Heatmap: Cluster_299 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051580.1 (Contig348.g4711)
2.6 16.86 7.14 12.54 14.26 19.24 31.44 17.26 14.23 38.08 29.41 41.93 53.94 75.08 35.8 57.95 31.2 36.27 45.5 53.37 33.46 49.14 23.6 25.27 32.14 31.66 24.99
0.04 0.65 0.63 0.34 0.31 0.2 1.48 0.6 2.55 2.15 1.89 1.29 3.81 4.32 2.85 5.48 2.64 2.64 2.95 4.6 1.98 3.19 1.44 0.3 0.68 0.67 1.38
Sro1063_g237130.1 (Contig4044.g31064)
0.0 3.69 4.33 4.61 5.97 2.05 3.5 1.21 11.78 7.75 4.67 7.66 21.07 20.32 9.41 24.4 10.64 8.89 10.3 18.79 10.28 10.34 6.95 1.11 4.21 5.97 2.72
Sro1146_g246340.1 (Contig2727.g21995)
0.19 2.91 2.72 2.06 1.8 1.62 4.51 2.66 2.81 3.43 3.28 4.23 4.92 3.77 3.62 4.74 3.27 1.94 2.32 3.9 4.13 3.89 2.73 2.92 2.34 2.44 2.95
Sro1165_g248070.1 (Contig3103.g24678)
0.28 2.44 0.46 1.14 1.6 1.24 2.16 1.03 1.83 3.39 2.02 3.4 8.41 5.43 3.11 3.28 3.78 3.39 3.1 7.24 5.04 4.24 1.61 1.19 1.87 0.58 1.1
Sro11_g008890.1 (Contig724.g8363)
0.47 4.89 4.44 1.94 2.55 2.45 8.66 4.93 7.19 7.43 6.07 9.06 9.22 7.45 5.75 7.46 4.95 6.66 9.49 17.57 7.6 9.35 7.7 5.12 2.88 3.1 5.05
Sro1220_g253540.1 (Contig4141.g31641)
0.09 1.64 0.82 0.75 0.56 0.31 0.65 0.38 1.28 2.48 1.0 2.97 3.26 6.17 1.59 4.0 2.42 1.59 2.95 3.99 3.58 2.74 1.3 0.19 0.16 1.49 0.99
Sro1270_g257910.1 (Contig750.g8554)
0.01 2.95 2.0 1.37 0.63 0.63 3.15 1.4 0.85 3.19 3.72 2.17 6.93 1.12 3.9 4.9 1.87 5.68 5.21 10.51 4.07 0.96 0.54 2.79 3.06 2.77 3.37
Sro1384_g268050.1 (Contig2234.g18567)
0.07 0.35 0.39 0.28 0.18 0.14 1.83 1.0 1.92 1.49 1.24 1.36 3.5 1.43 1.25 2.39 1.39 2.11 1.97 4.49 1.95 2.89 1.25 0.8 0.4 0.66 1.0
Sro1395_g269070.1 (Contig847.g9324)
14.51 21.17 19.66 14.43 10.3 5.34 14.91 7.9 16.45 15.17 15.53 14.84 20.95 17.18 13.08 14.22 14.99 10.93 11.9 28.48 17.16 14.97 15.02 6.82 3.39 5.95 11.26
Sro1481_g276210.1 (Contig2701.g21754)
0.49 1.88 1.28 1.33 0.96 1.15 1.56 0.57 1.22 4.0 2.98 3.77 7.98 8.09 4.16 6.49 3.51 4.39 5.26 10.46 6.03 5.63 1.4 2.14 2.5 2.23 2.46
Sro1488_g276890.1 (Contig1217.g11423)
0.27 1.33 3.26 0.46 0.5 1.41 3.74 2.68 3.17 6.94 6.41 7.27 11.63 8.93 6.49 9.09 5.13 6.68 8.07 16.82 12.18 10.42 4.11 3.61 3.09 5.91 6.0
Sro154_g070060.1 (Contig2716.g21884)
0.25 0.72 0.37 0.2 0.18 1.68 5.94 4.37 5.5 4.07 4.21 4.43 6.33 5.45 4.75 4.8 3.3 6.18 4.21 9.05 5.69 4.01 5.08 2.73 1.52 1.14 3.46
Sro174_g076840.1 (Contig4298.g32468)
0.05 0.72 1.18 0.41 0.24 0.99 1.42 0.74 2.58 2.26 1.85 2.81 5.72 2.89 2.14 3.76 2.98 2.25 3.08 5.31 3.02 2.91 1.47 1.1 0.93 1.23 1.56
Sro1790_g297740.1 (Contig4724.g35072)
0.57 3.93 2.26 1.3 1.56 2.18 3.81 2.15 3.55 6.71 4.84 8.76 7.43 8.16 5.18 6.99 3.29 5.63 8.15 11.85 8.79 7.84 4.19 3.3 2.96 3.94 4.74
Sro1796_g298120.1 (Contig441.g5925)
0.42 5.97 9.2 5.48 4.59 6.14 10.54 6.31 11.33 13.73 13.66 16.1 36.6 21.42 13.41 17.55 15.07 18.3 23.18 36.14 17.22 19.76 13.18 6.95 7.01 7.73 9.01
Sro20_g013870.1 (Contig2954.g23417)
0.28 0.53 0.84 0.51 0.46 0.7 2.26 1.4 2.51 2.91 2.11 3.18 3.29 2.01 1.96 1.76 1.2 1.88 2.62 6.98 3.9 2.87 1.7 1.19 0.62 0.63 1.58
Sro20_g013890.1 (Contig2954.g23419)
0.03 1.9 1.35 1.2 0.53 0.12 1.48 0.48 2.11 2.13 1.73 1.7 8.94 3.45 2.28 2.21 3.64 3.7 3.76 7.93 3.86 2.92 2.01 1.09 2.2 0.32 0.54
Sro2117_g315230.1 (Contig3258.g25693)
0.45 3.6 2.89 3.31 2.48 2.5 5.83 6.6 2.22 6.02 4.3 7.11 13.05 2.79 6.68 8.04 2.22 5.37 6.01 13.54 6.35 0.56 1.58 5.04 3.08 2.13 6.63
Sro2151_g316710.1 (Contig2086.g17790)
1.65 46.85 64.38 41.31 36.66 30.5 43.34 30.58 35.9 57.83 71.75 60.44 94.94 71.66 70.33 90.51 91.56 71.08 71.02 95.35 67.55 72.26 41.15 47.84 29.44 39.06 42.94
0.02 0.31 0.45 0.2 0.06 0.05 0.8 0.81 0.41 1.07 0.07 0.85 1.23 0.25 0.91 2.61 0.51 0.48 0.63 4.29 0.92 1.01 0.32 0.53 0.28 0.68 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.25 0.0 0.18 0.88 0.3 0.77 2.11 1.19 0.65 1.91 0.46 1.41 1.44 1.63 2.1 0.03 0.18 0.39 0.03 0.19 0.45
Sro2203_g318940.1 (Contig3463.g26860)
0.5 3.45 2.11 1.19 1.62 2.34 8.42 4.09 6.49 9.78 6.57 11.23 27.38 12.99 8.32 10.62 6.1 10.26 9.91 23.61 14.97 13.97 7.2 3.47 4.75 3.39 4.92
Sro23_g015990.1 (Contig2259.g18749)
0.15 2.08 2.03 0.76 1.4 2.45 6.19 3.92 4.42 11.36 7.6 10.03 18.54 42.57 18.23 37.4 13.03 13.33 13.96 18.38 10.91 21.13 7.06 3.14 8.28 9.71 4.73
Sro2555_g331130.1 (Contig261.g3243)
0.3 2.55 2.52 1.58 1.35 1.49 3.25 3.06 4.96 4.68 3.45 5.99 8.44 5.41 3.62 4.44 4.07 4.17 4.78 10.26 5.82 6.22 3.6 2.59 1.96 2.31 2.6
Sro263_g102230.1 (Contig612.g7545)
7.27 5.31 4.91 2.96 3.12 1.8 4.93 3.47 6.42 5.43 3.55 3.97 12.5 9.13 4.72 5.5 4.0 4.61 4.46 13.73 7.79 12.24 5.26 3.0 1.74 1.93 2.37
Sro2654_g333800.1 (Contig2938.g23357)
0.0 0.82 0.54 0.24 0.47 0.76 2.09 1.27 1.11 2.87 2.15 3.57 3.62 4.09 2.56 2.9 1.99 3.67 3.83 5.46 4.21 2.6 1.0 1.61 2.31 2.58 1.99
Sro2795_g337300.1 (Contig2797.g22500)
0.15 5.37 3.38 4.57 4.63 1.36 4.35 2.27 3.45 6.17 5.78 8.23 12.81 9.69 6.11 11.85 6.79 4.8 4.98 9.77 6.42 6.45 3.63 1.87 2.91 3.18 3.22
Sro350_g123710.1 (Contig1556.g14141)
0.43 0.74 0.47 0.43 0.36 2.36 4.76 2.73 3.08 5.94 5.94 5.96 13.34 8.92 6.56 12.1 4.89 6.67 7.76 13.91 7.33 7.38 4.02 2.61 1.55 2.58 5.26
Sro3886_g351690.1 (Contig1192.g11275)
11.12 55.53 36.18 20.43 27.16 58.26 209.06 97.83 88.73 141.49 83.5 102.52 235.46 142.54 180.68 258.3 113.85 241.27 190.59 288.38 212.77 245.21 106.04 210.27 248.59 144.11 72.66
0.81 2.0 0.72 1.7 2.4 4.75 13.48 9.28 7.39 10.64 2.06 9.72 11.33 8.28 11.2 13.23 5.22 12.53 11.69 18.04 9.25 17.66 8.97 6.3 10.74 7.72 4.91
Sro414_g138210.1 (Contig453.g6096)
0.41 14.35 12.28 10.79 7.13 5.08 9.29 6.07 8.69 12.05 13.24 15.66 15.34 13.35 10.65 11.51 13.12 11.42 13.84 16.25 13.98 12.33 8.47 6.48 5.13 6.07 10.22
Sro414_g138270.1 (Contig453.g6102)
0.2 12.38 10.05 7.44 6.79 4.02 11.07 7.09 8.84 11.39 10.64 13.52 18.11 11.47 10.58 13.03 9.96 10.13 10.44 15.82 15.61 11.09 7.09 9.23 9.77 7.57 7.06
Sro419_g139150.1 (Contig4415.g33176)
0.2 0.85 0.2 0.27 0.19 1.56 3.15 1.92 2.29 3.62 3.35 3.13 4.1 5.95 3.91 6.74 3.29 5.16 4.33 6.65 4.57 3.75 2.46 1.54 0.86 1.2 2.95
Sro419_g139160.1 (Contig4415.g33177)
0.13 0.03 0.02 0.0 0.02 0.49 0.56 0.25 0.46 1.56 1.12 1.62 2.04 3.03 1.58 2.65 1.09 2.24 2.28 2.51 2.64 0.5 0.48 0.6 0.25 0.34 1.18
Sro492_g153940.1 (Contig2481.g20320)
0.22 1.08 1.38 0.69 1.06 0.55 9.15 6.41 9.33 7.43 4.56 9.71 27.25 16.72 8.99 5.7 7.09 10.79 6.14 22.41 12.2 8.69 6.28 4.08 9.1 3.87 2.33
Sro495_g154530.1 (Contig3243.g25633)
0.06 0.38 0.31 0.3 0.38 0.67 1.35 0.74 1.34 1.93 1.18 1.91 4.15 3.56 1.69 4.14 1.29 2.3 3.23 4.63 2.47 3.19 1.09 0.33 0.27 0.7 0.74
Sro498_g154920.1 (Contig3753.g28746)
0.96 2.47 1.9 0.5 0.57 2.22 6.83 3.14 7.45 5.73 7.99 6.06 15.49 9.9 8.09 8.77 9.27 7.33 6.68 16.7 6.35 8.27 7.86 3.28 2.0 1.6 3.75
Sro516_g158550.1 (Contig3306.g25919)
1.05 1.73 0.95 0.49 0.45 1.51 3.94 3.35 3.38 4.73 6.61 5.11 8.73 6.68 6.35 6.97 6.85 7.44 3.44 10.71 5.47 6.05 3.77 4.86 2.73 1.57 3.73
Sro536_g162200.1 (Contig299.g3950)
15.63 0.74 0.32 1.58 1.03 3.6 13.66 7.06 13.63 13.9 11.51 16.49 43.36 19.99 13.42 15.09 10.04 17.21 8.44 35.07 19.43 15.89 10.83 7.42 7.08 5.1 4.18
Sro567_g168080.1 (Contig3851.g29664)
0.21 0.36 0.27 0.13 0.14 1.68 7.95 3.88 8.7 8.32 6.48 7.04 32.11 17.21 8.95 8.2 5.81 13.69 11.46 42.34 7.79 17.36 7.39 2.99 2.44 2.69 3.44
Sro588_g171530.1 (Contig4679.g34795)
0.04 0.81 1.59 0.16 0.29 0.67 1.88 0.84 2.34 3.22 2.93 3.38 6.62 9.05 4.25 7.02 2.73 3.41 3.52 8.46 4.66 4.37 1.75 1.06 1.25 1.73 1.2
Sro59_g034090.1 (Contig571.g7255)
0.03 0.25 0.29 0.15 0.23 0.18 2.54 0.69 1.01 3.12 1.8 3.29 3.95 3.45 2.98 5.01 1.01 3.3 2.49 9.92 3.28 2.49 0.78 1.54 1.43 1.44 1.15
0.54 7.07 6.06 5.45 4.41 4.19 12.47 5.75 7.09 12.37 10.97 10.56 17.88 8.3 8.71 10.69 11.96 12.28 15.3 30.91 15.08 12.24 8.56 10.78 11.95 8.08 8.83
Sro646_g180730.1 (Contig2967.g23571)
1.21 0.11 0.05 0.06 0.03 0.8 2.43 1.07 1.37 2.44 2.14 2.83 3.35 4.74 2.78 5.09 1.91 4.87 3.06 6.14 3.05 1.19 1.41 2.5 0.92 0.75 1.83
Sro68_g038330.1 (Contig2027.g17414)
0.07 2.59 2.05 1.9 1.64 1.02 2.9 2.73 0.76 2.87 2.55 2.91 4.91 1.09 3.22 4.66 1.2 3.57 4.11 5.66 4.33 0.73 0.87 2.0 2.75 2.0 2.49
Sro714_g191660.1 (Contig596.g7419)
1.43 9.86 11.31 5.4 5.44 2.93 7.41 5.06 8.61 8.47 7.87 9.03 15.02 9.36 7.5 8.11 6.59 8.86 8.74 15.46 9.13 9.04 7.06 3.86 1.78 4.17 6.18
Sro714_g191670.1 (Contig596.g7420)
0.44 1.38 0.66 0.28 0.44 1.45 5.95 4.09 2.49 5.68 4.99 3.22 16.98 1.81 7.61 11.39 3.99 12.63 8.98 14.7 7.7 1.8 1.17 5.78 8.63 4.19 6.54
Sro73_g040480.1 (Contig3929.g30149)
0.14 7.09 5.69 3.78 3.65 2.09 6.11 3.22 4.89 6.26 7.42 8.41 12.18 10.52 6.05 6.53 4.89 7.08 6.48 12.19 6.84 5.96 5.46 3.39 1.88 3.83 4.7
Sro75_g041210.1 (Contig2656.g21493)
0.0 0.37 1.32 0.18 0.21 0.35 4.84 2.95 0.32 2.94 2.06 1.52 5.44 0.5 4.83 3.64 1.87 9.29 4.87 8.89 4.98 1.01 0.22 1.95 4.44 2.67 3.08
Sro767_g199500.1 (Contig2377.g19538)
0.05 0.44 1.05 0.44 0.38 0.28 1.66 0.58 2.25 1.46 0.73 2.13 3.63 3.26 2.09 1.87 0.87 0.52 0.4 2.45 2.51 1.92 1.01 0.59 1.15 0.78 0.67
Sro792_g203060.1 (Contig385.g5174)
0.68 0.0 0.53 0.35 0.67 1.48 5.15 6.64 6.91 4.95 6.15 7.47 17.72 3.81 6.26 4.45 2.1 8.37 8.52 25.58 7.68 5.44 4.74 1.5 0.38 2.89 3.28
0.15 1.45 0.46 0.47 0.39 2.32 4.81 2.87 3.89 5.77 6.35 5.26 11.87 4.83 6.17 6.87 6.13 5.61 5.84 18.67 9.04 5.18 3.77 1.71 1.22 2.4 4.63
Sro807_g205230.1 (Contig531.g6909)
0.97 23.75 24.72 12.43 11.46 7.73 15.68 9.8 15.93 16.57 18.67 19.66 22.4 20.68 15.08 13.34 21.1 13.32 17.27 27.37 21.5 20.55 14.5 10.79 6.82 10.41 12.61
Sro84_g045080.1 (Contig220.g2641)
0.12 0.56 0.45 0.43 0.21 1.03 2.83 0.83 4.68 4.85 3.51 5.08 10.6 8.17 3.96 9.41 3.51 6.5 10.27 13.77 9.28 9.99 3.28 2.26 2.42 4.04 1.83
Sro87_g045930.1 (Contig2014.g17201)
0.18 2.06 2.0 1.4 1.39 0.4 2.27 1.73 1.94 2.93 1.92 2.83 4.9 2.21 2.72 4.06 1.24 4.35 5.01 7.01 4.04 3.81 3.6 2.16 1.32 1.29 2.07
Sro88_g046400.1 (Contig265.g3298)
1.71 7.3 8.87 5.09 3.64 2.09 3.4 4.0 2.72 7.82 5.88 7.82 8.76 4.27 5.49 6.27 4.83 4.2 9.27 19.66 9.04 5.29 2.18 3.19 2.18 3.43 5.47
Sro98_g050510.1 (Contig3362.g26343)
0.11 0.31 0.17 0.07 0.16 0.78 2.89 1.21 2.71 2.61 2.23 2.58 6.31 4.67 2.78 4.49 2.04 3.45 2.84 8.13 3.41 3.93 2.48 1.37 1.1 1.12 1.17
Sro992_g228800.1 (Contig4505.g33783)
0.01 0.09 0.1 0.05 0.01 0.26 0.67 0.38 0.35 0.86 0.85 0.64 3.37 0.6 1.08 1.08 0.66 1.16 1.51 2.93 0.87 1.07 0.33 0.45 0.43 0.49 0.94

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)