Heatmap: Cluster_299 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051580.1 (Contig348.g4711)
0.03 0.22 0.1 0.17 0.19 0.26 0.42 0.23 0.19 0.51 0.39 0.56 0.72 1.0 0.48 0.77 0.42 0.48 0.61 0.71 0.45 0.65 0.31 0.34 0.43 0.42 0.33
0.01 0.12 0.11 0.06 0.06 0.04 0.27 0.11 0.47 0.39 0.34 0.24 0.7 0.79 0.52 1.0 0.48 0.48 0.54 0.84 0.36 0.58 0.26 0.06 0.12 0.12 0.25
Sro1063_g237130.1 (Contig4044.g31064)
0.0 0.15 0.18 0.19 0.24 0.08 0.14 0.05 0.48 0.32 0.19 0.31 0.86 0.83 0.39 1.0 0.44 0.36 0.42 0.77 0.42 0.42 0.28 0.05 0.17 0.24 0.11
Sro1146_g246340.1 (Contig2727.g21995)
0.04 0.59 0.55 0.42 0.37 0.33 0.92 0.54 0.57 0.7 0.67 0.86 1.0 0.77 0.74 0.96 0.67 0.39 0.47 0.79 0.84 0.79 0.56 0.59 0.47 0.5 0.6
Sro1165_g248070.1 (Contig3103.g24678)
0.03 0.29 0.06 0.14 0.19 0.15 0.26 0.12 0.22 0.4 0.24 0.4 1.0 0.65 0.37 0.39 0.45 0.4 0.37 0.86 0.6 0.5 0.19 0.14 0.22 0.07 0.13
Sro11_g008890.1 (Contig724.g8363)
0.03 0.28 0.25 0.11 0.15 0.14 0.49 0.28 0.41 0.42 0.35 0.52 0.52 0.42 0.33 0.42 0.28 0.38 0.54 1.0 0.43 0.53 0.44 0.29 0.16 0.18 0.29
Sro1220_g253540.1 (Contig4141.g31641)
0.01 0.27 0.13 0.12 0.09 0.05 0.11 0.06 0.21 0.4 0.16 0.48 0.53 1.0 0.26 0.65 0.39 0.26 0.48 0.65 0.58 0.44 0.21 0.03 0.03 0.24 0.16
Sro1270_g257910.1 (Contig750.g8554)
0.0 0.28 0.19 0.13 0.06 0.06 0.3 0.13 0.08 0.3 0.35 0.21 0.66 0.11 0.37 0.47 0.18 0.54 0.5 1.0 0.39 0.09 0.05 0.27 0.29 0.26 0.32
Sro1384_g268050.1 (Contig2234.g18567)
0.02 0.08 0.09 0.06 0.04 0.03 0.41 0.22 0.43 0.33 0.28 0.3 0.78 0.32 0.28 0.53 0.31 0.47 0.44 1.0 0.43 0.64 0.28 0.18 0.09 0.15 0.22
Sro1395_g269070.1 (Contig847.g9324)
0.51 0.74 0.69 0.51 0.36 0.19 0.52 0.28 0.58 0.53 0.55 0.52 0.74 0.6 0.46 0.5 0.53 0.38 0.42 1.0 0.6 0.53 0.53 0.24 0.12 0.21 0.4
Sro1481_g276210.1 (Contig2701.g21754)
0.05 0.18 0.12 0.13 0.09 0.11 0.15 0.05 0.12 0.38 0.28 0.36 0.76 0.77 0.4 0.62 0.34 0.42 0.5 1.0 0.58 0.54 0.13 0.2 0.24 0.21 0.24
Sro1488_g276890.1 (Contig1217.g11423)
0.02 0.08 0.19 0.03 0.03 0.08 0.22 0.16 0.19 0.41 0.38 0.43 0.69 0.53 0.39 0.54 0.3 0.4 0.48 1.0 0.72 0.62 0.24 0.21 0.18 0.35 0.36
Sro154_g070060.1 (Contig2716.g21884)
0.03 0.08 0.04 0.02 0.02 0.19 0.66 0.48 0.61 0.45 0.47 0.49 0.7 0.6 0.52 0.53 0.37 0.68 0.47 1.0 0.63 0.44 0.56 0.3 0.17 0.13 0.38
Sro174_g076840.1 (Contig4298.g32468)
0.01 0.13 0.21 0.07 0.04 0.17 0.25 0.13 0.45 0.39 0.32 0.49 1.0 0.51 0.37 0.66 0.52 0.39 0.54 0.93 0.53 0.51 0.26 0.19 0.16 0.21 0.27
Sro1790_g297740.1 (Contig4724.g35072)
0.05 0.33 0.19 0.11 0.13 0.18 0.32 0.18 0.3 0.57 0.41 0.74 0.63 0.69 0.44 0.59 0.28 0.48 0.69 1.0 0.74 0.66 0.35 0.28 0.25 0.33 0.4
Sro1796_g298120.1 (Contig441.g5925)
0.01 0.16 0.25 0.15 0.13 0.17 0.29 0.17 0.31 0.38 0.37 0.44 1.0 0.59 0.37 0.48 0.41 0.5 0.63 0.99 0.47 0.54 0.36 0.19 0.19 0.21 0.25
Sro20_g013870.1 (Contig2954.g23417)
0.04 0.08 0.12 0.07 0.07 0.1 0.32 0.2 0.36 0.42 0.3 0.46 0.47 0.29 0.28 0.25 0.17 0.27 0.38 1.0 0.56 0.41 0.24 0.17 0.09 0.09 0.23
Sro20_g013890.1 (Contig2954.g23419)
0.0 0.21 0.15 0.13 0.06 0.01 0.17 0.05 0.24 0.24 0.19 0.19 1.0 0.39 0.25 0.25 0.41 0.41 0.42 0.89 0.43 0.33 0.22 0.12 0.25 0.04 0.06
Sro2117_g315230.1 (Contig3258.g25693)
0.03 0.27 0.21 0.24 0.18 0.18 0.43 0.49 0.16 0.44 0.32 0.53 0.96 0.21 0.49 0.59 0.16 0.4 0.44 1.0 0.47 0.04 0.12 0.37 0.23 0.16 0.49
Sro2151_g316710.1 (Contig2086.g17790)
0.02 0.49 0.68 0.43 0.38 0.32 0.45 0.32 0.38 0.61 0.75 0.63 1.0 0.75 0.74 0.95 0.96 0.75 0.74 1.0 0.71 0.76 0.43 0.5 0.31 0.41 0.45
0.0 0.07 0.1 0.05 0.01 0.01 0.19 0.19 0.1 0.25 0.02 0.2 0.29 0.06 0.21 0.61 0.12 0.11 0.15 1.0 0.21 0.24 0.07 0.12 0.07 0.16 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.0 0.08 0.42 0.14 0.37 1.0 0.57 0.31 0.91 0.22 0.67 0.69 0.77 1.0 0.02 0.08 0.18 0.02 0.09 0.22
Sro2203_g318940.1 (Contig3463.g26860)
0.02 0.13 0.08 0.04 0.06 0.09 0.31 0.15 0.24 0.36 0.24 0.41 1.0 0.47 0.3 0.39 0.22 0.37 0.36 0.86 0.55 0.51 0.26 0.13 0.17 0.12 0.18
Sro23_g015990.1 (Contig2259.g18749)
0.0 0.05 0.05 0.02 0.03 0.06 0.15 0.09 0.1 0.27 0.18 0.24 0.44 1.0 0.43 0.88 0.31 0.31 0.33 0.43 0.26 0.5 0.17 0.07 0.19 0.23 0.11
Sro2555_g331130.1 (Contig261.g3243)
0.03 0.25 0.25 0.15 0.13 0.14 0.32 0.3 0.48 0.46 0.34 0.58 0.82 0.53 0.35 0.43 0.4 0.41 0.47 1.0 0.57 0.61 0.35 0.25 0.19 0.23 0.25
Sro263_g102230.1 (Contig612.g7545)
0.53 0.39 0.36 0.22 0.23 0.13 0.36 0.25 0.47 0.4 0.26 0.29 0.91 0.66 0.34 0.4 0.29 0.34 0.33 1.0 0.57 0.89 0.38 0.22 0.13 0.14 0.17
Sro2654_g333800.1 (Contig2938.g23357)
0.0 0.15 0.1 0.04 0.09 0.14 0.38 0.23 0.2 0.53 0.39 0.65 0.66 0.75 0.47 0.53 0.36 0.67 0.7 1.0 0.77 0.48 0.18 0.29 0.42 0.47 0.36
Sro2795_g337300.1 (Contig2797.g22500)
0.01 0.42 0.26 0.36 0.36 0.11 0.34 0.18 0.27 0.48 0.45 0.64 1.0 0.76 0.48 0.92 0.53 0.37 0.39 0.76 0.5 0.5 0.28 0.15 0.23 0.25 0.25
Sro350_g123710.1 (Contig1556.g14141)
0.03 0.05 0.03 0.03 0.03 0.17 0.34 0.2 0.22 0.43 0.43 0.43 0.96 0.64 0.47 0.87 0.35 0.48 0.56 1.0 0.53 0.53 0.29 0.19 0.11 0.19 0.38
Sro3886_g351690.1 (Contig1192.g11275)
0.04 0.19 0.13 0.07 0.09 0.2 0.72 0.34 0.31 0.49 0.29 0.36 0.82 0.49 0.63 0.9 0.39 0.84 0.66 1.0 0.74 0.85 0.37 0.73 0.86 0.5 0.25
0.05 0.11 0.04 0.09 0.13 0.26 0.75 0.51 0.41 0.59 0.11 0.54 0.63 0.46 0.62 0.73 0.29 0.69 0.65 1.0 0.51 0.98 0.5 0.35 0.6 0.43 0.27
Sro414_g138210.1 (Contig453.g6096)
0.03 0.88 0.76 0.66 0.44 0.31 0.57 0.37 0.53 0.74 0.81 0.96 0.94 0.82 0.66 0.71 0.81 0.7 0.85 1.0 0.86 0.76 0.52 0.4 0.32 0.37 0.63
Sro414_g138270.1 (Contig453.g6102)
0.01 0.68 0.56 0.41 0.37 0.22 0.61 0.39 0.49 0.63 0.59 0.75 1.0 0.63 0.58 0.72 0.55 0.56 0.58 0.87 0.86 0.61 0.39 0.51 0.54 0.42 0.39
Sro419_g139150.1 (Contig4415.g33176)
0.03 0.13 0.03 0.04 0.03 0.23 0.47 0.28 0.34 0.54 0.5 0.47 0.61 0.88 0.58 1.0 0.49 0.77 0.64 0.99 0.68 0.56 0.36 0.23 0.13 0.18 0.44
Sro419_g139160.1 (Contig4415.g33177)
0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.16 0.18 0.08 0.15 0.52 0.37 0.54 0.67 1.0 0.52 0.88 0.36 0.74 0.75 0.83 0.87 0.16 0.16 0.2 0.08 0.11 0.39
Sro492_g153940.1 (Contig2481.g20320)
0.01 0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 0.34 0.24 0.34 0.27 0.17 0.36 1.0 0.61 0.33 0.21 0.26 0.4 0.23 0.82 0.45 0.32 0.23 0.15 0.33 0.14 0.09
Sro495_g154530.1 (Contig3243.g25633)
0.01 0.08 0.07 0.07 0.08 0.15 0.29 0.16 0.29 0.42 0.25 0.41 0.9 0.77 0.37 0.89 0.28 0.5 0.7 1.0 0.53 0.69 0.24 0.07 0.06 0.15 0.16
Sro498_g154920.1 (Contig3753.g28746)
0.06 0.15 0.11 0.03 0.03 0.13 0.41 0.19 0.45 0.34 0.48 0.36 0.93 0.59 0.48 0.53 0.56 0.44 0.4 1.0 0.38 0.5 0.47 0.2 0.12 0.1 0.22
Sro516_g158550.1 (Contig3306.g25919)
0.1 0.16 0.09 0.05 0.04 0.14 0.37 0.31 0.32 0.44 0.62 0.48 0.82 0.62 0.59 0.65 0.64 0.69 0.32 1.0 0.51 0.56 0.35 0.45 0.25 0.15 0.35
Sro536_g162200.1 (Contig299.g3950)
0.36 0.02 0.01 0.04 0.02 0.08 0.31 0.16 0.31 0.32 0.27 0.38 1.0 0.46 0.31 0.35 0.23 0.4 0.19 0.81 0.45 0.37 0.25 0.17 0.16 0.12 0.1
Sro567_g168080.1 (Contig3851.g29664)
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.19 0.09 0.21 0.2 0.15 0.17 0.76 0.41 0.21 0.19 0.14 0.32 0.27 1.0 0.18 0.41 0.17 0.07 0.06 0.06 0.08
Sro588_g171530.1 (Contig4679.g34795)
0.0 0.09 0.18 0.02 0.03 0.07 0.21 0.09 0.26 0.36 0.32 0.37 0.73 1.0 0.47 0.78 0.3 0.38 0.39 0.93 0.51 0.48 0.19 0.12 0.14 0.19 0.13
Sro59_g034090.1 (Contig571.g7255)
0.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.26 0.07 0.1 0.32 0.18 0.33 0.4 0.35 0.3 0.5 0.1 0.33 0.25 1.0 0.33 0.25 0.08 0.15 0.14 0.15 0.12
0.02 0.23 0.2 0.18 0.14 0.14 0.4 0.19 0.23 0.4 0.36 0.34 0.58 0.27 0.28 0.35 0.39 0.4 0.49 1.0 0.49 0.4 0.28 0.35 0.39 0.26 0.29
Sro646_g180730.1 (Contig2967.g23571)
0.2 0.02 0.01 0.01 0.01 0.13 0.4 0.17 0.22 0.4 0.35 0.46 0.55 0.77 0.45 0.83 0.31 0.79 0.5 1.0 0.5 0.19 0.23 0.41 0.15 0.12 0.3
Sro68_g038330.1 (Contig2027.g17414)
0.01 0.46 0.36 0.34 0.29 0.18 0.51 0.48 0.13 0.51 0.45 0.51 0.87 0.19 0.57 0.82 0.21 0.63 0.73 1.0 0.77 0.13 0.15 0.35 0.49 0.35 0.44
Sro714_g191660.1 (Contig596.g7419)
0.09 0.64 0.73 0.35 0.35 0.19 0.48 0.33 0.56 0.55 0.51 0.58 0.97 0.61 0.49 0.52 0.43 0.57 0.57 1.0 0.59 0.58 0.46 0.25 0.12 0.27 0.4
Sro714_g191670.1 (Contig596.g7420)
0.03 0.08 0.04 0.02 0.03 0.09 0.35 0.24 0.15 0.33 0.29 0.19 1.0 0.11 0.45 0.67 0.23 0.74 0.53 0.87 0.45 0.11 0.07 0.34 0.51 0.25 0.39
Sro73_g040480.1 (Contig3929.g30149)
0.01 0.58 0.47 0.31 0.3 0.17 0.5 0.26 0.4 0.51 0.61 0.69 1.0 0.86 0.5 0.54 0.4 0.58 0.53 1.0 0.56 0.49 0.45 0.28 0.15 0.31 0.39
Sro75_g041210.1 (Contig2656.g21493)
0.0 0.04 0.14 0.02 0.02 0.04 0.52 0.32 0.03 0.32 0.22 0.16 0.59 0.05 0.52 0.39 0.2 1.0 0.52 0.96 0.54 0.11 0.02 0.21 0.48 0.29 0.33
Sro767_g199500.1 (Contig2377.g19538)
0.01 0.12 0.29 0.12 0.1 0.08 0.46 0.16 0.62 0.4 0.2 0.59 1.0 0.9 0.58 0.52 0.24 0.14 0.11 0.68 0.69 0.53 0.28 0.16 0.32 0.22 0.19
Sro792_g203060.1 (Contig385.g5174)
0.03 0.0 0.02 0.01 0.03 0.06 0.2 0.26 0.27 0.19 0.24 0.29 0.69 0.15 0.24 0.17 0.08 0.33 0.33 1.0 0.3 0.21 0.19 0.06 0.01 0.11 0.13
0.01 0.08 0.02 0.03 0.02 0.12 0.26 0.15 0.21 0.31 0.34 0.28 0.64 0.26 0.33 0.37 0.33 0.3 0.31 1.0 0.48 0.28 0.2 0.09 0.07 0.13 0.25
Sro807_g205230.1 (Contig531.g6909)
0.04 0.87 0.9 0.45 0.42 0.28 0.57 0.36 0.58 0.61 0.68 0.72 0.82 0.76 0.55 0.49 0.77 0.49 0.63 1.0 0.79 0.75 0.53 0.39 0.25 0.38 0.46
Sro84_g045080.1 (Contig220.g2641)
0.01 0.04 0.03 0.03 0.02 0.07 0.21 0.06 0.34 0.35 0.25 0.37 0.77 0.59 0.29 0.68 0.26 0.47 0.75 1.0 0.67 0.73 0.24 0.16 0.18 0.29 0.13
Sro87_g045930.1 (Contig2014.g17201)
0.03 0.29 0.29 0.2 0.2 0.06 0.32 0.25 0.28 0.42 0.27 0.4 0.7 0.32 0.39 0.58 0.18 0.62 0.72 1.0 0.58 0.54 0.51 0.31 0.19 0.18 0.29
Sro88_g046400.1 (Contig265.g3298)
0.09 0.37 0.45 0.26 0.18 0.11 0.17 0.2 0.14 0.4 0.3 0.4 0.45 0.22 0.28 0.32 0.25 0.21 0.47 1.0 0.46 0.27 0.11 0.16 0.11 0.17 0.28
Sro98_g050510.1 (Contig3362.g26343)
0.01 0.04 0.02 0.01 0.02 0.1 0.36 0.15 0.33 0.32 0.27 0.32 0.78 0.57 0.34 0.55 0.25 0.42 0.35 1.0 0.42 0.48 0.31 0.17 0.13 0.14 0.14
Sro992_g228800.1 (Contig4505.g33783)
0.0 0.03 0.03 0.01 0.0 0.08 0.2 0.11 0.1 0.26 0.25 0.19 1.0 0.18 0.32 0.32 0.2 0.35 0.45 0.87 0.26 0.32 0.1 0.13 0.13 0.15 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)