1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_322 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro100_g051270.1 (Contig63.g532)
 0.8 103.9 131.01 84.04 87.39 27.78 61.09 75.04 94.78 46.8 37.44 51.13 86.38 40.08 38.79 32.62 40.67 32.14 53.27 45.3 34.94 65.78 82.68 30.29 36.24 29.61 35.86
Sro102_g052130.1 (Contig319.g4257)
 0.49 21.4 24.36 15.06 15.76 6.19 7.4 8.09 11.64 6.85 6.0 5.73 9.93 5.44 6.27 4.75 8.07 8.88 10.03 9.43 6.72 13.52 12.18 3.51 2.83 4.8 4.68
Sro1041_g234610.1 (Contig1456.g13346)
 0.0 15.11 2.62 8.55 11.26 0.86 3.4 0.62 3.3 1.44 0.74 0.65 1.15 1.05 0.6 0.07 1.76 1.95 4.45 0.86 0.2 0.61 5.05 0.03 0.17 0.7 0.38
Sro1042_g234660.1 (Contig734.g8414)
 0.09 26.81 26.23 14.36 14.44 2.92 8.02 12.25 16.36 6.5 4.36 3.61 7.71 3.11 5.46 4.42 7.36 7.79 8.64 11.18 4.78 12.52 12.99 4.97 2.0 4.72 3.98
Sro1064_g237230.1 (Contig2708.g21803)
 1.1 43.33 65.8 24.91 24.12 1.26 11.65 8.12 24.55 11.33 7.12 9.87 11.15 7.47 6.68 6.39 5.67 4.3 8.49 9.97 7.96 19.14 24.33 12.09 4.03 2.51 4.16
Sro106_g053430.1 (Contig1122.g10740)
 1.2 33.02 37.57 26.66 24.11 4.74 12.2 10.33 16.43 12.69 18.66 12.29 11.44 11.55 14.51 13.12 18.36 7.56 8.68 17.68 10.09 15.82 15.53 10.38 6.41 7.1 11.59
Sro1073_g238200.1 (Contig2105.g17884)
 8.08 44.94 93.34 50.67 45.73 7.02 17.28 18.36 27.22 8.16 11.91 4.25 6.55 1.41 13.34 12.75 11.75 28.68 15.35 4.49 5.31 21.13 34.83 10.7 8.52 11.29 7.09
Sro1090_g240140.1 (Contig48.g342)
 0.33 34.02 21.64 11.85 16.79 0.08 1.25 9.45 11.26 4.15 0.32 0.09 2.29 0.18 1.37 1.08 0.02 2.47 6.65 0.68 0.15 7.76 8.56 3.28 4.91 1.77 0.69
Sro1145_g246270.1 (Contig1590.g14445)
 0.34 20.37 22.63 12.07 11.92 3.46 5.58 3.75 4.54 6.77 5.56 3.13 3.39 3.44 5.7 3.6 5.38 4.72 7.7 7.37 5.11 12.47 5.79 5.0 3.6 3.29 3.82
3.7 37.75 35.37 34.6 35.99 7.33 7.42 9.48 21.17 10.42 10.09 4.38 3.28 2.6 12.87 2.56 16.02 6.58 2.68 7.45 7.5 17.93 11.64 7.16 2.09 2.13 3.51
Sro120_g058530.1 (Contig2411.g19731)
 0.05 9.1 13.54 5.77 10.01 0.74 7.39 6.98 12.86 3.58 0.5 0.21 2.04 1.13 0.89 0.33 2.27 1.05 2.58 3.52 1.76 13.27 8.38 3.88 0.48 1.54 1.3
Sro1263_g257220.1 (Contig245.g2988)
 16.75 24.56 29.42 23.37 26.09 7.86 20.38 20.68 26.91 15.23 17.14 14.45 21.92 15.81 15.55 18.01 17.8 10.21 11.4 22.57 9.21 22.66 22.54 10.36 7.43 7.82 10.9
Sro1265_g257500.1 (Contig3808.g29178)
 0.05 12.54 16.1 5.8 4.74 0.56 3.6 4.07 3.16 3.05 1.27 0.4 4.29 0.97 2.61 1.96 0.0 3.03 2.75 1.85 0.82 5.79 3.37 2.95 4.2 1.23 1.06
4.84 39.98 46.91 12.04 18.77 3.56 7.71 6.08 9.99 6.46 2.72 4.24 6.67 2.71 3.16 0.14 2.58 3.75 2.26 6.97 4.99 14.14 17.45 5.07 0.77 2.37 3.12
0.08 15.68 24.41 6.98 6.91 1.7 3.44 3.35 7.94 2.36 1.52 1.03 1.01 1.92 3.04 2.74 8.17 1.81 3.42 0.9 1.07 8.41 8.93 1.53 0.63 2.35 1.75
Sro13_g010230.1 (Contig337.g4564)
 3.2 111.56 93.76 65.14 80.27 21.61 41.35 48.33 82.41 36.26 20.93 31.66 47.73 44.35 28.59 18.69 40.75 34.56 44.07 34.68 21.95 64.34 72.71 26.18 12.35 18.03 13.88
Sro141_g065890.1 (Contig65.g613)
 0.07 20.76 19.03 8.19 8.12 4.78 3.9 6.76 21.91 6.1 6.74 4.69 13.26 6.22 7.78 4.61 14.8 2.36 2.33 20.73 2.98 12.32 17.3 5.08 1.32 6.51 5.41
Sro1455_g274150.1 (Contig3944.g30239)
 4.31 188.47 153.14 129.42 126.95 32.71 79.4 58.19 107.19 44.52 39.51 38.92 48.73 40.68 47.17 42.59 43.19 39.47 37.54 47.97 37.44 57.62 94.4 79.22 113.64 69.93 40.41
Sro145_g067400.1 (Contig3646.g28186)
 0.71 96.68 98.53 59.86 47.65 3.3 15.23 7.01 23.4 13.7 9.51 7.66 25.13 15.36 11.79 7.21 11.34 11.94 14.71 40.8 4.69 9.95 26.56 5.55 1.68 2.58 5.88
Sro1515_g278980.1 (Contig1412.g12970)
 2.16 246.34 241.89 157.7 179.9 39.93 77.21 70.5 119.9 67.66 63.28 76.32 31.73 51.39 64.37 55.4 54.24 40.77 69.71 22.3 33.14 149.87 100.99 61.1 18.75 33.27 52.74
Sro1539_g280830.1 (Contig832.g9192)
 0.03 27.21 28.61 15.24 11.96 4.92 1.82 1.71 7.93 4.59 5.24 4.38 4.11 6.09 5.55 1.87 11.98 1.62 4.67 3.49 2.66 9.52 6.65 7.03 1.2 4.03 3.02
0.92 17.25 21.58 19.59 22.41 2.24 10.65 12.72 13.69 5.47 8.18 3.65 0.0 1.45 7.01 2.86 12.47 0.0 0.0 0.0 2.77 9.3 15.65 8.12 4.25 7.02 5.96
Sro158_g071600.1 (Contig163.g1845)
 11.81 63.0 65.48 36.42 36.94 2.28 16.82 16.71 29.77 7.71 6.03 4.67 7.69 7.68 8.02 7.16 5.43 13.35 27.36 3.35 4.75 17.1 28.5 11.18 2.07 4.67 5.72
Sro1630_g287180.1 (Contig19.g147)
 0.02 9.26 13.16 6.47 4.77 2.12 1.81 1.29 2.88 3.26 3.43 3.06 2.98 2.53 3.1 3.04 4.84 2.21 3.19 3.07 3.27 4.33 2.91 1.91 1.26 2.93 3.34
Sro1649_g288590.1 (Contig3529.g27269)
 0.03 23.87 24.3 8.42 8.01 2.09 9.15 9.09 16.26 5.94 3.06 2.07 5.05 4.85 5.34 4.4 5.93 6.41 10.93 9.75 2.34 13.35 18.49 4.98 2.81 5.24 3.9
Sro1775_g296860.1 (Contig695.g8116)
 0.33 13.38 12.21 5.04 5.22 0.48 2.5 1.38 2.09 2.66 2.43 3.13 4.46 3.65 3.63 1.2 2.33 0.18 0.35 2.47 2.22 3.67 5.8 0.96 0.04 1.17 0.98
Sro17_g012490.1 (Contig269.g3428)
 2.85 20.92 35.5 12.69 18.82 2.36 6.72 4.07 10.59 5.92 5.66 1.96 2.63 1.61 4.06 4.18 4.51 5.56 7.6 2.48 3.28 6.16 8.84 4.71 3.01 2.55 3.3
0.0 25.04 15.85 9.8 14.28 3.18 4.46 1.63 7.67 4.95 4.04 3.11 8.66 4.91 7.69 2.54 2.37 1.51 3.12 1.91 2.85 10.43 24.34 5.73 1.66 3.42 1.23
Sro1866_g302510.1 (Contig2934.g23352)
 0.08 19.71 28.16 15.42 11.58 2.43 5.09 6.55 11.9 6.27 8.19 6.89 7.37 5.91 5.42 4.33 10.14 5.23 6.57 7.16 5.61 8.87 6.81 5.37 3.33 4.78 5.03
Sro189_g081400.1 (Contig744.g8504)
 0.04 51.05 78.44 39.7 33.51 8.32 9.77 17.01 34.2 18.28 26.53 19.74 11.71 19.69 16.86 10.54 29.5 8.72 13.95 11.58 9.55 21.01 29.85 10.73 10.7 12.92 14.79
0.04 24.84 35.65 11.91 10.38 0.12 8.58 7.46 13.05 3.01 1.88 0.77 2.46 1.26 3.58 2.2 4.23 4.79 1.9 2.36 1.1 9.58 14.1 1.84 0.99 0.39 0.99
Sro212_g088170.1 (Contig3756.g28800)
 0.67 35.87 32.29 16.85 19.62 3.75 4.35 5.44 4.99 7.54 6.85 3.01 4.31 4.36 8.49 7.28 7.72 7.74 8.79 8.21 5.49 8.36 5.05 7.77 5.33 7.6 6.82
Sro2192_g318430.1 (Contig3677.g28398)
 0.15 101.43 69.92 75.99 78.32 14.18 28.13 15.08 37.32 22.21 12.69 9.47 14.62 13.61 23.72 16.32 18.48 17.55 12.04 9.49 10.23 15.05 39.75 3.8 2.63 7.25 21.52
Sro221_g091050.1 (Contig91.g1028)
 0.04 12.63 16.28 7.77 7.3 1.46 3.98 2.32 3.55 2.55 2.25 0.92 1.82 1.31 3.17 0.89 2.58 2.22 3.15 3.55 1.65 5.44 3.71 2.69 0.53 1.47 1.93
1.66 19.19 13.71 11.72 10.98 4.61 9.6 6.52 12.25 5.93 3.09 3.5 0.65 4.56 5.87 3.39 7.09 1.57 2.48 1.86 3.22 5.88 13.41 5.12 3.46 2.76 1.92
0.34 12.69 8.47 3.35 4.18 0.52 4.44 4.02 5.95 4.19 2.73 4.13 7.56 3.64 2.63 3.78 1.63 3.25 2.95 7.53 4.32 5.33 5.56 5.5 8.03 3.27 2.05
Sro2527_g330300.1 (Contig147.g1628)
 0.06 11.03 11.35 5.61 5.82 1.41 5.99 7.34 9.96 2.86 2.49 2.34 4.32 1.43 2.71 2.43 1.56 3.99 3.44 5.95 2.03 7.65 6.82 2.34 1.12 1.59 2.29
Sro254_g100220.1 (Contig387.g5217)
 0.15 19.86 20.96 11.16 10.83 0.61 3.63 4.14 9.09 3.91 2.12 0.99 4.64 0.21 3.31 3.76 1.29 4.96 11.27 2.23 1.67 14.53 7.66 10.13 3.73 3.18 2.83
Sro2561_g331320.1 (Contig2894.g23075)
 14.98 239.27 191.42 119.82 132.4 22.95 69.74 41.73 116.8 57.92 53.26 35.32 52.25 42.6 44.17 20.74 75.71 48.92 54.73 59.04 25.7 32.58 118.67 27.16 17.92 34.26 31.84
Sro257_g100930.1 (Contig2018.g17272)
 0.36 5.2 5.37 4.91 4.2 0.59 1.74 2.84 4.45 2.62 0.84 1.94 2.86 1.22 1.33 1.02 1.93 0.92 2.06 3.74 1.6 6.34 3.24 1.4 1.16 1.84 0.97
Sro268_g103650.1 (Contig1776.g15714)
 2.06 38.29 35.74 13.63 16.04 3.07 4.95 6.44 10.36 6.77 5.39 5.45 8.19 7.09 7.77 4.66 8.27 4.43 5.56 7.63 4.43 13.01 12.61 2.77 1.11 2.74 3.88
9.26 44.46 41.83 16.86 18.03 2.27 17.38 19.75 27.24 7.94 4.54 0.58 7.03 3.85 8.76 4.96 7.92 5.79 6.59 8.23 4.08 19.59 22.34 9.07 3.5 2.45 3.72
Sro327_g118350.1 (Contig839.g9243)
 2.2 60.0 77.04 28.72 31.23 8.15 15.96 21.7 41.02 13.98 15.27 13.82 11.39 5.28 15.51 12.82 18.14 16.82 18.04 9.98 7.3 38.08 34.99 6.29 4.62 8.83 11.93
Sro330_g118940.1 (Contig55.g410)
 0.0 60.06 48.49 78.67 84.45 9.55 25.1 14.96 25.66 13.5 3.56 7.47 9.08 4.68 10.62 6.38 18.13 7.64 7.63 8.5 8.25 23.24 32.81 10.48 12.21 9.21 4.41
Sro3359_g347200.1 (Contig3047.g24243)
 10.78 49.41 102.19 30.81 35.53 4.17 12.68 12.23 19.74 19.12 13.93 7.74 4.51 8.83 13.17 11.91 17.18 5.94 10.97 8.06 15.82 18.33 15.83 8.53 6.07 4.85 13.37
0.0 61.86 66.81 41.58 34.7 0.0 3.06 2.18 12.73 5.94 0.0 1.35 1.3 0.3 1.93 0.57 1.07 0.34 5.86 1.56 0.43 24.27 19.84 2.5 0.24 1.65 0.7
Sro351_g123860.1 (Contig4381.g32940)
 0.31 19.44 24.54 11.44 9.31 4.09 6.36 7.79 8.68 5.68 5.03 3.54 11.11 5.3 5.07 6.03 5.93 5.7 6.69 11.72 3.09 9.55 10.48 2.81 2.42 3.56 4.19
Sro381_g130750.1 (Contig161.g1808)
 0.04 27.81 42.97 20.18 16.85 8.03 8.24 8.22 17.75 8.47 12.46 8.52 13.83 8.32 9.69 6.43 23.1 5.29 5.64 9.71 7.98 16.02 15.89 5.41 3.78 5.73 6.53
1.51 28.1 19.6 9.53 17.79 0.11 8.05 4.71 11.32 4.05 2.82 1.7 1.69 2.34 2.94 2.75 1.7 8.52 4.33 3.68 1.32 7.6 11.26 1.64 2.12 3.85 1.93
26.81 74.48 60.55 40.85 42.67 3.67 18.52 30.11 40.18 18.46 14.35 14.62 11.51 7.92 11.91 15.98 10.14 14.69 16.43 15.74 14.42 26.93 31.33 12.98 12.75 12.76 10.34
Sro44_g026630.1 (Contig358.g4832)
 125.72 644.89 1071.57 462.4 467.11 70.69 134.66 212.13 241.63 217.58 168.38 109.14 86.08 90.5 212.51 150.46 232.8 232.71 370.12 142.84 155.22 345.23 225.65 179.2 103.7 112.18 126.33
Sro463_g148260.1 (Contig3968.g30435)
 0.12 34.67 24.88 16.33 16.42 2.1 11.88 9.56 13.9 6.61 6.13 4.48 6.54 4.64 6.91 5.15 6.23 7.33 8.43 7.65 3.86 12.39 13.23 7.82 6.41 4.29 4.88
Sro484_g152190.1 (Contig2684.g21690)
 0.01 3.65 3.18 1.8 2.39 0.81 1.93 1.82 1.95 1.58 2.0 1.71 1.56 1.67 1.42 1.24 2.01 1.52 2.48 2.03 1.46 1.15 2.07 1.22 1.2 1.22 1.23
Sro497_g154770.1 (Contig738.g8459)
 0.12 21.29 24.87 9.66 8.36 0.46 8.73 4.99 12.51 3.66 0.26 0.78 0.87 0.89 4.24 0.48 0.57 0.43 2.36 1.06 0.29 11.1 16.17 3.11 0.82 1.12 0.99
Sro50_g029180.1 (Contig297.g3906)
 0.26 25.31 28.62 16.51 15.76 3.45 6.45 7.44 12.81 8.68 9.8 11.41 5.57 8.77 6.34 6.15 7.31 3.57 6.71 4.69 9.99 11.67 8.4 4.68 2.84 5.1 6.36
Sro566_g167820.1 (Contig3739.g28677)
 0.0 7.38 7.29 14.13 21.39 0.06 5.03 4.01 8.69 2.18 0.16 0.47 2.4 0.6 2.34 0.73 1.08 3.9 1.05 0.75 0.58 5.97 10.08 1.52 1.91 3.98 1.53
Sro572_g168730.1 (Contig1817.g16002)
 0.42 16.71 27.26 10.96 10.69 1.5 4.98 3.77 7.49 3.75 4.55 3.12 3.18 2.16 4.13 6.64 4.26 3.11 4.06 3.1 2.72 8.47 8.33 8.12 2.84 3.96 3.93
Sro60_g034660.1 (Contig797.g8943)
 1.78 27.46 30.21 30.52 34.58 5.73 22.91 14.71 20.73 12.21 19.88 11.68 6.28 13.48 13.07 4.41 16.82 10.71 16.77 7.48 6.12 9.33 23.27 19.24 20.6 17.21 10.92
Sro650_g181380.1 (Contig647.g7754)
 0.04 0.57 0.78 0.02 0.03 0.0 0.06 0.04 0.11 0.15 0.06 0.12 0.17 0.12 0.04 0.02 0.05 0.2 0.12 0.33 0.06 0.25 0.07 0.09 0.12 0.16 0.01
Sro67_g037640.1 (Contig495.g6680)
 0.19 37.25 39.23 22.05 25.47 4.69 16.29 12.21 24.05 10.99 11.57 10.0 17.91 9.34 12.48 11.36 9.78 11.84 17.07 9.32 7.52 17.96 24.0 11.17 6.52 5.95 9.12
1.78 55.4 44.71 18.19 24.12 3.75 7.97 5.51 23.87 8.78 2.65 2.49 3.58 0.77 6.79 2.91 3.83 2.61 3.94 5.17 3.5 25.3 22.92 7.36 4.2 2.5 3.11
Sro85_g045100.1 (Contig4580.g34187)
 0.32 55.6 58.96 19.44 24.68 1.35 18.03 17.73 24.77 8.65 8.01 4.38 9.96 2.59 9.58 3.2 6.17 8.71 7.85 10.98 4.83 29.15 27.88 9.06 5.47 3.69 4.23
Sro970_g226320.1 (Contig1965.g16828)
 0.25 6.46 9.31 5.16 6.71 2.66 20.42 12.54 15.45 2.89 2.75 1.39 1.35 2.1 5.94 1.82 3.24 5.31 1.83 0.73 1.79 0.16 24.81 5.7 4.96 8.21 1.84
Sro976_g227000.1 (Contig4239.g32123)
 3.17 145.81 219.51 95.37 96.9 14.82 36.34 18.15 69.81 31.94 32.62 16.81 12.1 8.33 35.72 58.55 29.56 17.1 26.88 22.49 21.05 119.91 81.28 38.6 29.49 24.18 24.5
0.58 31.15 32.56 12.79 10.42 3.11 13.56 7.1 19.57 6.43 7.35 4.68 8.92 3.61 6.41 5.22 4.61 2.79 4.57 10.46 4.66 21.21 18.02 1.46 1.63 2.03 5.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)