Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1047_g235160.1 (Contig1910.g16510)	0.02	0.09	0.11	0.04	0.05	0.16	0.34	0.14	0.24	0.41	0.41	0.42	1.0	0.42	0.61	0.38	0.23	0.21	0.18	0.76	0.52	0.4	0.16	0.28	0.4	0.3	0.27
Sro1123_g243650.1 (Contig3394.g26539)	0.19	0.07	0.05	0.04	0.07	0.09	0.21	0.09	0.21	0.36	0.16	0.4	0.97	0.56	0.28	0.5	0.24	0.35	0.33	1.0	0.48	0.57	0.23	0.2	0.42	0.24	0.16
Sro1228_g254410.1 (Contig2695.g21742)	0.02	0.06	0.04	0.11	0.03	0.21	0.32	0.17	0.14	0.65	0.47	0.7	0.69	0.67	0.64	1.0	0.38	0.37	0.42	0.88	0.79	0.73	0.18	0.26	0.41	0.27	0.45
Sro1265_g257440.1 (Contig3808.g29172)	0.0	0.09	0.12	0.09	0.11	0.27	0.44	0.36	0.41	0.58	0.47	0.75	0.92	0.79	0.5	0.77	0.33	0.51	0.45	1.0	0.75	0.68	0.21	0.3	0.5	0.3	0.41
Sro1358_g265890.1 (Contig914.g9576)	0.03	0.09	0.03	0.03	0.04	0.25	0.52	0.21	0.18	0.68	0.33	0.77	0.7	0.89	0.42	0.65	0.37	0.6	0.52	0.9	1.0	0.55	0.23	0.48	0.67	0.42	0.41
Sro1618_g286380.1 (Contig4550.g34005)	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.09	0.44	0.25	0.31	0.43	0.29	0.5	1.0	0.69	0.49	0.42	0.23	0.36	0.27	0.89	0.59	0.71	0.23	0.22	0.23	0.16	0.16
Sro18_g012800.1 (Contig1351.g12440)	0.14	0.08	0.06	0.15	0.06	0.08	0.43	0.3	0.25	0.29	0.3	0.21	1.0	0.48	0.28	0.14	0.16	0.7	0.6	0.91	0.43	0.57	0.2	0.29	0.29	0.23	0.12
Sro1909_g304840.1 (Contig4171.g31813)	0.07	0.16	0.12	0.05	0.05	0.07	0.22	0.11	0.19	0.5	0.35	0.57	1.0	0.79	0.37	0.89	0.25	0.48	0.45	0.91	0.86	0.77	0.2	0.24	0.27	0.23	0.18
Sro1959_g307920.1 (Contig1986.g16993)	0.12	0.15	0.15	0.08	0.11	0.15	0.37	0.31	0.3	0.55	0.42	0.68	0.76	0.86	0.51	1.0	0.46	0.64	0.55	0.93	0.87	0.65	0.37	0.37	0.37	0.44	0.28
Sro1_g000710.1 (Contig3007.g23986)	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.18	0.24	0.14	0.24	0.56	0.45	0.64	0.92	0.93	0.43	0.71	0.59	0.62	0.56	1.0	0.82	0.64	0.26	0.17	0.23	0.3	0.35
Sro2125_g315690.1 (Contig3267.g25731)	0.22	0.08	0.06	0.11	0.04	0.28	0.83	0.47	0.25	0.54	0.46	0.82	0.53	0.76	0.63	0.56	0.23	0.48	0.59	0.8	1.0	0.65	0.13	0.97	0.57	0.46	0.36
Sro236_g094980.1 (Contig1410.g12936)	0.3	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.34	0.17	0.18	0.49	0.23	0.57	0.88	0.68	0.43	0.92	0.23	0.62	0.61	0.81	1.0	0.62	0.27	0.14	0.24	0.13	0.16
Sro2397_g326050.1 (Contig2368.g19492)	0.07	0.28	0.21	0.16	0.16	0.17	0.5	0.21	0.3	0.63	0.51	0.81	0.79	0.82	0.64	0.9	0.51	0.58	0.57	1.0	0.99	1.0	0.4	0.3	0.43	0.28	0.32
Sro2464_g328450.1 (Contig2847.g22840)	0.0	0.06	0.02	0.03	0.0	0.0	0.2	0.01	0.18	0.28	0.27	0.53	0.7	0.39	0.19	0.36	0.03	0.13	0.21	1.0	0.51	0.57	0.17	0.26	0.35	0.24	0.08
Sro246_g097790.1 (Contig171.g1963)	0.04	0.44	0.31	0.35	0.31	0.17	0.41	0.18	0.32	0.54	0.35	0.58	1.0	0.73	0.36	0.36	0.23	0.26	0.4	0.91	0.72	0.77	0.33	0.25	0.51	0.28	0.33
Sro256_g100610.1 (Contig3587.g27706)	0.02	0.04	0.06	0.02	0.01	0.11	0.34	0.08	0.13	0.5	0.43	0.48	0.8	0.65	0.45	0.62	0.61	0.49	0.38	1.0	0.71	0.63	0.13	0.46	0.81	0.33	0.35
Sro2646_g333570.1 (Contig1915.g16542)	0.02	0.19	0.11	0.14	0.15	0.46	0.66	0.33	0.41	0.58	0.35	0.65	0.87	0.85	0.46	0.32	0.29	0.66	0.45	1.0	0.79	0.95	0.44	0.24	0.49	0.28	0.27
Sro271_g104400.1 (Contig2573.g20873)	0.02	0.12	0.15	0.14	0.14	0.1	0.36	0.21	0.22	0.55	0.41	0.66	0.91	0.93	0.46	0.68	0.53	0.48	0.4	1.0	0.72	0.85	0.31	0.29	0.49	0.47	0.29
Sro272_g104930.1 (Contig2144.g18034)	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.26	0.15	0.18	0.33	0.36	0.32	0.66	0.64	0.42	1.0	0.34	0.62	0.35	0.75	0.5	0.51	0.18	0.2	0.17	0.26	0.16
Sro2786_g337040.1 (Contig3248.g25652)	0.0	0.22	0.15	0.18	0.25	0.16	0.3	0.19	0.22	0.53	0.45	0.62	1.0	0.82	0.5	0.78	0.28	0.45	0.58	0.96	0.57	0.52	0.21	0.29	0.37	0.29	0.42
Sro2821_g337940.1 (Contig2953.g23407)	0.0	0.03	0.02	0.04	0.03	0.14	0.34	0.19	0.15	0.36	0.23	0.3	0.58	0.58	0.44	0.89	0.4	0.74	0.36	0.76	0.62	1.0	0.25	0.34	0.47	0.23	0.29
Sro285_g108170.1 (Contig491.g6623)	0.11	0.03	0.04	0.02	0.03	0.16	0.38	0.14	0.35	0.56	0.31	0.88	0.74	0.74	0.39	0.54	0.48	0.42	0.46	1.0	0.92	0.55	0.27	0.23	0.37	0.32	0.19
Sro3157_g344560.1 (Contig789.g8803)	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.24	0.27	0.14	0.27	0.08	0.4	0.97	0.05	0.05	0.04	0.09	0.35	0.26	1.0	0.31	0.49	0.12	0.02	0.11	0.07	0.05
Sro31_g020540.1 (Contig420.g5649)	0.04	0.07	0.05	0.04	0.04	0.1	0.4	0.23	0.19	0.37	0.34	0.4	1.0	0.48	0.41	0.32	0.28	0.33	0.43	0.92	0.37	0.63	0.16	0.45	0.53	0.32	0.22
Sro35_g022420.1 (Contig3323.g26119)	0.04	0.33	0.26	0.21	0.2	0.17	0.45	0.28	0.31	0.56	0.65	0.86	1.0	0.51	0.49	0.75	0.5	0.33	0.46	0.91	0.48	0.59	0.29	0.31	0.46	0.24	0.36
Sro371_g128600.1 (Contig736.g8438)	0.0	0.08	0.06	0.03	0.03	0.05	0.2	0.07	0.24	0.29	0.16	0.39	1.0	0.54	0.28	0.51	0.28	0.29	0.35	0.79	0.46	0.64	0.19	0.14	0.19	0.19	0.14
Sro3794_g351100.1 (Contig2283.g18900)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.43	0.12	0.22	0.42	0.59	0.47	0.97	0.69	0.6	0.43	0.31	0.22	0.31	1.0	0.46	0.38	0.17	0.17	0.19	0.11	0.21
Sro379_g130490.1 (Contig3398.g26566)	0.02	0.11	0.13	0.07	0.08	0.04	0.3	0.15	0.13	0.38	0.24	0.42	0.99	0.65	0.3	0.27	0.2	0.32	0.22	1.0	0.48	0.6	0.17	0.2	0.2	0.14	0.1
Sro383_g131230.1 (Contig132.g1488)	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.3	0.48	0.19	0.19	0.56	0.47	0.49	0.85	0.68	0.6	1.0	0.24	0.28	0.28	0.9	0.86	0.5	0.13	0.32	0.72	0.32	0.4
Sro408_g137010.1 (Contig3193.g25236)	0.04	0.08	0.07	0.06	0.11	0.31	0.58	0.33	0.39	0.71	0.49	0.88	0.78	0.82	0.62	0.83	0.41	0.58	0.53	0.93	1.0	0.98	0.48	0.43	0.86	0.52	0.45
Sro415_g138530.1 (Contig3170.g25088)	0.02	0.1	0.02	0.04	0.04	0.08	0.54	0.39	0.36	0.43	0.33	0.44	0.95	0.62	0.43	0.45	0.28	0.76	0.46	1.0	0.63	0.54	0.33	0.57	0.93	0.47	0.31
Sro419_g139060.1 (Contig4415.g33167)	0.04	0.31	0.11	0.18	0.23	0.4	0.5	0.32	0.43	0.63	0.56	0.8	0.97	0.97	0.74	0.85	0.5	0.78	0.53	1.0	0.77	0.86	0.39	0.57	0.94	0.59	0.34
Sro444_g144340.1 (Contig1407.g12907)	0.04	0.1	0.09	0.21	0.08	0.07	0.28	0.35	0.1	0.38	0.42	0.4	0.93	0.27	0.37	0.5	0.22	0.7	0.66	1.0	0.64	0.59	0.09	0.28	0.45	0.28	0.25
Sro470_g149460.1 (Contig850.g9340)	0.01	0.06	0.05	0.04	0.05	0.15	0.36	0.32	0.12	0.42	0.43	0.43	0.72	0.41	0.48	0.49	0.23	0.62	0.5	1.0	0.39	0.61	0.1	0.25	0.41	0.23	0.18
Sro471_g149710.1 (Contig458.g6184)	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.05	0.33	0.18	0.23	0.34	0.4	0.36	0.79	0.39	0.38	0.59	0.27	0.47	0.42	1.0	0.49	0.69	0.22	0.2	0.26	0.22	0.31
Sro524_g160000.1 (Contig202.g2397)	0.0	0.03	0.0	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.17	0.08	0.1	1.0	0.43	0.14	0.44	0.07	0.25	0.26	0.72	0.23	0.44	0.05	0.02	0.03	0.1	0.05
Sro530_g161220.1 (Contig4609.g34407)	0.04	0.01	0.02	0.0	0.02	0.04	0.25	0.11	0.26	0.4	0.21	0.38	0.76	0.5	0.25	0.56	0.29	0.53	0.34	1.0	0.7	0.76	0.19	0.23	0.55	0.24	0.1
Sro538_g162560.1 (Contig95.g1097)	0.02	0.06	0.09	0.07	0.09	0.22	0.48	0.32	0.28	0.54	0.41	0.58	0.74	0.71	0.51	0.6	0.39	0.45	0.47	1.0	0.72	0.68	0.31	0.31	0.59	0.52	0.38
Sro54_g031780.1 (Contig2430.g19866)	0.03	0.1	0.15	0.12	0.18	0.42	0.35	0.14	0.14	0.78	0.75	1.0	1.0	0.95	0.64	0.93	0.57	0.32	0.59	0.96	0.72	0.67	0.17	0.43	0.49	0.39	0.55
Sro599_g173270.1 (Contig1154.g11038)	0.1	0.19	0.16	0.14	0.11	0.26	0.55	0.31	0.37	0.75	0.4	1.0	0.86	0.79	0.58	0.71	0.43	0.71	0.76	0.88	0.94	0.71	0.46	0.34	0.56	0.42	0.33
Sro59_g034420.1 (Contig571.g7288)	0.02	0.09	0.13	0.09	0.08	0.1	0.38	0.21	0.3	0.37	0.27	0.49	0.9	0.59	0.43	0.43	0.2	0.37	0.32	0.86	0.39	1.0	0.37	0.23	0.39	0.31	0.15
Sro623_g177090.1 (Contig3858.g29688)	0.01	0.06	0.05	0.02	0.02	0.2	0.57	0.34	0.22	0.56	0.59	0.55	0.84	0.45	0.61	0.68	0.36	0.67	0.48	0.88	0.83	1.0	0.21	0.6	0.86	0.6	0.41
Sro623_g177110.1 (Contig3858.g29690)	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.3	0.24	0.12	0.12	0.49	0.34	0.58	0.69	1.0	0.35	0.32	0.31	0.26	0.22	0.68	0.41	0.44	0.11	0.16	0.23	0.22	0.33
Sro691_g187790.1 (Contig1133.g10874)	0.02	0.07	0.08	0.05	0.07	0.1	0.17	0.18	0.25	0.34	0.2	0.37	1.0	0.44	0.27	0.36	0.22	0.4	0.41	0.94	0.47	0.77	0.21	0.12	0.3	0.15	0.12
Sro692_g188180.1 (Contig950.g9826)	0.02	0.01	0.0	0.01	0.02	0.11	0.33	0.23	0.22	0.48	0.32	0.47	0.77	1.0	0.41	0.8	0.34	0.52	0.27	0.71	0.69	0.52	0.21	0.25	0.62	0.47	0.22
Sro695_g188580.1 (Contig4098.g31305)	0.01	0.09	0.04	0.05	0.09	0.14	0.33	0.15	0.16	0.45	0.43	0.48	0.7	0.69	0.48	1.0	0.38	0.41	0.43	0.82	0.54	0.58	0.21	0.3	0.26	0.26	0.41
Sro696_g188960.1 (Contig116.g1336)	0.1	0.04	0.03	0.03	0.02	0.08	0.3	0.21	0.22	0.37	0.21	0.46	0.83	0.39	0.27	0.31	0.27	0.24	0.23	1.0	0.5	0.53	0.23	0.19	0.43	0.17	0.17
Sro713_g191550.1 (Contig2997.g23822)	0.07	0.31	0.09	0.15	0.18	0.49	0.45	0.26	0.18	0.59	0.59	0.68	0.96	0.89	0.63	0.56	0.45	0.66	0.66	0.95	0.89	0.9	0.35	0.59	1.0	0.45	0.27
Sro725_g193390.1 (Contig3530.g27291)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.11	0.33	0.27	0.12	0.37	0.3	0.47	0.8	0.44	0.45	0.34	0.2	0.62	0.59	1.0	0.43	0.61	0.09	0.39	0.32	0.25	0.27
Sro752_g197230.1 (Contig1730.g15447)	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.17	0.48	0.27	0.19	0.55	0.56	0.63	0.96	0.78	0.64	0.94	0.32	0.38	0.26	0.94	1.0	0.69	0.22	0.44	0.79	0.49	0.41
Sro808_g205350.1 (Contig630.g7644)	0.01	0.07	0.03	0.01	0.02	0.16	0.24	0.13	0.11	0.34	0.27	0.34	1.0	0.8	0.52	0.21	0.22	0.39	0.23	0.98	0.61	0.56	0.13	0.22	0.59	0.43	0.12
Sro83_g044430.1 (Contig4450.g33417)	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.14	0.13	0.2	0.05	0.26	1.0	0.2	0.08	0.02	0.0	0.21	0.24	0.89	0.15	0.43	0.01	0.03	0.06	0.05	0.03
Sro868_g213260.1 (Contig2961.g23528)	0.03	0.12	0.08	0.09	0.09	0.19	0.41	0.27	0.17	0.52	0.44	0.45	0.77	0.56	0.61	0.73	0.37	0.87	0.58	1.0	0.66	0.72	0.16	0.44	0.69	0.5	0.43
Sro88_g046330.1 (Contig265.g3291)	0.0	0.16	0.07	0.04	0.04	0.13	0.44	0.26	0.32	0.5	0.24	0.61	0.93	0.82	0.38	0.43	0.11	0.37	0.42	1.0	0.89	0.75	0.31	0.4	0.64	0.31	0.24
Sro944_g222960.1 (Contig4161.g31788)	0.01	0.21	0.06	0.1	0.05	0.2	0.17	0.09	0.1	0.47	0.35	0.76	0.69	1.0	0.43	0.5	0.33	0.43	0.46	0.76	0.35	0.66	0.12	0.27	0.27	0.13	0.31
Sro9_g007430.1 (Contig4120.g31511)	0.06	0.19	0.08	0.16	0.19	0.42	0.45	0.32	0.31	0.61	0.57	0.72	0.91	1.0	0.58	0.81	0.63	0.74	0.71	0.95	0.69	0.63	0.4	0.44	0.39	0.36	0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)