 4.97 3.15 3.62
Sro207_g086930.1 (Contig755.g8596)
 2.87 1.11 0.52 0.48 0.45 3.26 9.35 6.0 4.96 11.59 9.27 14.93 10.94 5.05 7.84 8.69 6.54 9.14 9.51 20.36 13.18 6.29 3.6 8.19 6.95 4.89 7.74
Sro209_g087400.1 (Contig4070.g31211)
 9.56 0.2 0.28 0.08 0.21 1.64 2.5 3.09 2.03 11.57 3.78 16.04 9.18 10.18 6.94 19.17 2.66 9.41 10.63 11.78 12.78 2.64 0.93 1.55 1.12 3.06 3.95
Sro2104_g314730.1 (Contig873.g9428)
 32.75 4.5 6.59 3.07 1.87 7.36 15.35 12.36 14.0 22.14 44.52 34.32 11.29 5.35 30.56 33.08 21.5 4.26 1.84 14.62 33.61 5.35 11.98 38.45 21.12 8.21 22.02
Sro2113_g315070.1 (Contig664.g7842)
 0.34 0.14 0.1 0.2 0.36 0.84 5.06 3.17 3.5 7.01 2.44 9.35 5.43 4.5 5.07 5.3 2.22 3.93 5.04 12.61 9.29 4.8 1.35 1.78 3.34 1.81 2.73
Sro214_g088730.1 (Contig282.g3658)
 57.24 6.53 5.59 4.55 5.58 7.61 20.9 11.64 13.89 45.55 58.47 106.89 95.58 8.91 37.24 54.89 22.56 6.15 13.1 44.47 82.14 7.05 17.58 10.22 4.55 11.0 27.39
Sro214_g088740.1 (Contig282.g3659)
 15.15 2.23 2.06 2.56 3.27 1.15 8.0 4.91 7.32 13.31 9.19 25.25 15.78 6.01 6.73 10.0 6.93 8.41 6.24 19.82 13.86 5.91 5.87 5.51 2.87 4.64 6.07
Sro2150_g316680.1 (Contig4565.g34111)
 1.2 1.28 1.18 0.85 0.76 2.77 13.28 10.04 10.64 16.1 9.93 23.47 12.13 9.81 9.52 9.49 6.28 10.53 11.55 21.33 17.54 7.72 6.92 7.16 6.05 5.36 8.58
Sro217_g089700.1 (Contig1718.g15344)
 18.51 7.74 7.58 7.71 6.28 6.52 14.09 14.26 15.48 20.89 16.67 26.5 23.44 12.21 14.13 15.09 11.98 15.6 20.77 30.5 29.77 15.35 11.05 10.2 9.64 8.54 12.14
Sro2194_g318530.1 (Contig3813.g29203)
 0.57 0.48 0.45 0.48 0.55 3.93 4.66 4.12 0.58 12.56 9.4 15.57 11.85 8.58 12.51 16.55 5.15 5.74 6.01 18.55 12.95 1.98 0.81 8.79 7.59 5.73 4.93
Sro250_g099090.1 (Contig1989.g17025)
 0.27 0.23 0.23 0.09 0.17 1.06 3.24 1.72 1.05 3.7 1.77 3.71 2.3 2.0 2.36 2.94 1.23 2.14 3.04 4.2 5.53 1.59 0.63 1.27 1.96 1.41 1.35
Sro2546_g330840.1 (Contig2878.g22999)
 9.74 1.41 1.82 1.44 2.09 3.99 15.4 5.68 2.65 28.66 15.24 41.34 16.98 3.72 20.99 27.32 8.04 10.32 8.79 49.77 45.76 2.3 1.57 10.6 11.18 4.07 10.98
Sro261_g101720.1 (Contig3068.g24444)
 2.92 0.66 0.49 0.27 0.17 2.9 7.14 6.32 3.95 10.0 6.77 13.62 6.84 4.57 7.88 6.84 4.57 6.88 7.21 15.41 11.06 2.16 1.96 6.44 4.7 4.68 5.41
Sro26_g017560.1 (Contig2432.g19927)
 1.36 0.86 0.57 0.61 0.26 2.21 3.44 4.43 2.81 10.8 5.04 12.02 5.88 8.4 5.88 11.37 5.29 6.31 7.64 15.95 14.24 4.68 1.17 7.46 13.59 4.45 5.54
Sro275_g105800.1 (Contig3464.g26882)
 0.34 0.44 0.0 0.32 0.31 0.19 0.57 0.38 0.03 2.76 2.23 4.75 0.12 2.01 1.64 3.41 1.53 0.35 0.14 0.19 3.59 0.14 0.13 1.13 0.78 1.32 0.69
Sro2815_g337730.1 (Contig4348.g32792)
 0.18 0.27 0.26 0.36 0.35 3.48 12.28 11.42 4.28 9.89 6.29 10.43 6.34 7.17 9.74 7.86 4.76 13.12 9.8 11.76 9.82 2.27 3.33 9.19 12.86 8.85 5.33
Sro294_g110120.1 (Contig215.g2560)
 0.4 0.55 0.6 0.35 0.52 3.0 11.14 4.91 3.89 10.91 3.23 16.3 12.97 7.45 6.98 16.42 2.56 8.41 7.7 10.62 13.55 3.92 3.88 2.23 5.54 1.72 5.12
Sro2986_g341670.1 (Contig224.g2649)
 0.01 0.25 0.5 0.24 0.13 0.18 0.76 0.77 0.68 1.57 0.95 1.95 2.3 0.74 0.8 1.15 0.61 1.1 1.21 1.9 2.08 0.61 0.24 0.75 0.82 0.51 0.76
Sro361_g126560.1 (Contig1094.g10581)
 0.03 0.99 1.27 0.48 1.13 0.7 3.43 4.57 1.62 3.9 5.93 4.97 2.3 1.63 5.3 8.83 3.95 1.8 1.93 1.73 5.74 0.95 1.03 4.91 4.05 2.85 3.31
Sro386_g131920.1 (Contig4061.g31133)
 5.88 16.06 20.18 11.85 13.26 8.46 18.32 20.19 9.71 28.2 41.45 37.72 34.4 9.76 28.58 37.12 15.94 24.16 26.92 41.76 43.53 16.4 8.73 20.83 25.29 13.64 23.19
Sro3_g002420.1 (Contig3832.g29427)
 0.7 5.82 11.77 12.12 6.75 2.36 9.88 6.87 7.67 21.12 31.14 24.3 3.6 2.7 21.52 26.69 7.64 7.57 11.01 8.91 44.63 2.96 6.04 5.76 4.58 3.32 18.04
Sro419_g139100.1 (Contig4415.g33171)
 0.21 0.22 0.13 0.11 0.08 1.16 2.67 2.13 0.42 4.92 4.2 5.34 1.87 2.73 6.03 11.56 3.12 3.26 2.71 3.2 10.06 0.95 0.37 2.61 5.33 3.6 4.95
Sro41_g025300.1 (Contig169.g1936)
 1.11 0.56 0.42 0.33 0.34 0.47 0.95 0.7 0.58 3.65 7.96 6.54 2.05 0.54 5.65 9.22 1.04 1.47 1.32 2.43 7.06 1.12 0.53 0.41 0.18 0.65 4.08
Sro431_g141470.1 (Contig2042.g17550)
 9.25 17.82 16.07 21.24 17.47 16.84 35.92 32.1 19.1 52.7 72.24 65.09 25.05 29.3 50.02 55.02 41.11 39.29 31.6 39.82 62.33 8.14 15.3 48.71 29.28 30.4 42.61
Sro46_g027300.1 (Contig1636.g14720)
 1.04 0.15 0.19 0.15 0.3 1.15 3.05 2.26 1.0 7.01 1.99 10.68 2.45 4.75 3.74 7.89 0.91 4.1 4.01 4.27 7.5 1.87 0.82 1.06 1.93 1.25 2.96
Sro473_g150100.1 (Contig2918.g23230)
 2.21 0.5 0.23 0.17 0.21 2.35 3.62 2.82 2.34 8.37 10.96 9.69 3.1 3.57 11.08 10.21 5.12 6.82 2.8 4.49 12.32 1.47 0.71 6.79 7.04 5.22 7.24
Sro473_g150120.1 (Contig2918.g23232)
 1.82 1.05 0.87 0.55 0.52 2.14 4.3 3.54 2.65 7.55 7.69 10.14 1.99 4.21 7.73 7.55 2.89 3.76 1.66 2.67 11.64 0.85 1.05 5.07 1.67 2.4 5.77
Sro485_g152470.1 (Contig1932.g16647)
 0.55 1.31 1.4 0.97 0.69 2.93 4.39 5.69 4.77 7.91 7.03 10.98 10.84 4.07 5.61 6.79 5.28 5.35 7.18 12.72 10.76 3.38 2.73 4.45 4.46 4.22 4.95
Sro489_g153270.1 (Contig402.g5436)
 0.86 0.97 0.39 0.62 0.48 1.28 8.94 4.6 2.43 7.94 7.37 9.24 1.61 6.32 4.74 2.19 3.16 1.06 1.9 3.31 6.58 1.12 1.13 2.79 1.56 1.94 3.36
Sro4_g003340.1 (Contig3815.g29252)
 6.8 0.07 0.29 0.28 0.41 3.21 7.61 5.74 3.27 16.87 13.27 34.04 3.2 3.06 14.01 17.75 4.56 2.76 3.19 11.22 24.31 6.16 2.21 1.24 0.02 0.91 9.15
Sro504_g155990.1 (Contig4263.g32265)
 0.06 1.51 0.5 0.65 0.75 3.54 4.16 1.83 1.62 7.05 4.9 7.76 3.32 7.34 7.33 12.14 5.41 5.54 6.11 4.67 11.63 4.51 2.32 5.16 5.08 7.0 4.94
Sro56_g032640.1 (Contig3029.g24140)
 0.82 1.33 1.02 1.76 1.27 2.59 7.15 6.64 4.49 7.22 5.36 11.65 8.51 6.18 5.77 4.01 3.58 10.36 13.92 12.52 6.42 1.95 1.69 10.2 5.17 3.87 3.87
Sro642_g180120.1 (Contig442.g5930)
 1.66 3.72 5.86 8.71 8.14 6.61 27.93 26.04 13.56 40.38 27.58 64.83 31.14 16.5 45.57 57.27 22.66 22.2 13.52 45.99 45.29 10.5 6.06 11.9 3.24 2.92 27.4
Sro662_g183290.1 (Contig3613.g27923)
 5.43 0.58 0.4 0.89 0.89 1.48 5.74 3.82 2.48 16.44 8.48 26.18 9.72 2.19 11.9 14.79 4.19 5.15 4.03 26.15 26.68 2.83 0.69 4.08 4.06 2.35 6.54
Sro761_g198510.1 (Contig3384.g26460)
 0.2 0.29 0.0 0.08 0.0 0.16 1.15 0.81 0.47 1.9 0.84 2.41 1.13 1.05 1.66 1.85 0.63 0.93 0.93 1.71 3.37 0.7 0.37 1.23 1.46 0.96 1.02
Sro796_g203820.1 (Contig2034.g17480)
 56.02 50.95 74.6 43.8 47.32 14.24 59.68 68.18 35.27 72.07 60.48 125.3 32.49 52.97 69.21 44.15 30.12 95.54 60.97 38.47 118.03 5.54 41.02 105.22 56.02 51.24 40.37
Sro7_g006300.1 (Contig389.g5283)
 3.03 3.56 2.2 1.85 2.45 3.28 10.5 8.69 3.71 16.4 25.58 21.38 3.65 8.43 17.41 18.58 11.41 9.12 7.32 9.34 20.7 2.04 2.57 17.44 7.05 5.58 12.64
Sro802_g204740.1 (Contig712.g8241)
 1.84 0.0 0.0 1.61 0.56 0.94 5.05 3.69 1.98 8.98 4.12 11.11 13.77 5.6 5.86 4.52 2.11 2.82 1.73 15.29 10.37 1.63 1.03 4.77 8.41 3.73 3.47
Sro821_g207350.1 (Contig535.g6942)
 0.0 0.05 0.62 0.03 0.05 0.12 0.64 0.44 0.2 2.24 1.55 2.74 1.45 2.45 1.88 4.82 2.22 1.06 1.47 2.49 2.88 0.79 0.52 0.67 1.03 1.17 1.12
Sro843_g209780.1 (Contig42.g289)
 8.68 0.9 0.73 0.71 0.32 1.82 5.61 6.0 2.4 14.43 10.52 19.61 3.16 6.08 12.63 19.06 6.33 9.47 8.0 7.03 16.47 3.31 1.75 7.53 3.99 3.65 8.74
Sro869_g213430.1 (Contig2492.g20419)
 178.59 33.72 43.85 44.93 38.02 110.42 192.43 172.59 137.63 257.11 299.92 359.75 275.98 127.05 251.37 249.71 217.79 170.32 207.18 390.47 308.59 93.12 110.5 200.48 156.92 100.19 205.78
Sro87_g046250.1 (Contig2014.g17233)
 8.9 6.46 7.78 8.94 6.43 29.88 51.66 41.1 22.34 52.78 46.21 67.05 57.63 32.72 58.6 33.82 30.54 40.67 39.1 80.04 46.38 18.31 15.3 40.43 28.52 21.02 32.42

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)