Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1047_g235160.1 (Contig1910.g16510)
0.4 1.65 2.02 0.69 0.85 2.89 6.11 2.52 4.33 7.3 7.3 7.42 17.72 7.44 10.81 6.69 4.05 3.78 3.18 13.48 9.15 7.13 2.88 4.97 7.15 5.39 4.7
Sro1123_g243650.1 (Contig3394.g26539)
9.61 3.4 2.38 2.3 3.8 4.74 10.87 4.66 10.9 18.52 8.15 20.56 49.73 28.88 14.55 25.69 12.38 17.8 17.15 51.31 24.67 29.38 12.0 10.49 21.62 12.16 8.17
Sro1228_g254410.1 (Contig2695.g21742)
0.19 0.5 0.3 0.89 0.28 1.75 2.69 1.42 1.21 5.45 3.96 5.9 5.8 5.63 5.42 8.43 3.17 3.11 3.51 7.43 6.65 6.15 1.49 2.21 3.49 2.25 3.82
Sro1265_g257440.1 (Contig3808.g29172)
0.03 0.98 1.33 1.01 1.15 2.96 4.78 3.92 4.47 6.29 5.06 8.15 9.93 8.55 5.42 8.35 3.52 5.48 4.92 10.83 8.11 7.4 2.25 3.3 5.42 3.27 4.39
Sro1358_g265890.1 (Contig914.g9576)
0.17 0.58 0.22 0.17 0.23 1.61 3.35 1.35 1.19 4.36 2.11 4.94 4.48 5.74 2.72 4.21 2.38 3.84 3.34 5.77 6.44 3.54 1.47 3.11 4.29 2.71 2.63
Sro1618_g286380.1 (Contig4550.g34005)
0.11 0.25 0.21 0.28 0.26 0.64 3.28 1.83 2.31 3.17 2.15 3.71 7.43 5.14 3.62 3.11 1.68 2.67 2.02 6.61 4.4 5.3 1.68 1.61 1.74 1.17 1.19
Sro18_g012800.1 (Contig1351.g12440)
4.47 2.71 2.09 4.8 1.84 2.72 13.91 9.7 8.19 9.51 9.85 6.9 32.59 15.56 9.02 4.68 5.22 22.84 19.47 29.59 14.08 18.5 6.43 9.53 9.36 7.51 4.02
Sro1909_g304840.1 (Contig4171.g31813)
0.7 1.65 1.23 0.54 0.52 0.71 2.21 1.11 1.94 5.04 3.52 5.82 10.14 8.0 3.77 9.04 2.5 4.82 4.52 9.21 8.67 7.8 2.06 2.44 2.7 2.36 1.87
Sro1959_g307920.1 (Contig1986.g16993)
3.87 4.69 4.72 2.58 3.37 4.61 11.53 9.57 9.27 17.07 12.99 21.17 23.51 26.55 15.87 31.0 14.18 19.88 17.14 28.85 26.94 20.05 11.58 11.48 11.38 13.58 8.68
Sro1_g000710.1 (Contig3007.g23986)
0.6 1.64 0.72 0.87 0.84 6.26 8.34 4.88 8.25 19.01 15.31 22.03 31.6 31.7 14.81 24.15 20.2 21.18 19.29 34.24 28.1 22.01 9.03 5.89 7.94 10.22 11.85
Sro2125_g315690.1 (Contig3267.g25731)
0.87 0.32 0.26 0.46 0.16 1.12 3.32 1.89 1.01 2.14 1.82 3.26 2.12 3.01 2.5 2.24 0.92 1.9 2.35 3.2 3.99 2.59 0.52 3.88 2.29 1.81 1.42
Sro236_g094980.1 (Contig1410.g12936)
12.14 0.49 0.53 0.45 0.61 2.87 13.57 6.67 7.31 19.73 9.38 22.81 35.32 27.36 17.05 36.78 9.17 24.91 24.45 32.44 40.06 24.97 10.99 5.41 9.64 5.14 6.43
Sro2397_g326050.1 (Contig2368.g19492)
0.35 1.4 1.05 0.81 0.79 0.85 2.47 1.06 1.5 3.11 2.52 4.02 3.91 4.06 3.2 4.46 2.53 2.86 2.83 4.97 4.93 4.97 1.97 1.49 2.12 1.39 1.58
Sro2464_g328450.1 (Contig2847.g22840)
0.0 0.79 0.33 0.42 0.0 0.0 2.81 0.16 2.51 3.96 3.81 7.58 10.03 5.54 2.75 5.19 0.36 1.9 3.06 14.29 7.35 8.2 2.41 3.71 5.02 3.42 1.15
Sro246_g097790.1 (Contig171.g1963)
1.63 18.88 13.52 15.07 13.48 7.36 17.58 7.91 13.96 23.47 15.11 25.23 43.16 31.41 15.71 15.73 10.03 11.29 17.26 39.1 30.97 33.45 14.28 10.63 22.1 11.96 14.21
Sro256_g100610.1 (Contig3587.g27706)
0.17 0.31 0.4 0.17 0.08 0.77 2.41 0.56 0.88 3.48 3.04 3.36 5.64 4.59 3.18 4.33 4.29 3.42 2.67 7.03 5.02 4.45 0.89 3.2 5.7 2.3 2.44
Sro2646_g333570.1 (Contig1915.g16542)
0.45 5.5 3.26 3.99 4.31 13.26 19.06 9.41 11.87 16.83 10.19 18.67 25.07 24.56 13.28 9.31 8.5 19.05 12.97 28.83 22.77 27.43 12.71 7.06 14.18 8.0 7.78
Sro271_g104400.1 (Contig2573.g20873)
2.39 12.37 16.08 15.32 15.04 10.2 38.16 22.62 22.86 58.22 43.35 70.09 96.52 98.25 49.08 72.15 55.96 50.66 42.25 105.75 76.35 89.97 33.03 30.74 51.76 50.03 30.34
Sro272_g104930.1 (Contig2144.g18034)
0.25 0.42 0.21 0.2 0.62 1.84 6.53 3.83 4.55 8.28 8.91 7.88 16.51 15.89 10.57 25.01 8.47 15.52 8.72 18.71 12.51 12.7 4.53 5.12 4.37 6.48 4.03
Sro2786_g337040.1 (Contig3248.g25652)
0.0 3.06 2.02 2.43 3.49 2.15 4.08 2.63 3.06 7.26 6.12 8.53 13.68 11.25 6.9 10.65 3.79 6.22 8.0 13.17 7.82 7.06 2.83 3.94 5.02 3.98 5.72
Sro2821_g337940.1 (Contig2953.g23407)
0.06 0.57 0.32 0.76 0.69 2.82 6.84 3.75 3.03 7.29 4.68 6.09 11.67 11.73 8.84 17.95 8.06 14.94 7.32 15.28 12.56 20.17 5.08 6.83 9.57 4.65 5.77
Sro285_g108170.1 (Contig491.g6623)
2.63 0.65 1.02 0.54 0.72 3.91 9.35 3.51 8.57 13.74 7.73 21.66 18.11 18.22 9.55 13.23 11.9 10.3 11.18 24.54 22.56 13.53 6.54 5.73 9.02 7.73 4.67
Sro3157_g344560.1 (Contig789.g8803)
0.15 0.08 0.08 0.17 0.13 0.09 2.0 2.26 1.14 2.24 0.66 3.3 7.94 0.38 0.42 0.35 0.72 2.88 2.12 8.21 2.53 4.0 0.98 0.15 0.91 0.58 0.44
Sro31_g020540.1 (Contig420.g5649)
0.65 1.07 0.69 0.68 0.58 1.6 6.18 3.51 2.88 5.71 5.28 6.14 15.31 7.38 6.35 4.84 4.34 5.07 6.51 14.03 5.7 9.59 2.44 6.9 8.18 4.96 3.41
Sro35_g022420.1 (Contig3323.g26119)
1.06 8.38 6.66 5.53 5.26 4.44 11.49 7.27 7.89 14.5 16.69 22.25 25.76 13.1 12.6 19.19 12.97 8.39 11.77 23.45 12.41 15.3 7.37 7.93 11.87 6.18 9.39
Sro371_g128600.1 (Contig736.g8438)
0.03 0.82 0.67 0.34 0.36 0.54 2.15 0.74 2.56 3.15 1.76 4.17 10.73 5.79 2.96 5.45 2.98 3.16 3.74 8.43 4.92 6.82 2.04 1.45 2.07 2.01 1.48
Sro3794_g351100.1 (Contig2283.g18900)
0.03 0.06 0.06 0.05 0.05 1.23 5.49 1.56 2.85 5.29 7.55 6.02 12.35 8.76 7.66 5.42 3.91 2.82 3.98 12.76 5.81 4.89 2.21 2.16 2.46 1.35 2.73
Sro379_g130490.1 (Contig3398.g26566)
0.13 0.89 1.1 0.56 0.68 0.33 2.52 1.24 1.05 3.14 1.98 3.52 8.25 5.45 2.5 2.3 1.67 2.64 1.84 8.36 4.02 5.03 1.39 1.63 1.69 1.18 0.79
Sro383_g131230.1 (Contig132.g1488)
0.21 0.19 0.29 0.08 0.04 2.17 3.43 1.39 1.35 4.04 3.38 3.49 6.09 4.91 4.28 7.18 1.73 1.98 2.04 6.44 6.2 3.56 0.97 2.27 5.17 2.31 2.86
Sro408_g137010.1 (Contig3193.g25236)
2.79 5.98 5.35 4.02 8.15 22.04 41.95 23.76 28.22 51.3 35.29 63.07 56.49 59.39 44.38 59.93 29.58 41.71 37.98 67.04 72.01 70.35 34.9 30.76 61.57 37.19 32.64
Sro415_g138530.1 (Contig3170.g25088)
1.02 4.37 0.93 1.64 1.81 3.72 23.76 17.3 15.7 18.83 14.53 19.24 41.67 27.1 18.95 19.88 12.33 33.63 20.38 44.01 27.88 23.61 14.53 25.15 40.72 20.51 13.54
Sro419_g139060.1 (Contig4415.g33167)
18.83 140.15 49.09 81.22 101.73 178.42 224.52 144.39 191.65 280.78 251.03 356.14 436.04 434.1 333.15 382.71 225.59 351.33 236.77 447.65 345.56 386.09 174.6 255.69 421.37 263.2 150.75
Sro444_g144340.1 (Contig1407.g12907)
0.54 1.4 1.15 2.88 1.01 0.95 3.79 4.65 1.35 5.16 5.68 5.41 12.48 3.65 5.05 6.72 2.97 9.5 8.95 13.47 8.6 7.97 1.26 3.77 6.13 3.83 3.42
Sro470_g149460.1 (Contig850.g9340)
0.13 0.69 0.6 0.48 0.54 1.78 4.22 3.72 1.43 4.93 4.94 5.02 8.36 4.8 5.58 5.69 2.67 7.23 5.75 11.61 4.52 7.11 1.2 2.91 4.76 2.66 2.08
Sro471_g149710.1 (Contig458.g6184)
0.2 0.53 0.26 0.31 0.37 0.7 4.22 2.25 2.88 4.29 5.09 4.62 10.09 4.98 4.8 7.48 3.41 6.05 5.37 12.76 6.26 8.84 2.75 2.52 3.35 2.85 3.98
Sro524_g160000.1 (Contig202.g2397)
0.09 0.57 0.0 0.31 0.51 0.58 0.85 0.18 1.09 3.65 1.61 2.09 21.33 9.18 2.88 9.49 1.54 5.44 5.5 15.46 4.99 9.34 1.07 0.39 0.66 2.16 1.05
Sro530_g161220.1 (Contig4609.g34407)
0.59 0.22 0.27 0.05 0.34 0.75 4.29 1.92 4.43 6.77 3.55 6.45 12.81 8.44 4.18 9.41 4.88 8.84 5.8 16.83 11.71 12.73 3.27 3.82 9.32 4.03 1.73
Sro538_g162560.1 (Contig95.g1097)
0.75 2.81 4.39 3.54 4.43 10.91 23.57 15.65 13.9 26.4 20.05 28.61 36.46 34.88 25.2 29.37 19.3 22.24 23.13 49.32 35.35 33.5 15.17 15.11 29.01 25.72 18.68
Sro54_g031780.1 (Contig2430.g19866)
0.42 1.65 2.37 1.93 2.88 6.75 5.62 2.19 2.26 12.32 11.99 15.85 15.9 15.15 10.2 14.83 9.13 5.12 9.45 15.22 11.51 10.7 2.65 6.78 7.71 6.28 8.78
Sro599_g173270.1 (Contig1154.g11038)
12.16 22.85 19.87 17.32 13.18 31.87 67.31 38.16 45.73 91.89 48.91 122.51 104.75 96.48 70.53 86.89 52.81 86.45 93.27 108.27 115.48 86.64 56.44 41.08 69.03 51.46 40.03
Sro59_g034420.1 (Contig571.g7288)
4.19 21.67 31.49 20.04 19.44 23.53 89.25 48.92 69.94 87.58 64.26 115.72 211.14 139.32 100.55 101.72 47.51 86.0 75.46 201.34 90.68 234.48 87.55 54.23 90.8 71.69 35.39
Sro623_g177090.1 (Contig3858.g29688)
0.09 0.91 0.78 0.39 0.38 3.23 9.08 5.46 3.47 8.98 9.32 8.76 13.37 7.13 9.73 10.84 5.71 10.63 7.69 14.02 13.28 15.91 3.37 9.62 13.68 9.51 6.51
Sro623_g177110.1 (Contig3858.g29690)
0.09 0.52 0.53 0.85 0.38 4.95 4.05 2.05 1.99 8.21 5.73 9.61 11.53 16.64 5.78 5.3 5.17 4.34 3.65 11.33 6.81 7.3 1.75 2.65 3.78 3.72 5.54
Sro691_g187790.1 (Contig1133.g10874)
0.9 3.41 3.66 2.34 3.26 4.94 8.2 8.73 12.22 16.56 9.91 18.11 48.41 21.18 12.89 17.34 10.87 19.47 19.73 45.49 22.54 37.15 10.03 5.66 14.29 7.16 5.58
Sro692_g188180.1 (Contig950.g9826)
0.92 0.62 0.24 0.25 1.11 5.13 15.66 10.64 10.3 22.46 14.91 22.09 36.14 47.2 19.35 37.96 15.99 24.66 12.67 33.5 32.75 24.63 10.09 11.67 29.3 22.24 10.3
Sro695_g188580.1 (Contig4098.g31305)
0.4 3.08 1.53 1.6 3.08 4.69 11.2 5.26 5.61 15.55 14.87 16.55 23.92 23.71 16.51 34.25 13.15 13.88 14.58 28.16 18.39 19.8 7.16 10.31 8.79 8.83 14.15
Sro696_g188960.1 (Contig116.g1336)
2.12 0.92 0.75 0.71 0.36 1.78 6.6 4.71 4.73 8.11 4.66 10.0 18.13 8.63 5.84 6.72 5.97 5.19 5.05 21.94 10.96 11.73 5.14 4.23 9.45 3.76 3.67
Sro713_g191550.1 (Contig2997.g23822)
10.83 50.42 13.84 24.0 28.64 78.15 72.73 42.14 28.58 94.55 94.64 109.64 154.07 142.56 100.41 89.31 71.97 105.34 105.59 151.67 142.67 144.93 56.89 94.97 160.35 71.45 43.83
Sro725_g193390.1 (Contig3530.g27291)
0.01 0.12 0.02 0.02 0.02 0.52 1.51 1.21 0.54 1.71 1.36 2.16 3.64 2.0 2.05 1.54 0.92 2.82 2.67 4.56 1.96 2.77 0.42 1.79 1.46 1.15 1.23
Sro752_g197230.1 (Contig1730.g15447)
0.23 0.23 0.3 0.1 0.28 1.6 4.48 2.46 1.75 5.1 5.21 5.8 8.86 7.2 5.91 8.67 2.94 3.48 2.43 8.72 9.23 6.33 2.07 4.07 7.29 4.54 3.82
Sro808_g205350.1 (Contig630.g7644)
0.26 1.74 0.75 0.35 0.51 3.91 6.01 3.24 2.79 8.45 6.85 8.55 24.91 19.82 12.86 5.25 5.53 9.78 5.73 24.52 15.18 14.02 3.17 5.6 14.72 10.63 2.91
Sro83_g044430.1 (Contig4450.g33417)
0.08 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.32 0.6 0.6 0.89 0.22 1.15 4.46 0.89 0.35 0.09 0.0 0.96 1.09 3.99 0.69 1.92 0.05 0.11 0.26 0.21 0.12
Sro868_g213260.1 (Contig2961.g23528)
0.4 1.86 1.22 1.4 1.43 3.03 6.46 4.34 2.75 8.31 6.95 7.18 12.22 8.83 9.76 11.57 5.92 13.8 9.29 15.9 10.51 11.42 2.47 7.04 10.93 7.96 6.82
Sro88_g046330.1 (Contig265.g3291)
0.26 8.37 3.43 2.22 2.15 6.82 22.82 13.73 16.98 26.19 12.34 32.12 48.8 42.98 20.04 22.55 5.77 19.26 21.88 52.43 46.58 39.43 16.43 21.11 33.62 16.47 12.81
Sro944_g222960.1 (Contig4161.g31788)
0.27 3.87 1.18 1.9 0.89 3.57 3.11 1.65 1.8 8.51 6.39 13.75 12.56 18.1 7.73 9.08 6.0 7.78 8.42 13.84 6.29 11.96 2.26 4.95 4.84 2.29 5.66
Sro9_g007430.1 (Contig4120.g31511)
6.42 21.81 9.42 18.1 21.67 48.92 52.5 37.07 35.83 70.69 65.59 83.57 105.67 115.69 66.72 93.5 73.28 85.24 81.63 109.34 79.29 73.24 46.13 50.39 44.89 41.42 52.66

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)