Heatmap: Cluster_322 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro100_g051270.1 (Contig63.g532)
0.01 0.79 1.0 0.64 0.67 0.21 0.47 0.57 0.72 0.36 0.29 0.39 0.66 0.31 0.3 0.25 0.31 0.25 0.41 0.35 0.27 0.5 0.63 0.23 0.28 0.23 0.27
Sro102_g052130.1 (Contig319.g4257)
0.02 0.88 1.0 0.62 0.65 0.25 0.3 0.33 0.48 0.28 0.25 0.24 0.41 0.22 0.26 0.2 0.33 0.36 0.41 0.39 0.28 0.55 0.5 0.14 0.12 0.2 0.19
Sro1041_g234610.1 (Contig1456.g13346)
0.0 1.0 0.17 0.57 0.75 0.06 0.23 0.04 0.22 0.1 0.05 0.04 0.08 0.07 0.04 0.0 0.12 0.13 0.29 0.06 0.01 0.04 0.33 0.0 0.01 0.05 0.03
Sro1042_g234660.1 (Contig734.g8414)
0.0 1.0 0.98 0.54 0.54 0.11 0.3 0.46 0.61 0.24 0.16 0.13 0.29 0.12 0.2 0.16 0.27 0.29 0.32 0.42 0.18 0.47 0.48 0.19 0.07 0.18 0.15
Sro1064_g237230.1 (Contig2708.g21803)
0.02 0.66 1.0 0.38 0.37 0.02 0.18 0.12 0.37 0.17 0.11 0.15 0.17 0.11 0.1 0.1 0.09 0.07 0.13 0.15 0.12 0.29 0.37 0.18 0.06 0.04 0.06
Sro106_g053430.1 (Contig1122.g10740)
0.03 0.88 1.0 0.71 0.64 0.13 0.32 0.27 0.44 0.34 0.5 0.33 0.3 0.31 0.39 0.35 0.49 0.2 0.23 0.47 0.27 0.42 0.41 0.28 0.17 0.19 0.31
Sro1073_g238200.1 (Contig2105.g17884)
0.09 0.48 1.0 0.54 0.49 0.08 0.19 0.2 0.29 0.09 0.13 0.05 0.07 0.02 0.14 0.14 0.13 0.31 0.16 0.05 0.06 0.23 0.37 0.11 0.09 0.12 0.08
Sro1090_g240140.1 (Contig48.g342)
0.01 1.0 0.64 0.35 0.49 0.0 0.04 0.28 0.33 0.12 0.01 0.0 0.07 0.01 0.04 0.03 0.0 0.07 0.2 0.02 0.0 0.23 0.25 0.1 0.14 0.05 0.02
Sro1145_g246270.1 (Contig1590.g14445)
0.02 0.9 1.0 0.53 0.53 0.15 0.25 0.17 0.2 0.3 0.25 0.14 0.15 0.15 0.25 0.16 0.24 0.21 0.34 0.33 0.23 0.55 0.26 0.22 0.16 0.15 0.17
0.1 1.0 0.94 0.92 0.95 0.19 0.2 0.25 0.56 0.28 0.27 0.12 0.09 0.07 0.34 0.07 0.42 0.17 0.07 0.2 0.2 0.48 0.31 0.19 0.06 0.06 0.09
Sro120_g058530.1 (Contig2411.g19731)
0.0 0.67 1.0 0.43 0.74 0.05 0.55 0.52 0.95 0.26 0.04 0.02 0.15 0.08 0.07 0.02 0.17 0.08 0.19 0.26 0.13 0.98 0.62 0.29 0.04 0.11 0.1
Sro1263_g257220.1 (Contig245.g2988)
0.57 0.83 1.0 0.79 0.89 0.27 0.69 0.7 0.91 0.52 0.58 0.49 0.75 0.54 0.53 0.61 0.6 0.35 0.39 0.77 0.31 0.77 0.77 0.35 0.25 0.27 0.37
Sro1265_g257500.1 (Contig3808.g29178)
0.0 0.78 1.0 0.36 0.29 0.03 0.22 0.25 0.2 0.19 0.08 0.02 0.27 0.06 0.16 0.12 0.0 0.19 0.17 0.12 0.05 0.36 0.21 0.18 0.26 0.08 0.07
0.1 0.85 1.0 0.26 0.4 0.08 0.16 0.13 0.21 0.14 0.06 0.09 0.14 0.06 0.07 0.0 0.05 0.08 0.05 0.15 0.11 0.3 0.37 0.11 0.02 0.05 0.07
0.0 0.64 1.0 0.29 0.28 0.07 0.14 0.14 0.33 0.1 0.06 0.04 0.04 0.08 0.12 0.11 0.33 0.07 0.14 0.04 0.04 0.34 0.37 0.06 0.03 0.1 0.07
Sro13_g010230.1 (Contig337.g4564)
0.03 1.0 0.84 0.58 0.72 0.19 0.37 0.43 0.74 0.33 0.19 0.28 0.43 0.4 0.26 0.17 0.37 0.31 0.4 0.31 0.2 0.58 0.65 0.23 0.11 0.16 0.12
Sro141_g065890.1 (Contig65.g613)
0.0 0.95 0.87 0.37 0.37 0.22 0.18 0.31 1.0 0.28 0.31 0.21 0.61 0.28 0.36 0.21 0.68 0.11 0.11 0.95 0.14 0.56 0.79 0.23 0.06 0.3 0.25
Sro1455_g274150.1 (Contig3944.g30239)
0.02 1.0 0.81 0.69 0.67 0.17 0.42 0.31 0.57 0.24 0.21 0.21 0.26 0.22 0.25 0.23 0.23 0.21 0.2 0.25 0.2 0.31 0.5 0.42 0.6 0.37 0.21
Sro145_g067400.1 (Contig3646.g28186)
0.01 0.98 1.0 0.61 0.48 0.03 0.15 0.07 0.24 0.14 0.1 0.08 0.26 0.16 0.12 0.07 0.12 0.12 0.15 0.41 0.05 0.1 0.27 0.06 0.02 0.03 0.06
Sro1515_g278980.1 (Contig1412.g12970)
0.01 1.0 0.98 0.64 0.73 0.16 0.31 0.29 0.49 0.27 0.26 0.31 0.13 0.21 0.26 0.22 0.22 0.17 0.28 0.09 0.13 0.61 0.41 0.25 0.08 0.14 0.21
Sro1539_g280830.1 (Contig832.g9192)
0.0 0.95 1.0 0.53 0.42 0.17 0.06 0.06 0.28 0.16 0.18 0.15 0.14 0.21 0.19 0.07 0.42 0.06 0.16 0.12 0.09 0.33 0.23 0.25 0.04 0.14 0.11
0.04 0.77 0.96 0.87 1.0 0.1 0.48 0.57 0.61 0.24 0.37 0.16 0.0 0.06 0.31 0.13 0.56 0.0 0.0 0.0 0.12 0.42 0.7 0.36 0.19 0.31 0.27
Sro158_g071600.1 (Contig163.g1845)
0.18 0.96 1.0 0.56 0.56 0.03 0.26 0.26 0.45 0.12 0.09 0.07 0.12 0.12 0.12 0.11 0.08 0.2 0.42 0.05 0.07 0.26 0.44 0.17 0.03 0.07 0.09
Sro1630_g287180.1 (Contig19.g147)
0.0 0.7 1.0 0.49 0.36 0.16 0.14 0.1 0.22 0.25 0.26 0.23 0.23 0.19 0.24 0.23 0.37 0.17 0.24 0.23 0.25 0.33 0.22 0.15 0.1 0.22 0.25
Sro1649_g288590.1 (Contig3529.g27269)
0.0 0.98 1.0 0.35 0.33 0.09 0.38 0.37 0.67 0.24 0.13 0.09 0.21 0.2 0.22 0.18 0.24 0.26 0.45 0.4 0.1 0.55 0.76 0.2 0.12 0.22 0.16
Sro1775_g296860.1 (Contig695.g8116)
0.02 1.0 0.91 0.38 0.39 0.04 0.19 0.1 0.16 0.2 0.18 0.23 0.33 0.27 0.27 0.09 0.17 0.01 0.03 0.18 0.17 0.27 0.43 0.07 0.0 0.09 0.07
Sro17_g012490.1 (Contig269.g3428)
0.08 0.59 1.0 0.36 0.53 0.07 0.19 0.11 0.3 0.17 0.16 0.06 0.07 0.05 0.11 0.12 0.13 0.16 0.21 0.07 0.09 0.17 0.25 0.13 0.08 0.07 0.09
0.0 1.0 0.63 0.39 0.57 0.13 0.18 0.07 0.31 0.2 0.16 0.12 0.35 0.2 0.31 0.1 0.09 0.06 0.12 0.08 0.11 0.42 0.97 0.23 0.07 0.14 0.05
Sro1866_g302510.1 (Contig2934.g23352)
0.0 0.7 1.0 0.55 0.41 0.09 0.18 0.23 0.42 0.22 0.29 0.24 0.26 0.21 0.19 0.15 0.36 0.19 0.23 0.25 0.2 0.31 0.24 0.19 0.12 0.17 0.18
Sro189_g081400.1 (Contig744.g8504)
0.0 0.65 1.0 0.51 0.43 0.11 0.12 0.22 0.44 0.23 0.34 0.25 0.15 0.25 0.21 0.13 0.38 0.11 0.18 0.15 0.12 0.27 0.38 0.14 0.14 0.16 0.19
0.0 0.7 1.0 0.33 0.29 0.0 0.24 0.21 0.37 0.08 0.05 0.02 0.07 0.04 0.1 0.06 0.12 0.13 0.05 0.07 0.03 0.27 0.4 0.05 0.03 0.01 0.03
Sro212_g088170.1 (Contig3756.g28800)
0.02 1.0 0.9 0.47 0.55 0.1 0.12 0.15 0.14 0.21 0.19 0.08 0.12 0.12 0.24 0.2 0.22 0.22 0.25 0.23 0.15 0.23 0.14 0.22 0.15 0.21 0.19
Sro2192_g318430.1 (Contig3677.g28398)
0.0 1.0 0.69 0.75 0.77 0.14 0.28 0.15 0.37 0.22 0.13 0.09 0.14 0.13 0.23 0.16 0.18 0.17 0.12 0.09 0.1 0.15 0.39 0.04 0.03 0.07 0.21
Sro221_g091050.1 (Contig91.g1028)
0.0 0.78 1.0 0.48 0.45 0.09 0.24 0.14 0.22 0.16 0.14 0.06 0.11 0.08 0.19 0.05 0.16 0.14 0.19 0.22 0.1 0.33 0.23 0.17 0.03 0.09 0.12
0.09 1.0 0.71 0.61 0.57 0.24 0.5 0.34 0.64 0.31 0.16 0.18 0.03 0.24 0.31 0.18 0.37 0.08 0.13 0.1 0.17 0.31 0.7 0.27 0.18 0.14 0.1
0.03 1.0 0.67 0.26 0.33 0.04 0.35 0.32 0.47 0.33 0.21 0.33 0.6 0.29 0.21 0.3 0.13 0.26 0.23 0.59 0.34 0.42 0.44 0.43 0.63 0.26 0.16
Sro2527_g330300.1 (Contig147.g1628)
0.01 0.97 1.0 0.49 0.51 0.12 0.53 0.65 0.88 0.25 0.22 0.21 0.38 0.13 0.24 0.21 0.14 0.35 0.3 0.52 0.18 0.67 0.6 0.21 0.1 0.14 0.2
Sro254_g100220.1 (Contig387.g5217)
0.01 0.95 1.0 0.53 0.52 0.03 0.17 0.2 0.43 0.19 0.1 0.05 0.22 0.01 0.16 0.18 0.06 0.24 0.54 0.11 0.08 0.69 0.37 0.48 0.18 0.15 0.14
Sro2561_g331320.1 (Contig2894.g23075)
0.06 1.0 0.8 0.5 0.55 0.1 0.29 0.17 0.49 0.24 0.22 0.15 0.22 0.18 0.18 0.09 0.32 0.2 0.23 0.25 0.11 0.14 0.5 0.11 0.07 0.14 0.13
Sro257_g100930.1 (Contig2018.g17272)
0.06 0.82 0.85 0.78 0.66 0.09 0.27 0.45 0.7 0.41 0.13 0.31 0.45 0.19 0.21 0.16 0.3 0.15 0.33 0.59 0.25 1.0 0.51 0.22 0.18 0.29 0.15
Sro268_g103650.1 (Contig1776.g15714)
0.05 1.0 0.93 0.36 0.42 0.08 0.13 0.17 0.27 0.18 0.14 0.14 0.21 0.19 0.2 0.12 0.22 0.12 0.15 0.2 0.12 0.34 0.33 0.07 0.03 0.07 0.1
0.21 1.0 0.94 0.38 0.41 0.05 0.39 0.44 0.61 0.18 0.1 0.01 0.16 0.09 0.2 0.11 0.18 0.13 0.15 0.19 0.09 0.44 0.5 0.2 0.08 0.06 0.08
Sro327_g118350.1 (Contig839.g9243)
0.03 0.78 1.0 0.37 0.41 0.11 0.21 0.28 0.53 0.18 0.2 0.18 0.15 0.07 0.2 0.17 0.24 0.22 0.23 0.13 0.09 0.49 0.45 0.08 0.06 0.11 0.15
Sro330_g118940.1 (Contig55.g410)
0.0 0.71 0.57 0.93 1.0 0.11 0.3 0.18 0.3 0.16 0.04 0.09 0.11 0.06 0.13 0.08 0.21 0.09 0.09 0.1 0.1 0.28 0.39 0.12 0.14 0.11 0.05
Sro3359_g347200.1 (Contig3047.g24243)
0.11 0.48 1.0 0.3 0.35 0.04 0.12 0.12 0.19 0.19 0.14 0.08 0.04 0.09 0.13 0.12 0.17 0.06 0.11 0.08 0.15 0.18 0.15 0.08 0.06 0.05 0.13
0.0 0.93 1.0 0.62 0.52 0.0 0.05 0.03 0.19 0.09 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.09 0.02 0.01 0.36 0.3 0.04 0.0 0.02 0.01
Sro351_g123860.1 (Contig4381.g32940)
0.01 0.79 1.0 0.47 0.38 0.17 0.26 0.32 0.35 0.23 0.21 0.14 0.45 0.22 0.21 0.25 0.24 0.23 0.27 0.48 0.13 0.39 0.43 0.11 0.1 0.14 0.17
Sro381_g130750.1 (Contig161.g1808)
0.0 0.65 1.0 0.47 0.39 0.19 0.19 0.19 0.41 0.2 0.29 0.2 0.32 0.19 0.23 0.15 0.54 0.12 0.13 0.23 0.19 0.37 0.37 0.13 0.09 0.13 0.15
0.05 1.0 0.7 0.34 0.63 0.0 0.29 0.17 0.4 0.14 0.1 0.06 0.06 0.08 0.1 0.1 0.06 0.3 0.15 0.13 0.05 0.27 0.4 0.06 0.08 0.14 0.07
0.36 1.0 0.81 0.55 0.57 0.05 0.25 0.4 0.54 0.25 0.19 0.2 0.15 0.11 0.16 0.21 0.14 0.2 0.22 0.21 0.19 0.36 0.42 0.17 0.17 0.17 0.14
Sro44_g026630.1 (Contig358.g4832)
0.12 0.6 1.0 0.43 0.44 0.07 0.13 0.2 0.23 0.2 0.16 0.1 0.08 0.08 0.2 0.14 0.22 0.22 0.35 0.13 0.14 0.32 0.21 0.17 0.1 0.1 0.12
Sro463_g148260.1 (Contig3968.g30435)
0.0 1.0 0.72 0.47 0.47 0.06 0.34 0.28 0.4 0.19 0.18 0.13 0.19 0.13 0.2 0.15 0.18 0.21 0.24 0.22 0.11 0.36 0.38 0.23 0.18 0.12 0.14
Sro484_g152190.1 (Contig2684.g21690)
0.0 1.0 0.87 0.49 0.65 0.22 0.53 0.5 0.53 0.43 0.55 0.47 0.43 0.46 0.39 0.34 0.55 0.42 0.68 0.56 0.4 0.31 0.57 0.33 0.33 0.33 0.34
Sro497_g154770.1 (Contig738.g8459)
0.0 0.86 1.0 0.39 0.34 0.02 0.35 0.2 0.5 0.15 0.01 0.03 0.04 0.04 0.17 0.02 0.02 0.02 0.09 0.04 0.01 0.45 0.65 0.12 0.03 0.05 0.04
Sro50_g029180.1 (Contig297.g3906)
0.01 0.88 1.0 0.58 0.55 0.12 0.23 0.26 0.45 0.3 0.34 0.4 0.19 0.31 0.22 0.21 0.26 0.12 0.23 0.16 0.35 0.41 0.29 0.16 0.1 0.18 0.22
Sro566_g167820.1 (Contig3739.g28677)
0.0 0.35 0.34 0.66 1.0 0.0 0.23 0.19 0.41 0.1 0.01 0.02 0.11 0.03 0.11 0.03 0.05 0.18 0.05 0.04 0.03 0.28 0.47 0.07 0.09 0.19 0.07
Sro572_g168730.1 (Contig1817.g16002)
0.02 0.61 1.0 0.4 0.39 0.05 0.18 0.14 0.27 0.14 0.17 0.11 0.12 0.08 0.15 0.24 0.16 0.11 0.15 0.11 0.1 0.31 0.31 0.3 0.1 0.15 0.14
Sro60_g034660.1 (Contig797.g8943)
0.05 0.79 0.87 0.88 1.0 0.17 0.66 0.43 0.6 0.35 0.57 0.34 0.18 0.39 0.38 0.13 0.49 0.31 0.48 0.22 0.18 0.27 0.67 0.56 0.6 0.5 0.32
Sro650_g181380.1 (Contig647.g7754)
0.05 0.73 1.0 0.03 0.04 0.0 0.08 0.05 0.14 0.19 0.08 0.15 0.22 0.15 0.05 0.03 0.06 0.25 0.16 0.42 0.08 0.32 0.09 0.12 0.16 0.21 0.01
Sro67_g037640.1 (Contig495.g6680)
0.0 0.95 1.0 0.56 0.65 0.12 0.42 0.31 0.61 0.28 0.29 0.25 0.46 0.24 0.32 0.29 0.25 0.3 0.43 0.24 0.19 0.46 0.61 0.28 0.17 0.15 0.23
0.03 1.0 0.81 0.33 0.44 0.07 0.14 0.1 0.43 0.16 0.05 0.04 0.06 0.01 0.12 0.05 0.07 0.05 0.07 0.09 0.06 0.46 0.41 0.13 0.08 0.05 0.06
Sro85_g045100.1 (Contig4580.g34187)
0.01 0.94 1.0 0.33 0.42 0.02 0.31 0.3 0.42 0.15 0.14 0.07 0.17 0.04 0.16 0.05 0.1 0.15 0.13 0.19 0.08 0.49 0.47 0.15 0.09 0.06 0.07
Sro970_g226320.1 (Contig1965.g16828)
0.01 0.26 0.38 0.21 0.27 0.11 0.82 0.51 0.62 0.12 0.11 0.06 0.05 0.08 0.24 0.07 0.13 0.21 0.07 0.03 0.07 0.01 1.0 0.23 0.2 0.33 0.07
Sro976_g227000.1 (Contig4239.g32123)
0.01 0.66 1.0 0.43 0.44 0.07 0.17 0.08 0.32 0.15 0.15 0.08 0.06 0.04 0.16 0.27 0.13 0.08 0.12 0.1 0.1 0.55 0.37 0.18 0.13 0.11 0.11
0.02 0.96 1.0 0.39 0.32 0.1 0.42 0.22 0.6 0.2 0.23 0.14 0.27 0.11 0.2 0.16 0.14 0.09 0.14 0.32 0.14 0.65 0.55 0.04 0.05 0.06 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)